MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 24932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_018624	AAC	2	6	282449	282454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460440
6003	NC_018624	CA	3	6	282494	282499	50 %	0 %	0 %	50 %	407460440
6004	NC_018624	TTG	2	6	282552	282557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460440
6005	NC_018624	T	6	6	282582	282587	0 %	100 %	0 %	0 %	407460440
6006	NC_018624	TTG	2	6	282610	282615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460440
6007	NC_018624	CAT	2	6	282639	282644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460440
6008	NC_018624	TTA	2	6	282663	282668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460440
6009	NC_018624	TCC	2	6	282827	282832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460440
6010	NC_018624	TTA	2	6	282843	282848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460440
6011	NC_018624	CCG	2	6	282867	282872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407460440
6012	NC_018624	TTC	2	6	282886	282891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460440
6013	NC_018624	CTT	3	9	282928	282936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460440
6014	NC_018624	TCA	2	6	283021	283026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460441
6015	NC_018624	TTC	2	6	283125	283130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460441
6016	NC_018624	ATA	2	6	283205	283210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460441
6017	NC_018624	GAT	2	6	283270	283275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460441
6018	NC_018624	CAG	2	6	283300	283305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460441
6019	NC_018624	TC	3	6	283306	283311	0 %	50 %	0 %	50 %	407460441
6020	NC_018624	CTG	2	6	283400	283405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460441
6021	NC_018624	ATC	2	6	283481	283486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460441
6022	NC_018624	TC	3	6	283599	283604	0 %	50 %	0 %	50 %	407460441
6023	NC_018624	TCT	2	6	283609	283614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460441
6024	NC_018624	CCT	2	6	283621	283626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460441
6025	NC_018624	A	7	7	283701	283707	100 %	0 %	0 %	0 %	407460441
6026	NC_018624	ATG	2	6	283778	283783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460441
6027	NC_018624	TCGT	2	8	283801	283808	0 %	50 %	25 %	25 %	407460441
6028	NC_018624	A	8	8	283822	283829	100 %	0 %	0 %	0 %	407460442
6029	NC_018624	AGA	2	6	283836	283841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460442
6030	NC_018624	GA	3	6	283853	283858	50 %	0 %	50 %	0 %	407460442
6031	NC_018624	GAA	2	6	283960	283965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460442
6032	NC_018624	TCT	2	6	284047	284052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460442
6033	NC_018624	ATTG	2	8	284124	284131	25 %	50 %	25 %	0 %	407460442
6034	NC_018624	TGA	2	6	284133	284138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460442
6035	NC_018624	CAG	2	6	284155	284160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460442
6036	NC_018624	AGCACG	2	12	284271	284282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460442
6037	NC_018624	GGT	2	6	284341	284346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460442
6038	NC_018624	GGA	2	6	284353	284358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460442
6039	NC_018624	TAGA	2	8	284393	284400	50 %	25 %	25 %	0 %	407460442
6040	NC_018624	GAT	2	6	284403	284408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460442
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6042	NC_018624	GCG	2	6	284469	284474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407460442
6043	NC_018624	GT	3	6	284622	284627	0 %	50 %	50 %	0 %	407460442
6044	NC_018624	TTG	2	6	284696	284701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460442
6045	NC_018624	TGT	2	6	284754	284759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460442
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6048	NC_018624	TCT	2	6	284961	284966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460442
6049	NC_018624	ATG	2	6	285056	285061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460442
6050	NC_018624	TCG	2	6	285081	285086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460442
6051	NC_018624	GAT	2	6	285091	285096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460442
6052	NC_018624	TTC	2	6	285168	285173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460442
6053	NC_018624	A	6	6	285232	285237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_018624	TTA	2	6	285246	285251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_018624	T	7	7	285292	285298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_018624	TTGT	2	8	285352	285359	0 %	75 %	25 %	0 %	407460443
6057	NC_018624	CTT	2	6	285413	285418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460443
6058	NC_018624	T	6	6	285551	285556	0 %	100 %	0 %	0 %	407460443
6059	NC_018624	GTT	2	6	285558	285563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460443
6060	NC_018624	GTT	2	6	285568	285573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460443
6061	NC_018624	T	6	6	285594	285599	0 %	100 %	0 %	0 %	407460443
6062	NC_018624	AGAC	2	8	285608	285615	50 %	0 %	25 %	25 %	407460443
6063	NC_018624	TCT	2	6	285620	285625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460443
6064	NC_018624	TAT	2	6	285773	285778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460443
6065	NC_018624	CTTA	2	8	285781	285788	25 %	50 %	0 %	25 %	407460443
6066	NC_018624	TCCCG	2	10	285804	285813	0 %	20 %	20 %	60 %	407460443
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6068	NC_018624	CTTAT	2	10	285922	285931	20 %	60 %	0 %	20 %	407460443
6069	NC_018624	AGAA	2	8	285959	285966	75 %	0 %	25 %	0 %	407460443
6070	NC_018624	TCT	2	6	285975	285980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460443
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6073	NC_018624	TAT	3	9	286018	286026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460443
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6092	NC_018624	TCCT	2	8	286962	286969	0 %	50 %	0 %	50 %	407460444
6093	NC_018624	AAGA	2	8	287073	287080	75 %	0 %	25 %	0 %	407460444
6094	NC_018624	A	8	8	287080	287087	100 %	0 %	0 %	0 %	407460444
6095	NC_018624	TTTA	2	8	287227	287234	25 %	75 %	0 %	0 %	407460444
6096	NC_018624	TAT	2	6	287266	287271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460444
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6100	NC_018624	CTT	2	6	287432	287437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460444
6101	NC_018624	TTC	2	6	287446	287451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460444
6102	NC_018624	A	6	6	287539	287544	100 %	0 %	0 %	0 %	407460444
6103	NC_018624	TTA	2	6	287630	287635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460445
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6106	NC_018624	TATC	2	8	287836	287843	25 %	50 %	0 %	25 %	407460445
6107	NC_018624	T	6	6	287908	287913	0 %	100 %	0 %	0 %	407460445
6108	NC_018624	TCA	2	6	287917	287922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460445
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6110	NC_018624	TGT	2	6	288031	288036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460445
6111	NC_018624	ATT	2	6	288106	288111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460445
6112	NC_018624	GAA	2	6	288125	288130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460445
6113	NC_018624	CTC	3	9	288213	288221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460445
6114	NC_018624	TGGA	2	8	288275	288282	25 %	25 %	50 %	0 %	407460445
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6118	NC_018624	ACC	2	6	288546	288551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407460445
6119	NC_018624	GCTTT	2	10	288612	288621	0 %	60 %	20 %	20 %	407460445
6120	NC_018624	TGT	2	6	288807	288812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460445
6121	NC_018624	AAG	2	6	288831	288836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460445
6122	NC_018624	AG	3	6	288866	288871	50 %	0 %	50 %	0 %	407460445
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6496	NC_018624	AGATTT	2	12	306733	306744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	407460453
6497	NC_018624	CTCTTT	2	12	306754	306765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460453
6498	NC_018624	TTG	2	6	306768	306773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460453
6499	NC_018624	GTT	2	6	306877	306882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460453
6500	NC_018624	GTT	2	6	306958	306963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460453

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