MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_018622	GAT	2	6	284051	284056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457827
6003	NC_018622	AAAGA	2	10	284107	284116	80 %	0 %	20 %	0 %	407457827
6004	NC_018622	GCG	2	6	284117	284122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407457827
6005	NC_018622	GT	3	6	284270	284275	0 %	50 %	50 %	0 %	407457827
6006	NC_018622	TTG	2	6	284344	284349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457827
6007	NC_018622	TGT	2	6	284402	284407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457827
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6009	NC_018622	CAC	2	6	284560	284565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407457827
6010	NC_018622	TCT	2	6	284609	284614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457827
6011	NC_018622	ATG	2	6	284704	284709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457827
6012	NC_018622	TCG	2	6	284729	284734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457827
6013	NC_018622	GAT	2	6	284739	284744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457827
6014	NC_018622	TTC	2	6	284816	284821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457827
6015	NC_018622	A	6	6	284880	284885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_018622	TTA	2	6	284894	284899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_018622	T	8	8	284940	284947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_018622	TTGT	2	8	285001	285008	0 %	75 %	25 %	0 %	407457828
6019	NC_018622	CTT	2	6	285062	285067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457828
6020	NC_018622	T	6	6	285200	285205	0 %	100 %	0 %	0 %	407457828
6021	NC_018622	GTT	2	6	285207	285212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457828
6022	NC_018622	GTT	2	6	285217	285222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457828
6023	NC_018622	T	6	6	285243	285248	0 %	100 %	0 %	0 %	407457828
6024	NC_018622	AGAC	2	8	285257	285264	50 %	0 %	25 %	25 %	407457828
6025	NC_018622	TCT	2	6	285269	285274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457828
6026	NC_018622	TAT	2	6	285422	285427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457828
6027	NC_018622	CTTA	2	8	285430	285437	25 %	50 %	0 %	25 %	407457828
6028	NC_018622	TCCCG	2	10	285453	285462	0 %	20 %	20 %	60 %	407457828
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6030	NC_018622	CTTAT	2	10	285571	285580	20 %	60 %	0 %	20 %	407457828
6031	NC_018622	AGAA	2	8	285608	285615	75 %	0 %	25 %	0 %	407457828
6032	NC_018622	TCT	2	6	285624	285629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457828
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6035	NC_018622	TAT	3	9	285667	285675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457828
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6039	NC_018622	TTA	2	6	285904	285909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457828
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6041	NC_018622	TCT	2	6	285963	285968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457828
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6049	NC_018622	TGT	2	6	286444	286449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457829
6050	NC_018622	TAC	2	6	286466	286471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457829
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6053	NC_018622	CTTT	2	8	286544	286551	0 %	75 %	0 %	25 %	407457829
6054	NC_018622	TCCT	2	8	286611	286618	0 %	50 %	0 %	50 %	407457829
6055	NC_018622	AAGA	2	8	286722	286729	75 %	0 %	25 %	0 %	407457829
6056	NC_018622	A	8	8	286729	286736	100 %	0 %	0 %	0 %	407457829
6057	NC_018622	TTTA	2	8	286876	286883	25 %	75 %	0 %	0 %	407457829
6058	NC_018622	TAT	2	6	286915	286920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457829
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6101	NC_018622	TAAA	2	8	289404	289411	75 %	25 %	0 %	0 %	407457830
6102	NC_018622	AAT	2	6	289436	289441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_018622	TGT	2	6	289454	289459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_018622	ATTT	2	8	289461	289468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_018622	TAAT	3	12	289508	289519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_018622	ATTTT	2	10	289525	289534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_018622	T	6	6	289537	289542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_018622	GAT	2	6	289572	289577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457831
6109	NC_018622	TC	4	8	289610	289617	0 %	50 %	0 %	50 %	407457831
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6112	NC_018622	TTA	2	6	289713	289718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457831
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6114	NC_018622	GTATT	2	10	289798	289807	20 %	60 %	20 %	0 %	407457831
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6122	NC_018622	AAG	2	6	290157	290162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457831
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6124	NC_018622	CTG	2	6	290263	290268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457831
6125	NC_018622	ATTG	2	8	290276	290283	25 %	50 %	25 %	0 %	407457831
6126	NC_018622	TGCT	2	8	290284	290291	0 %	50 %	25 %	25 %	407457831
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6152	NC_018622	TCTA	2	8	291376	291383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6153	NC_018622	TCT	2	6	291402	291407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6155	NC_018622	TATT	2	8	291427	291434	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6156	NC_018622	TAA	2	6	291439	291444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6157	NC_018622	TAAAAT	2	12	291456	291467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6232	NC_018622	ATA	2	6	295344	295349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457833
6233	NC_018622	CTC	2	6	295350	295355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457833
6234	NC_018622	CTG	2	6	295513	295518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457833
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6237	NC_018622	GTT	2	6	295655	295660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457833
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6240	NC_018622	A	7	7	295955	295961	100 %	0 %	0 %	0 %	407457833
6241	NC_018622	ATT	2	6	295967	295972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457833
6242	NC_018622	GAA	2	6	296013	296018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457833
6243	NC_018622	GCC	2	6	296033	296038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407457833
6244	NC_018622	TAT	2	6	296053	296058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457833
6245	NC_018622	GCAAA	2	10	296061	296070	60 %	0 %	20 %	20 %	407457833
6246	NC_018622	GCA	2	6	296105	296110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457833
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6496	NC_018622	CAT	2	6	309341	309346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457839
6497	NC_018622	TGA	2	6	309386	309391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457839
6498	NC_018622	T	7	7	309418	309424	0 %	100 %	0 %	0 %	407457839
6499	NC_018622	ATA	2	6	309463	309468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457839
6500	NC_018622	TAT	2	6	309560	309565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457839

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