MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 24932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018624	AAG	2	6	260362	260367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460420
5502	NC_018624	GGA	2	6	260705	260710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460420
5503	NC_018624	CTT	2	6	260763	260768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460420
5504	NC_018624	CGTA	2	8	260790	260797	25 %	25 %	25 %	25 %	407460420
5505	NC_018624	GCT	2	6	260819	260824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460420
5506	NC_018624	TCT	2	6	260864	260869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460420
5507	NC_018624	TTC	2	6	260893	260898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460420
5508	NC_018624	TCC	2	6	260920	260925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460420
5509	NC_018624	TTCA	2	8	261004	261011	25 %	50 %	0 %	25 %	407460420
5510	NC_018624	TCC	2	6	261044	261049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460420
5511	NC_018624	ATCTC	2	10	261092	261101	20 %	40 %	0 %	40 %	407460420
5512	NC_018624	TTC	2	6	261144	261149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460420
5513	NC_018624	AAAC	2	8	261165	261172	75 %	0 %	0 %	25 %	407460420
5514	NC_018624	GT	3	6	261190	261195	0 %	50 %	50 %	0 %	407460420
5515	NC_018624	TCT	2	6	261218	261223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460420
5516	NC_018624	AGA	2	6	261242	261247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460420
5517	NC_018624	T	6	6	261279	261284	0 %	100 %	0 %	0 %	407460420
5518	NC_018624	TTC	2	6	261346	261351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460420
5519	NC_018624	AAT	2	6	261355	261360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460420
5520	NC_018624	CAT	2	6	261364	261369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460420
5521	NC_018624	GTGTAA	2	12	261398	261409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460420
5522	NC_018624	CTT	2	6	261474	261479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460420
5523	NC_018624	A	6	6	261504	261509	100 %	0 %	0 %	0 %	407460420
5524	NC_018624	T	6	6	261550	261555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_018624	GT	3	6	261573	261578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_018624	ATT	2	6	261691	261696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_018624	A	6	6	261717	261722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_018624	ATATAA	2	12	261738	261749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_018624	T	6	6	261766	261771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_018624	AGA	2	6	261837	261842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460421
5531	NC_018624	GTG	2	6	261899	261904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460421
5532	NC_018624	TGC	2	6	261963	261968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460421
5533	NC_018624	AG	3	6	262089	262094	50 %	0 %	50 %	0 %	407460421
5534	NC_018624	GAT	2	6	262105	262110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460421
5535	NC_018624	TGA	2	6	262176	262181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460421
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5537	NC_018624	AGA	2	6	262240	262245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460421
5538	NC_018624	GAC	2	6	262258	262263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460421
5539	NC_018624	CGT	2	6	262294	262299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460421
5540	NC_018624	AG	3	6	262335	262340	50 %	0 %	50 %	0 %	407460421
5541	NC_018624	ATT	2	6	262353	262358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460421
5542	NC_018624	AGA	3	9	262581	262589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460421
5543	NC_018624	GCG	2	6	262600	262605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407460421
5544	NC_018624	T	6	6	262624	262629	0 %	100 %	0 %	0 %	407460421
5545	NC_018624	TAT	2	6	262635	262640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460421
5546	NC_018624	ACT	2	6	262701	262706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460421
5547	NC_018624	A	6	6	262729	262734	100 %	0 %	0 %	0 %	407460421
5548	NC_018624	CTT	3	9	262841	262849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460421
5549	NC_018624	G	6	6	262871	262876	0 %	0 %	100 %	0 %	407460421
5550	NC_018624	GAG	2	6	262888	262893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460421
5551	NC_018624	GATA	2	8	262920	262927	50 %	25 %	25 %	0 %	407460421
5552	NC_018624	TAA	2	6	262938	262943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460421
5553	NC_018624	AAT	2	6	262957	262962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460421
5554	NC_018624	ATCT	2	8	262966	262973	25 %	50 %	0 %	25 %	407460421
5555	NC_018624	TGA	2	6	262974	262979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460421
5556	NC_018624	TAAA	2	8	262990	262997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_018624	ATT	2	6	263003	263008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_018624	GTT	2	6	263024	263029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_018624	T	8	8	263028	263035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_018624	TTTA	2	8	263086	263093	25 %	75 %	0 %	0 %	407460422
5561	NC_018624	GT	3	6	263123	263128	0 %	50 %	50 %	0 %	407460422
5562	NC_018624	GTT	2	6	263157	263162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460422
5563	NC_018624	TCCT	2	8	263182	263189	0 %	50 %	0 %	50 %	407460422
5564	NC_018624	ATTT	2	8	263292	263299	25 %	75 %	0 %	0 %	407460422
5565	NC_018624	AGC	2	6	263310	263315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460422
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5569	NC_018624	TGT	2	6	263434	263439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460422
5570	NC_018624	GAG	2	6	263502	263507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460422
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5572	NC_018624	AGA	2	6	263563	263568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460422
5573	NC_018624	AGA	2	6	263611	263616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460422
5574	NC_018624	CTTC	2	8	263642	263649	0 %	50 %	0 %	50 %	407460422
5575	NC_018624	AGA	2	6	263653	263658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460422
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5577	NC_018624	GTT	2	6	263690	263695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460422
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5582	NC_018624	TATTT	2	10	263833	263842	20 %	80 %	0 %	0 %	407460422
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5590	NC_018624	GA	3	6	264302	264307	50 %	0 %	50 %	0 %	407460423
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5606	NC_018624	T	6	6	264968	264973	0 %	100 %	0 %	0 %	407460424
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5611	NC_018624	GA	3	6	265231	265236	50 %	0 %	50 %	0 %	407460424
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5614	NC_018624	A	7	7	265326	265332	100 %	0 %	0 %	0 %	407460424
5615	NC_018624	GAA	2	6	265351	265356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460424
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