MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 24932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018624	TCT	2	6	236464	236469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460395
5002	NC_018624	TTA	2	6	236480	236485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460395
5003	NC_018624	GTA	2	6	236487	236492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460395
5004	NC_018624	TC	4	8	236499	236506	0 %	50 %	0 %	50 %	407460395
5005	NC_018624	ATC	2	6	236523	236528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460395
5006	NC_018624	TCT	2	6	236645	236650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460395
5007	NC_018624	TG	4	8	236663	236670	0 %	50 %	50 %	0 %	407460395
5008	NC_018624	TC	4	8	236755	236762	0 %	50 %	0 %	50 %	407460395
5009	NC_018624	CTT	2	6	236822	236827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460395
5010	NC_018624	ATG	2	6	236837	236842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460395
5011	NC_018624	TGT	2	6	236872	236877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460395
5012	NC_018624	TGG	2	6	236901	236906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407460395
5013	NC_018624	AG	3	6	236968	236973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_018624	AT	3	6	237038	237043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_018624	CTA	2	6	237147	237152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_018624	CGA	2	6	237385	237390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460396
5017	NC_018624	TGC	2	6	237396	237401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460396
5018	NC_018624	T	6	6	237480	237485	0 %	100 %	0 %	0 %	407460396
5019	NC_018624	AAC	3	9	237555	237563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460396
5020	NC_018624	T	6	6	237570	237575	0 %	100 %	0 %	0 %	407460396
5021	NC_018624	GTT	2	6	237576	237581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460396
5022	NC_018624	TAA	2	6	237582	237587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460396
5023	NC_018624	TGC	2	6	237643	237648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460396
5024	NC_018624	CTT	2	6	237662	237667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460396
5025	NC_018624	ACT	2	6	237714	237719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460396
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5027	NC_018624	TGC	2	6	237831	237836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460396
5028	NC_018624	CATC	2	8	237866	237873	25 %	25 %	0 %	50 %	407460396
5029	NC_018624	GCT	2	6	237883	237888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460396
5030	NC_018624	CTT	2	6	237944	237949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460396
5031	NC_018624	CGA	2	6	238000	238005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460396
5032	NC_018624	CATG	2	8	238124	238131	25 %	25 %	25 %	25 %	407460396
5033	NC_018624	CTTG	2	8	238142	238149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_018624	GAAT	2	8	238193	238200	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_018624	GAA	3	9	238207	238215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_018624	T	6	6	238230	238235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_018624	AAG	2	6	238239	238244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_018624	T	7	7	238254	238260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_018624	AAG	2	6	238293	238298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_018624	ACC	2	6	238312	238317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_018624	AATT	2	8	238332	238339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_018624	GAT	2	6	238373	238378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_018624	TTTC	2	8	238432	238439	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_018624	GTT	2	6	238460	238465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_018624	A	8	8	238500	238507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_018624	AGA	2	6	238542	238547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_018624	GAG	2	6	238628	238633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460397
5048	NC_018624	T	6	6	238688	238693	0 %	100 %	0 %	0 %	407460397
5049	NC_018624	GTT	2	6	238744	238749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460397
5050	NC_018624	CT	3	6	238751	238756	0 %	50 %	0 %	50 %	407460397
5051	NC_018624	AGC	2	6	238804	238809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460397
5052	NC_018624	TTG	2	6	238812	238817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460397
5053	NC_018624	CTC	2	6	238901	238906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407460397
5054	NC_018624	CTTT	2	8	238947	238954	0 %	75 %	0 %	25 %	407460397
5055	NC_018624	T	6	6	238952	238957	0 %	100 %	0 %	0 %	407460397
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5057	NC_018624	GATT	2	8	239115	239122	25 %	50 %	25 %	0 %	407460397
5058	NC_018624	GCA	2	6	239148	239153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407460397
5059	NC_018624	ACTA	2	8	239324	239331	50 %	25 %	0 %	25 %	407460397
5060	NC_018624	TTG	2	6	239411	239416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460397
5061	NC_018624	GGA	2	6	239459	239464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460397
5062	NC_018624	AGGC	2	8	239482	239489	25 %	0 %	50 %	25 %	407460397
5063	NC_018624	AAG	2	6	239560	239565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460397
5064	NC_018624	T	7	7	239588	239594	0 %	100 %	0 %	0 %	407460397
5065	NC_018624	ATTATA	2	12	239674	239685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_018624	A	6	6	239709	239714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_018624	CTT	2	6	239746	239751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_018624	TAT	2	6	239773	239778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_018624	ATAA	2	8	239814	239821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_018624	GA	3	6	239856	239861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_018624	A	6	6	239891	239896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_018624	GCA	2	6	239909	239914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_018624	GCA	2	6	239919	239924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_018624	CAA	2	6	239977	239982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460398
5075	NC_018624	GCTT	2	8	239992	239999	0 %	50 %	25 %	25 %	407460398
5076	NC_018624	TTC	2	6	240035	240040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460398
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5078	NC_018624	T	6	6	240135	240140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_018624	TCA	2	6	240142	240147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460399
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5082	NC_018624	A	6	6	240401	240406	100 %	0 %	0 %	0 %	407460399
5083	NC_018624	TAG	2	6	240507	240512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460399
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5085	NC_018624	AAAT	2	8	240630	240637	75 %	25 %	0 %	0 %	407460399
5086	NC_018624	TCT	2	6	240680	240685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460399
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5089	NC_018624	GTTT	2	8	240863	240870	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_018624	TAG	2	6	240931	240936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_018624	A	7	7	241023	241029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_018624	AG	3	6	241065	241070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_018624	TAT	2	6	241081	241086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_018624	TCAT	2	8	241093	241100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5095	NC_018624	ATA	2	6	241108	241113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_018624	CGT	2	6	241129	241134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407460400
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5098	NC_018624	ATC	2	6	241213	241218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460400
5099	NC_018624	TAT	2	6	241250	241255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460400
5100	NC_018624	GAG	2	6	241265	241270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460400
5101	NC_018624	GAT	2	6	241289	241294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460400
5102	NC_018624	TTCAG	2	10	241319	241328	20 %	40 %	20 %	20 %	407460400
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5107	NC_018624	AGG	2	6	241658	241663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407460400
5108	NC_018624	TG	3	6	241716	241721	0 %	50 %	50 %	0 %	407460400
5109	NC_018624	ATT	2	6	241756	241761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460400
5110	NC_018624	TTC	2	6	241817	241822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460400
5111	NC_018624	AGA	2	6	241830	241835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460400
5112	NC_018624	TGA	2	6	241865	241870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460400
5113	NC_018624	TTG	2	6	241915	241920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460400
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5115	NC_018624	TTG	2	6	241933	241938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460400
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5121	NC_018624	A	6	6	242145	242150	100 %	0 %	0 %	0 %	407460400
5122	NC_018624	TCA	2	6	242156	242161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460400
5123	NC_018624	GCTT	2	8	242215	242222	0 %	50 %	25 %	25 %	407460400
5124	NC_018624	AT	3	6	242296	242301	50 %	50 %	0 %	0 %	407460400
5125	NC_018624	TGA	2	6	242420	242425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460400
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5127	NC_018624	ATT	2	6	242445	242450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460400
5128	NC_018624	TGA	2	6	242489	242494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460400
5129	NC_018624	GAA	2	6	242538	242543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460400
5130	NC_018624	TTA	2	6	242565	242570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460400
5131	NC_018624	TTTAG	2	10	242609	242618	20 %	60 %	20 %	0 %	407460400
5132	NC_018624	TGT	2	6	242629	242634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_018624	AG	3	6	242679	242684	50 %	0 %	50 %	0 %	407460401
5134	NC_018624	T	7	7	242710	242716	0 %	100 %	0 %	0 %	407460401
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5143	NC_018624	ATCG	2	8	243130	243137	25 %	25 %	25 %	25 %	407460401
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5160	NC_018624	AAAG	2	8	243950	243957	75 %	0 %	25 %	0 %	407460402
5161	NC_018624	TTGAAT	2	12	243987	243998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_018624	AGGA	2	8	244023	244030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5163	NC_018624	AG	3	6	244031	244036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5164	NC_018624	T	7	7	244045	244051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_018624	TTA	2	6	244135	244140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407460403
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5167	NC_018624	AAG	2	6	244247	244252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460403
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5169	NC_018624	A	6	6	244361	244366	100 %	0 %	0 %	0 %	407460403
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5231	NC_018624	TCT	2	6	247538	247543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460406
5232	NC_018624	ATC	2	6	247570	247575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460406
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5234	NC_018624	T	6	6	247682	247687	0 %	100 %	0 %	0 %	407460407
5235	NC_018624	AAT	2	6	247776	247781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460407
5236	NC_018624	TCA	2	6	247813	247818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460407
5237	NC_018624	AAG	2	6	247820	247825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5238	NC_018624	ATA	2	6	247919	247924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407460408
5239	NC_018624	TAC	2	6	248008	248013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460408
5240	NC_018624	GAA	2	6	248021	248026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460408
5241	NC_018624	TTGAG	2	10	248067	248076	20 %	40 %	40 %	0 %	407460408
5242	NC_018624	GTT	2	6	248133	248138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460408
5243	NC_018624	GAT	2	6	248183	248188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407460408
5244	NC_018624	GA	3	6	248237	248242	50 %	0 %	50 %	0 %	407460408
5245	NC_018624	TATT	2	8	248253	248260	25 %	75 %	0 %	0 %	407460408
5246	NC_018624	GAA	2	6	248309	248314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407460408
5247	NC_018624	ATC	2	6	248333	248338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460408
5248	NC_018624	CAA	2	6	248350	248355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460408
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5250	NC_018624	TTCT	2	8	248455	248462	0 %	75 %	0 %	25 %	407460408
5251	NC_018624	AAC	2	6	248464	248469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407460408
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5275	NC_018624	AAT	2	6	250133	250138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5276	NC_018624	T	6	6	250191	250196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5371	NC_018624	TCT	2	6	254198	254203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407460416
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5376	NC_018624	TCA	2	6	254492	254497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460416
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5384	NC_018624	TAGA	2	8	254981	254988	50 %	25 %	25 %	0 %	407460416
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5392	NC_018624	CTTTT	2	10	255552	255561	0 %	80 %	0 %	20 %	407460416
5393	NC_018624	T	6	6	255558	255563	0 %	100 %	0 %	0 %	407460416
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5492	NC_018624	TTTAA	2	10	259970	259979	40 %	60 %	0 %	0 %	407460420
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5497	NC_018624	ATC	2	6	260140	260145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407460420
5498	NC_018624	GTT	2	6	260151	260156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460420
5499	NC_018624	ATGC	2	8	260159	260166	25 %	25 %	25 %	25 %	407460420
5500	NC_018624	TTG	2	6	260327	260332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407460420

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