MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 24876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018625	TCG	2	6	210679	210684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592021
4502	NC_018625	GATT	2	8	210697	210704	25 %	50 %	25 %	0 %	406592021
4503	NC_018625	GT	3	6	210715	210720	0 %	50 %	50 %	0 %	406592021
4504	NC_018625	AG	3	6	210735	210740	50 %	0 %	50 %	0 %	406592021
4505	NC_018625	AAAG	2	8	210749	210756	75 %	0 %	25 %	0 %	406592021
4506	NC_018625	TTG	2	6	210848	210853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592021
4507	NC_018625	CTC	2	6	210883	210888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592021
4508	NC_018625	CTAA	2	8	210907	210914	50 %	25 %	0 %	25 %	406592021
4509	NC_018625	GTC	2	6	211071	211076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_018625	T	6	6	211160	211165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_018625	AAT	2	6	211257	211262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406592022
4512	NC_018625	AAGC	2	8	211272	211279	50 %	0 %	25 %	25 %	406592022
4513	NC_018625	ATT	2	6	211317	211322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592022
4514	NC_018625	AAG	2	6	211343	211348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592022
4515	NC_018625	GTT	2	6	211365	211370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592022
4516	NC_018625	GTA	2	6	211423	211428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592022
4517	NC_018625	GA	3	6	211457	211462	50 %	0 %	50 %	0 %	406592022
4518	NC_018625	GTAG	2	8	211744	211751	25 %	25 %	50 %	0 %	406592023
4519	NC_018625	TGA	2	6	211758	211763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592023
4520	NC_018625	TTG	2	6	211790	211795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592023
4521	NC_018625	AT	3	6	211818	211823	50 %	50 %	0 %	0 %	406592023
4522	NC_018625	TTC	2	6	211829	211834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592023
4523	NC_018625	GTTT	2	8	211869	211876	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_018625	T	6	6	211888	211893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_018625	TGG	2	6	212069	212074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592024
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4527	NC_018625	GTT	2	6	212301	212306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592024
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4530	NC_018625	ATT	2	6	212681	212686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592024
4531	NC_018625	GTT	2	6	212687	212692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592024
4532	NC_018625	TCC	2	6	212721	212726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592024
4533	NC_018625	AGA	3	9	212729	212737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406592024
4534	NC_018625	TGA	2	6	212819	212824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592024
4535	NC_018625	TTG	2	6	212989	212994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_018625	ATC	2	6	213069	213074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_018625	TGC	2	6	213185	213190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_018625	AGC	2	6	213198	213203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_018625	CAT	2	6	213239	213244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_018625	AT	3	6	213243	213248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_018625	AAAG	2	8	213264	213271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_018625	TAC	2	6	213290	213295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_018625	GGT	2	6	213344	213349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_018625	TCT	2	6	213468	213473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_018625	CATA	2	8	213541	213548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_018625	CCT	2	6	213600	213605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_018625	ATGT	2	8	213657	213664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_018625	ACA	2	6	213669	213674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_018625	GCC	2	6	213699	213704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_018625	AAG	2	6	213709	213714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_018625	A	7	7	213743	213749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_018625	T	7	7	213767	213773	0 %	100 %	0 %	0 %	406592025
4553	NC_018625	TTG	2	6	213804	213809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592025
4554	NC_018625	GTT	2	6	213824	213829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592025
4555	NC_018625	ATG	2	6	213874	213879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592025
4556	NC_018625	GTT	2	6	213945	213950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592025
4557	NC_018625	AGAT	2	8	214051	214058	50 %	25 %	25 %	0 %	406592025
4558	NC_018625	AGAA	2	8	214174	214181	75 %	0 %	25 %	0 %	406592025
4559	NC_018625	GAAAA	2	10	214203	214212	80 %	0 %	20 %	0 %	406592025
4560	NC_018625	TGC	2	6	214226	214231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406592025
4561	NC_018625	T	7	7	214258	214264	0 %	100 %	0 %	0 %	406592025
4562	NC_018625	GTA	2	6	214295	214300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406592025
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4570	NC_018625	TAGCA	2	10	214569	214578	40 %	20 %	20 %	20 %	406592026
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4573	NC_018625	ACG	2	6	214696	214701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406592026
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4578	NC_018625	T	7	7	215032	215038	0 %	100 %	0 %	0 %	406592026
4579	NC_018625	TTC	2	6	215232	215237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592026
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4581	NC_018625	AAG	2	6	215283	215288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_018625	TGA	2	6	215320	215325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_018625	TAA	2	6	215357	215362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_018625	T	6	6	215390	215395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4588	NC_018625	CT	3	6	215572	215577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4590	NC_018625	T	6	6	215665	215670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_018625	T	6	6	215711	215716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_018625	A	6	6	215762	215767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_018625	AG	3	6	215801	215806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_018625	TC	3	6	215860	215865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4598	NC_018625	GT	3	6	216122	216127	0 %	50 %	50 %	0 %	406592027
4599	NC_018625	GACA	2	8	216159	216166	50 %	0 %	25 %	25 %	406592027
4600	NC_018625	AG	3	6	216188	216193	50 %	0 %	50 %	0 %	406592027
4601	NC_018625	CTC	2	6	216245	216250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406592027
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4610	NC_018625	ATTT	2	8	216740	216747	25 %	75 %	0 %	0 %	406592028
4611	NC_018625	TCA	2	6	216852	216857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592028
4612	NC_018625	GTG	2	6	216935	216940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406592028
4613	NC_018625	ACTC	2	8	216949	216956	25 %	25 %	0 %	50 %	406592028
4614	NC_018625	TTA	2	6	217043	217048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406592028
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4616	NC_018625	TG	3	6	217205	217210	0 %	50 %	50 %	0 %	406592028
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4619	NC_018625	AT	3	6	217541	217546	50 %	50 %	0 %	0 %	406592029
4620	NC_018625	AGAA	2	8	217846	217853	75 %	0 %	25 %	0 %	406592029
4621	NC_018625	TTG	2	6	217858	217863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406592029
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4623	NC_018625	TTC	2	6	218252	218257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406592029
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4625	NC_018625	ATC	2	6	218318	218323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406592029
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4627	NC_018625	GA	3	6	218375	218380	50 %	0 %	50 %	0 %	406592029
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4870	NC_018625	CCT	2	6	229728	229733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4871	NC_018625	ATA	2	6	229756	229761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4872	NC_018625	T	8	8	229803	229810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4873	NC_018625	GA	3	6	229987	229992	50 %	0 %	50 %	0 %	406592037
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