MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 24738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018623	AACAAA	2	12	118661	118672	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	407458912
2502	NC_018623	AAG	2	6	118713	118718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458912
2503	NC_018623	T	7	7	118725	118731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_018623	A	6	6	118766	118771	100 %	0 %	0 %	0 %	407458913
2505	NC_018623	GTT	2	6	118811	118816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458913
2506	NC_018623	CAA	2	6	118834	118839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458913
2507	NC_018623	TGC	2	6	118936	118941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458913
2508	NC_018623	GT	3	6	119003	119008	0 %	50 %	50 %	0 %	407458913
2509	NC_018623	GTT	2	6	119069	119074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458913
2510	NC_018623	GAG	2	6	119152	119157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_018623	TTTAC	2	10	119184	119193	20 %	60 %	0 %	20 %	407458914
2512	NC_018623	AGTC	2	8	119213	119220	25 %	25 %	25 %	25 %	407458914
2513	NC_018623	ATG	2	6	119224	119229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458914
2514	NC_018623	ATT	2	6	119362	119367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458914
2515	NC_018623	AGA	2	6	119421	119426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458914
2516	NC_018623	ATC	2	6	119437	119442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458914
2517	NC_018623	TTA	2	6	119461	119466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458914
2518	NC_018623	ATT	2	6	119511	119516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458914
2519	NC_018623	TGG	2	6	119559	119564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458914
2520	NC_018623	AAG	2	6	119597	119602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458914
2521	NC_018623	TAC	2	6	119700	119705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458914
2522	NC_018623	CGT	2	6	119772	119777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458914
2523	NC_018623	AGA	2	6	119796	119801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458914
2524	NC_018623	AAG	2	6	119876	119881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458914
2525	NC_018623	A	6	6	119930	119935	100 %	0 %	0 %	0 %	407458914
2526	NC_018623	GAA	2	6	119943	119948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458914
2527	NC_018623	GAA	2	6	119959	119964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458914
2528	NC_018623	TTC	2	6	119999	120004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458914
2529	NC_018623	AGTT	2	8	120008	120015	25 %	50 %	25 %	0 %	407458914
2530	NC_018623	TTA	2	6	120098	120103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458914
2531	NC_018623	A	6	6	120242	120247	100 %	0 %	0 %	0 %	407458914
2532	NC_018623	AGAA	2	8	120315	120322	75 %	0 %	25 %	0 %	407458915
2533	NC_018623	CCA	2	6	120389	120394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458915
2534	NC_018623	AGAA	2	8	120395	120402	75 %	0 %	25 %	0 %	407458915
2535	NC_018623	ACT	2	6	120408	120413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458915
2536	NC_018623	CGT	2	6	120435	120440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458915
2537	NC_018623	GAT	2	6	120452	120457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458915
2538	NC_018623	AAG	2	6	120541	120546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458915
2539	NC_018623	GGT	2	6	120561	120566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458915
2540	NC_018623	TGG	2	6	120647	120652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407458915
2541	NC_018623	TAT	2	6	120707	120712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458915
2542	NC_018623	T	8	8	120736	120743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_018623	ACT	2	6	120753	120758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_018623	TTC	2	6	120838	120843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458916
2545	NC_018623	CAG	2	6	120930	120935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458916
2546	NC_018623	TTG	2	6	120960	120965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458916
2547	NC_018623	A	6	6	121070	121075	100 %	0 %	0 %	0 %	407458916
2548	NC_018623	TAC	2	6	121222	121227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458916
2549	NC_018623	AGA	2	6	121276	121281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458916
2550	NC_018623	ACC	2	6	121292	121297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407458916
2551	NC_018623	CGC	2	6	121303	121308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407458916
2552	NC_018623	CA	3	6	121315	121320	50 %	0 %	0 %	50 %	407458916
2553	NC_018623	A	7	7	121342	121348	100 %	0 %	0 %	0 %	407458916
2554	NC_018623	GAA	2	6	121532	121537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458916
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2558	NC_018623	TCT	2	6	121613	121618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458916
2559	NC_018623	TTC	2	6	121639	121644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407458916
2560	NC_018623	TTA	2	6	121745	121750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458916
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2562	NC_018623	AGC	2	6	121869	121874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458917
2563	NC_018623	TGT	2	6	121891	121896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458917
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2565	NC_018623	CTG	2	6	121974	121979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458917
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2570	NC_018623	CTG	2	6	122163	122168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458917
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2574	NC_018623	TAA	2	6	122260	122265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407458917
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2585	NC_018623	ATT	2	6	122528	122533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407458917
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2588	NC_018623	AGA	2	6	122599	122604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458917
2589	NC_018623	TCT	2	6	122637	122642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_018623	T	6	6	122702	122707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_018623	ATTT	2	8	122751	122758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_018623	AAT	2	6	122763	122768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_018623	ATT	2	6	122783	122788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_018623	TGG	2	6	122796	122801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_018623	CTTTT	2	10	122873	122882	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2596	NC_018623	AAAG	2	8	122926	122933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_018623	T	6	6	122942	122947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_018623	T	6	6	122960	122965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_018623	T	6	6	123013	123018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_018623	TTTCTT	2	12	123031	123042	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2601	NC_018623	TAAT	2	8	123095	123102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_018623	GCG	2	6	123121	123126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_018623	TTC	3	9	123184	123192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_018623	AT	3	6	123206	123211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_018623	AAC	2	6	123315	123320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458918
2606	NC_018623	AGCA	2	8	123345	123352	50 %	0 %	25 %	25 %	407458918
2607	NC_018623	TCCT	2	8	123354	123361	0 %	50 %	0 %	50 %	407458918
2608	NC_018623	AGAA	2	8	123411	123418	75 %	0 %	25 %	0 %	407458918
2609	NC_018623	GAGAT	2	10	123429	123438	40 %	20 %	40 %	0 %	407458918
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2612	NC_018623	TGA	2	6	123538	123543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407458918
2613	NC_018623	CAA	2	6	123572	123577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407458918
2614	NC_018623	AAG	2	6	123738	123743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458918
2615	NC_018623	TAC	2	6	123773	123778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407458918
2616	NC_018623	AGA	3	9	123843	123851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407458918
2617	NC_018623	GTT	2	6	123875	123880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458918
2618	NC_018623	TA	4	8	124052	124059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_018623	TTG	2	6	124190	124195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407458919
2620	NC_018623	AGC	2	6	124196	124201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458919
2621	NC_018623	AGC	2	6	124274	124279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407458919
2622	NC_018623	GAG	2	6	124391	124396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407458919
2623	NC_018623	GCT	3	9	124408	124416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407458919
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