MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 24932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018624	AAC	2	6	23107	23112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460181
502	NC_018624	GGT	2	6	23159	23164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460181
503	NC_018624	AGC	2	6	23175	23180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460181
504	NC_018624	ATG	2	6	23265	23270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460181
505	NC_018624	AGC	2	6	23282	23287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460181
506	NC_018624	GCT	2	6	23288	23293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460181
507	NC_018624	CTG	2	6	23379	23384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460181
508	NC_018624	ATG	2	6	23580	23585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460181
509	NC_018624	TTA	2	6	23598	23603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460181
510	NC_018624	AAG	2	6	23655	23660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460181
511	NC_018624	GA	3	6	23669	23674	50 %	0 %	50 %	0 %	407460181
512	NC_018624	T	7	7	23802	23808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018624	A	6	6	23886	23891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018624	AGA	2	6	23901	23906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_018624	TTG	2	6	24011	24016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460182
516	NC_018624	TGT	2	6	24048	24053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460182
517	NC_018624	AGT	2	6	24065	24070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460182
518	NC_018624	TTG	2	6	24077	24082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460182
519	NC_018624	TCC	2	6	24116	24121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460182
520	NC_018624	AGCT	2	8	24166	24173	25 %	25 %	25 %	25 %	407460182
521	NC_018624	TTG	2	6	24353	24358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460182
522	NC_018624	GAA	2	6	24363	24368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460182
523	NC_018624	T	6	6	24380	24385	0 %	100 %	0 %	0 %	407460182
524	NC_018624	AAAT	2	8	24503	24510	75 %	25 %	0 %	0 %	407460182
525	NC_018624	CTT	2	6	24517	24522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460182
526	NC_018624	AGG	2	6	24538	24543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460182
527	NC_018624	GTA	2	6	24551	24556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460182
528	NC_018624	GCA	2	6	24612	24617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460182
529	NC_018624	TTA	2	6	24621	24626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460182
530	NC_018624	AATT	2	8	24628	24635	50 %	50 %	0 %	0 %	407460182
531	NC_018624	ATAA	2	8	24695	24702	75 %	25 %	0 %	0 %	407460182
532	NC_018624	T	7	7	24797	24803	0 %	100 %	0 %	0 %	407460183
533	NC_018624	TGT	2	6	24818	24823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460183
534	NC_018624	GCT	2	6	24848	24853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460183
535	NC_018624	TTCT	2	8	24925	24932	0 %	75 %	0 %	25 %	407460183
536	NC_018624	ATC	2	6	24940	24945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460183
537	NC_018624	ACC	2	6	24964	24969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407460183
538	NC_018624	TAGT	2	8	24983	24990	25 %	50 %	25 %	0 %	407460183
539	NC_018624	TTG	2	6	25008	25013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460183
540	NC_018624	TTG	2	6	25018	25023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460183
541	NC_018624	ATT	2	6	25111	25116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460183
542	NC_018624	TTC	2	6	25237	25242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460183
543	NC_018624	TTG	2	6	25387	25392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460183
544	NC_018624	GAAC	2	8	25442	25449	50 %	0 %	25 %	25 %	407460183
545	NC_018624	CAG	2	6	25467	25472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460183
546	NC_018624	TA	3	6	25502	25507	50 %	50 %	0 %	0 %	407460183
547	NC_018624	GCA	2	6	25508	25513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460183
548	NC_018624	GTT	2	6	25541	25546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460183
549	NC_018624	AG	3	6	25609	25614	50 %	0 %	50 %	0 %	407460183
550	NC_018624	TAA	2	6	25641	25646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460183
551	NC_018624	CTT	3	9	25647	25655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460183
552	NC_018624	TTA	2	6	25676	25681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460183
553	NC_018624	TTA	2	6	25751	25756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460183
554	NC_018624	TAT	2	6	25788	25793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460183
555	NC_018624	TCA	2	6	25794	25799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460183
556	NC_018624	CCA	2	6	25814	25819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407460183
557	NC_018624	TGG	2	6	25821	25826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460183
558	NC_018624	A	6	6	25864	25869	100 %	0 %	0 %	0 %	407460183
559	NC_018624	ATTC	2	8	25881	25888	25 %	50 %	0 %	25 %	407460183
560	NC_018624	TTC	2	6	25894	25899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460183
561	NC_018624	TCT	2	6	25916	25921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460183
562	NC_018624	T	6	6	25993	25998	0 %	100 %	0 %	0 %	407460183
563	NC_018624	TTTC	2	8	26013	26020	0 %	75 %	0 %	25 %	407460183
564	NC_018624	ATT	2	6	26038	26043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460183
565	NC_018624	ATAG	2	8	26108	26115	50 %	25 %	25 %	0 %	407460183
566	NC_018624	AAT	2	6	26116	26121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460183
567	NC_018624	TGT	2	6	26209	26214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460183
568	NC_018624	AGG	2	6	26293	26298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460183
569	NC_018624	AAC	2	6	26327	26332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460183
570	NC_018624	TAAA	2	8	26472	26479	75 %	25 %	0 %	0 %	407460183
571	NC_018624	TA	3	6	26512	26517	50 %	50 %	0 %	0 %	407460183
572	NC_018624	AGA	2	6	26521	26526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460183
573	NC_018624	ATT	2	6	26534	26539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460184
574	NC_018624	T	7	7	26577	26583	0 %	100 %	0 %	0 %	407460184
575	NC_018624	TTC	2	6	26613	26618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460184
576	NC_018624	ATTT	2	8	26654	26661	25 %	75 %	0 %	0 %	407460184
577	NC_018624	ATTA	2	8	26665	26672	50 %	50 %	0 %	0 %	407460184
578	NC_018624	TTA	2	6	26696	26701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460184
579	NC_018624	A	6	6	26771	26776	100 %	0 %	0 %	0 %	407460185
580	NC_018624	CCA	2	6	26815	26820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407460185
581	NC_018624	TTA	2	6	26822	26827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460185
582	NC_018624	CAA	2	6	26900	26905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460185
583	NC_018624	TGA	2	6	26908	26913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460185
584	NC_018624	AGA	2	6	26956	26961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460185
585	NC_018624	TAA	2	6	26971	26976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460185
586	NC_018624	CTG	2	6	27054	27059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460185
587	NC_018624	GTA	2	6	27063	27068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460185
588	NC_018624	ACA	2	6	27112	27117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460185
589	NC_018624	TTA	2	6	27131	27136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460185
590	NC_018624	A	6	6	27146	27151	100 %	0 %	0 %	0 %	407460185
591	NC_018624	CTGG	2	8	27185	27192	0 %	25 %	50 %	25 %	407460185
592	NC_018624	AAG	2	6	27273	27278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460185
593	NC_018624	AGC	2	6	27289	27294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460185
594	NC_018624	TA	3	6	27372	27377	50 %	50 %	0 %	0 %	407460185
595	NC_018624	TCT	2	6	27413	27418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460185
596	NC_018624	GGT	2	6	27428	27433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460185
597	NC_018624	TC	3	6	27457	27462	0 %	50 %	0 %	50 %	407460185
598	NC_018624	AGA	3	9	27562	27570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460185
599	NC_018624	ACA	2	6	27592	27597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460185
600	NC_018624	GCT	2	6	27767	27772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460185
601	NC_018624	GTT	2	6	27791	27796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460185
602	NC_018624	CAG	2	6	27916	27921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460185
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604	NC_018624	AATT	2	8	27958	27965	50 %	50 %	0 %	0 %	407460185
605	NC_018624	TGA	2	6	27973	27978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460185
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608	NC_018624	TA	3	6	28049	28054	50 %	50 %	0 %	0 %	407460185
609	NC_018624	TTG	2	6	28074	28079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460185
610	NC_018624	CTA	2	6	28095	28100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460185
611	NC_018624	ACA	2	6	28103	28108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460185
612	NC_018624	AAG	2	6	28140	28145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460185
613	NC_018624	GAC	2	6	28195	28200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460185
614	NC_018624	AAG	2	6	28260	28265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460185
615	NC_018624	CAA	2	6	28286	28291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460185
616	NC_018624	GCA	2	6	28367	28372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460185
617	NC_018624	T	6	6	28615	28620	0 %	100 %	0 %	0 %	407460185
618	NC_018624	TGC	2	6	28708	28713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460185
619	NC_018624	CAG	2	6	28745	28750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460185
620	NC_018624	CTG	2	6	28752	28757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460185
621	NC_018624	AAAT	2	8	28807	28814	75 %	25 %	0 %	0 %	407460185
622	NC_018624	AGC	2	6	28834	28839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460185
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624	NC_018624	GTT	2	6	28999	29004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460185
625	NC_018624	TAAGTG	2	12	29025	29036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460185
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627	NC_018624	GGCA	2	8	29085	29092	25 %	0 %	50 %	25 %	407460185
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762	NC_018624	AT	3	6	35448	35453	50 %	50 %	0 %	0 %	407460194
763	NC_018624	GCT	2	6	35457	35462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460194
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889	NC_018624	GAAA	2	8	41242	41249	75 %	0 %	25 %	0 %	407460199
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