MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 2972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018622	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	407457549
2	NC_018622	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	407457549
3	NC_018622	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	407457550
4	NC_018622	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	407457550
5	NC_018622	TGTT	2	8	2840	2847	0 %	75 %	25 %	0 %	407457551
6	NC_018622	GAAG	2	8	2951	2958	50 %	0 %	50 %	0 %	407457551
7	NC_018622	TTTG	2	8	3299	3306	0 %	75 %	25 %	0 %	407457552
8	NC_018622	TCCT	2	8	3325	3332	0 %	50 %	0 %	50 %	407457552
9	NC_018622	TGGT	2	8	3490	3497	0 %	50 %	50 %	0 %	407457552
10	NC_018622	GAAA	2	8	5254	5261	75 %	0 %	25 %	0 %	407457552
11	NC_018622	AATC	2	8	5413	5420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018622	CGAG	2	8	5525	5532	25 %	0 %	50 %	25 %	407457553
13	NC_018622	TAAT	2	8	6731	6738	50 %	50 %	0 %	0 %	407457554
14	NC_018622	GAAT	2	8	6851	6858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018622	AGAA	2	8	6963	6970	75 %	0 %	25 %	0 %	407457555
16	NC_018622	TCCC	2	8	7280	7287	0 %	25 %	0 %	75 %	407457555
17	NC_018622	GTAG	2	8	7314	7321	25 %	25 %	50 %	0 %	407457555
18	NC_018622	AATA	2	8	8011	8018	75 %	25 %	0 %	0 %	407457556
19	NC_018622	ATGA	2	8	8482	8489	50 %	25 %	25 %	0 %	407457556
20	NC_018622	TGGA	2	8	8670	8677	25 %	25 %	50 %	0 %	407457556
21	NC_018622	CTGT	2	8	8680	8687	0 %	50 %	25 %	25 %	407457556
22	NC_018622	ATTT	2	8	9401	9408	25 %	75 %	0 %	0 %	407457557
23	NC_018622	AAAG	2	8	10225	10232	75 %	0 %	25 %	0 %	407457557
24	NC_018622	AAGT	2	8	10524	10531	50 %	25 %	25 %	0 %	407457557
25	NC_018622	AGGG	2	8	10763	10770	25 %	0 %	75 %	0 %	407457557
26	NC_018622	TAAG	2	8	10773	10780	50 %	25 %	25 %	0 %	407457557
27	NC_018622	AAAG	2	8	11066	11073	75 %	0 %	25 %	0 %	407457558
28	NC_018622	AGTA	2	8	11724	11731	50 %	25 %	25 %	0 %	407457558
29	NC_018622	TCTT	2	8	12005	12012	0 %	75 %	0 %	25 %	407457558
30	NC_018622	TAAT	2	8	12146	12153	50 %	50 %	0 %	0 %	407457558
31	NC_018622	CAAA	2	8	12457	12464	75 %	0 %	0 %	25 %	407457558
32	NC_018622	AGAT	2	8	12567	12574	50 %	25 %	25 %	0 %	407457558
33	NC_018622	AAGA	2	8	12578	12585	75 %	0 %	25 %	0 %	407457558
34	NC_018622	ACTT	2	8	12700	12707	25 %	50 %	0 %	25 %	407457558
35	NC_018622	CACT	2	8	12797	12804	25 %	25 %	0 %	50 %	407457558
36	NC_018622	GCAA	2	8	13325	13332	50 %	0 %	25 %	25 %	407457558
37	NC_018622	GAAA	2	8	13745	13752	75 %	0 %	25 %	0 %	407457558
38	NC_018622	AGAT	2	8	14314	14321	50 %	25 %	25 %	0 %	407457559
39	NC_018622	TTGT	2	8	14364	14371	0 %	75 %	25 %	0 %	407457559
40	NC_018622	GGAT	2	8	14948	14955	25 %	25 %	50 %	0 %	407457559
41	NC_018622	CCCA	2	8	15419	15426	25 %	0 %	0 %	75 %	407457559
42	NC_018622	TAAA	2	8	17023	17030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018622	AGAA	2	8	17163	17170	75 %	0 %	25 %	0 %	407457561
44	NC_018622	TCTT	2	8	17433	17440	0 %	75 %	0 %	25 %	407457561
45	NC_018622	TTTC	2	8	17680	17687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018622	GTCA	2	8	17836	17843	25 %	25 %	25 %	25 %	407457562
47	NC_018622	AAGC	2	8	18227	18234	50 %	0 %	25 %	25 %	407457562
48	NC_018622	ATTA	2	8	18367	18374	50 %	50 %	0 %	0 %	407457562
49	NC_018622	ATTA	2	8	18989	18996	50 %	50 %	0 %	0 %	407457564
50	NC_018622	GTTT	2	8	19262	19269	0 %	75 %	25 %	0 %	407457564
51	NC_018622	TTTG	2	8	19502	19509	0 %	75 %	25 %	0 %	407457564
52	NC_018622	TGCC	2	8	19534	19541	0 %	25 %	25 %	50 %	407457564
53	NC_018622	GCGT	2	8	19666	19673	0 %	25 %	50 %	25 %	407457564
54	NC_018622	TGGT	2	8	20447	20454	0 %	50 %	50 %	0 %	407457565
55	NC_018622	TAAA	2	8	21087	21094	75 %	25 %	0 %	0 %	407457565
56	NC_018622	TATG	2	8	21586	21593	25 %	50 %	25 %	0 %	407457565
57	NC_018622	CAAT	2	8	22281	22288	50 %	25 %	0 %	25 %	407457566
58	NC_018622	AGAA	2	8	22698	22705	75 %	0 %	25 %	0 %	407457566
59	NC_018622	TGAT	2	8	22905	22912	25 %	50 %	25 %	0 %	407457566
60	NC_018622	TGTC	2	8	24055	24062	0 %	50 %	25 %	25 %	407457567
61	NC_018622	AGCT	2	8	24168	24175	25 %	25 %	25 %	25 %	407457567
62	NC_018622	AATT	2	8	24627	24634	50 %	50 %	0 %	0 %	407457567
63	NC_018622	ATAA	2	8	24694	24701	75 %	25 %	0 %	0 %	407457567
64	NC_018622	TCTG	2	8	24926	24933	0 %	50 %	25 %	25 %	407457567
65	NC_018622	TAGT	2	8	24983	24990	25 %	50 %	25 %	0 %	407457567
66	NC_018622	TTGC	2	8	25254	25261	0 %	50 %	25 %	25 %	407457567
67	NC_018622	GAAC	2	8	25442	25449	50 %	0 %	25 %	25 %	407457567
68	NC_018622	GAGT	2	8	25626	25633	25 %	25 %	50 %	0 %	407457567
69	NC_018622	TCAT	2	8	25790	25797	25 %	50 %	0 %	25 %	407457567
70	NC_018622	TCTT	2	8	26015	26022	0 %	75 %	0 %	25 %	407457567
71	NC_018622	ATAG	2	8	26108	26115	50 %	25 %	25 %	0 %	407457567
72	NC_018622	TAAA	2	8	26472	26479	75 %	25 %	0 %	0 %	407457567
73	NC_018622	ATTT	2	8	26654	26661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018622	ATTA	2	8	26665	26672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018622	CTGG	2	8	27185	27192	0 %	25 %	50 %	25 %	407457568
76	NC_018622	AATC	2	8	27721	27728	50 %	25 %	0 %	25 %	407457568
77	NC_018622	AATT	2	8	27958	27965	50 %	50 %	0 %	0 %	407457568
78	NC_018622	AGAT	2	8	28452	28459	50 %	25 %	25 %	0 %	407457568
79	NC_018622	ATCG	2	8	28583	28590	25 %	25 %	25 %	25 %	407457568
80	NC_018622	AAAT	2	8	28804	28811	75 %	25 %	0 %	0 %	407457568
81	NC_018622	GTGA	2	8	29027	29034	25 %	25 %	50 %	0 %	407457568
82	NC_018622	GGCA	2	8	29082	29089	25 %	0 %	50 %	25 %	407457568
83	NC_018622	AGGG	2	8	29426	29433	25 %	0 %	75 %	0 %	407457569
84	NC_018622	GAAT	2	8	29620	29627	50 %	25 %	25 %	0 %	407457570
85	NC_018622	ACCA	2	8	30235	30242	50 %	0 %	0 %	50 %	407457570
86	NC_018622	GTTT	2	8	31406	31413	0 %	75 %	25 %	0 %	407457572
87	NC_018622	TTTC	2	8	31646	31653	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018622	TCTA	2	8	32050	32057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018622	AATT	2	8	32374	32381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018622	TTAA	2	8	32414	32421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018622	ATTT	2	8	32429	32436	25 %	75 %	0 %	0 %	407457574
92	NC_018622	TTGT	2	8	32455	32462	0 %	75 %	25 %	0 %	407457574
93	NC_018622	TAGA	2	8	32661	32668	50 %	25 %	25 %	0 %	407457574
94	NC_018622	TTTA	2	8	33115	33122	25 %	75 %	0 %	0 %	407457574
95	NC_018622	TTAA	2	8	33510	33517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018622	AGAT	2	8	33553	33560	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018622	TTAG	2	8	33608	33615	25 %	50 %	25 %	0 %	407457575
98	NC_018622	TGAA	2	8	34012	34019	50 %	25 %	25 %	0 %	407457576
99	NC_018622	GTAC	2	8	34090	34097	25 %	25 %	25 %	25 %	407457576
100	NC_018622	GATA	2	8	34126	34133	50 %	25 %	25 %	0 %	407457576
101	NC_018622	TCTT	2	8	34386	34393	0 %	75 %	0 %	25 %	407457577
102	NC_018622	AGGA	2	8	35338	35345	50 %	0 %	50 %	0 %	407457577
103	NC_018622	TAAT	2	8	36126	36133	50 %	50 %	0 %	0 %	407457578
104	NC_018622	CGCT	2	8	36842	36849	0 %	25 %	25 %	50 %	407457578
105	NC_018622	TCAA	2	8	37775	37782	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018622	AAAG	2	8	38197	38204	75 %	0 %	25 %	0 %	407457579
107	NC_018622	TAAT	2	8	38213	38220	50 %	50 %	0 %	0 %	407457579
108	NC_018622	TCAA	2	8	38349	38356	50 %	25 %	0 %	25 %	407457579
109	NC_018622	TTTA	2	8	38682	38689	25 %	75 %	0 %	0 %	407457579
110	NC_018622	CTTT	2	8	38812	38819	0 %	75 %	0 %	25 %	407457579
111	NC_018622	AGCG	2	8	39001	39008	25 %	0 %	50 %	25 %	407457579
112	NC_018622	GAAA	2	8	41238	41245	75 %	0 %	25 %	0 %	407457581
113	NC_018622	AGCA	2	8	41409	41416	50 %	0 %	25 %	25 %	407457581
114	NC_018622	CTGT	2	8	41877	41884	0 %	50 %	25 %	25 %	407457581
115	NC_018622	TCTT	2	8	41917	41924	0 %	75 %	0 %	25 %	407457581
116	NC_018622	GAAG	2	8	42328	42335	50 %	0 %	50 %	0 %	407457581
117	NC_018622	AATA	2	8	42359	42366	75 %	25 %	0 %	0 %	407457581
118	NC_018622	GAAA	2	8	43496	43503	75 %	0 %	25 %	0 %	407457585
119	NC_018622	GTCG	2	8	44194	44201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018622	TTAA	2	8	44224	44231	50 %	50 %	0 %	0 %	407457586
121	NC_018622	ATCA	2	8	44813	44820	50 %	25 %	0 %	25 %	407457586
122	NC_018622	ATGA	2	8	45091	45098	50 %	25 %	25 %	0 %	407457586
123	NC_018622	TAAA	2	8	45990	45997	75 %	25 %	0 %	0 %	407457587
124	NC_018622	GAAA	2	8	46972	46979	75 %	0 %	25 %	0 %	407457589
125	NC_018622	TCTT	2	8	47078	47085	0 %	75 %	0 %	25 %	407457589
126	NC_018622	GCTT	2	8	47607	47614	0 %	50 %	25 %	25 %	407457589
127	NC_018622	AAGA	2	8	48049	48056	75 %	0 %	25 %	0 %	407457590
128	NC_018622	TGTT	2	8	48459	48466	0 %	75 %	25 %	0 %	407457590
129	NC_018622	ATAA	2	8	49527	49534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018622	TAAA	2	8	49696	49703	75 %	25 %	0 %	0 %	407457591
131	NC_018622	AAGC	2	8	49725	49732	50 %	0 %	25 %	25 %	407457591
132	NC_018622	CCAA	2	8	49749	49756	50 %	0 %	0 %	50 %	407457591
133	NC_018622	TTCC	2	8	49896	49903	0 %	50 %	0 %	50 %	407457591
134	NC_018622	AACA	2	8	50873	50880	75 %	0 %	0 %	25 %	407457591
135	NC_018622	AAAG	2	8	52607	52614	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018622	TTTA	2	8	52617	52624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018622	GAAG	2	8	52720	52727	50 %	0 %	50 %	0 %	407457592
138	NC_018622	ATCC	2	8	53026	53033	25 %	25 %	0 %	50 %	407457593
139	NC_018622	AGCA	2	8	53318	53325	50 %	0 %	25 %	25 %	407457593
140	NC_018622	TTCA	2	8	53478	53485	25 %	50 %	0 %	25 %	407457593
141	NC_018622	GTAT	2	8	54131	54138	25 %	50 %	25 %	0 %	407457594
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