MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 2146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018624	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018624	GT	3	6	309	314	0 %	50 %	50 %	0 %	407460164
3	NC_018624	TG	3	6	498	503	0 %	50 %	50 %	0 %	407460164
4	NC_018624	TC	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	407460164
5	NC_018624	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	407460165
6	NC_018624	GT	3	6	1461	1466	0 %	50 %	50 %	0 %	407460165
7	NC_018624	TC	3	6	1584	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	407460165
8	NC_018624	TG	3	6	1888	1893	0 %	50 %	50 %	0 %	407460165
9	NC_018624	GA	3	6	2785	2790	50 %	0 %	50 %	0 %	407460166
10	NC_018624	GA	3	6	3339	3344	50 %	0 %	50 %	0 %	407460167
11	NC_018624	AT	3	6	4226	4231	50 %	50 %	0 %	0 %	407460167
12	NC_018624	CT	3	6	4728	4733	0 %	50 %	0 %	50 %	407460167
13	NC_018624	CT	3	6	6468	6473	0 %	50 %	0 %	50 %	407460168
14	NC_018624	GA	3	6	6892	6897	50 %	0 %	50 %	0 %	407460170
15	NC_018624	GT	3	6	7803	7808	0 %	50 %	50 %	0 %	407460170
16	NC_018624	TC	3	6	7874	7879	0 %	50 %	0 %	50 %	407460170
17	NC_018624	AT	3	6	8463	8468	50 %	50 %	0 %	0 %	407460171
18	NC_018624	GT	3	6	8686	8691	0 %	50 %	50 %	0 %	407460171
19	NC_018624	AG	3	6	9229	9234	50 %	0 %	50 %	0 %	407460172
20	NC_018624	TG	3	6	10491	10496	0 %	50 %	50 %	0 %	407460172
21	NC_018624	TC	3	6	11261	11266	0 %	50 %	0 %	50 %	407460173
22	NC_018624	AC	3	6	11277	11282	50 %	0 %	0 %	50 %	407460173
23	NC_018624	AT	3	6	11521	11526	50 %	50 %	0 %	0 %	407460173
24	NC_018624	GA	3	6	11600	11605	50 %	0 %	50 %	0 %	407460173
25	NC_018624	AG	3	6	11788	11793	50 %	0 %	50 %	0 %	407460173
26	NC_018624	TC	3	6	11841	11846	0 %	50 %	0 %	50 %	407460173
27	NC_018624	GT	3	6	12056	12061	0 %	50 %	50 %	0 %	407460173
28	NC_018624	GA	3	6	12444	12449	50 %	0 %	50 %	0 %	407460173
29	NC_018624	AG	3	6	12513	12518	50 %	0 %	50 %	0 %	407460173
30	NC_018624	GA	3	6	12584	12589	50 %	0 %	50 %	0 %	407460173
31	NC_018624	GT	3	6	12865	12870	0 %	50 %	50 %	0 %	407460173
32	NC_018624	TA	3	6	13805	13810	50 %	50 %	0 %	0 %	407460173
33	NC_018624	TA	3	6	13825	13830	50 %	50 %	0 %	0 %	407460173
34	NC_018624	AT	3	6	14109	14114	50 %	50 %	0 %	0 %	407460174
35	NC_018624	CT	3	6	14789	14794	0 %	50 %	0 %	50 %	407460174
36	NC_018624	TA	3	6	15119	15124	50 %	50 %	0 %	0 %	407460174
37	NC_018624	TG	4	8	15657	15664	0 %	50 %	50 %	0 %	407460174
38	NC_018624	AG	3	6	17696	17701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018624	TC	3	6	18952	18957	0 %	50 %	0 %	50 %	407460179
40	NC_018624	GT	3	6	19393	19398	0 %	50 %	50 %	0 %	407460179
41	NC_018624	TA	3	6	19437	19442	50 %	50 %	0 %	0 %	407460179
42	NC_018624	TC	3	6	19543	19548	0 %	50 %	0 %	50 %	407460179
43	NC_018624	GT	3	6	19672	19677	0 %	50 %	50 %	0 %	407460179
44	NC_018624	AC	3	6	20113	20118	50 %	0 %	0 %	50 %	407460179
45	NC_018624	TC	3	6	21144	21149	0 %	50 %	0 %	50 %	407460180
46	NC_018624	GA	3	6	22446	22451	50 %	0 %	50 %	0 %	407460181
47	NC_018624	GA	3	6	23669	23674	50 %	0 %	50 %	0 %	407460181
48	NC_018624	TA	3	6	25502	25507	50 %	50 %	0 %	0 %	407460183
49	NC_018624	AG	3	6	25609	25614	50 %	0 %	50 %	0 %	407460183
50	NC_018624	TA	3	6	26512	26517	50 %	50 %	0 %	0 %	407460183
51	NC_018624	TA	3	6	27372	27377	50 %	50 %	0 %	0 %	407460185
52	NC_018624	TC	3	6	27457	27462	0 %	50 %	0 %	50 %	407460185
53	NC_018624	TA	3	6	28049	28054	50 %	50 %	0 %	0 %	407460185
54	NC_018624	AG	3	6	29924	29929	50 %	0 %	50 %	0 %	407460187
55	NC_018624	AG	3	6	30585	30590	50 %	0 %	50 %	0 %	407460188
56	NC_018624	GA	3	6	31107	31112	50 %	0 %	50 %	0 %	407460189
57	NC_018624	GA	4	8	31237	31244	50 %	0 %	50 %	0 %	407460189
58	NC_018624	TC	3	6	31850	31855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018624	GT	3	6	33081	33086	0 %	50 %	50 %	0 %	407460191
60	NC_018624	AG	3	6	34610	34615	50 %	0 %	50 %	0 %	407460194
61	NC_018624	AG	3	6	34682	34687	50 %	0 %	50 %	0 %	407460194
62	NC_018624	AT	3	6	34728	34733	50 %	50 %	0 %	0 %	407460194
63	NC_018624	TG	3	6	34817	34822	0 %	50 %	50 %	0 %	407460194
64	NC_018624	CG	3	6	35129	35134	0 %	0 %	50 %	50 %	407460194
65	NC_018624	AT	3	6	35448	35453	50 %	50 %	0 %	0 %	407460194
66	NC_018624	GA	3	6	35929	35934	50 %	0 %	50 %	0 %	407460195
67	NC_018624	TA	3	6	37502	37507	50 %	50 %	0 %	0 %	407460195
68	NC_018624	TC	3	6	37740	37745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018624	GA	3	6	38472	38477	50 %	0 %	50 %	0 %	407460196
70	NC_018624	CG	3	6	38501	38506	0 %	0 %	50 %	50 %	407460196
71	NC_018624	TA	3	6	38507	38512	50 %	50 %	0 %	0 %	407460196
72	NC_018624	GC	3	6	39839	39844	0 %	0 %	50 %	50 %	407460198
73	NC_018624	AG	3	6	39850	39855	50 %	0 %	50 %	0 %	407460198
74	NC_018624	AG	3	6	40730	40735	50 %	0 %	50 %	0 %	407460199
75	NC_018624	GC	3	6	41447	41452	0 %	0 %	50 %	50 %	407460199
76	NC_018624	AT	3	6	41779	41784	50 %	50 %	0 %	0 %	407460199
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83	NC_018624	TA	3	6	48251	48256	50 %	50 %	0 %	0 %	407460208
84	NC_018624	AT	3	6	48265	48270	50 %	50 %	0 %	0 %	407460208
85	NC_018624	AT	3	6	48517	48522	50 %	50 %	0 %	0 %	407460208
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87	NC_018624	TA	3	6	48877	48882	50 %	50 %	0 %	0 %	407460208
88	NC_018624	AG	3	6	49405	49410	50 %	0 %	50 %	0 %	407460208
89	NC_018624	GC	3	6	49974	49979	0 %	0 %	50 %	50 %	407460209
90	NC_018624	TC	3	6	50379	50384	0 %	50 %	0 %	50 %	407460209
91	NC_018624	TA	3	6	50552	50557	50 %	50 %	0 %	0 %	407460209
92	NC_018624	TA	3	6	52214	52219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018624	GT	3	6	53104	53109	0 %	50 %	50 %	0 %	407460211
94	NC_018624	AT	3	6	53291	53296	50 %	50 %	0 %	0 %	407460211
95	NC_018624	AG	3	6	55434	55439	50 %	0 %	50 %	0 %	407460214
96	NC_018624	AG	4	8	56048	56055	50 %	0 %	50 %	0 %	407460214
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102	NC_018624	GA	3	6	59311	59316	50 %	0 %	50 %	0 %	407460217
103	NC_018624	AG	3	6	60289	60294	50 %	0 %	50 %	0 %	407460218
104	NC_018624	AG	3	6	60590	60595	50 %	0 %	50 %	0 %	407460218
105	NC_018624	GA	3	6	61834	61839	50 %	0 %	50 %	0 %	407460218
106	NC_018624	AG	3	6	62122	62127	50 %	0 %	50 %	0 %	407460218
107	NC_018624	TC	3	6	62574	62579	0 %	50 %	0 %	50 %	407460218
108	NC_018624	AG	3	6	63217	63222	50 %	0 %	50 %	0 %	407460218
109	NC_018624	TG	3	6	63290	63295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_018624	TG	3	6	65534	65539	0 %	50 %	50 %	0 %	407460220
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113	NC_018624	GA	4	8	66560	66567	50 %	0 %	50 %	0 %	407460221
114	NC_018624	AT	3	6	67339	67344	50 %	50 %	0 %	0 %	407460222
115	NC_018624	GA	4	8	67446	67453	50 %	0 %	50 %	0 %	407460222
116	NC_018624	AG	3	6	67559	67564	50 %	0 %	50 %	0 %	407460222
117	NC_018624	TG	3	6	67908	67913	0 %	50 %	50 %	0 %	407460222
118	NC_018624	GT	3	6	68152	68157	0 %	50 %	50 %	0 %	407460223
119	NC_018624	TA	3	6	68593	68598	50 %	50 %	0 %	0 %	407460223
120	NC_018624	TA	3	6	69296	69301	50 %	50 %	0 %	0 %	407460223
121	NC_018624	AG	3	6	70219	70224	50 %	0 %	50 %	0 %	407460225
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124	NC_018624	GT	3	6	73680	73685	0 %	50 %	50 %	0 %	407460229
125	NC_018624	GA	3	6	74622	74627	50 %	0 %	50 %	0 %	407460230
126	NC_018624	TC	3	6	75210	75215	0 %	50 %	0 %	50 %	407460231
127	NC_018624	TC	3	6	76015	76020	0 %	50 %	0 %	50 %	407460231
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129	NC_018624	TC	3	6	76314	76319	0 %	50 %	0 %	50 %	407460232
130	NC_018624	TC	3	6	76417	76422	0 %	50 %	0 %	50 %	407460232
131	NC_018624	CA	3	6	76552	76557	50 %	0 %	0 %	50 %	407460232
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133	NC_018624	CG	3	6	76850	76855	0 %	0 %	50 %	50 %	407460232
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138	NC_018624	AG	3	6	81199	81204	50 %	0 %	50 %	0 %	407460235
139	NC_018624	CT	3	6	81379	81384	0 %	50 %	0 %	50 %	407460235
140	NC_018624	AC	3	6	81726	81731	50 %	0 %	0 %	50 %	407460235
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142	NC_018624	GT	3	6	82042	82047	0 %	50 %	50 %	0 %	407460236
143	NC_018624	AC	3	6	82306	82311	50 %	0 %	0 %	50 %	407460236
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