MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 2037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018622	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018622	GT	3	6	309	314	0 %	50 %	50 %	0 %	407457549
3	NC_018622	TG	3	6	498	503	0 %	50 %	50 %	0 %	407457549
4	NC_018622	TC	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	407457549
5	NC_018622	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	407457550
6	NC_018622	GT	3	6	1461	1466	0 %	50 %	50 %	0 %	407457550
7	NC_018622	TC	3	6	1584	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	407457550
8	NC_018622	TG	3	6	1888	1893	0 %	50 %	50 %	0 %	407457550
9	NC_018622	GA	3	6	2785	2790	50 %	0 %	50 %	0 %	407457551
10	NC_018622	GA	3	6	3339	3344	50 %	0 %	50 %	0 %	407457552
11	NC_018622	AT	3	6	4226	4231	50 %	50 %	0 %	0 %	407457552
12	NC_018622	CT	3	6	4728	4733	0 %	50 %	0 %	50 %	407457552
13	NC_018622	AC	3	6	6152	6157	50 %	0 %	0 %	50 %	407457553
14	NC_018622	CT	3	6	6468	6473	0 %	50 %	0 %	50 %	407457553
15	NC_018622	GA	3	6	6892	6897	50 %	0 %	50 %	0 %	407457555
16	NC_018622	GT	3	6	7803	7808	0 %	50 %	50 %	0 %	407457555
17	NC_018622	TC	3	6	7874	7879	0 %	50 %	0 %	50 %	407457555
18	NC_018622	AT	3	6	8463	8468	50 %	50 %	0 %	0 %	407457556
19	NC_018622	GT	3	6	8686	8691	0 %	50 %	50 %	0 %	407457556
20	NC_018622	AG	3	6	9229	9234	50 %	0 %	50 %	0 %	407457557
21	NC_018622	TG	3	6	10491	10496	0 %	50 %	50 %	0 %	407457557
22	NC_018622	GT	3	6	10800	10805	0 %	50 %	50 %	0 %	407457557
23	NC_018622	TC	3	6	11261	11266	0 %	50 %	0 %	50 %	407457558
24	NC_018622	AC	3	6	11277	11282	50 %	0 %	0 %	50 %	407457558
25	NC_018622	AT	3	6	11521	11526	50 %	50 %	0 %	0 %	407457558
26	NC_018622	GA	3	6	11600	11605	50 %	0 %	50 %	0 %	407457558
27	NC_018622	AG	3	6	11788	11793	50 %	0 %	50 %	0 %	407457558
28	NC_018622	TC	3	6	11841	11846	0 %	50 %	0 %	50 %	407457558
29	NC_018622	GT	3	6	12056	12061	0 %	50 %	50 %	0 %	407457558
30	NC_018622	AG	3	6	12513	12518	50 %	0 %	50 %	0 %	407457558
31	NC_018622	GA	3	6	12584	12589	50 %	0 %	50 %	0 %	407457558
32	NC_018622	GT	3	6	12865	12870	0 %	50 %	50 %	0 %	407457558
33	NC_018622	TA	3	6	13805	13810	50 %	50 %	0 %	0 %	407457558
34	NC_018622	TA	3	6	13825	13830	50 %	50 %	0 %	0 %	407457558
35	NC_018622	AT	3	6	14109	14114	50 %	50 %	0 %	0 %	407457559
36	NC_018622	CT	3	6	14789	14794	0 %	50 %	0 %	50 %	407457559
37	NC_018622	TA	3	6	15119	15124	50 %	50 %	0 %	0 %	407457559
38	NC_018622	TG	4	8	15657	15664	0 %	50 %	50 %	0 %	407457559
39	NC_018622	AG	3	6	17696	17701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018622	TC	3	6	18952	18957	0 %	50 %	0 %	50 %	407457564
41	NC_018622	GT	3	6	19393	19398	0 %	50 %	50 %	0 %	407457564
42	NC_018622	TA	3	6	19437	19442	50 %	50 %	0 %	0 %	407457564
43	NC_018622	TC	3	6	19543	19548	0 %	50 %	0 %	50 %	407457564
44	NC_018622	GT	3	6	19672	19677	0 %	50 %	50 %	0 %	407457564
45	NC_018622	AC	3	6	20113	20118	50 %	0 %	0 %	50 %	407457564
46	NC_018622	TC	3	6	21144	21149	0 %	50 %	0 %	50 %	407457565
47	NC_018622	GA	3	6	22446	22451	50 %	0 %	50 %	0 %	407457566
48	NC_018622	GA	3	6	23669	23674	50 %	0 %	50 %	0 %	407457566
49	NC_018622	AT	3	6	24449	24454	50 %	50 %	0 %	0 %	407457567
50	NC_018622	TC	3	6	24510	24515	0 %	50 %	0 %	50 %	407457567
51	NC_018622	AG	3	6	25609	25614	50 %	0 %	50 %	0 %	407457567
52	NC_018622	TA	3	6	26512	26517	50 %	50 %	0 %	0 %	407457567
53	NC_018622	TA	3	6	27372	27377	50 %	50 %	0 %	0 %	407457568
54	NC_018622	TC	3	6	27457	27462	0 %	50 %	0 %	50 %	407457568
55	NC_018622	AC	3	6	27625	27630	50 %	0 %	0 %	50 %	407457568
56	NC_018622	TA	3	6	28049	28054	50 %	50 %	0 %	0 %	407457568
57	NC_018622	GA	3	6	28758	28763	50 %	0 %	50 %	0 %	407457568
58	NC_018622	AG	3	6	29920	29925	50 %	0 %	50 %	0 %	407457570
59	NC_018622	AG	3	6	30581	30586	50 %	0 %	50 %	0 %	407457571
60	NC_018622	GA	3	6	31103	31108	50 %	0 %	50 %	0 %	407457572
61	NC_018622	GA	4	8	31233	31240	50 %	0 %	50 %	0 %	407457572
62	NC_018622	TC	3	6	31846	31851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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64	NC_018622	AG	3	6	34606	34611	50 %	0 %	50 %	0 %	407457577
65	NC_018622	AG	3	6	34678	34683	50 %	0 %	50 %	0 %	407457577
66	NC_018622	AT	3	6	34724	34729	50 %	50 %	0 %	0 %	407457577
67	NC_018622	TG	3	6	34813	34818	0 %	50 %	50 %	0 %	407457577
68	NC_018622	CG	3	6	35125	35130	0 %	0 %	50 %	50 %	407457577
69	NC_018622	AT	3	6	35444	35449	50 %	50 %	0 %	0 %	407457577
70	NC_018622	GA	3	6	35925	35930	50 %	0 %	50 %	0 %	407457578
71	NC_018622	TA	3	6	37498	37503	50 %	50 %	0 %	0 %	407457578
72	NC_018622	TC	3	6	37736	37741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018622	GA	3	6	38468	38473	50 %	0 %	50 %	0 %	407457579
74	NC_018622	CG	3	6	38497	38502	0 %	0 %	50 %	50 %	407457579
75	NC_018622	TA	3	6	38503	38508	50 %	50 %	0 %	0 %	407457579
76	NC_018622	GC	3	6	39835	39840	0 %	0 %	50 %	50 %	407457580
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78	NC_018622	GC	3	6	40341	40346	0 %	0 %	50 %	50 %	407457581
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80	NC_018622	AT	3	6	41775	41780	50 %	50 %	0 %	0 %	407457581
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88	NC_018622	AT	3	6	48261	48266	50 %	50 %	0 %	0 %	407457590
89	NC_018622	AT	3	6	48513	48518	50 %	50 %	0 %	0 %	407457590
90	NC_018622	CT	3	6	48570	48575	0 %	50 %	0 %	50 %	407457590
91	NC_018622	TA	3	6	48873	48878	50 %	50 %	0 %	0 %	407457590
92	NC_018622	AG	3	6	49401	49406	50 %	0 %	50 %	0 %	407457590
93	NC_018622	GC	3	6	49970	49975	0 %	0 %	50 %	50 %	407457591
94	NC_018622	TC	3	6	50375	50380	0 %	50 %	0 %	50 %	407457591
95	NC_018622	TA	3	6	50548	50553	50 %	50 %	0 %	0 %	407457591
96	NC_018622	TA	3	6	52210	52215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_018622	CA	3	6	57540	57545	50 %	0 %	0 %	50 %	407457598
104	NC_018622	AT	3	6	58496	58501	50 %	50 %	0 %	0 %	407457599
105	NC_018622	GA	3	6	59324	59329	50 %	0 %	50 %	0 %	407457599
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107	NC_018622	AG	3	6	60603	60608	50 %	0 %	50 %	0 %	407457600
108	NC_018622	GA	3	6	61847	61852	50 %	0 %	50 %	0 %	407457600
109	NC_018622	AG	3	6	62135	62140	50 %	0 %	50 %	0 %	407457600
110	NC_018622	TC	3	6	62587	62592	0 %	50 %	0 %	50 %	407457600
111	NC_018622	AG	3	6	63230	63235	50 %	0 %	50 %	0 %	407457600
112	NC_018622	TG	3	6	63303	63308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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114	NC_018622	TG	3	6	65548	65553	0 %	50 %	50 %	0 %	407457602
115	NC_018622	CA	4	8	65835	65842	50 %	0 %	0 %	50 %	407457602
116	NC_018622	GA	4	8	66574	66581	50 %	0 %	50 %	0 %	407457603
117	NC_018622	AT	3	6	67353	67358	50 %	50 %	0 %	0 %	407457604
118	NC_018622	GA	4	8	67460	67467	50 %	0 %	50 %	0 %	407457604
119	NC_018622	CT	3	6	67538	67543	0 %	50 %	0 %	50 %	407457604
120	NC_018622	AG	3	6	67573	67578	50 %	0 %	50 %	0 %	407457604
121	NC_018622	GT	3	6	68166	68171	0 %	50 %	50 %	0 %	407457604
122	NC_018622	TA	3	6	68607	68612	50 %	50 %	0 %	0 %	407457605
123	NC_018622	TA	3	6	69310	69315	50 %	50 %	0 %	0 %	407457605
124	NC_018622	AG	3	6	70233	70238	50 %	0 %	50 %	0 %	407457607
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126	NC_018622	GT	3	6	72032	72037	0 %	50 %	50 %	0 %	407457609
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132	NC_018622	TC	3	6	76328	76333	0 %	50 %	0 %	50 %	407457614
133	NC_018622	TC	3	6	76431	76436	0 %	50 %	0 %	50 %	407457614
134	NC_018622	CA	3	6	76566	76571	50 %	0 %	0 %	50 %	407457614
135	NC_018622	CT	3	6	76754	76759	0 %	50 %	0 %	50 %	407457614
136	NC_018622	CG	3	6	76864	76869	0 %	0 %	50 %	50 %	407457614
137	NC_018622	GA	3	6	78861	78866	50 %	0 %	50 %	0 %	407457615
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142	NC_018622	AC	3	6	81748	81753	50 %	0 %	0 %	50 %	407457617
143	NC_018622	AC	3	6	81950	81955	50 %	0 %	0 %	50 %	407457618
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