MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 24876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018625	ATC	2	6	236119	236124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592043
5002	NC_018625	T	7	7	236136	236142	0 %	100 %	0 %	0 %	406592043
5003	NC_018625	GC	3	6	236207	236212	0 %	0 %	50 %	50 %	406592043
5004	NC_018625	GCT	2	6	236223	236228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592043
5005	NC_018625	GTCC	2	8	236259	236266	0 %	25 %	25 %	50 %	406592043
5006	NC_018625	GTCT	2	8	236277	236284	0 %	50 %	25 %	25 %	406592043
5007	NC_018625	T	6	6	236284	236289	0 %	100 %	0 %	0 %	406592043
5008	NC_018625	GAA	2	6	236430	236435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592043
5009	NC_018625	ACA	2	6	236460	236465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592043
5010	NC_018625	CAA	2	6	236467	236472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592043
5011	NC_018625	ACT	2	6	236480	236485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592043
5012	NC_018625	TCT	2	6	236495	236500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592043
5013	NC_018625	TTA	2	6	236511	236516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592043
5014	NC_018625	GTA	2	6	236518	236523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592043
5015	NC_018625	TC	4	8	236530	236537	0 %	50 %	0 %	50 %	406592043
5016	NC_018625	ATC	2	6	236554	236559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592043
5017	NC_018625	TCT	2	6	236676	236681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592043
5018	NC_018625	TG	4	8	236694	236701	0 %	50 %	50 %	0 %	406592043
5019	NC_018625	TC	4	8	236786	236793	0 %	50 %	0 %	50 %	406592043
5020	NC_018625	CTT	2	6	236853	236858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592043
5021	NC_018625	ATG	2	6	236868	236873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592043
5022	NC_018625	TGT	2	6	236903	236908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592043
5023	NC_018625	TGG	2	6	236932	236937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592043
5024	NC_018625	AG	3	6	236999	237004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_018625	AT	3	6	237069	237074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_018625	CTA	2	6	237178	237183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_018625	CGA	2	6	237416	237421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592044
5028	NC_018625	TGC	2	6	237427	237432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592044
5029	NC_018625	T	6	6	237511	237516	0 %	100 %	0 %	0 %	406592044
5030	NC_018625	AAC	3	9	237586	237594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592044
5031	NC_018625	T	6	6	237601	237606	0 %	100 %	0 %	0 %	406592044
5032	NC_018625	GTT	2	6	237607	237612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592044
5033	NC_018625	TAA	2	6	237613	237618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592044
5034	NC_018625	TGC	2	6	237674	237679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592044
5035	NC_018625	CTT	2	6	237693	237698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592044
5036	NC_018625	ACT	2	6	237745	237750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592044
5037	NC_018625	CTTT	2	8	237770	237777	0 %	75 %	0 %	25 %	406592044
5038	NC_018625	TGC	2	6	237862	237867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592044
5039	NC_018625	CATC	2	8	237897	237904	25 %	25 %	0 %	50 %	406592044
5040	NC_018625	TTG	2	6	237919	237924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592044
5041	NC_018625	CTT	2	6	237975	237980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592044
5042	NC_018625	CGA	2	6	238031	238036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592044
5043	NC_018625	CATG	2	8	238155	238162	25 %	25 %	25 %	25 %	406592044
5044	NC_018625	CTTG	2	8	238173	238180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_018625	GAAT	2	8	238224	238231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_018625	GAA	3	9	238238	238246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_018625	T	6	6	238261	238266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_018625	AAG	2	6	238270	238275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_018625	T	7	7	238285	238291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_018625	AAG	2	6	238324	238329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_018625	ACC	2	6	238343	238348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_018625	AATT	2	8	238363	238370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_018625	GAT	2	6	238404	238409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_018625	TTTC	2	8	238463	238470	0 %	75 %	0 %	25 %	406592045
5055	NC_018625	GTT	2	6	238491	238496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592045
5056	NC_018625	A	8	8	238532	238539	100 %	0 %	0 %	0 %	406592045
5057	NC_018625	AGA	2	6	238574	238579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_018625	GAG	2	6	238660	238665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592046
5059	NC_018625	T	6	6	238720	238725	0 %	100 %	0 %	0 %	406592046
5060	NC_018625	CT	3	6	238783	238788	0 %	50 %	0 %	50 %	406592046
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5062	NC_018625	TTG	2	6	238844	238849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592046
5063	NC_018625	CTC	2	6	238933	238938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592046
5064	NC_018625	CTTT	2	8	238979	238986	0 %	75 %	0 %	25 %	406592046
5065	NC_018625	T	6	6	238984	238989	0 %	100 %	0 %	0 %	406592046
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5067	NC_018625	GATT	2	8	239147	239154	25 %	50 %	25 %	0 %	406592046
5068	NC_018625	GCA	2	6	239180	239185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592046
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5070	NC_018625	TTG	2	6	239443	239448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592046
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5072	NC_018625	AGGC	2	8	239514	239521	25 %	0 %	50 %	25 %	406592046
5073	NC_018625	AAG	2	6	239592	239597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592046
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5075	NC_018625	TTTG	2	8	239673	239680	0 %	75 %	25 %	0 %	406592046
5076	NC_018625	ATTATA	2	12	239706	239717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5078	NC_018625	CTT	2	6	239778	239783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_018625	TAT	2	6	239805	239810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_018625	ATAA	2	8	239846	239853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_018625	GA	3	6	239888	239893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_018625	A	6	6	239923	239928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_018625	GCA	2	6	239941	239946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_018625	GCA	2	6	239951	239956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_018625	CAA	2	6	240009	240014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406592047
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5089	NC_018625	T	6	6	240167	240172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_018625	TCA	2	6	240174	240179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5093	NC_018625	A	7	7	240433	240439	100 %	0 %	0 %	0 %	406592049
5094	NC_018625	TAG	2	6	240540	240545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592049
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5096	NC_018625	AAAT	2	8	240663	240670	75 %	25 %	0 %	0 %	406592049
5097	NC_018625	TCT	2	6	240713	240718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592049
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5100	NC_018625	GTTT	2	8	240896	240903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_018625	TAG	2	6	240964	240969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_018625	A	7	7	241056	241062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_018625	AG	3	6	241098	241103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_018625	TAT	2	6	241114	241119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_018625	TCAT	2	8	241126	241133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5106	NC_018625	ATA	2	6	241141	241146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_018625	CGT	2	6	241162	241167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592050
5108	NC_018625	GAA	2	6	241199	241204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592050
5109	NC_018625	ATC	2	6	241246	241251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592050
5110	NC_018625	TAT	2	6	241283	241288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592050
5111	NC_018625	GAG	2	6	241298	241303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406592050
5112	NC_018625	GAT	2	6	241322	241327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592050
5113	NC_018625	TTCAG	2	10	241352	241361	20 %	40 %	20 %	20 %	406592050
5114	NC_018625	TTG	2	6	241427	241432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592050
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5247	NC_018625	T	6	6	247716	247721	0 %	100 %	0 %	0 %	406592057
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5250	NC_018625	AAG	2	6	247854	247859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_018625	ATA	2	6	247953	247958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592058
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5375	NC_018625	CTT	2	6	254029	254034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592066
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5377	NC_018625	GATT	2	8	254071	254078	25 %	50 %	25 %	0 %	406592066
5378	NC_018625	TGA	2	6	254080	254085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592066
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5495	NC_018625	GTAG	2	8	259330	259337	25 %	25 %	50 %	0 %	406592070
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5499	NC_018625	AAT	2	6	259562	259567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592070
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