MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 24932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_018624	AACGGA	2	12	1153497	1153508	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407461190
24503	NC_018624	CTAT	2	8	1153516	1153523	25 %	50 %	0 %	25 %	407461190
24504	NC_018624	CGTT	2	8	1153552	1153559	0 %	50 %	25 %	25 %	407461190
24505	NC_018624	TTC	2	6	1153612	1153617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461190
24506	NC_018624	ATAA	2	8	1153779	1153786	75 %	25 %	0 %	0 %	407461190
24507	NC_018624	A	6	6	1153788	1153793	100 %	0 %	0 %	0 %	407461190
24508	NC_018624	TAT	2	6	1153812	1153817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461190
24509	NC_018624	GAA	2	6	1153842	1153847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461190
24510	NC_018624	AGAT	2	8	1153912	1153919	50 %	25 %	25 %	0 %	407461190
24511	NC_018624	CAG	2	6	1153933	1153938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461190
24512	NC_018624	A	7	7	1153968	1153974	100 %	0 %	0 %	0 %	407461190
24513	NC_018624	ACAA	2	8	1154040	1154047	75 %	0 %	0 %	25 %	407461191
24514	NC_018624	T	7	7	1154054	1154060	0 %	100 %	0 %	0 %	407461191
24515	NC_018624	CTA	2	6	1154132	1154137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461191
24516	NC_018624	TTC	2	6	1154275	1154280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461191
24517	NC_018624	CT	3	6	1154289	1154294	0 %	50 %	0 %	50 %	407461191
24518	NC_018624	CAC	2	6	1154346	1154351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407461191
24519	NC_018624	CA	3	6	1154359	1154364	50 %	0 %	0 %	50 %	407461191
24520	NC_018624	GATAAC	2	12	1154390	1154401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407461191
24521	NC_018624	TGG	3	9	1154416	1154424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461191
24522	NC_018624	A	6	6	1154490	1154495	100 %	0 %	0 %	0 %	407461191
24523	NC_018624	T	6	6	1154595	1154600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24524	NC_018624	AC	3	6	1154658	1154663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24525	NC_018624	ATG	2	6	1154673	1154678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24526	NC_018624	TAA	2	6	1154719	1154724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24527	NC_018624	CAA	2	6	1154728	1154733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24528	NC_018624	TACAGA	2	12	1154737	1154748	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24529	NC_018624	AAAAG	2	10	1154815	1154824	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24530	NC_018624	ATC	2	6	1154839	1154844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24531	NC_018624	CAC	2	6	1154851	1154856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24532	NC_018624	GAA	2	6	1154883	1154888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24533	NC_018624	TTC	2	6	1154898	1154903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24534	NC_018624	TC	3	6	1154902	1154907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24535	NC_018624	A	6	6	1154946	1154951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24536	NC_018624	AATG	2	8	1154966	1154973	50 %	25 %	25 %	0 %	407461192
24537	NC_018624	A	6	6	1154985	1154990	100 %	0 %	0 %	0 %	407461192
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24542	NC_018624	A	6	6	1155220	1155225	100 %	0 %	0 %	0 %	407461192
24543	NC_018624	TGC	2	6	1155236	1155241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461192
24544	NC_018624	GCT	2	6	1155408	1155413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461192
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24546	NC_018624	ACA	3	9	1155591	1155599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461192
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24551	NC_018624	AATAT	2	10	1155811	1155820	60 %	40 %	0 %	0 %	407461192
24552	NC_018624	A	6	6	1155828	1155833	100 %	0 %	0 %	0 %	407461192
24553	NC_018624	GAA	2	6	1155891	1155896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461192
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24556	NC_018624	A	6	6	1155981	1155986	100 %	0 %	0 %	0 %	407461192
24557	NC_018624	GAA	2	6	1155987	1155992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461192
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24560	NC_018624	TAAT	2	8	1156067	1156074	50 %	50 %	0 %	0 %	407461193
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24600	NC_018624	TGC	3	9	1158032	1158040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461196
24601	NC_018624	CAT	2	6	1158067	1158072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461196
24602	NC_018624	GTAA	2	8	1158079	1158086	50 %	25 %	25 %	0 %	407461196
24603	NC_018624	TGT	2	6	1158099	1158104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461196
24604	NC_018624	CAT	2	6	1158148	1158153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461196
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24608	NC_018624	TGC	2	6	1158339	1158344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461196
24609	NC_018624	GGA	2	6	1158408	1158413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407461196
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24613	NC_018624	CAT	2	6	1158493	1158498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461196
24614	NC_018624	CT	3	6	1158529	1158534	0 %	50 %	0 %	50 %	407461196
24615	NC_018624	TAA	2	6	1158535	1158540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461196
24616	NC_018624	TCAA	2	8	1158651	1158658	50 %	25 %	0 %	25 %	407461196
24617	NC_018624	TTGC	2	8	1158679	1158686	0 %	50 %	25 %	25 %	407461196
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.