MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018622	ATA	2	6	70702	70707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457608
1502	NC_018622	AGG	2	6	70825	70830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457608
1503	NC_018622	GAA	3	9	70872	70880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457608
1504	NC_018622	T	7	7	70904	70910	0 %	100 %	0 %	0 %	407457608
1505	NC_018622	GGATA	2	10	70945	70954	40 %	20 %	40 %	0 %	407457608
1506	NC_018622	TTC	2	6	71015	71020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457608
1507	NC_018622	T	7	7	71070	71076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_018622	A	7	7	71120	71126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_018622	CACTT	2	10	71128	71137	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1510	NC_018622	ATA	2	6	71236	71241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_018622	AAT	2	6	71289	71294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457609
1512	NC_018622	ACA	2	6	71309	71314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457609
1513	NC_018622	TCG	2	6	71337	71342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457609
1514	NC_018622	TGT	2	6	71412	71417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457609
1515	NC_018622	TAT	2	6	71449	71454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457609
1516	NC_018622	TGT	2	6	71517	71522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457609
1517	NC_018622	TCA	2	6	71630	71635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457609
1518	NC_018622	A	6	6	71680	71685	100 %	0 %	0 %	0 %	407457609
1519	NC_018622	T	6	6	71714	71719	0 %	100 %	0 %	0 %	407457609
1520	NC_018622	A	6	6	71738	71743	100 %	0 %	0 %	0 %	407457609
1521	NC_018622	GA	3	6	71756	71761	50 %	0 %	50 %	0 %	407457609
1522	NC_018622	ATC	2	6	71833	71838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457609
1523	NC_018622	AAG	2	6	71870	71875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457609
1524	NC_018622	TGT	2	6	71885	71890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457609
1525	NC_018622	AAC	2	6	71904	71909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457609
1526	NC_018622	GT	3	6	72032	72037	0 %	50 %	50 %	0 %	407457609
1527	NC_018622	GAA	2	6	72055	72060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457609
1528	NC_018622	AGA	2	6	72075	72080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457609
1529	NC_018622	GAA	2	6	72090	72095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457609
1530	NC_018622	T	6	6	72121	72126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_018622	GTAT	2	8	72151	72158	25 %	50 %	25 %	0 %	407457610
1532	NC_018622	TGTT	2	8	72172	72179	0 %	75 %	25 %	0 %	407457610
1533	NC_018622	T	6	6	72204	72209	0 %	100 %	0 %	0 %	407457610
1534	NC_018622	AGA	2	6	72231	72236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457610
1535	NC_018622	T	7	7	72269	72275	0 %	100 %	0 %	0 %	407457610
1536	NC_018622	TGC	2	6	72300	72305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457610
1537	NC_018622	CAG	2	6	72337	72342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457610
1538	NC_018622	CAA	2	6	72399	72404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457610
1539	NC_018622	ATG	2	6	72419	72424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457610
1540	NC_018622	ACA	2	6	72449	72454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457610
1541	NC_018622	TCA	2	6	72563	72568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457610
1542	NC_018622	ATA	3	9	72649	72657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457610
1543	NC_018622	CAG	2	6	72666	72671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457610
1544	NC_018622	GAT	2	6	72735	72740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457610
1545	NC_018622	T	7	7	72835	72841	0 %	100 %	0 %	0 %	407457610
1546	NC_018622	ATAA	2	8	72885	72892	75 %	25 %	0 %	0 %	407457610
1547	NC_018622	AGC	2	6	72908	72913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457610
1548	NC_018622	TAGGGC	2	12	72919	72930	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407457610
1549	NC_018622	CCTGAT	2	12	72944	72955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407457610
1550	NC_018622	T	8	8	73029	73036	0 %	100 %	0 %	0 %	407457610
1551	NC_018622	T	7	7	73066	73072	0 %	100 %	0 %	0 %	407457610
1552	NC_018622	TCAT	2	8	73097	73104	25 %	50 %	0 %	25 %	407457610
1553	NC_018622	GTA	2	6	73196	73201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457611
1554	NC_018622	GCA	2	6	73202	73207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457611
1555	NC_018622	CTGC	2	8	73359	73366	0 %	25 %	25 %	50 %	407457611
1556	NC_018622	ACG	2	6	73401	73406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457611
1557	NC_018622	TGT	2	6	73505	73510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457611
1558	NC_018622	GTAA	2	8	73542	73549	50 %	25 %	25 %	0 %	407457611
1559	NC_018622	AAT	2	6	73655	73660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457611
1560	NC_018622	T	6	6	73665	73670	0 %	100 %	0 %	0 %	407457611
1561	NC_018622	TAG	2	6	73678	73683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457611
1562	NC_018622	GT	3	6	73694	73699	0 %	50 %	50 %	0 %	407457611
1563	NC_018622	TTG	2	6	73718	73723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457611
1564	NC_018622	TTC	2	6	73830	73835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457611
1565	NC_018622	TAA	2	6	73880	73885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457611
1566	NC_018622	AAT	2	6	73934	73939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457611
1567	NC_018622	CAA	2	6	73981	73986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457611
1568	NC_018622	TTA	3	9	74088	74096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_018622	ACAA	2	8	74247	74254	75 %	0 %	0 %	25 %	407457612
1570	NC_018622	A	6	6	74298	74303	100 %	0 %	0 %	0 %	407457612
1571	NC_018622	TTAT	2	8	74332	74339	25 %	75 %	0 %	0 %	407457612
1572	NC_018622	ATT	2	6	74368	74373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457612
1573	NC_018622	ATAGC	2	10	74384	74393	40 %	20 %	20 %	20 %	407457612
1574	NC_018622	T	6	6	74467	74472	0 %	100 %	0 %	0 %	407457612
1575	NC_018622	GGA	2	6	74557	74562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457612
1576	NC_018622	GA	3	6	74636	74641	50 %	0 %	50 %	0 %	407457612
1577	NC_018622	TTTA	2	8	74690	74697	25 %	75 %	0 %	0 %	407457612
1578	NC_018622	GAA	2	6	74776	74781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457612
1579	NC_018622	TGTTTC	2	12	75000	75011	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	407457613
1580	NC_018622	CCT	2	6	75092	75097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457613
1581	NC_018622	TAGT	2	8	75209	75216	25 %	50 %	25 %	0 %	407457613
1582	NC_018622	TC	3	6	75224	75229	0 %	50 %	0 %	50 %	407457613
1583	NC_018622	G	6	6	75237	75242	0 %	0 %	100 %	0 %	407457613
1584	NC_018622	TCT	2	6	75260	75265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457613
1585	NC_018622	TGC	2	6	75336	75341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457613
1586	NC_018622	TCG	2	6	75350	75355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457613
1587	NC_018622	ATT	3	9	75364	75372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457613
1588	NC_018622	GGA	2	6	75547	75552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457613
1589	NC_018622	AGAA	2	8	75579	75586	75 %	0 %	25 %	0 %	407457613
1590	NC_018622	CTTA	2	8	75593	75600	25 %	50 %	0 %	25 %	407457613
1591	NC_018622	ATT	2	6	75604	75609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457613
1592	NC_018622	TTC	2	6	75708	75713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457613
1593	NC_018622	TGG	2	6	75741	75746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457613
1594	NC_018622	CTG	2	6	75857	75862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457613
1595	NC_018622	CAA	2	6	75902	75907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457613
1596	NC_018622	ATT	2	6	75976	75981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457613
1597	NC_018622	CAG	2	6	76016	76021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457613
1598	NC_018622	TC	3	6	76029	76034	0 %	50 %	0 %	50 %	407457613
1599	NC_018622	ATC	2	6	76085	76090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_018622	AGA	2	6	76144	76149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457614
1601	NC_018622	A	7	7	76149	76155	100 %	0 %	0 %	0 %	407457614
1602	NC_018622	TGA	2	6	76207	76212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457614
1603	NC_018622	AATT	2	8	76240	76247	50 %	50 %	0 %	0 %	407457614
1604	NC_018622	GC	3	6	76261	76266	0 %	0 %	50 %	50 %	407457614
1605	NC_018622	GAA	2	6	76316	76321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457614
1606	NC_018622	TC	3	6	76328	76333	0 %	50 %	0 %	50 %	407457614
1607	NC_018622	TGT	2	6	76339	76344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457614
1608	NC_018622	CAT	2	6	76370	76375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457614
1609	NC_018622	TC	3	6	76431	76436	0 %	50 %	0 %	50 %	407457614
1610	NC_018622	GTT	2	6	76447	76452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457614
1611	NC_018622	TCCA	2	8	76470	76477	25 %	25 %	0 %	50 %	407457614
1612	NC_018622	GAA	2	6	76481	76486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457614
1613	NC_018622	TGC	2	6	76510	76515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457614
1614	NC_018622	TCC	2	6	76523	76528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457614
1615	NC_018622	ATG	2	6	76548	76553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457614
1616	NC_018622	CA	3	6	76566	76571	50 %	0 %	0 %	50 %	407457614
1617	NC_018622	CGG	2	6	76620	76625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407457614
1618	NC_018622	TCT	2	6	76630	76635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457614
1619	NC_018622	GGT	2	6	76709	76714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457614
1620	NC_018622	CT	3	6	76754	76759	0 %	50 %	0 %	50 %	407457614
1621	NC_018622	AGG	2	6	76783	76788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457614
1622	NC_018622	GAA	2	6	76844	76849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457614
1623	NC_018622	CG	3	6	76864	76869	0 %	0 %	50 %	50 %	407457614
1624	NC_018622	AGC	2	6	76890	76895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457614
1625	NC_018622	TTC	2	6	76911	76916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457614
1626	NC_018622	TCA	2	6	77060	77065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457614
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1628	NC_018622	AGT	2	6	77170	77175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457614
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