MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 2080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018623	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018623	GT	3	6	309	314	0 %	50 %	50 %	0 %	407458795
3	NC_018623	TC	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	407458795
4	NC_018623	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	407458796
5	NC_018623	GT	3	6	1461	1466	0 %	50 %	50 %	0 %	407458796
6	NC_018623	TC	3	6	1584	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	407458796
7	NC_018623	TG	3	6	1888	1893	0 %	50 %	50 %	0 %	407458796
8	NC_018623	GA	3	6	2786	2791	50 %	0 %	50 %	0 %	407458797
9	NC_018623	GA	3	6	3340	3345	50 %	0 %	50 %	0 %	407458798
10	NC_018623	AT	3	6	4227	4232	50 %	50 %	0 %	0 %	407458798
11	NC_018623	CT	3	6	4729	4734	0 %	50 %	0 %	50 %	407458798
12	NC_018623	CT	3	6	6469	6474	0 %	50 %	0 %	50 %	407458799
13	NC_018623	GA	3	6	6893	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	407458801
14	NC_018623	GT	3	6	7804	7809	0 %	50 %	50 %	0 %	407458801
15	NC_018623	TC	3	6	7875	7880	0 %	50 %	0 %	50 %	407458801
16	NC_018623	AT	3	6	8464	8469	50 %	50 %	0 %	0 %	407458802
17	NC_018623	GT	3	6	8687	8692	0 %	50 %	50 %	0 %	407458802
18	NC_018623	TG	3	6	10493	10498	0 %	50 %	50 %	0 %	407458802
19	NC_018623	TC	3	6	11263	11268	0 %	50 %	0 %	50 %	407458803
20	NC_018623	AC	3	6	11279	11284	50 %	0 %	0 %	50 %	407458803
21	NC_018623	AT	3	6	11523	11528	50 %	50 %	0 %	0 %	407458803
22	NC_018623	GA	3	6	11602	11607	50 %	0 %	50 %	0 %	407458803
23	NC_018623	AG	3	6	11790	11795	50 %	0 %	50 %	0 %	407458803
24	NC_018623	TC	3	6	11843	11848	0 %	50 %	0 %	50 %	407458803
25	NC_018623	GT	3	6	12058	12063	0 %	50 %	50 %	0 %	407458803
26	NC_018623	GA	3	6	12446	12451	50 %	0 %	50 %	0 %	407458803
27	NC_018623	AG	3	6	12515	12520	50 %	0 %	50 %	0 %	407458803
28	NC_018623	GA	3	6	12586	12591	50 %	0 %	50 %	0 %	407458803
29	NC_018623	GT	3	6	12867	12872	0 %	50 %	50 %	0 %	407458803
30	NC_018623	TA	3	6	13807	13812	50 %	50 %	0 %	0 %	407458803
31	NC_018623	TA	3	6	13827	13832	50 %	50 %	0 %	0 %	407458803
32	NC_018623	AT	3	6	14111	14116	50 %	50 %	0 %	0 %	407458804
33	NC_018623	CT	3	6	14791	14796	0 %	50 %	0 %	50 %	407458804
34	NC_018623	TA	3	6	15121	15126	50 %	50 %	0 %	0 %	407458804
35	NC_018623	TG	4	8	15659	15666	0 %	50 %	50 %	0 %	407458804
36	NC_018623	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018623	GT	3	6	19395	19400	0 %	50 %	50 %	0 %	407458809
38	NC_018623	TA	3	6	19439	19444	50 %	50 %	0 %	0 %	407458809
39	NC_018623	TC	3	6	19545	19550	0 %	50 %	0 %	50 %	407458809
40	NC_018623	GT	3	6	19674	19679	0 %	50 %	50 %	0 %	407458809
41	NC_018623	AC	3	6	20115	20120	50 %	0 %	0 %	50 %	407458809
42	NC_018623	TC	3	6	21146	21151	0 %	50 %	0 %	50 %	407458810
43	NC_018623	GA	3	6	22448	22453	50 %	0 %	50 %	0 %	407458811
44	NC_018623	GA	3	6	23671	23676	50 %	0 %	50 %	0 %	407458811
45	NC_018623	AT	3	6	24452	24457	50 %	50 %	0 %	0 %	407458812
46	NC_018623	TA	3	6	25501	25506	50 %	50 %	0 %	0 %	407458813
47	NC_018623	AG	3	6	25608	25613	50 %	0 %	50 %	0 %	407458813
48	NC_018623	TA	3	6	26511	26516	50 %	50 %	0 %	0 %	407458813
49	NC_018623	TA	3	6	27373	27378	50 %	50 %	0 %	0 %	407458814
50	NC_018623	TA	3	6	27751	27756	50 %	50 %	0 %	0 %	407458814
51	NC_018623	AC	3	6	28021	28026	50 %	0 %	0 %	50 %	407458814
52	NC_018623	TA	3	6	28050	28055	50 %	50 %	0 %	0 %	407458814
53	NC_018623	GA	3	6	31111	31116	50 %	0 %	50 %	0 %	407458818
54	NC_018623	GA	4	8	31241	31248	50 %	0 %	50 %	0 %	407458818
55	NC_018623	GA	3	6	31716	31721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018623	TC	3	6	31982	31987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018623	CA	3	6	32870	32875	50 %	0 %	0 %	50 %	407458820
58	NC_018623	GT	3	6	33084	33089	0 %	50 %	50 %	0 %	407458820
59	NC_018623	TG	3	6	33246	33251	0 %	50 %	50 %	0 %	407458820
60	NC_018623	GA	3	6	33806	33811	50 %	0 %	50 %	0 %	407458821
61	NC_018623	GA	3	6	34261	34266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018623	AG	3	6	34610	34615	50 %	0 %	50 %	0 %	407458823
63	NC_018623	AG	3	6	34682	34687	50 %	0 %	50 %	0 %	407458823
64	NC_018623	AT	3	6	34728	34733	50 %	50 %	0 %	0 %	407458823
65	NC_018623	TG	3	6	34817	34822	0 %	50 %	50 %	0 %	407458823
66	NC_018623	GC	3	6	35130	35135	0 %	0 %	50 %	50 %	407458823
67	NC_018623	AT	3	6	35448	35453	50 %	50 %	0 %	0 %	407458823
68	NC_018623	GA	3	6	35929	35934	50 %	0 %	50 %	0 %	407458824
69	NC_018623	GT	4	8	36852	36859	0 %	50 %	50 %	0 %	407458824
70	NC_018623	TA	3	6	37502	37507	50 %	50 %	0 %	0 %	407458824
71	NC_018623	AG	3	6	37613	37618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018623	TG	3	6	37706	37711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018623	TC	3	6	37740	37745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018623	GA	3	6	38473	38478	50 %	0 %	50 %	0 %	407458825
75	NC_018623	TA	3	6	38508	38513	50 %	50 %	0 %	0 %	407458825
76	NC_018623	AT	3	6	39119	39124	50 %	50 %	0 %	0 %	407458825
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78	NC_018623	AG	3	6	39851	39856	50 %	0 %	50 %	0 %	407458827
79	NC_018623	GC	3	6	41448	41453	0 %	0 %	50 %	50 %	407458828
80	NC_018623	AT	3	6	41780	41785	50 %	50 %	0 %	0 %	407458828
81	NC_018623	CA	3	6	44110	44115	50 %	0 %	0 %	50 %	407458832
82	NC_018623	CA	3	6	44321	44326	50 %	0 %	0 %	50 %	407458833
83	NC_018623	TC	3	6	44661	44666	0 %	50 %	0 %	50 %	407458833
84	NC_018623	AC	3	6	44986	44991	50 %	0 %	0 %	50 %	407458833
85	NC_018623	AG	3	6	45653	45658	50 %	0 %	50 %	0 %	407458834
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87	NC_018623	TA	3	6	48249	48254	50 %	50 %	0 %	0 %	407458837
88	NC_018623	AT	3	6	48263	48268	50 %	50 %	0 %	0 %	407458837
89	NC_018623	AT	3	6	48515	48520	50 %	50 %	0 %	0 %	407458837
90	NC_018623	TA	3	6	48875	48880	50 %	50 %	0 %	0 %	407458837
91	NC_018623	AG	3	6	49403	49408	50 %	0 %	50 %	0 %	407458837
92	NC_018623	GC	3	6	49972	49977	0 %	0 %	50 %	50 %	407458838
93	NC_018623	TC	3	6	50377	50382	0 %	50 %	0 %	50 %	407458838
94	NC_018623	GT	3	6	50538	50543	0 %	50 %	50 %	0 %	407458838
95	NC_018623	TA	3	6	50550	50555	50 %	50 %	0 %	0 %	407458838
96	NC_018623	TA	3	6	52212	52217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018623	GT	3	6	53102	53107	0 %	50 %	50 %	0 %	407458840
98	NC_018623	AT	3	6	53289	53294	50 %	50 %	0 %	0 %	407458840
99	NC_018623	AG	3	6	55432	55437	50 %	0 %	50 %	0 %	407458843
100	NC_018623	AG	4	8	56046	56053	50 %	0 %	50 %	0 %	407458843
101	NC_018623	TC	3	6	56552	56557	0 %	50 %	0 %	50 %	407458844
102	NC_018623	GA	3	6	57079	57084	50 %	0 %	50 %	0 %	407458845
103	NC_018623	AT	3	6	58500	58505	50 %	50 %	0 %	0 %	407458846
104	NC_018623	GA	3	6	59328	59333	50 %	0 %	50 %	0 %	407458846
105	NC_018623	GT	4	8	59893	59900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018623	AG	3	6	60307	60312	50 %	0 %	50 %	0 %	407458847
107	NC_018623	AG	3	6	60608	60613	50 %	0 %	50 %	0 %	407458847
108	NC_018623	AG	3	6	62140	62145	50 %	0 %	50 %	0 %	407458847
109	NC_018623	TC	3	6	62592	62597	0 %	50 %	0 %	50 %	407458847
110	NC_018623	TG	3	6	63308	63313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018623	TC	3	6	64787	64792	0 %	50 %	0 %	50 %	407458849
112	NC_018623	TG	3	6	65552	65557	0 %	50 %	50 %	0 %	407458849
113	NC_018623	CA	4	8	65839	65846	50 %	0 %	0 %	50 %	407458849
114	NC_018623	GA	4	8	66578	66585	50 %	0 %	50 %	0 %	407458850
115	NC_018623	AT	3	6	67357	67362	50 %	50 %	0 %	0 %	407458851
116	NC_018623	GA	4	8	67464	67471	50 %	0 %	50 %	0 %	407458851
117	NC_018623	AG	3	6	67577	67582	50 %	0 %	50 %	0 %	407458851
118	NC_018623	TG	3	6	67926	67931	0 %	50 %	50 %	0 %	407458851
119	NC_018623	GT	3	6	68170	68175	0 %	50 %	50 %	0 %	407458851
120	NC_018623	TA	3	6	68611	68616	50 %	50 %	0 %	0 %	407458852
121	NC_018623	TA	3	6	69314	69319	50 %	50 %	0 %	0 %	407458852
122	NC_018623	AG	3	6	70237	70242	50 %	0 %	50 %	0 %	407458854
123	NC_018623	AC	3	6	71912	71917	50 %	0 %	0 %	50 %	407458856
124	NC_018623	GT	3	6	72036	72041	0 %	50 %	50 %	0 %	407458856
125	NC_018623	GA	3	6	74645	74650	50 %	0 %	50 %	0 %	407458859
126	NC_018623	TC	3	6	75233	75238	0 %	50 %	0 %	50 %	407458860
127	NC_018623	TC	3	6	76038	76043	0 %	50 %	0 %	50 %	407458860
128	NC_018623	GC	3	6	76270	76275	0 %	0 %	50 %	50 %	407458861
129	NC_018623	TC	3	6	76337	76342	0 %	50 %	0 %	50 %	407458861
130	NC_018623	CA	3	6	76575	76580	50 %	0 %	0 %	50 %	407458861
131	NC_018623	CT	3	6	76763	76768	0 %	50 %	0 %	50 %	407458861
132	NC_018623	GA	3	6	78655	78660	50 %	0 %	50 %	0 %	407458862
133	NC_018623	GA	3	6	78846	78851	50 %	0 %	50 %	0 %	407458862
134	NC_018623	AG	3	6	79046	79051	50 %	0 %	50 %	0 %	407458862
135	NC_018623	AG	3	6	79180	79185	50 %	0 %	50 %	0 %	407458862
136	NC_018623	AC	3	6	80161	80166	50 %	0 %	0 %	50 %	407458863
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138	NC_018623	AG	3	6	81212	81217	50 %	0 %	50 %	0 %	407458864
139	NC_018623	CT	3	6	81392	81397	0 %	50 %	0 %	50 %	407458864
140	NC_018623	AC	3	6	81739	81744	50 %	0 %	0 %	50 %	407458864
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142	NC_018623	GT	3	6	82055	82060	0 %	50 %	50 %	0 %	407458865
143	NC_018623	AC	3	6	82319	82324	50 %	0 %	0 %	50 %	407458865
144	NC_018623	TG	3	6	82798	82803	0 %	50 %	50 %	0 %	407458865
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