MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018622	CAA	2	6	45427	45432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457586
1002	NC_018622	GCT	2	6	45600	45605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457587
1003	NC_018622	A	6	6	45617	45622	100 %	0 %	0 %	0 %	407457587
1004	NC_018622	A	6	6	45634	45639	100 %	0 %	0 %	0 %	407457587
1005	NC_018622	AG	3	6	45651	45656	50 %	0 %	50 %	0 %	407457587
1006	NC_018622	GTT	2	6	45714	45719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457587
1007	NC_018622	GAA	4	12	45735	45746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457587
1008	NC_018622	AGC	2	6	45776	45781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457587
1009	NC_018622	AGA	3	9	45830	45838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457587
1010	NC_018622	AGA	2	6	45857	45862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457587
1011	NC_018622	AAG	2	6	45871	45876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457587
1012	NC_018622	AGA	2	6	45884	45889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457587
1013	NC_018622	A	9	9	45948	45956	100 %	0 %	0 %	0 %	407457587
1014	NC_018622	TAAA	2	8	45990	45997	75 %	25 %	0 %	0 %	407457587
1015	NC_018622	ACA	2	6	46042	46047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457588
1016	NC_018622	TCTTT	2	10	46089	46098	0 %	80 %	0 %	20 %	407457588
1017	NC_018622	CAA	2	6	46109	46114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457588
1018	NC_018622	AAG	2	6	46161	46166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457588
1019	NC_018622	GTG	2	6	46170	46175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457588
1020	NC_018622	TGA	2	6	46177	46182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457588
1021	NC_018622	AGA	2	6	46192	46197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457588
1022	NC_018622	TCT	2	6	46214	46219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457588
1023	NC_018622	AGA	3	9	46222	46230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457588
1024	NC_018622	AGA	2	6	46234	46239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457588
1025	NC_018622	CAG	2	6	46272	46277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457588
1026	NC_018622	GTT	2	6	46319	46324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457588
1027	NC_018622	CAG	2	6	46427	46432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457588
1028	NC_018622	TAG	2	6	46434	46439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457588
1029	NC_018622	GAT	2	6	46547	46552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457588
1030	NC_018622	AAT	2	6	46586	46591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457588
1031	NC_018622	A	6	6	46624	46629	100 %	0 %	0 %	0 %	407457588
1032	NC_018622	GAA	2	6	46691	46696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457588
1033	NC_018622	TGC	2	6	46720	46725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457588
1034	NC_018622	AAG	2	6	46758	46763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457588
1035	NC_018622	CAG	4	12	46772	46783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457588
1036	NC_018622	GAA	2	6	46814	46819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457588
1037	NC_018622	AGC	2	6	46852	46857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457589
1038	NC_018622	TCC	2	6	46936	46941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457589
1039	NC_018622	GAAA	2	8	46972	46979	75 %	0 %	25 %	0 %	407457589
1040	NC_018622	AGA	2	6	46990	46995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457589
1041	NC_018622	GCT	3	9	47030	47038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457589
1042	NC_018622	CA	3	6	47059	47064	50 %	0 %	0 %	50 %	407457589
1043	NC_018622	TCTT	2	8	47078	47085	0 %	75 %	0 %	25 %	407457589
1044	NC_018622	AGCCC	2	10	47086	47095	20 %	0 %	20 %	60 %	407457589
1045	NC_018622	TCAAA	2	10	47441	47450	60 %	20 %	0 %	20 %	407457589
1046	NC_018622	TCA	2	6	47461	47466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457589
1047	NC_018622	GAA	2	6	47525	47530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457589
1048	NC_018622	CAA	2	6	47534	47539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457589
1049	NC_018622	GTT	2	6	47571	47576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457589
1050	NC_018622	AGA	2	6	47593	47598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457589
1051	NC_018622	GCTT	2	8	47607	47614	0 %	50 %	25 %	25 %	407457589
1052	NC_018622	TTG	2	6	47649	47654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457589
1053	NC_018622	AAG	2	6	47703	47708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457589
1054	NC_018622	GAA	2	6	47717	47722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457589
1055	NC_018622	GCA	2	6	47741	47746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457589
1056	NC_018622	TAG	2	6	47769	47774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457589
1057	NC_018622	TC	4	8	47818	47825	0 %	50 %	0 %	50 %	407457589
1058	NC_018622	AAGA	2	8	48049	48056	75 %	0 %	25 %	0 %	407457590
1059	NC_018622	AAG	2	6	48167	48172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457590
1060	NC_018622	ATT	2	6	48178	48183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457590
1061	NC_018622	TA	3	6	48247	48252	50 %	50 %	0 %	0 %	407457590
1062	NC_018622	AT	3	6	48261	48266	50 %	50 %	0 %	0 %	407457590
1063	NC_018622	TGTT	2	8	48459	48466	0 %	75 %	25 %	0 %	407457590
1064	NC_018622	AT	3	6	48513	48518	50 %	50 %	0 %	0 %	407457590
1065	NC_018622	AAC	2	6	48527	48532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457590
1066	NC_018622	CT	3	6	48570	48575	0 %	50 %	0 %	50 %	407457590
1067	NC_018622	TAA	2	6	48774	48779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457590
1068	NC_018622	AGC	2	6	48803	48808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457590
1069	NC_018622	CAG	2	6	48814	48819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457590
1070	NC_018622	TTG	2	6	48845	48850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457590
1071	NC_018622	CTT	2	6	48858	48863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457590
1072	NC_018622	TA	3	6	48873	48878	50 %	50 %	0 %	0 %	407457590
1073	NC_018622	TAC	2	6	48910	48915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457590
1074	NC_018622	TAT	2	6	48993	48998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457590
1075	NC_018622	A	7	7	49136	49142	100 %	0 %	0 %	0 %	407457590
1076	NC_018622	A	7	7	49185	49191	100 %	0 %	0 %	0 %	407457590
1077	NC_018622	TAC	2	6	49215	49220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457590
1078	NC_018622	AG	3	6	49401	49406	50 %	0 %	50 %	0 %	407457590
1079	NC_018622	GAA	2	6	49507	49512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_018622	ATAA	2	8	49527	49534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_018622	A	6	6	49536	49541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_018622	TCTAT	2	10	49560	49569	20 %	60 %	0 %	20 %	407457591
1083	NC_018622	TGC	2	6	49673	49678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457591
1084	NC_018622	TAAA	2	8	49696	49703	75 %	25 %	0 %	0 %	407457591
1085	NC_018622	A	7	7	49712	49718	100 %	0 %	0 %	0 %	407457591
1086	NC_018622	AAGC	2	8	49725	49732	50 %	0 %	25 %	25 %	407457591
1087	NC_018622	CCAA	2	8	49749	49756	50 %	0 %	0 %	50 %	407457591
1088	NC_018622	A	6	6	49773	49778	100 %	0 %	0 %	0 %	407457591
1089	NC_018622	A	7	7	49838	49844	100 %	0 %	0 %	0 %	407457591
1090	NC_018622	A	6	6	49880	49885	100 %	0 %	0 %	0 %	407457591
1091	NC_018622	TTCC	2	8	49896	49903	0 %	50 %	0 %	50 %	407457591
1092	NC_018622	AAG	2	6	49909	49914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457591
1093	NC_018622	A	6	6	49915	49920	100 %	0 %	0 %	0 %	407457591
1094	NC_018622	GAA	3	9	49944	49952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457591
1095	NC_018622	GC	3	6	49970	49975	0 %	0 %	50 %	50 %	407457591
1096	NC_018622	A	6	6	50016	50021	100 %	0 %	0 %	0 %	407457591
1097	NC_018622	AGA	2	6	50027	50032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457591
1098	NC_018622	AAG	3	9	50053	50061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457591
1099	NC_018622	AAC	2	6	50122	50127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457591
1100	NC_018622	CAA	2	6	50161	50166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457591
1101	NC_018622	AAG	3	9	50167	50175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457591
1102	NC_018622	TTA	2	6	50268	50273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457591
1103	NC_018622	TC	3	6	50375	50380	0 %	50 %	0 %	50 %	407457591
1104	NC_018622	TGT	2	6	50522	50527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457591
1105	NC_018622	TA	3	6	50548	50553	50 %	50 %	0 %	0 %	407457591
1106	NC_018622	ATT	2	6	50580	50585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457591
1107	NC_018622	ATG	2	6	50602	50607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457591
1108	NC_018622	AGC	2	6	50690	50695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457591
1109	NC_018622	TCC	2	6	50859	50864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457591
1110	NC_018622	AACA	2	8	50873	50880	75 %	0 %	0 %	25 %	407457591
1111	NC_018622	ACT	2	6	50891	50896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457591
1112	NC_018622	GAT	2	6	50934	50939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457591
1113	NC_018622	GCA	2	6	50952	50957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457591
1114	NC_018622	ATC	2	6	50966	50971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457591
1115	NC_018622	TCA	2	6	51103	51108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457591
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1117	NC_018622	AGT	2	6	51185	51190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457591
1118	NC_018622	TGA	2	6	51305	51310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457591
1119	NC_018622	CCT	2	6	51384	51389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457591
1120	NC_018622	ATG	2	6	51453	51458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457591
1121	NC_018622	TTTGG	2	10	51474	51483	0 %	60 %	40 %	0 %	407457591
1122	NC_018622	CTC	2	6	51540	51545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457591
1123	NC_018622	CAA	2	6	51612	51617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457591
1124	NC_018622	CAT	2	6	51619	51624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457591
1125	NC_018622	TTG	2	6	51628	51633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457591
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1127	NC_018622	ATT	2	6	51666	51671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457591
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1253	NC_018622	TTC	2	6	57340	57345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457598
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