MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 24876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018625	TTG	2	6	282190	282195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592090
6002	NC_018625	TTC	2	6	282269	282274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592090
6003	NC_018625	AAC	2	6	282284	282289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592090
6004	NC_018625	CA	3	6	282329	282334	50 %	0 %	0 %	50 %	406592090
6005	NC_018625	TTG	2	6	282387	282392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592090
6006	NC_018625	T	7	7	282417	282423	0 %	100 %	0 %	0 %	406592090
6007	NC_018625	TTG	2	6	282445	282450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592090
6008	NC_018625	CAT	2	6	282474	282479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592090
6009	NC_018625	TTA	2	6	282498	282503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592090
6010	NC_018625	TCC	2	6	282662	282667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592090
6011	NC_018625	TTA	2	6	282678	282683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592090
6012	NC_018625	CCG	2	6	282702	282707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406592090
6013	NC_018625	TTC	2	6	282721	282726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592090
6014	NC_018625	CTT	3	9	282763	282771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592090
6015	NC_018625	TCA	2	6	282856	282861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592091
6016	NC_018625	TTC	2	6	282960	282965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592091
6017	NC_018625	ATA	2	6	283040	283045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592091
6018	NC_018625	GAT	2	6	283105	283110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592091
6019	NC_018625	CAG	2	6	283135	283140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592091
6020	NC_018625	TC	3	6	283141	283146	0 %	50 %	0 %	50 %	406592091
6021	NC_018625	CTG	2	6	283235	283240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592091
6022	NC_018625	ATC	2	6	283316	283321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592091
6023	NC_018625	TC	3	6	283434	283439	0 %	50 %	0 %	50 %	406592091
6024	NC_018625	TCT	2	6	283444	283449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592091
6025	NC_018625	CCT	2	6	283456	283461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592091
6026	NC_018625	A	7	7	283536	283542	100 %	0 %	0 %	0 %	406592091
6027	NC_018625	ATG	2	6	283613	283618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592091
6028	NC_018625	TCGT	2	8	283636	283643	0 %	50 %	25 %	25 %	406592091
6029	NC_018625	A	8	8	283657	283664	100 %	0 %	0 %	0 %	406592092
6030	NC_018625	AGA	2	6	283671	283676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592092
6031	NC_018625	AG	3	6	283689	283694	50 %	0 %	50 %	0 %	406592092
6032	NC_018625	GAA	2	6	283795	283800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592092
6033	NC_018625	TCT	2	6	283882	283887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592092
6034	NC_018625	ATTG	2	8	283959	283966	25 %	50 %	25 %	0 %	406592092
6035	NC_018625	TGA	2	6	283968	283973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592092
6036	NC_018625	CAG	2	6	283990	283995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592092
6037	NC_018625	AGCACG	2	12	284106	284117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592092
6038	NC_018625	GGT	2	6	284176	284181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592092
6039	NC_018625	GGA	2	6	284188	284193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592092
6040	NC_018625	TAGA	2	8	284228	284235	50 %	25 %	25 %	0 %	406592092
6041	NC_018625	GAT	2	6	284238	284243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592092
6042	NC_018625	AAAGA	2	10	284294	284303	80 %	0 %	20 %	0 %	406592092
6043	NC_018625	GCG	2	6	284304	284309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406592092
6044	NC_018625	CTG	2	6	284380	284385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592092
6045	NC_018625	GT	3	6	284457	284462	0 %	50 %	50 %	0 %	406592092
6046	NC_018625	TTG	2	6	284531	284536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592092
6047	NC_018625	TGT	2	6	284589	284594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592092
6048	NC_018625	ATC	2	6	284677	284682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592092
6049	NC_018625	CAC	2	6	284747	284752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406592092
6050	NC_018625	TCT	2	6	284796	284801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592092
6051	NC_018625	ATG	2	6	284891	284896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592092
6052	NC_018625	CATCG	2	10	284909	284918	20 %	20 %	20 %	40 %	406592092
6053	NC_018625	GAT	2	6	284926	284931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592092
6054	NC_018625	TTC	2	6	285003	285008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592092
6055	NC_018625	A	6	6	285067	285072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_018625	TTA	2	6	285081	285086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_018625	T	7	7	285127	285133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_018625	TTGT	2	8	285187	285194	0 %	75 %	25 %	0 %	406592093
6059	NC_018625	CTT	2	6	285248	285253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592093
6060	NC_018625	T	6	6	285386	285391	0 %	100 %	0 %	0 %	406592093
6061	NC_018625	GTT	2	6	285393	285398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592093
6062	NC_018625	GTT	2	6	285403	285408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592093
6063	NC_018625	T	6	6	285429	285434	0 %	100 %	0 %	0 %	406592093
6064	NC_018625	AGAC	2	8	285443	285450	50 %	0 %	25 %	25 %	406592093
6065	NC_018625	TCT	2	6	285455	285460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592093
6066	NC_018625	TAT	2	6	285608	285613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592093
6067	NC_018625	CTTA	2	8	285616	285623	25 %	50 %	0 %	25 %	406592093
6068	NC_018625	TCCCG	2	10	285639	285648	0 %	20 %	20 %	60 %	406592093
6069	NC_018625	GAG	2	6	285663	285668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592093
6070	NC_018625	CTTAT	2	10	285757	285766	20 %	60 %	0 %	20 %	406592093
6071	NC_018625	AGAA	2	8	285794	285801	75 %	0 %	25 %	0 %	406592093
6072	NC_018625	TTC	2	6	285809	285814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592093
6073	NC_018625	GAC	2	6	285837	285842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592093
6074	NC_018625	AT	3	6	285850	285855	50 %	50 %	0 %	0 %	406592093
6075	NC_018625	TAT	3	9	285853	285861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592093
6076	NC_018625	TTC	2	6	285881	285886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592093
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6081	NC_018625	TCT	2	6	286148	286153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592093
6082	NC_018625	AACG	2	8	286175	286182	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6083	NC_018625	GAA	2	6	286183	286188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_018625	TTG	2	6	286263	286268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592094
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6089	NC_018625	TGT	2	6	286629	286634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592095
6090	NC_018625	TAC	2	6	286651	286656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592095
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6092	NC_018625	A	6	6	286672	286677	100 %	0 %	0 %	0 %	406592095
6093	NC_018625	CTTT	2	8	286729	286736	0 %	75 %	0 %	25 %	406592095
6094	NC_018625	AAGA	2	8	286907	286914	75 %	0 %	25 %	0 %	406592095
6095	NC_018625	A	7	7	286914	286920	100 %	0 %	0 %	0 %	406592095
6096	NC_018625	TTTA	2	8	287060	287067	25 %	75 %	0 %	0 %	406592096
6097	NC_018625	TAT	2	6	287099	287104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592096
6098	NC_018625	TTC	2	6	287128	287133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592096
6099	NC_018625	AAG	2	6	287217	287222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592096
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6101	NC_018625	CTT	2	6	287265	287270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592096
6102	NC_018625	TTC	2	6	287279	287284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592096
6103	NC_018625	TCT	2	6	287337	287342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592096
6104	NC_018625	A	6	6	287372	287377	100 %	0 %	0 %	0 %	406592096
6105	NC_018625	TTA	2	6	287463	287468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592097
6106	NC_018625	CTC	2	6	287522	287527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592097
6107	NC_018625	CAT	2	6	287610	287615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592097
6108	NC_018625	TATC	2	8	287669	287676	25 %	50 %	0 %	25 %	406592097
6109	NC_018625	T	6	6	287741	287746	0 %	100 %	0 %	0 %	406592097
6110	NC_018625	TCA	2	6	287750	287755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592097
6111	NC_018625	ATG	2	6	287800	287805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592097
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6114	NC_018625	GAA	2	6	287958	287963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592097
6115	NC_018625	CTC	3	9	288046	288054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592097
6116	NC_018625	TGGA	2	8	288108	288115	25 %	25 %	50 %	0 %	406592097
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6118	NC_018625	TAC	2	6	288324	288329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592097
6119	NC_018625	T	6	6	288369	288374	0 %	100 %	0 %	0 %	406592097
6120	NC_018625	ACC	2	6	288379	288384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406592097
6121	NC_018625	GCTTT	2	10	288445	288454	0 %	60 %	20 %	20 %	406592097
6122	NC_018625	AAG	2	6	288550	288555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592097
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6495	NC_018625	TTTTTC	2	12	306578	306589	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406592106
6496	NC_018625	CTTTT	2	10	306590	306599	0 %	80 %	0 %	20 %	406592106
6497	NC_018625	GTT	2	6	306713	306718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592106
6498	NC_018625	TGG	2	6	306854	306859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592106
6499	NC_018625	CAC	2	6	306877	306882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406592106
6500	NC_018625	ATGG	2	8	306915	306922	25 %	25 %	50 %	0 %	406592106

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