MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 802

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018624	GAAAA	2	10	3355	3364	80 %	0 %	20 %	0 %	407460167
2	NC_018624	AGGAG	2	10	4412	4421	40 %	0 %	60 %	0 %	407460167
3	NC_018624	TGTTT	2	10	6760	6769	0 %	80 %	20 %	0 %	407460169
4	NC_018624	AACAT	2	10	7324	7333	60 %	20 %	0 %	20 %	407460170
5	NC_018624	AAGAA	2	10	9569	9578	80 %	0 %	20 %	0 %	407460172
6	NC_018624	ATAAA	2	10	13044	13053	80 %	20 %	0 %	0 %	407460173
7	NC_018624	AACTC	2	10	13488	13497	40 %	20 %	0 %	40 %	407460173
8	NC_018624	GTTTT	2	10	13558	13567	0 %	80 %	20 %	0 %	407460173
9	NC_018624	GAAAC	2	10	14326	14335	60 %	0 %	20 %	20 %	407460174
10	NC_018624	AACAA	2	10	15355	15364	80 %	0 %	0 %	20 %	407460174
11	NC_018624	AATAG	2	10	17067	17076	60 %	20 %	20 %	0 %	407460176
12	NC_018624	AGTGT	2	10	21117	21126	20 %	40 %	40 %	0 %	407460180
13	NC_018624	GCCAC	2	10	29445	29454	20 %	0 %	20 %	60 %	407460186
14	NC_018624	ATAAA	2	10	34285	34294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018624	AAGGA	2	10	38577	38586	60 %	0 %	40 %	0 %	407460196
16	NC_018624	CCATA	2	10	38784	38793	40 %	20 %	0 %	40 %	407460196
17	NC_018624	CTTTA	2	10	38950	38959	20 %	60 %	0 %	20 %	407460196
18	NC_018624	CTTTC	2	10	43213	43222	0 %	60 %	0 %	40 %	407460202
19	NC_018624	ACAAA	2	10	43875	43884	80 %	0 %	0 %	20 %	407460203
20	NC_018624	TATGG	2	10	44285	44294	20 %	40 %	40 %	0 %	407460204
21	NC_018624	TCTTT	2	10	46093	46102	0 %	80 %	0 %	20 %	407460206
22	NC_018624	AGCCC	2	10	47090	47099	20 %	0 %	20 %	60 %	407460207
23	NC_018624	TCAAA	2	10	47445	47454	60 %	20 %	0 %	20 %	407460207
24	NC_018624	TCTAT	2	10	49564	49573	20 %	60 %	0 %	20 %	407460209
25	NC_018624	TTTGG	2	10	51478	51487	0 %	60 %	40 %	0 %	407460209
26	NC_018624	TTTTG	2	10	52487	52496	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018624	TTTTC	2	10	55347	55356	0 %	80 %	0 %	20 %	407460213
28	NC_018624	GTAAG	2	10	57395	57404	40 %	20 %	40 %	0 %	407460216
29	NC_018624	TTAAT	2	10	57967	57976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018624	TCTTT	2	10	59394	59403	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018624	AAAAT	2	10	60200	60209	80 %	20 %	0 %	0 %	407460218
32	NC_018624	GTTAT	2	10	61233	61242	20 %	60 %	20 %	0 %	407460218
33	NC_018624	TAGTT	2	10	62802	62811	20 %	60 %	20 %	0 %	407460218
34	NC_018624	GAATG	2	10	62818	62827	40 %	20 %	40 %	0 %	407460218
35	NC_018624	TCCTA	2	10	64867	64876	20 %	40 %	0 %	40 %	407460220
36	NC_018624	AGAAA	2	10	70123	70132	80 %	0 %	20 %	0 %	407460224
37	NC_018624	GGATA	2	10	70931	70940	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018624	CACTT	2	10	71114	71123	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_018624	ATAGC	2	10	74370	74379	40 %	20 %	20 %	20 %	407460230
40	NC_018624	GCACA	2	10	77203	77212	40 %	0 %	20 %	40 %	407460232
41	NC_018624	AATTT	2	10	77727	77736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018624	AAAGA	2	10	78156	78165	80 %	0 %	20 %	0 %	407460233
43	NC_018624	AGTTC	2	10	79161	79170	20 %	40 %	20 %	20 %	407460233
44	NC_018624	CGTAT	2	10	81530	81539	20 %	40 %	20 %	20 %	407460235
45	NC_018624	GAAAA	2	10	82740	82749	80 %	0 %	20 %	0 %	407460236
46	NC_018624	AGGAA	2	10	84739	84748	60 %	0 %	40 %	0 %	407460239
47	NC_018624	CTTTT	2	10	85627	85636	0 %	80 %	0 %	20 %	407460241
48	NC_018624	CAAAG	2	10	87098	87107	60 %	0 %	20 %	20 %	407460243
49	NC_018624	AACAA	2	10	87265	87274	80 %	0 %	0 %	20 %	407460243
50	NC_018624	AGAAA	2	10	87335	87344	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018624	AAAGA	2	10	89171	89180	80 %	0 %	20 %	0 %	407460245
52	NC_018624	TTTTC	2	10	90186	90195	0 %	80 %	0 %	20 %	407460245
53	NC_018624	AGGAT	2	10	90709	90718	40 %	20 %	40 %	0 %	407460245
54	NC_018624	ATAAC	2	10	90795	90804	60 %	20 %	0 %	20 %	407460245
55	NC_018624	TGGCA	2	10	93280	93289	20 %	20 %	40 %	20 %	407460246
56	NC_018624	AATTA	2	10	93944	93953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018624	TGTTT	2	10	95005	95014	0 %	80 %	20 %	0 %	407460248
58	NC_018624	TCACC	2	10	96579	96588	20 %	20 %	0 %	60 %	407460249
59	NC_018624	AAAAT	2	10	96714	96723	80 %	20 %	0 %	0 %	407460249
60	NC_018624	TTAAT	2	10	97758	97767	40 %	60 %	0 %	0 %	407460250
61	NC_018624	ATTTG	2	10	98941	98950	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018624	AAAAT	2	10	99662	99671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018624	ATTAC	2	10	102889	102898	40 %	40 %	0 %	20 %	407460258
64	NC_018624	CTACA	2	10	103263	103272	40 %	20 %	0 %	40 %	407460258
65	NC_018624	AATTA	2	10	104810	104819	60 %	40 %	0 %	0 %	407460260
66	NC_018624	CTATA	2	10	105800	105809	40 %	40 %	0 %	20 %	407460261
67	NC_018624	CTTTT	2	10	108342	108351	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018624	AGCTT	2	10	108453	108462	20 %	40 %	20 %	20 %	407460265
69	NC_018624	GTTTG	2	10	108760	108769	0 %	60 %	40 %	0 %	407460265
70	NC_018624	AGTTA	2	10	115565	115574	40 %	40 %	20 %	0 %	407460280
71	NC_018624	AGTTT	2	10	116055	116064	20 %	60 %	20 %	0 %	407460281
72	NC_018624	TTTGC	2	10	116970	116979	0 %	60 %	20 %	20 %	407460283
73	NC_018624	TTTAC	2	10	119167	119176	20 %	60 %	0 %	20 %	407460286
74	NC_018624	AATTA	2	10	122060	122069	60 %	40 %	0 %	0 %	407460289
75	NC_018624	CTTTT	2	10	122856	122865	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018624	GAGAT	2	10	123412	123421	40 %	20 %	40 %	0 %	407460290
77	NC_018624	GTCAA	2	10	124731	124740	40 %	20 %	20 %	20 %	407460292
78	NC_018624	TAGGG	2	10	127203	127212	20 %	20 %	60 %	0 %	407460295
79	NC_018624	AACTT	2	10	128135	128144	40 %	40 %	0 %	20 %	407460295
80	NC_018624	TTCTT	2	10	131339	131348	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018624	TGTCA	2	10	132020	132029	20 %	40 %	20 %	20 %	407460298
82	NC_018624	AAAAG	2	10	135426	135435	80 %	0 %	20 %	0 %	407460300
83	NC_018624	TAAAA	2	10	135707	135716	80 %	20 %	0 %	0 %	407460300
84	NC_018624	GATTT	2	10	137966	137975	20 %	60 %	20 %	0 %	407460302
85	NC_018624	TTGTT	2	10	138308	138317	0 %	80 %	20 %	0 %	407460302
86	NC_018624	AAGAA	2	10	138789	138798	80 %	0 %	20 %	0 %	407460302
87	NC_018624	TTCTT	2	10	139382	139391	0 %	80 %	0 %	20 %	407460303
88	NC_018624	CTTTG	2	10	141286	141295	0 %	60 %	20 %	20 %	407460305
89	NC_018624	AGAAA	2	10	143323	143332	80 %	0 %	20 %	0 %	407460308
90	NC_018624	AAAGA	2	10	145988	145997	80 %	0 %	20 %	0 %	407460310
91	NC_018624	TTTTA	2	10	148167	148176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018624	TACTC	2	10	149619	149628	20 %	40 %	0 %	40 %	407460317
93	NC_018624	CGTTT	2	10	149666	149675	0 %	60 %	20 %	20 %	407460317
94	NC_018624	ATTTT	2	10	149806	149815	20 %	80 %	0 %	0 %	407460317
95	NC_018624	ACCAT	2	10	151837	151846	40 %	20 %	0 %	40 %	407460318
96	NC_018624	CAGAA	2	10	152802	152811	60 %	0 %	20 %	20 %	407460319
97	NC_018624	TTCAT	2	10	153372	153381	20 %	60 %	0 %	20 %	407460319
98	NC_018624	AAAGG	2	10	154202	154211	60 %	0 %	40 %	0 %	407460320
99	NC_018624	ATAGG	2	10	155894	155903	40 %	20 %	40 %	0 %	407460322
100	NC_018624	TTTGA	2	10	155980	155989	20 %	60 %	20 %	0 %	407460322
101	NC_018624	AAGGT	2	10	160921	160930	40 %	20 %	40 %	0 %	407460325
102	NC_018624	TTTTG	2	10	161860	161869	0 %	80 %	20 %	0 %	407460327
103	NC_018624	GGGGC	2	10	162007	162016	0 %	0 %	80 %	20 %	407460327
104	NC_018624	AGCAT	2	10	163299	163308	40 %	20 %	20 %	20 %	407460329
105	NC_018624	TAAAT	2	10	164486	164495	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018624	AAATG	2	10	166414	166423	60 %	20 %	20 %	0 %	407460330
107	NC_018624	GGGGA	2	10	168189	168198	20 %	0 %	80 %	0 %	407460331
108	NC_018624	TTTTC	2	10	169227	169236	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018624	CTGTT	2	10	169705	169714	0 %	60 %	20 %	20 %	407460333
110	NC_018624	AATGA	2	10	169740	169749	60 %	20 %	20 %	0 %	407460333
111	NC_018624	ATTTT	2	10	173199	173208	20 %	80 %	0 %	0 %	407460337
112	NC_018624	GAGAG	2	10	173216	173225	40 %	0 %	60 %	0 %	407460337
113	NC_018624	CAAAA	2	10	173546	173555	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018624	CGCAT	2	10	173916	173925	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_018624	CTAAG	2	10	181165	181174	40 %	20 %	20 %	20 %	407460344
116	NC_018624	TTTTC	2	10	181765	181774	0 %	80 %	0 %	20 %	407460344
117	NC_018624	GGTAC	2	10	183760	183769	20 %	20 %	40 %	20 %	407460346
118	NC_018624	AGGGA	2	10	186947	186956	40 %	0 %	60 %	0 %	407460351
119	NC_018624	AATGT	2	10	187356	187365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018624	AGGAA	2	10	187970	187979	60 %	0 %	40 %	0 %	407460352
121	NC_018624	TTCTT	2	10	188349	188358	0 %	80 %	0 %	20 %	407460352
122	NC_018624	GATAA	2	10	190992	191001	60 %	20 %	20 %	0 %	407460352
123	NC_018624	CCCTT	2	10	193196	193205	0 %	40 %	0 %	60 %	407460353
124	NC_018624	TTTTA	2	10	193897	193906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018624	AGTTA	2	10	194187	194196	40 %	40 %	20 %	0 %	407460354
126	NC_018624	TTATT	2	10	194207	194216	20 %	80 %	0 %	0 %	407460354
127	NC_018624	CCCTA	2	10	195260	195269	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_018624	AGGGT	2	10	197124	197133	20 %	20 %	60 %	0 %	407460356
129	NC_018624	TGGAT	2	10	197565	197574	20 %	40 %	40 %	0 %	407460356
130	NC_018624	CTAAA	2	10	197622	197631	60 %	20 %	0 %	20 %	407460356
131	NC_018624	CTTTA	2	10	197925	197934	20 %	60 %	0 %	20 %	407460356
132	NC_018624	AAAAT	2	10	198102	198111	80 %	20 %	0 %	0 %	407460356
133	NC_018624	GTTTT	2	10	198605	198614	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018624	ATTAA	2	10	201029	201038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018624	TTGGT	2	10	201405	201414	0 %	60 %	40 %	0 %	407460361
136	NC_018624	AGCAA	2	10	203882	203891	60 %	0 %	20 %	20 %	407460364
137	NC_018624	TAATG	2	10	204997	205006	40 %	40 %	20 %	0 %	407460365
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