MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 2994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018623	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	407458795
2	NC_018623	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	407458795
3	NC_018623	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	407458796
4	NC_018623	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	407458796
5	NC_018623	TGTT	2	8	2841	2848	0 %	75 %	25 %	0 %	407458797
6	NC_018623	GAAG	2	8	2952	2959	50 %	0 %	50 %	0 %	407458797
7	NC_018623	AGTA	2	8	2982	2989	50 %	25 %	25 %	0 %	407458797
8	NC_018623	TTTG	2	8	3300	3307	0 %	75 %	25 %	0 %	407458798
9	NC_018623	TCCT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	0 %	50 %	407458798
10	NC_018623	GAAA	2	8	5255	5262	75 %	0 %	25 %	0 %	407458798
11	NC_018623	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018623	CGAG	2	8	5526	5533	25 %	0 %	50 %	25 %	407458799
13	NC_018623	TAAT	2	8	6732	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	407458800
14	NC_018623	GAAT	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018623	AGAA	2	8	6964	6971	75 %	0 %	25 %	0 %	407458801
16	NC_018623	TCCC	2	8	7281	7288	0 %	25 %	0 %	75 %	407458801
17	NC_018623	GTAG	2	8	7315	7322	25 %	25 %	50 %	0 %	407458801
18	NC_018623	AATA	2	8	8012	8019	75 %	25 %	0 %	0 %	407458802
19	NC_018623	ATGA	2	8	8483	8490	50 %	25 %	25 %	0 %	407458802
20	NC_018623	TGGA	2	8	8671	8678	25 %	25 %	50 %	0 %	407458802
21	NC_018623	CTGT	2	8	8681	8688	0 %	50 %	25 %	25 %	407458802
22	NC_018623	ATTT	2	8	9403	9410	25 %	75 %	0 %	0 %	407458802
23	NC_018623	AAAG	2	8	10227	10234	75 %	0 %	25 %	0 %	407458802
24	NC_018623	AAGT	2	8	10526	10533	50 %	25 %	25 %	0 %	407458802
25	NC_018623	AGGG	2	8	10765	10772	25 %	0 %	75 %	0 %	407458802
26	NC_018623	TAAG	2	8	10775	10782	50 %	25 %	25 %	0 %	407458802
27	NC_018623	AAAG	2	8	11068	11075	75 %	0 %	25 %	0 %	407458803
28	NC_018623	AGTA	2	8	11726	11733	50 %	25 %	25 %	0 %	407458803
29	NC_018623	TCTT	2	8	12007	12014	0 %	75 %	0 %	25 %	407458803
30	NC_018623	TAAT	2	8	12148	12155	50 %	50 %	0 %	0 %	407458803
31	NC_018623	CAAA	2	8	12459	12466	75 %	0 %	0 %	25 %	407458803
32	NC_018623	AAGA	2	8	12580	12587	75 %	0 %	25 %	0 %	407458803
33	NC_018623	ACTT	2	8	12702	12709	25 %	50 %	0 %	25 %	407458803
34	NC_018623	CACT	2	8	12799	12806	25 %	25 %	0 %	50 %	407458803
35	NC_018623	GCAA	2	8	13327	13334	50 %	0 %	25 %	25 %	407458803
36	NC_018623	GAAA	2	8	13747	13754	75 %	0 %	25 %	0 %	407458803
37	NC_018623	AGAT	2	8	14316	14323	50 %	25 %	25 %	0 %	407458804
38	NC_018623	TTGT	2	8	14366	14373	0 %	75 %	25 %	0 %	407458804
39	NC_018623	GGAT	2	8	14950	14957	25 %	25 %	50 %	0 %	407458804
40	NC_018623	CCCA	2	8	15421	15428	25 %	0 %	0 %	75 %	407458804
41	NC_018623	TAAA	2	8	17025	17032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018623	AGAA	2	8	17165	17172	75 %	0 %	25 %	0 %	407458806
43	NC_018623	TCTT	2	8	17435	17442	0 %	75 %	0 %	25 %	407458806
44	NC_018623	TTTC	2	8	17682	17689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018623	GTCA	2	8	17838	17845	25 %	25 %	25 %	25 %	407458807
46	NC_018623	AAGC	2	8	18229	18236	50 %	0 %	25 %	25 %	407458807
47	NC_018623	ATTA	2	8	18369	18376	50 %	50 %	0 %	0 %	407458807
48	NC_018623	ATTA	2	8	18991	18998	50 %	50 %	0 %	0 %	407458809
49	NC_018623	GTTT	2	8	19264	19271	0 %	75 %	25 %	0 %	407458809
50	NC_018623	TTTG	2	8	19504	19511	0 %	75 %	25 %	0 %	407458809
51	NC_018623	GCGT	2	8	19668	19675	0 %	25 %	50 %	25 %	407458809
52	NC_018623	TGGT	2	8	20449	20456	0 %	50 %	50 %	0 %	407458810
53	NC_018623	TAAA	2	8	21089	21096	75 %	25 %	0 %	0 %	407458810
54	NC_018623	TATG	2	8	21588	21595	25 %	50 %	25 %	0 %	407458810
55	NC_018623	CAAT	2	8	22283	22290	50 %	25 %	0 %	25 %	407458811
56	NC_018623	AGAA	2	8	22700	22707	75 %	0 %	25 %	0 %	407458811
57	NC_018623	TGAT	2	8	22907	22914	25 %	50 %	25 %	0 %	407458811
58	NC_018623	TGTC	2	8	24058	24065	0 %	50 %	25 %	25 %	407458812
59	NC_018623	AGCT	2	8	24171	24178	25 %	25 %	25 %	25 %	407458812
60	NC_018623	TTGA	2	8	24295	24302	25 %	50 %	25 %	0 %	407458812
61	NC_018623	AATT	2	8	24630	24637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018623	ATAA	2	8	24697	24704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018623	TGCT	2	8	24882	24889	0 %	50 %	25 %	25 %	407458813
64	NC_018623	TTGC	2	8	25253	25260	0 %	50 %	25 %	25 %	407458813
65	NC_018623	GTTT	2	8	25417	25424	0 %	75 %	25 %	0 %	407458813
66	NC_018623	GAAC	2	8	25441	25448	50 %	0 %	25 %	25 %	407458813
67	NC_018623	AGTT	2	8	25626	25633	25 %	50 %	25 %	0 %	407458813
68	NC_018623	TAAA	2	8	26471	26478	75 %	25 %	0 %	0 %	407458813
69	NC_018623	ATTA	2	8	26663	26670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018623	AATT	2	8	27959	27966	50 %	50 %	0 %	0 %	407458814
71	NC_018623	AAAT	2	8	28808	28815	75 %	25 %	0 %	0 %	407458814
72	NC_018623	GGCA	2	8	29086	29093	25 %	0 %	50 %	25 %	407458814
73	NC_018623	AGGG	2	8	29432	29439	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018623	GAAT	2	8	29628	29635	50 %	25 %	25 %	0 %	407458816
75	NC_018623	AGAA	2	8	29793	29800	75 %	0 %	25 %	0 %	407458816
76	NC_018623	ACCA	2	8	30243	30250	50 %	0 %	0 %	50 %	407458816
77	NC_018623	AGAA	2	8	31203	31210	75 %	0 %	25 %	0 %	407458818
78	NC_018623	GTTT	2	8	31414	31421	0 %	75 %	25 %	0 %	407458818
79	NC_018623	TTTC	2	8	31654	31661	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018623	TCTA	2	8	32060	32067	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018623	AATT	2	8	32381	32388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018623	TTAA	2	8	32421	32428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018623	ATTT	2	8	32436	32443	25 %	75 %	0 %	0 %	407458820
84	NC_018623	TTGT	2	8	32462	32469	0 %	75 %	25 %	0 %	407458820
85	NC_018623	TTTA	2	8	33122	33129	25 %	75 %	0 %	0 %	407458820
86	NC_018623	TAGT	2	8	33612	33619	25 %	50 %	25 %	0 %	407458821
87	NC_018623	GAAG	2	8	33758	33765	50 %	0 %	50 %	0 %	407458821
88	NC_018623	TGAA	2	8	34015	34022	50 %	25 %	25 %	0 %	407458822
89	NC_018623	GATA	2	8	34129	34136	50 %	25 %	25 %	0 %	407458822
90	NC_018623	TCTT	2	8	34390	34397	0 %	75 %	0 %	25 %	407458823
91	NC_018623	ACAG	2	8	34708	34715	50 %	0 %	25 %	25 %	407458823
92	NC_018623	AGGA	2	8	35342	35349	50 %	0 %	50 %	0 %	407458823
93	NC_018623	TAAT	2	8	36130	36137	50 %	50 %	0 %	0 %	407458824
94	NC_018623	ATTT	2	8	36571	36578	25 %	75 %	0 %	0 %	407458824
95	NC_018623	GAAA	2	8	37058	37065	75 %	0 %	25 %	0 %	407458824
96	NC_018623	TCAA	2	8	37779	37786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018623	TGTT	2	8	37991	37998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018623	ATCT	2	8	38009	38016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018623	ATAG	2	8	38043	38050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018623	AAAG	2	8	38202	38209	75 %	0 %	25 %	0 %	407458825
101	NC_018623	TAAT	2	8	38218	38225	50 %	50 %	0 %	0 %	407458825
102	NC_018623	ATTT	2	8	38431	38438	25 %	75 %	0 %	0 %	407458825
103	NC_018623	TTTA	2	8	38687	38694	25 %	75 %	0 %	0 %	407458825
104	NC_018623	CTTT	2	8	38817	38824	0 %	75 %	0 %	25 %	407458825
105	NC_018623	AGCG	2	8	39006	39013	25 %	0 %	50 %	25 %	407458825
106	NC_018623	GAAA	2	8	41243	41250	75 %	0 %	25 %	0 %	407458828
107	NC_018623	AGCA	2	8	41414	41421	50 %	0 %	25 %	25 %	407458828
108	NC_018623	CTGT	2	8	41882	41889	0 %	50 %	25 %	25 %	407458828
109	NC_018623	TCTT	2	8	41922	41929	0 %	75 %	0 %	25 %	407458828
110	NC_018623	GAAG	2	8	42333	42340	50 %	0 %	50 %	0 %	407458828
111	NC_018623	AATA	2	8	42364	42371	75 %	25 %	0 %	0 %	407458828
112	NC_018623	GAAA	2	8	43501	43508	75 %	0 %	25 %	0 %	407458832
113	NC_018623	GTCG	2	8	44196	44203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018623	TTAA	2	8	44226	44233	50 %	50 %	0 %	0 %	407458833
115	NC_018623	ATCA	2	8	44815	44822	50 %	25 %	0 %	25 %	407458833
116	NC_018623	ATGA	2	8	45093	45100	50 %	25 %	25 %	0 %	407458833
117	NC_018623	AGAA	2	8	45762	45769	75 %	0 %	25 %	0 %	407458834
118	NC_018623	TAAA	2	8	45992	45999	75 %	25 %	0 %	0 %	407458834
119	NC_018623	GAAA	2	8	46974	46981	75 %	0 %	25 %	0 %	407458836
120	NC_018623	TCTT	2	8	47080	47087	0 %	75 %	0 %	25 %	407458836
121	NC_018623	GCTT	2	8	47609	47616	0 %	50 %	25 %	25 %	407458836
122	NC_018623	AAGA	2	8	48051	48058	75 %	0 %	25 %	0 %	407458837
123	NC_018623	TGTT	2	8	48461	48468	0 %	75 %	25 %	0 %	407458837
124	NC_018623	ATAA	2	8	49529	49536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018623	TAAA	2	8	49698	49705	75 %	25 %	0 %	0 %	407458838
126	NC_018623	AAGC	2	8	49727	49734	50 %	0 %	25 %	25 %	407458838
127	NC_018623	CCAA	2	8	49751	49758	50 %	0 %	0 %	50 %	407458838
128	NC_018623	TTCC	2	8	49898	49905	0 %	50 %	0 %	50 %	407458838
129	NC_018623	AACA	2	8	50875	50882	75 %	0 %	0 %	25 %	407458838
130	NC_018623	AACA	2	8	51780	51787	75 %	0 %	0 %	25 %	407458838
131	NC_018623	AAAG	2	8	52609	52616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018623	TTTA	2	8	52619	52626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018623	GAAG	2	8	52722	52729	50 %	0 %	50 %	0 %	407458839
134	NC_018623	ATCC	2	8	53028	53035	25 %	25 %	0 %	50 %	407458840
135	NC_018623	AGCA	2	8	53320	53327	50 %	0 %	25 %	25 %	407458840
136	NC_018623	TTCA	2	8	53480	53487	25 %	50 %	0 %	25 %	407458840
137	NC_018623	CATA	2	8	54328	54335	50 %	25 %	0 %	25 %	407458841
138	NC_018623	AAAG	2	8	54787	54794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018623	TAGC	2	8	55859	55866	25 %	25 %	25 %	25 %	407458843
140	NC_018623	CTGT	2	8	56038	56045	0 %	50 %	25 %	25 %	407458843
141	NC_018623	CTTT	2	8	56428	56435	0 %	75 %	0 %	25 %	407458844
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