MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018622	AGTC	2	8	119219	119226	25 %	25 %	25 %	25 %	407457668
2502	NC_018622	ATG	2	6	119230	119235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457668
2503	NC_018622	ATT	2	6	119368	119373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457668
2504	NC_018622	AGA	2	6	119427	119432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457668
2505	NC_018622	ATC	2	6	119443	119448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457668
2506	NC_018622	TTA	2	6	119467	119472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457668
2507	NC_018622	ATT	2	6	119517	119522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457668
2508	NC_018622	TGG	2	6	119565	119570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457668
2509	NC_018622	AAG	2	6	119603	119608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457668
2510	NC_018622	TAC	2	6	119706	119711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457668
2511	NC_018622	CGT	2	6	119778	119783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457668
2512	NC_018622	AGA	2	6	119802	119807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457668
2513	NC_018622	AAG	2	6	119882	119887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457668
2514	NC_018622	A	6	6	119936	119941	100 %	0 %	0 %	0 %	407457668
2515	NC_018622	GAA	2	6	119949	119954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457668
2516	NC_018622	GAA	2	6	119965	119970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457668
2517	NC_018622	TTC	2	6	120005	120010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457668
2518	NC_018622	AGTT	2	8	120014	120021	25 %	50 %	25 %	0 %	407457668
2519	NC_018622	TTA	2	6	120104	120109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457668
2520	NC_018622	A	6	6	120248	120253	100 %	0 %	0 %	0 %	407457668
2521	NC_018622	AGAA	2	8	120321	120328	75 %	0 %	25 %	0 %	407457669
2522	NC_018622	CCA	2	6	120395	120400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457669
2523	NC_018622	AGAA	2	8	120401	120408	75 %	0 %	25 %	0 %	407457669
2524	NC_018622	ACT	2	6	120414	120419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457669
2525	NC_018622	CGT	2	6	120441	120446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457669
2526	NC_018622	GAT	2	6	120458	120463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457669
2527	NC_018622	AAG	2	6	120547	120552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457669
2528	NC_018622	GGT	2	6	120567	120572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457669
2529	NC_018622	TGG	2	6	120653	120658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457669
2530	NC_018622	TAT	2	6	120713	120718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457669
2531	NC_018622	T	8	8	120742	120749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_018622	ACT	2	6	120759	120764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_018622	TTC	2	6	120844	120849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457670
2534	NC_018622	CAG	2	6	120936	120941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457670
2535	NC_018622	TTG	2	6	120966	120971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457670
2536	NC_018622	A	6	6	121076	121081	100 %	0 %	0 %	0 %	407457670
2537	NC_018622	TAC	2	6	121228	121233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457670
2538	NC_018622	AGA	2	6	121282	121287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457670
2539	NC_018622	ACC	2	6	121298	121303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457670
2540	NC_018622	CGC	2	6	121309	121314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407457670
2541	NC_018622	CA	3	6	121321	121326	50 %	0 %	0 %	50 %	407457670
2542	NC_018622	A	7	7	121348	121354	100 %	0 %	0 %	0 %	407457670
2543	NC_018622	GAA	2	6	121538	121543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457670
2544	NC_018622	GTT	2	6	121553	121558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457670
2545	NC_018622	AAG	2	6	121560	121565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457670
2546	NC_018622	AAG	2	6	121608	121613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457670
2547	NC_018622	TCT	2	6	121619	121624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457670
2548	NC_018622	TTC	2	6	121645	121650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457670
2549	NC_018622	TTA	2	6	121751	121756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457670
2550	NC_018622	TAAA	2	8	121777	121784	75 %	25 %	0 %	0 %	407457670
2551	NC_018622	AGC	2	6	121875	121880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457671
2552	NC_018622	TGT	2	6	121897	121902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457671
2553	NC_018622	T	6	6	121939	121944	0 %	100 %	0 %	0 %	407457671
2554	NC_018622	CTG	2	6	121980	121985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457671
2555	NC_018622	AATTA	2	10	122083	122092	60 %	40 %	0 %	0 %	407457671
2556	NC_018622	AGC	2	6	122098	122103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457671
2557	NC_018622	GAA	2	6	122120	122125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457671
2558	NC_018622	CTC	2	6	122154	122159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457671
2559	NC_018622	CTG	2	6	122169	122174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457671
2560	NC_018622	CTC	2	6	122181	122186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457671
2561	NC_018622	AGA	2	6	122238	122243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457671
2562	NC_018622	A	7	7	122258	122264	100 %	0 %	0 %	0 %	407457671
2563	NC_018622	TAA	2	6	122266	122271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457671
2564	NC_018622	AGT	2	6	122284	122289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457671
2565	NC_018622	ATC	2	6	122293	122298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457671
2566	NC_018622	ATT	2	6	122306	122311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457671
2567	NC_018622	GAA	2	6	122324	122329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457671
2568	NC_018622	GAA	2	6	122336	122341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457671
2569	NC_018622	AAAT	2	8	122350	122357	75 %	25 %	0 %	0 %	407457671
2570	NC_018622	AGA	2	6	122367	122372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457671
2571	NC_018622	ATT	2	6	122380	122385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457671
2572	NC_018622	CCT	2	6	122387	122392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457671
2573	NC_018622	AATT	2	8	122400	122407	50 %	50 %	0 %	0 %	407457671
2574	NC_018622	ATT	2	6	122534	122539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457671
2575	NC_018622	GAA	3	9	122546	122554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457671
2576	NC_018622	CTT	2	6	122592	122597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457671
2577	NC_018622	AGA	2	6	122605	122610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457671
2578	NC_018622	TCT	2	6	122643	122648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_018622	T	6	6	122708	122713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_018622	ATTT	2	8	122757	122764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_018622	AAT	2	6	122769	122774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_018622	ATT	2	6	122789	122794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_018622	TGG	2	6	122802	122807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_018622	CTTTT	2	10	122879	122888	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2585	NC_018622	AAAG	2	8	122932	122939	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_018622	T	6	6	122948	122953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_018622	T	6	6	122966	122971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_018622	T	6	6	123019	123024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_018622	TTTCTT	2	12	123037	123048	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2590	NC_018622	TAAT	2	8	123101	123108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_018622	GCG	2	6	123127	123132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_018622	TTC	3	9	123190	123198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_018622	AT	3	6	123212	123217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_018622	AAC	2	6	123321	123326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457672
2595	NC_018622	AGCA	2	8	123351	123358	50 %	0 %	25 %	25 %	407457672
2596	NC_018622	TCCT	2	8	123360	123367	0 %	50 %	0 %	50 %	407457672
2597	NC_018622	AGAA	2	8	123417	123424	75 %	0 %	25 %	0 %	407457672
2598	NC_018622	GAGAT	2	10	123435	123444	40 %	20 %	40 %	0 %	407457672
2599	NC_018622	ACA	2	6	123490	123495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457672
2600	NC_018622	CAA	2	6	123515	123520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457672
2601	NC_018622	TGA	2	6	123544	123549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457672
2602	NC_018622	CAA	2	6	123578	123583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457672
2603	NC_018622	AAG	2	6	123744	123749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457672
2604	NC_018622	TAC	2	6	123779	123784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457672
2605	NC_018622	AGA	3	9	123849	123857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457672
2606	NC_018622	TTG	2	6	123882	123887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457672
2607	NC_018622	CTTA	2	8	124032	124039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2608	NC_018622	TA	4	8	124058	124065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_018622	TTG	2	6	124196	124201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457673
2610	NC_018622	AGC	2	6	124202	124207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457673
2611	NC_018622	AGC	2	6	124280	124285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457673
2612	NC_018622	GAG	2	6	124397	124402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457673
2613	NC_018622	GCT	3	9	124414	124422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457673
2614	NC_018622	AG	3	6	124466	124471	50 %	0 %	50 %	0 %	407457673
2615	NC_018622	TGT	2	6	124473	124478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457673
2616	NC_018622	TGCATT	2	12	124578	124589	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407457673
2617	NC_018622	GTG	2	6	124657	124662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457674
2618	NC_018622	CTTA	2	8	124665	124672	25 %	50 %	0 %	25 %	407457674
2619	NC_018622	GTCAA	2	10	124754	124763	40 %	20 %	20 %	20 %	407457674
2620	NC_018622	TATACT	2	12	124785	124796	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407457674
2621	NC_018622	GTT	2	6	124797	124802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457674
2622	NC_018622	GAA	2	6	124994	124999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457674
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2855	NC_018622	A	7	7	135736	135742	100 %	0 %	0 %	0 %	407457682
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2873	NC_018622	GCAA	2	8	136465	136472	50 %	0 %	25 %	25 %	407457682
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2999	NC_018622	ATT	2	6	143359	143364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457690
3000	NC_018622	TAC	2	6	143377	143382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457690

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