MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018622	ACA	2	6	23015	23020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457566
502	NC_018622	ACA	2	6	23035	23040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457566
503	NC_018622	AAG	2	6	23049	23054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457566
504	NC_018622	AAG	2	6	23076	23081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457566
505	NC_018622	AAC	2	6	23107	23112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457566
506	NC_018622	GGT	2	6	23159	23164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457566
507	NC_018622	AGC	2	6	23175	23180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457566
508	NC_018622	ATG	2	6	23265	23270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457566
509	NC_018622	AGC	2	6	23282	23287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457566
510	NC_018622	GCT	2	6	23288	23293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457566
511	NC_018622	CTG	2	6	23379	23384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457566
512	NC_018622	ATG	2	6	23580	23585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457566
513	NC_018622	TTA	2	6	23598	23603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457566
514	NC_018622	AAG	2	6	23655	23660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457566
515	NC_018622	GA	3	6	23669	23674	50 %	0 %	50 %	0 %	407457566
516	NC_018622	TTC	2	6	23766	23771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_018622	T	7	7	23802	23808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018622	TGA	3	9	23843	23851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_018622	AAG	2	6	23888	23893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018622	CTA	2	6	23952	23957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457567
521	NC_018622	TTG	2	6	24013	24018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
522	NC_018622	CTG	2	6	24049	24054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457567
523	NC_018622	TGTC	2	8	24055	24062	0 %	50 %	25 %	25 %	407457567
524	NC_018622	AGT	2	6	24067	24072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457567
525	NC_018622	TTG	2	6	24079	24084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
526	NC_018622	TCC	2	6	24118	24123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457567
527	NC_018622	AGCT	2	8	24168	24175	25 %	25 %	25 %	25 %	407457567
528	NC_018622	T	7	7	24219	24225	0 %	100 %	0 %	0 %	407457567
529	NC_018622	TTG	2	6	24352	24357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
530	NC_018622	GAA	2	6	24362	24367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457567
531	NC_018622	GTT	2	6	24378	24383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
532	NC_018622	T	6	6	24387	24392	0 %	100 %	0 %	0 %	407457567
533	NC_018622	AT	3	6	24449	24454	50 %	50 %	0 %	0 %	407457567
534	NC_018622	TC	3	6	24510	24515	0 %	50 %	0 %	50 %	407457567
535	NC_018622	CTT	2	6	24516	24521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457567
536	NC_018622	AGG	2	6	24537	24542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457567
537	NC_018622	GTA	2	6	24550	24555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457567
538	NC_018622	GCA	2	6	24611	24616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457567
539	NC_018622	TTA	2	6	24620	24625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457567
540	NC_018622	AATT	2	8	24627	24634	50 %	50 %	0 %	0 %	407457567
541	NC_018622	ATAA	2	8	24694	24701	75 %	25 %	0 %	0 %	407457567
542	NC_018622	T	8	8	24796	24803	0 %	100 %	0 %	0 %	407457567
543	NC_018622	TGT	2	6	24818	24823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
544	NC_018622	GCT	2	6	24848	24853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457567
545	NC_018622	GCT	2	6	24878	24883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457567
546	NC_018622	CTA	2	6	24905	24910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457567
547	NC_018622	TCTG	2	8	24926	24933	0 %	50 %	25 %	25 %	407457567
548	NC_018622	ACC	2	6	24964	24969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457567
549	NC_018622	TAGT	2	8	24983	24990	25 %	50 %	25 %	0 %	407457567
550	NC_018622	TTG	2	6	25008	25013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
551	NC_018622	TTG	2	6	25018	25023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
552	NC_018622	ATT	2	6	25111	25116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457567
553	NC_018622	T	6	6	25233	25238	0 %	100 %	0 %	0 %	407457567
554	NC_018622	TTGC	2	8	25254	25261	0 %	50 %	25 %	25 %	407457567
555	NC_018622	AGC	2	6	25374	25379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457567
556	NC_018622	TTG	2	6	25387	25392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
557	NC_018622	GAAC	2	8	25442	25449	50 %	0 %	25 %	25 %	407457567
558	NC_018622	GCA	2	6	25508	25513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457567
559	NC_018622	GTT	2	6	25541	25546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
560	NC_018622	CTT	2	6	25587	25592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457567
561	NC_018622	AG	3	6	25609	25614	50 %	0 %	50 %	0 %	407457567
562	NC_018622	GAGT	2	8	25626	25633	25 %	25 %	50 %	0 %	407457567
563	NC_018622	TAA	2	6	25641	25646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457567
564	NC_018622	CTT	3	9	25647	25655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457567
565	NC_018622	CAC	2	6	25656	25661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457567
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567	NC_018622	TTA	2	6	25751	25756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457567
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572	NC_018622	T	6	6	25993	25998	0 %	100 %	0 %	0 %	407457567
573	NC_018622	TCTT	2	8	26015	26022	0 %	75 %	0 %	25 %	407457567
574	NC_018622	T	7	7	26051	26057	0 %	100 %	0 %	0 %	407457567
575	NC_018622	ATAG	2	8	26108	26115	50 %	25 %	25 %	0 %	407457567
576	NC_018622	AAT	2	6	26116	26121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457567
577	NC_018622	TGT	2	6	26209	26214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457567
578	NC_018622	AGG	2	6	26293	26298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457567
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581	NC_018622	TA	3	6	26512	26517	50 %	50 %	0 %	0 %	407457567
582	NC_018622	AGA	2	6	26521	26526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457567
583	NC_018622	ATT	2	6	26534	26539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018622	T	7	7	26577	26583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018622	TTC	2	6	26613	26618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_018622	ATTT	2	8	26654	26661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018622	ATTA	2	8	26665	26672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018622	TTA	2	6	26696	26701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018622	A	6	6	26771	26776	100 %	0 %	0 %	0 %	407457568
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592	NC_018622	TTA	2	6	26822	26827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457568
593	NC_018622	CAA	2	6	26900	26905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457568
594	NC_018622	TGA	2	6	26908	26913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457568
595	NC_018622	AGA	2	6	26956	26961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457568
596	NC_018622	TAA	2	6	26971	26976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457568
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599	NC_018622	ACA	2	6	27112	27117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457568
600	NC_018622	TTA	2	6	27131	27136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457568
601	NC_018622	A	6	6	27146	27151	100 %	0 %	0 %	0 %	407457568
602	NC_018622	CTGG	2	8	27185	27192	0 %	25 %	50 %	25 %	407457568
603	NC_018622	AAG	2	6	27273	27278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457568
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610	NC_018622	AGA	3	9	27562	27570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457568
611	NC_018622	ACA	2	6	27592	27597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457568
612	NC_018622	AC	3	6	27625	27630	50 %	0 %	0 %	50 %	407457568
613	NC_018622	AATC	2	8	27721	27728	50 %	25 %	0 %	25 %	407457568
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616	NC_018622	TCA	2	6	27820	27825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457568
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618	NC_018622	AGC	2	6	27917	27922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457568
619	NC_018622	GCT	2	6	27923	27928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457568
620	NC_018622	AATT	2	8	27958	27965	50 %	50 %	0 %	0 %	407457568
621	NC_018622	TGA	2	6	27973	27978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457568
622	NC_018622	AAC	3	9	27990	27998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457568
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624	NC_018622	TA	3	6	28049	28054	50 %	50 %	0 %	0 %	407457568
625	NC_018622	TTG	2	6	28074	28079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457568
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630	NC_018622	AGAT	2	8	28452	28459	50 %	25 %	25 %	0 %	407457568
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