MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 24932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018624	AGT	2	6	70626	70631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460226
1502	NC_018624	ATA	2	6	70688	70693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460226
1503	NC_018624	AGG	2	6	70811	70816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460226
1504	NC_018624	GAA	3	9	70858	70866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460226
1505	NC_018624	T	7	7	70890	70896	0 %	100 %	0 %	0 %	407460226
1506	NC_018624	GGATA	2	10	70931	70940	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_018624	TTC	2	6	71001	71006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_018624	T	7	7	71056	71062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_018624	A	7	7	71106	71112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_018624	CACTT	2	10	71114	71123	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1511	NC_018624	ATA	2	6	71222	71227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_018624	AAT	2	6	71275	71280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460227
1513	NC_018624	ACA	2	6	71295	71300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460227
1514	NC_018624	TCG	2	6	71323	71328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460227
1515	NC_018624	TGT	2	6	71398	71403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460227
1516	NC_018624	TAT	2	6	71435	71440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460227
1517	NC_018624	TGT	2	6	71503	71508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460227
1518	NC_018624	TCA	2	6	71616	71621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460227
1519	NC_018624	A	6	6	71666	71671	100 %	0 %	0 %	0 %	407460227
1520	NC_018624	T	6	6	71700	71705	0 %	100 %	0 %	0 %	407460227
1521	NC_018624	A	6	6	71724	71729	100 %	0 %	0 %	0 %	407460227
1522	NC_018624	GA	3	6	71742	71747	50 %	0 %	50 %	0 %	407460227
1523	NC_018624	ATC	2	6	71819	71824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460227
1524	NC_018624	AAG	2	6	71856	71861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460227
1525	NC_018624	TGT	2	6	71871	71876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460227
1526	NC_018624	AAC	2	6	71890	71895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460227
1527	NC_018624	GT	3	6	72018	72023	0 %	50 %	50 %	0 %	407460227
1528	NC_018624	GAA	2	6	72041	72046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460227
1529	NC_018624	AGA	2	6	72061	72066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460227
1530	NC_018624	GAA	2	6	72076	72081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460227
1531	NC_018624	T	6	6	72107	72112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_018624	ATGT	2	8	72139	72146	25 %	50 %	25 %	0 %	407460228
1533	NC_018624	TGTT	2	8	72158	72165	0 %	75 %	25 %	0 %	407460228
1534	NC_018624	T	6	6	72190	72195	0 %	100 %	0 %	0 %	407460228
1535	NC_018624	AGA	2	6	72217	72222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460228
1536	NC_018624	T	7	7	72255	72261	0 %	100 %	0 %	0 %	407460228
1537	NC_018624	TGC	2	6	72286	72291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460228
1538	NC_018624	CAG	2	6	72323	72328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460228
1539	NC_018624	CAA	2	6	72385	72390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460228
1540	NC_018624	ATG	2	6	72405	72410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460228
1541	NC_018624	ACA	2	6	72435	72440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460228
1542	NC_018624	TCA	2	6	72549	72554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460228
1543	NC_018624	ATA	3	9	72635	72643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460228
1544	NC_018624	CAG	2	6	72652	72657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460228
1545	NC_018624	GAT	2	6	72721	72726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460228
1546	NC_018624	T	7	7	72821	72827	0 %	100 %	0 %	0 %	407460228
1547	NC_018624	ATAA	2	8	72871	72878	75 %	25 %	0 %	0 %	407460228
1548	NC_018624	AGC	2	6	72894	72899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460228
1549	NC_018624	TAGGGC	2	12	72905	72916	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407460228
1550	NC_018624	CCTGAT	2	12	72930	72941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407460228
1551	NC_018624	T	8	8	73015	73022	0 %	100 %	0 %	0 %	407460228
1552	NC_018624	T	7	7	73052	73058	0 %	100 %	0 %	0 %	407460228
1553	NC_018624	TCAT	2	8	73083	73090	25 %	50 %	0 %	25 %	407460228
1554	NC_018624	GTA	2	6	73182	73187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460229
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1556	NC_018624	CTGC	2	8	73345	73352	0 %	25 %	25 %	50 %	407460229
1557	NC_018624	ACG	2	6	73387	73392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460229
1558	NC_018624	TGT	2	6	73491	73496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460229
1559	NC_018624	GTAA	2	8	73528	73535	50 %	25 %	25 %	0 %	407460229
1560	NC_018624	AAT	2	6	73641	73646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460229
1561	NC_018624	T	6	6	73651	73656	0 %	100 %	0 %	0 %	407460229
1562	NC_018624	TAG	2	6	73664	73669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460229
1563	NC_018624	GT	3	6	73680	73685	0 %	50 %	50 %	0 %	407460229
1564	NC_018624	TTG	2	6	73704	73709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460229
1565	NC_018624	TAA	2	6	73866	73871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460229
1566	NC_018624	CAA	2	6	73967	73972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460229
1567	NC_018624	TTA	3	9	74074	74082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_018624	ACAA	2	8	74233	74240	75 %	0 %	0 %	25 %	407460230
1569	NC_018624	A	6	6	74284	74289	100 %	0 %	0 %	0 %	407460230
1570	NC_018624	TTAT	2	8	74318	74325	25 %	75 %	0 %	0 %	407460230
1571	NC_018624	ATT	2	6	74354	74359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460230
1572	NC_018624	ATAGC	2	10	74370	74379	40 %	20 %	20 %	20 %	407460230
1573	NC_018624	T	6	6	74453	74458	0 %	100 %	0 %	0 %	407460230
1574	NC_018624	GGA	2	6	74543	74548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460230
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1576	NC_018624	TTTA	2	8	74676	74683	25 %	75 %	0 %	0 %	407460230
1577	NC_018624	GAA	2	6	74762	74767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460230
1578	NC_018624	TGTTTC	2	12	74986	74997	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407460231
1579	NC_018624	CCT	2	6	75078	75083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460231
1580	NC_018624	TAGT	2	8	75195	75202	25 %	50 %	25 %	0 %	407460231
1581	NC_018624	TC	3	6	75210	75215	0 %	50 %	0 %	50 %	407460231
1582	NC_018624	G	6	6	75223	75228	0 %	0 %	100 %	0 %	407460231
1583	NC_018624	TCT	2	6	75246	75251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460231
1584	NC_018624	TGC	2	6	75322	75327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460231
1585	NC_018624	TCG	2	6	75336	75341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460231
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1588	NC_018624	AGAA	2	8	75565	75572	75 %	0 %	25 %	0 %	407460231
1589	NC_018624	CTTA	2	8	75579	75586	25 %	50 %	0 %	25 %	407460231
1590	NC_018624	ATT	2	6	75590	75595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460231
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1592	NC_018624	TGG	2	6	75727	75732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460231
1593	NC_018624	CTG	2	6	75843	75848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460231
1594	NC_018624	CAA	2	6	75888	75893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460231
1595	NC_018624	ATT	2	6	75962	75967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460231
1596	NC_018624	CAG	2	6	76002	76007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460231
1597	NC_018624	TC	3	6	76015	76020	0 %	50 %	0 %	50 %	407460231
1598	NC_018624	ATC	2	6	76071	76076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1600	NC_018624	A	7	7	76135	76141	100 %	0 %	0 %	0 %	407460232
1601	NC_018624	TGA	2	6	76193	76198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460232
1602	NC_018624	AATT	2	8	76226	76233	50 %	50 %	0 %	0 %	407460232
1603	NC_018624	GC	3	6	76247	76252	0 %	0 %	50 %	50 %	407460232
1604	NC_018624	GAA	2	6	76302	76307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460232
1605	NC_018624	TC	3	6	76314	76319	0 %	50 %	0 %	50 %	407460232
1606	NC_018624	TGT	2	6	76325	76330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460232
1607	NC_018624	CAT	2	6	76356	76361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460232
1608	NC_018624	TC	3	6	76417	76422	0 %	50 %	0 %	50 %	407460232
1609	NC_018624	GTT	2	6	76433	76438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460232
1610	NC_018624	TCCA	2	8	76456	76463	25 %	25 %	0 %	50 %	407460232
1611	NC_018624	GAA	2	6	76467	76472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460232
1612	NC_018624	TGC	2	6	76496	76501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460232
1613	NC_018624	TCC	2	6	76509	76514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460232
1614	NC_018624	ATG	2	6	76534	76539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460232
1615	NC_018624	CA	3	6	76552	76557	50 %	0 %	0 %	50 %	407460232
1616	NC_018624	CGG	2	6	76606	76611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407460232
1617	NC_018624	TCT	2	6	76616	76621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460232
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1619	NC_018624	CT	3	6	76740	76745	0 %	50 %	0 %	50 %	407460232
1620	NC_018624	AGG	2	6	76769	76774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460232
1621	NC_018624	GAA	2	6	76830	76835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460232
1622	NC_018624	CG	3	6	76850	76855	0 %	0 %	50 %	50 %	407460232
1623	NC_018624	AGC	2	6	76876	76881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460232
1624	NC_018624	TTC	2	6	76897	76902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460232
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1626	NC_018624	TCC	2	6	77090	77095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460232
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