MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 24932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_018624	A	8	8	1131762	1131769	100 %	0 %	0 %	0 %	407461169
24003	NC_018624	CTT	2	6	1131799	1131804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461169
24004	NC_018624	CTT	2	6	1131902	1131907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461169
24005	NC_018624	CAG	2	6	1131920	1131925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461169
24006	NC_018624	TAT	2	6	1131945	1131950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461169
24007	NC_018624	CAA	2	6	1132044	1132049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461169
24008	NC_018624	GGA	2	6	1132133	1132138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407461169
24009	NC_018624	ATG	2	6	1132145	1132150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461169
24010	NC_018624	TTGT	2	8	1132190	1132197	0 %	75 %	25 %	0 %	407461169
24011	NC_018624	TTC	2	6	1132240	1132245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461169
24012	NC_018624	TAT	2	6	1132332	1132337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461170
24013	NC_018624	GAA	2	6	1132351	1132356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461170
24014	NC_018624	ATTG	2	8	1132380	1132387	25 %	50 %	25 %	0 %	407461170
24015	NC_018624	AGA	2	6	1132494	1132499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461170
24016	NC_018624	CAA	3	9	1132508	1132516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461170
24017	NC_018624	CTTT	2	8	1132561	1132568	0 %	75 %	0 %	25 %	407461170
24018	NC_018624	TGC	2	6	1132628	1132633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461170
24019	NC_018624	AAG	2	6	1132667	1132672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461170
24020	NC_018624	CAG	2	6	1132691	1132696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461170
24021	NC_018624	A	6	6	1132737	1132742	100 %	0 %	0 %	0 %	407461171
24022	NC_018624	CAT	2	6	1132766	1132771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461171
24023	NC_018624	CAAA	2	8	1132813	1132820	75 %	0 %	0 %	25 %	407461171
24024	NC_018624	A	6	6	1132849	1132854	100 %	0 %	0 %	0 %	407461171
24025	NC_018624	TTG	2	6	1132855	1132860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461171
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24028	NC_018624	GAAAA	2	10	1132983	1132992	80 %	0 %	20 %	0 %	407461171
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24030	NC_018624	CAAA	2	8	1133080	1133087	75 %	0 %	0 %	25 %	407461171
24031	NC_018624	AAG	2	6	1133098	1133103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461171
24032	NC_018624	TGA	2	6	1133153	1133158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461171
24033	NC_018624	GCTCG	2	10	1133166	1133175	0 %	20 %	40 %	40 %	407461171
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24035	NC_018624	ACAA	2	8	1133213	1133220	75 %	0 %	0 %	25 %	407461171
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24038	NC_018624	TAT	2	6	1133347	1133352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461171
24039	NC_018624	A	6	6	1133412	1133417	100 %	0 %	0 %	0 %	407461171
24040	NC_018624	CTG	2	6	1133466	1133471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461171
24041	NC_018624	TAG	2	6	1133489	1133494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24042	NC_018624	GTT	2	6	1133497	1133502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24043	NC_018624	ACG	2	6	1133511	1133516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461172
24044	NC_018624	GAT	2	6	1133547	1133552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461172
24045	NC_018624	CATA	2	8	1133610	1133617	50 %	25 %	0 %	25 %	407461172
24046	NC_018624	CAA	2	6	1133650	1133655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461172
24047	NC_018624	TAC	2	6	1133676	1133681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461172
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24052	NC_018624	ATG	2	6	1134014	1134019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461172
24053	NC_018624	ATTT	2	8	1134266	1134273	25 %	75 %	0 %	0 %	407461172
24054	NC_018624	CTT	2	6	1134356	1134361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461172
24055	NC_018624	AGTT	2	8	1134380	1134387	25 %	50 %	25 %	0 %	407461172
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24059	NC_018624	AAC	3	9	1134597	1134605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461172
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24061	NC_018624	TTTA	2	8	1134689	1134696	25 %	75 %	0 %	0 %	407461172
24062	NC_018624	A	6	6	1134713	1134718	100 %	0 %	0 %	0 %	407461172
24063	NC_018624	CTT	2	6	1134758	1134763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461172
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24070	NC_018624	CAGT	2	8	1135027	1135034	25 %	25 %	25 %	25 %	407461173
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24098	NC_018624	GTA	2	6	1136148	1136153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461175
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24100	NC_018624	CAA	2	6	1136190	1136195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461175
24101	NC_018624	T	6	6	1136294	1136299	0 %	100 %	0 %	0 %	407461175
24102	NC_018624	ACTTC	2	10	1136302	1136311	20 %	40 %	0 %	40 %	407461175
24103	NC_018624	ACT	2	6	1136324	1136329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461175
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24105	NC_018624	CAT	2	6	1136377	1136382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461175
24106	NC_018624	TC	3	6	1136396	1136401	0 %	50 %	0 %	50 %	407461175
24107	NC_018624	TAA	2	6	1136464	1136469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407461175
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24113	NC_018624	CCTT	2	8	1136666	1136673	0 %	50 %	0 %	50 %	407461176
24114	NC_018624	ATCA	2	8	1136674	1136681	50 %	25 %	0 %	25 %	407461176
24115	NC_018624	AGT	2	6	1136749	1136754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461176
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24118	NC_018624	GT	4	8	1136824	1136831	0 %	50 %	50 %	0 %	407461176
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24240	NC_018624	TATT	2	8	1142424	1142431	25 %	75 %	0 %	0 %	407461182
24241	NC_018624	TAT	2	6	1142473	1142478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407461182
24242	NC_018624	ATTTA	2	10	1142527	1142536	40 %	60 %	0 %	0 %	407461182
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24244	NC_018624	A	6	6	1142581	1142586	100 %	0 %	0 %	0 %	407461182
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24320	NC_018624	AGAA	2	8	1145647	1145654	75 %	0 %	25 %	0 %	407461184
24321	NC_018624	CT	3	6	1145675	1145680	0 %	50 %	0 %	50 %	407461184
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24337	NC_018624	TTA	2	6	1146326	1146331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24338	NC_018624	TAC	2	6	1146362	1146367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24339	NC_018624	ATT	2	6	1146368	1146373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24340	NC_018624	GAA	2	6	1146445	1146450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24341	NC_018624	T	6	6	1146543	1146548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24342	NC_018624	A	6	6	1146559	1146564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24343	NC_018624	CTT	2	6	1146586	1146591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24344	NC_018624	AGT	2	6	1146679	1146684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24345	NC_018624	TTGC	2	8	1146707	1146714	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24346	NC_018624	T	8	8	1146722	1146729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24347	NC_018624	A	6	6	1146750	1146755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24348	NC_018624	A	6	6	1146810	1146815	100 %	0 %	0 %	0 %	407461185
24349	NC_018624	TGT	2	6	1146905	1146910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461185
24350	NC_018624	TATCGA	2	12	1146935	1146946	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407461185
24351	NC_018624	TTC	2	6	1146973	1146978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461185
24352	NC_018624	AAG	2	6	1146988	1146993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461185
24353	NC_018624	TC	4	8	1147040	1147047	0 %	50 %	0 %	50 %	407461185
24354	NC_018624	GAGAAG	2	12	1147060	1147071	50 %	0 %	50 %	0 %	407461185
24355	NC_018624	CAA	2	6	1147209	1147214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461185
24356	NC_018624	TCG	2	6	1147217	1147222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461185
24357	NC_018624	ATCGT	2	10	1147231	1147240	20 %	40 %	20 %	20 %	407461185
24358	NC_018624	ACA	2	6	1147277	1147282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461185
24359	NC_018624	TACC	2	8	1147366	1147373	25 %	25 %	0 %	50 %	407461185
24360	NC_018624	TCC	2	6	1147396	1147401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407461185
24361	NC_018624	CTG	2	6	1147444	1147449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461185
24362	NC_018624	ATTA	2	8	1147505	1147512	50 %	50 %	0 %	0 %	407461185
24363	NC_018624	AGA	2	6	1147550	1147555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461185
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24365	NC_018624	ACG	2	6	1147595	1147600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461185
24366	NC_018624	CCA	2	6	1147611	1147616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407461185
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24370	NC_018624	TCT	3	9	1147665	1147673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461185
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24372	NC_018624	TA	3	6	1147806	1147811	50 %	50 %	0 %	0 %	407461185
24373	NC_018624	A	6	6	1147865	1147870	100 %	0 %	0 %	0 %	407461185
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24389	NC_018624	GAA	3	9	1148688	1148696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461185
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24435	NC_018624	T	6	6	1150743	1150748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24462	NC_018624	CAT	2	6	1152088	1152093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461188
24463	NC_018624	A	6	6	1152160	1152165	100 %	0 %	0 %	0 %	407461188
24464	NC_018624	TTAG	2	8	1152199	1152206	25 %	50 %	25 %	0 %	407461189
24465	NC_018624	ACA	2	6	1152247	1152252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461189
24466	NC_018624	TGA	2	6	1152296	1152301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461189
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24470	NC_018624	TAGG	2	8	1152407	1152414	25 %	25 %	50 %	0 %	407461189
24471	NC_018624	CCTC	2	8	1152431	1152438	0 %	25 %	0 %	75 %	407461189
24472	NC_018624	GTG	2	6	1152474	1152479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407461189
24473	NC_018624	TC	3	6	1152495	1152500	0 %	50 %	0 %	50 %	407461189
24474	NC_018624	GAT	2	6	1152541	1152546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407461189
24475	NC_018624	GAA	2	6	1152598	1152603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461189
24476	NC_018624	TCTA	2	8	1152608	1152615	25 %	50 %	0 %	25 %	407461189
24477	NC_018624	CTT	2	6	1152648	1152653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461189
24478	NC_018624	TAC	2	6	1152678	1152683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461189
24479	NC_018624	TGTT	2	8	1152753	1152760	0 %	75 %	25 %	0 %	407461190
24480	NC_018624	TCT	2	6	1152761	1152766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407461190
24481	NC_018624	TGT	2	6	1152768	1152773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407461190
24482	NC_018624	ACTCAC	2	12	1152815	1152826	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407461190
24483	NC_018624	CAT	2	6	1152836	1152841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461190
24484	NC_018624	A	6	6	1152888	1152893	100 %	0 %	0 %	0 %	407461190
24485	NC_018624	TC	4	8	1152911	1152918	0 %	50 %	0 %	50 %	407461190
24486	NC_018624	GTAT	2	8	1152943	1152950	25 %	50 %	25 %	0 %	407461190
24487	NC_018624	GAG	2	6	1152961	1152966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407461190
24488	NC_018624	ACA	2	6	1152984	1152989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407461190
24489	NC_018624	ACC	2	6	1152991	1152996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407461190
24490	NC_018624	AAAATC	2	12	1153077	1153088	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	407461190
24491	NC_018624	AGG	2	6	1153103	1153108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407461190
24492	NC_018624	CAG	2	6	1153129	1153134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407461190
24493	NC_018624	GCT	2	6	1153194	1153199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407461190
24494	NC_018624	ATTA	2	8	1153200	1153207	50 %	50 %	0 %	0 %	407461190
24495	NC_018624	TAC	2	6	1153239	1153244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461190
24496	NC_018624	CTA	2	6	1153332	1153337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407461190
24497	NC_018624	A	6	6	1153337	1153342	100 %	0 %	0 %	0 %	407461190
24498	NC_018624	GAA	2	6	1153389	1153394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461190
24499	NC_018624	CT	3	6	1153410	1153415	0 %	50 %	0 %	50 %	407461190
24500	NC_018624	GAA	3	9	1153416	1153424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407461190

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