MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 24932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_018624	AAG	2	6	190506	190511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460352
4003	NC_018624	CTT	2	6	190563	190568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460352
4004	NC_018624	TTAT	2	8	190647	190654	25 %	75 %	0 %	0 %	407460352
4005	NC_018624	TTC	3	9	190662	190670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460352
4006	NC_018624	ATG	2	6	190710	190715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460352
4007	NC_018624	GAT	2	6	190769	190774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460352
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4009	NC_018624	GGT	2	6	190854	190859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460352
4010	NC_018624	GCA	2	6	190915	190920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460352
4011	NC_018624	TTC	2	6	190985	190990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460352
4012	NC_018624	GATAA	2	10	190992	191001	60 %	20 %	20 %	0 %	407460352
4013	NC_018624	ATTT	2	8	191004	191011	25 %	75 %	0 %	0 %	407460352
4014	NC_018624	CTAT	2	8	191079	191086	25 %	50 %	0 %	25 %	407460352
4015	NC_018624	TGA	2	6	191089	191094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460352
4016	NC_018624	TCT	2	6	191124	191129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460352
4017	NC_018624	TAA	2	6	191183	191188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460352
4018	NC_018624	ACA	2	6	191195	191200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460352
4019	NC_018624	TTA	2	6	191226	191231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460352
4020	NC_018624	TCT	2	6	191306	191311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460352
4021	NC_018624	CTT	3	9	191342	191350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460352
4022	NC_018624	A	6	6	191353	191358	100 %	0 %	0 %	0 %	407460352
4023	NC_018624	ATA	2	6	191416	191421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460352
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4027	NC_018624	A	6	6	191506	191511	100 %	0 %	0 %	0 %	407460352
4028	NC_018624	GAA	2	6	191518	191523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460352
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4030	NC_018624	ATT	3	9	191564	191572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460352
4031	NC_018624	TGG	2	6	191576	191581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460352
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4035	NC_018624	GAAA	2	8	191691	191698	75 %	0 %	25 %	0 %	407460352
4036	NC_018624	ACA	2	6	191699	191704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460352
4037	NC_018624	TTG	2	6	191719	191724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_018624	AGAT	2	8	191762	191769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_018624	ACG	2	6	191785	191790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_018624	TTC	2	6	191817	191822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460353
4041	NC_018624	AT	3	6	191842	191847	50 %	50 %	0 %	0 %	407460353
4042	NC_018624	TCT	2	6	191872	191877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460353
4043	NC_018624	TGC	2	6	191907	191912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460353
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4052	NC_018624	GA	3	6	192551	192556	50 %	0 %	50 %	0 %	407460353
4053	NC_018624	T	6	6	192629	192634	0 %	100 %	0 %	0 %	407460353
4054	NC_018624	TTG	2	6	192739	192744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460353
4055	NC_018624	TGA	2	6	192768	192773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460353
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4059	NC_018624	A	6	6	192855	192860	100 %	0 %	0 %	0 %	407460353
4060	NC_018624	AGC	2	6	192882	192887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460353
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4062	NC_018624	TAA	2	6	192960	192965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460353
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4064	NC_018624	AGGG	2	8	192989	192996	25 %	0 %	75 %	0 %	407460353
4065	NC_018624	GGA	2	6	193081	193086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460353
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4069	NC_018624	CCCTT	2	10	193196	193205	0 %	40 %	0 %	60 %	407460353
4070	NC_018624	TGA	2	6	193224	193229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460353
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4081	NC_018624	CT	3	6	193687	193692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_018624	GTTT	2	8	193695	193702	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4085	NC_018624	TTTTA	2	10	193897	193906	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4087	NC_018624	T	8	8	193980	193987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4097	NC_018624	TGA	3	9	194523	194531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460354
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4103	NC_018624	TGT	2	6	194790	194795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460354
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4111	NC_018624	CAT	2	6	195073	195078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460354
4112	NC_018624	ACA	2	6	195105	195110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460354
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4114	NC_018624	ACA	2	6	195164	195169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460354
4115	NC_018624	TGT	2	6	195254	195259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_018624	CCCTA	2	10	195260	195269	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4117	NC_018624	AGT	2	6	195308	195313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_018624	ATT	2	6	195385	195390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_018624	TATT	2	8	195421	195428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_018624	CAG	2	6	195432	195437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_018624	TAAA	3	12	195452	195463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_018624	TCT	2	6	195501	195506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_018624	TAA	2	6	195602	195607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_018624	TTA	2	6	195627	195632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_018624	A	6	6	195667	195672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4253	NC_018624	CTT	2	6	200509	200514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460360
4254	NC_018624	ACA	2	6	200526	200531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460360
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4256	NC_018624	AGA	2	6	200642	200647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460360
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4265	NC_018624	CCT	2	6	201008	201013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4266	NC_018624	ATTAA	2	10	201029	201038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_018624	TAAT	2	8	201045	201052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_018624	ATC	2	6	201242	201247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4272	NC_018624	TTGGT	2	10	201405	201414	0 %	60 %	40 %	0 %	407460361
4273	NC_018624	GT	3	6	201434	201439	0 %	50 %	50 %	0 %	407460361
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4283	NC_018624	TCT	2	6	201859	201864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460362
4284	NC_018624	GTA	2	6	201882	201887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460362
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4286	NC_018624	A	6	6	202098	202103	100 %	0 %	0 %	0 %	407460362
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4292	NC_018624	T	6	6	202278	202283	0 %	100 %	0 %	0 %	407460362
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4332	NC_018624	TTG	2	6	204079	204084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4361	NC_018624	TAG	2	6	205218	205223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4369	NC_018624	GAC	2	6	205669	205674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460368
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4372	NC_018624	CTAT	2	8	205708	205715	25 %	50 %	0 %	25 %	407460368
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4375	NC_018624	A	7	7	205764	205770	100 %	0 %	0 %	0 %	407460368
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