MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018623	GAAAA	2	10	3356	3365	80 %	0 %	20 %	0 %	407458798
2	NC_018623	AGGAG	2	10	4413	4422	40 %	0 %	60 %	0 %	407458798
3	NC_018623	TGTTT	2	10	6761	6770	0 %	80 %	20 %	0 %	407458800
4	NC_018623	AACAT	2	10	7325	7334	60 %	20 %	0 %	20 %	407458801
5	NC_018623	AAGAA	2	10	9571	9580	80 %	0 %	20 %	0 %	407458802
6	NC_018623	GGATA	2	10	12558	12567	40 %	20 %	40 %	0 %	407458803
7	NC_018623	ATAAA	2	10	13046	13055	80 %	20 %	0 %	0 %	407458803
8	NC_018623	AACTC	2	10	13490	13499	40 %	20 %	0 %	40 %	407458803
9	NC_018623	GTTTT	2	10	13560	13569	0 %	80 %	20 %	0 %	407458803
10	NC_018623	GAAAC	2	10	14328	14337	60 %	0 %	20 %	20 %	407458804
11	NC_018623	GCCTT	2	10	15011	15020	0 %	40 %	20 %	40 %	407458804
12	NC_018623	AATAG	2	10	17069	17078	60 %	20 %	20 %	0 %	407458806
13	NC_018623	GCCTA	2	10	19905	19914	20 %	20 %	20 %	40 %	407458809
14	NC_018623	AGTGT	2	10	21119	21128	20 %	40 %	40 %	0 %	407458810
15	NC_018623	TTTGT	2	10	25065	25074	0 %	80 %	20 %	0 %	407458813
16	NC_018623	TCCAA	2	10	28447	28456	40 %	20 %	0 %	40 %	407458814
17	NC_018623	GCCAC	2	10	29449	29458	20 %	0 %	20 %	60 %	407458815
18	NC_018623	AACTT	2	10	32734	32743	40 %	40 %	0 %	20 %	407458820
19	NC_018623	ATAAA	2	10	34285	34294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018623	TTGAA	2	10	35000	35009	40 %	40 %	20 %	0 %	407458823
21	NC_018623	AAGGA	2	10	38578	38587	60 %	0 %	40 %	0 %	407458825
22	NC_018623	CCATA	2	10	38785	38794	40 %	20 %	0 %	40 %	407458825
23	NC_018623	GGATT	2	10	39771	39780	20 %	40 %	40 %	0 %	407458827
24	NC_018623	GTCCT	2	10	40134	40143	0 %	40 %	20 %	40 %	407458828
25	NC_018623	CTTTC	2	10	43214	43223	0 %	60 %	0 %	40 %	407458831
26	NC_018623	ACAAA	2	10	43873	43882	80 %	0 %	0 %	20 %	407458832
27	NC_018623	CCTAT	2	10	44509	44518	20 %	40 %	0 %	40 %	407458833
28	NC_018623	TTGTC	2	10	45142	45151	0 %	60 %	20 %	20 %	407458833
29	NC_018623	TCTTT	2	10	46091	46100	0 %	80 %	0 %	20 %	407458835
30	NC_018623	TAGCT	2	10	47175	47184	20 %	40 %	20 %	20 %	407458836
31	NC_018623	TCTAT	2	10	49562	49571	20 %	60 %	0 %	20 %	407458838
32	NC_018623	TTTGG	2	10	51476	51485	0 %	60 %	40 %	0 %	407458838
33	NC_018623	TTTTG	2	10	52485	52494	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018623	TCTTT	2	10	59411	59420	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018623	AAAAT	2	10	60218	60227	80 %	20 %	0 %	0 %	407458847
36	NC_018623	GTTAT	2	10	61251	61260	20 %	60 %	20 %	0 %	407458847
37	NC_018623	ATTTT	2	10	61298	61307	20 %	80 %	0 %	0 %	407458847
38	NC_018623	TAGTT	2	10	62820	62829	20 %	60 %	20 %	0 %	407458847
39	NC_018623	GCTTT	2	10	64550	64559	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018623	TCCTA	2	10	64885	64894	20 %	40 %	0 %	40 %	407458849
41	NC_018623	AGAAA	2	10	70141	70150	80 %	0 %	20 %	0 %	407458853
42	NC_018623	CACTT	2	10	71132	71141	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_018623	ATAGC	2	10	74393	74402	40 %	20 %	20 %	20 %	407458859
44	NC_018623	TCATG	2	10	76001	76010	20 %	40 %	20 %	20 %	407458860
45	NC_018623	AGCAG	2	10	76894	76903	40 %	0 %	40 %	20 %	407458861
46	NC_018623	GCACA	2	10	77226	77235	40 %	0 %	20 %	40 %	407458861
47	NC_018623	AATTT	2	10	77738	77747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018623	AATTC	2	10	79166	79175	40 %	40 %	0 %	20 %	407458862
49	NC_018623	CGTAT	2	10	81543	81552	20 %	40 %	20 %	20 %	407458864
50	NC_018623	GAAAA	2	10	82753	82762	80 %	0 %	20 %	0 %	407458865
51	NC_018623	TACGT	2	10	82829	82838	20 %	40 %	20 %	20 %	407458865
52	NC_018623	AGGAA	2	10	84751	84760	60 %	0 %	40 %	0 %	407458867
53	NC_018623	CTTTT	2	10	85640	85649	0 %	80 %	0 %	20 %	407458869
54	NC_018623	CAAAG	2	10	87111	87120	60 %	0 %	20 %	20 %	407458871
55	NC_018623	AGAAA	2	10	87348	87357	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018623	AAAGA	2	10	89184	89193	80 %	0 %	20 %	0 %	407458873
57	NC_018623	TTTTC	2	10	90199	90208	0 %	80 %	0 %	20 %	407458873
58	NC_018623	ATAAC	2	10	90808	90817	60 %	20 %	0 %	20 %	407458873
59	NC_018623	TGGCA	2	10	93293	93302	20 %	20 %	40 %	20 %	407458874
60	NC_018623	AATTA	2	10	93958	93967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018623	TGTTT	2	10	95019	95028	0 %	80 %	20 %	0 %	407458876
62	NC_018623	TCACC	2	10	96593	96602	20 %	20 %	0 %	60 %	407458877
63	NC_018623	AAAAT	2	10	96728	96737	80 %	20 %	0 %	0 %	407458877
64	NC_018623	TTAAT	2	10	97772	97781	40 %	60 %	0 %	0 %	407458878
65	NC_018623	ATTTG	2	10	98956	98965	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018623	AAAAT	2	10	99677	99686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018623	ATTAC	2	10	102905	102914	40 %	40 %	0 %	20 %	407458886
68	NC_018623	CTACA	2	10	103279	103288	40 %	20 %	0 %	40 %	407458886
69	NC_018623	AATTA	2	10	104826	104835	60 %	40 %	0 %	0 %	407458888
70	NC_018623	CTATA	2	10	105816	105825	40 %	40 %	0 %	20 %	407458889
71	NC_018623	ATTTA	2	10	107059	107068	40 %	60 %	0 %	0 %	407458890
72	NC_018623	CTTTC	2	10	107768	107777	0 %	60 %	0 %	40 %	407458891
73	NC_018623	CTTTT	2	10	108359	108368	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018623	AGCTT	2	10	108470	108479	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_018623	GTTTG	2	10	108777	108786	0 %	60 %	40 %	0 %	407458893
76	NC_018623	AGTTA	2	10	115582	115591	40 %	40 %	20 %	0 %	407458908
77	NC_018623	AGTTT	2	10	116072	116081	20 %	60 %	20 %	0 %	407458909
78	NC_018623	TTTGC	2	10	116987	116996	0 %	60 %	20 %	20 %	407458911
79	NC_018623	TGAAA	2	10	117991	118000	60 %	20 %	20 %	0 %	407458911
80	NC_018623	TTTAC	2	10	119184	119193	20 %	60 %	0 %	20 %	407458914
81	NC_018623	AATTA	2	10	122077	122086	60 %	40 %	0 %	0 %	407458917
82	NC_018623	CTTTT	2	10	122873	122882	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018623	GAGAT	2	10	123429	123438	40 %	20 %	40 %	0 %	407458918
84	NC_018623	GTCAA	2	10	124748	124757	40 %	20 %	20 %	20 %	407458920
85	NC_018623	TAGGG	2	10	127220	127229	20 %	20 %	60 %	0 %	407458923
86	NC_018623	AACTT	2	10	128152	128161	40 %	40 %	0 %	20 %	407458923
87	NC_018623	TTCTT	2	10	131357	131366	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018623	TGTCA	2	10	132038	132047	20 %	40 %	20 %	20 %	407458926
89	NC_018623	AAAAG	2	10	135441	135450	80 %	0 %	20 %	0 %	407458928
90	NC_018623	TAAAA	2	10	135722	135731	80 %	20 %	0 %	0 %	407458928
91	NC_018623	GATTT	2	10	137981	137990	20 %	60 %	20 %	0 %	407458930
92	NC_018623	TTGTT	2	10	138323	138332	0 %	80 %	20 %	0 %	407458930
93	NC_018623	AAGAA	2	10	138804	138813	80 %	0 %	20 %	0 %	407458930
94	NC_018623	TTCTT	2	10	139397	139406	0 %	80 %	0 %	20 %	407458931
95	NC_018623	CTTTG	2	10	141301	141310	0 %	60 %	20 %	20 %	407458933
96	NC_018623	AGAAA	2	10	143338	143347	80 %	0 %	20 %	0 %	407458936
97	NC_018623	AAAGA	2	10	146003	146012	80 %	0 %	20 %	0 %	407458938
98	NC_018623	TTTTA	2	10	148170	148179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018623	CGTTT	2	10	149669	149678	0 %	60 %	20 %	20 %	407458945
100	NC_018623	ATTTT	2	10	149809	149818	20 %	80 %	0 %	0 %	407458945
101	NC_018623	ACCAT	2	10	151852	151861	40 %	20 %	0 %	40 %	407458946
102	NC_018623	CAGAA	2	10	152817	152826	60 %	0 %	20 %	20 %	407458947
103	NC_018623	TTCAT	2	10	153387	153396	20 %	60 %	0 %	20 %	407458947
104	NC_018623	AAAGG	2	10	154217	154226	60 %	0 %	40 %	0 %	407458948
105	NC_018623	ATAGG	2	10	155909	155918	40 %	20 %	40 %	0 %	407458950
106	NC_018623	TTTGA	2	10	155995	156004	20 %	60 %	20 %	0 %	407458950
107	NC_018623	AAGGT	2	10	160936	160945	40 %	20 %	40 %	0 %	407458953
108	NC_018623	TTTTG	2	10	161875	161884	0 %	80 %	20 %	0 %	407458955
109	NC_018623	GGGGC	2	10	162022	162031	0 %	0 %	80 %	20 %	407458955
110	NC_018623	TAAAT	2	10	164501	164510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018623	AAATG	2	10	166429	166438	60 %	20 %	20 %	0 %	407458958
112	NC_018623	GGGGA	2	10	168204	168213	20 %	0 %	80 %	0 %	407458959
113	NC_018623	TTTTC	2	10	169242	169251	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018623	CTGTT	2	10	169721	169730	0 %	60 %	20 %	20 %	407458961
115	NC_018623	AATGA	2	10	169756	169765	60 %	20 %	20 %	0 %	407458961
116	NC_018623	AGGGG	2	10	171172	171181	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018623	ATTTT	2	10	173216	173225	20 %	80 %	0 %	0 %	407458967
118	NC_018623	GAGAG	2	10	173233	173242	40 %	0 %	60 %	0 %	407458967
119	NC_018623	CAAAA	2	10	173563	173572	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018623	CGCAT	2	10	173933	173942	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_018623	CTAAG	2	10	181142	181151	40 %	20 %	20 %	20 %	407458974
122	NC_018623	TTTTC	2	10	181742	181751	0 %	80 %	0 %	20 %	407458974
123	NC_018623	GGTAC	2	10	183737	183746	20 %	20 %	40 %	20 %	407458976
124	NC_018623	AGGGA	2	10	186924	186933	40 %	0 %	60 %	0 %	407458981
125	NC_018623	AATGT	2	10	187333	187342	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018623	AGGAA	2	10	187947	187956	60 %	0 %	40 %	0 %	407458982
127	NC_018623	TTCTT	2	10	188326	188335	0 %	80 %	0 %	20 %	407458982
128	NC_018623	GATAA	2	10	190969	190978	60 %	20 %	20 %	0 %	407458982
129	NC_018623	CCCTT	2	10	193173	193182	0 %	40 %	0 %	60 %	407458983
130	NC_018623	ATAGA	2	10	193392	193401	60 %	20 %	20 %	0 %	407458983
131	NC_018623	TTTTA	2	10	193871	193880	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018623	ATTTA	2	10	193905	193914	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018623	AGTTA	2	10	194161	194170	40 %	40 %	20 %	0 %	407458984
134	NC_018623	TTATT	2	10	194181	194190	20 %	80 %	0 %	0 %	407458984
135	NC_018623	CCCTA	2	10	195234	195243	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_018623	AGGGT	2	10	197101	197110	20 %	20 %	60 %	0 %	407458986
137	NC_018623	TGGAT	2	10	197542	197551	20 %	40 %	40 %	0 %	407458986
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277	NC_018623	AGCAT	2	10	363923	363932	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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