MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018622	CGA	2	6	237412	237417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457780
5002	NC_018622	TGC	2	6	237423	237428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457780
5003	NC_018622	T	6	6	237507	237512	0 %	100 %	0 %	0 %	407457780
5004	NC_018622	AAC	3	9	237582	237590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457780
5005	NC_018622	T	6	6	237597	237602	0 %	100 %	0 %	0 %	407457780
5006	NC_018622	GTT	2	6	237603	237608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457780
5007	NC_018622	TAA	2	6	237609	237614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457780
5008	NC_018622	TGC	2	6	237670	237675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457780
5009	NC_018622	CTT	2	6	237689	237694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457780
5010	NC_018622	ACT	2	6	237741	237746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457780
5011	NC_018622	CTTT	2	8	237766	237773	0 %	75 %	0 %	25 %	407457780
5012	NC_018622	TGC	2	6	237858	237863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457780
5013	NC_018622	CATC	2	8	237893	237900	25 %	25 %	0 %	50 %	407457780
5014	NC_018622	GCT	2	6	237910	237915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457780
5015	NC_018622	CTT	2	6	237971	237976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457780
5016	NC_018622	CGA	2	6	238027	238032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457780
5017	NC_018622	CATG	2	8	238151	238158	25 %	25 %	25 %	25 %	407457780
5018	NC_018622	CTTG	2	8	238169	238176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_018622	GAAT	2	8	238219	238226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_018622	GAA	3	9	238233	238241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_018622	T	6	6	238256	238261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_018622	AAG	2	6	238265	238270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_018622	T	7	7	238280	238286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_018622	CAC	2	6	238337	238342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5025	NC_018622	GAT	2	6	238399	238404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457781
5026	NC_018622	TTTC	2	8	238458	238465	0 %	75 %	0 %	25 %	407457781
5027	NC_018622	GTT	2	6	238486	238491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457781
5028	NC_018622	A	6	6	238526	238531	100 %	0 %	0 %	0 %	407457781
5029	NC_018622	ATA	2	6	238550	238555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_018622	AGA	2	6	238565	238570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_018622	CT	3	6	238606	238611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_018622	AGCG	2	8	238618	238625	25 %	0 %	50 %	25 %	407457782
5033	NC_018622	GAG	2	6	238651	238656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457782
5034	NC_018622	AGCG	2	8	238677	238684	25 %	0 %	50 %	25 %	407457782
5035	NC_018622	TGA	2	6	238724	238729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457782
5036	NC_018622	AAT	2	6	238746	238751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457782
5037	NC_018622	CGA	2	6	238798	238803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457782
5038	NC_018622	AGC	2	6	238827	238832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457782
5039	NC_018622	CTTT	2	8	238970	238977	0 %	75 %	0 %	25 %	407457782
5040	NC_018622	T	6	6	238975	238980	0 %	100 %	0 %	0 %	407457782
5041	NC_018622	GATT	2	8	239138	239145	25 %	50 %	25 %	0 %	407457782
5042	NC_018622	GCA	2	6	239171	239176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457782
5043	NC_018622	TGGTG	2	10	239269	239278	0 %	40 %	60 %	0 %	407457782
5044	NC_018622	GACT	2	8	239346	239353	25 %	25 %	25 %	25 %	407457782
5045	NC_018622	AAG	2	6	239354	239359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457782
5046	NC_018622	TTG	2	6	239434	239439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457782
5047	NC_018622	AAG	2	6	239583	239588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457782
5048	NC_018622	T	7	7	239611	239617	0 %	100 %	0 %	0 %	407457782
5049	NC_018622	AATTAT	2	12	239696	239707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_018622	TAAT	2	8	239720	239727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_018622	A	6	6	239733	239738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_018622	TTC	3	9	239764	239772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_018622	T	6	6	239773	239778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_018622	AAG	2	6	239800	239805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_018622	ATAA	2	8	239837	239844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_018622	AT	3	6	239882	239887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_018622	A	6	6	239914	239919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_018622	GCA	2	6	239932	239937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_018622	TGA	2	6	239967	239972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_018622	ATG	2	6	239975	239980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_018622	ATG	2	6	239987	239992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457783
5062	NC_018622	ACA	3	9	239999	240007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457783
5063	NC_018622	GA	3	6	240135	240140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_018622	T	6	6	240159	240164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_018622	TCA	2	6	240166	240171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457784
5066	NC_018622	T	7	7	240188	240194	0 %	100 %	0 %	0 %	407457784
5067	NC_018622	GAT	2	6	240210	240215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457784
5068	NC_018622	AG	3	6	240355	240360	50 %	0 %	50 %	0 %	407457784
5069	NC_018622	A	6	6	240400	240405	100 %	0 %	0 %	0 %	407457784
5070	NC_018622	A	6	6	240425	240430	100 %	0 %	0 %	0 %	407457784
5071	NC_018622	T	6	6	240635	240640	0 %	100 %	0 %	0 %	407457784
5072	NC_018622	AGCGT	2	10	240721	240730	20 %	20 %	40 %	20 %	407457784
5073	NC_018622	GAG	2	6	240735	240740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457784
5074	NC_018622	CTT	2	6	240743	240748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457784
5075	NC_018622	GTA	2	6	240787	240792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457784
5076	NC_018622	GTTT	2	8	240887	240894	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_018622	TAC	2	6	240942	240947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_018622	GAG	2	6	240975	240980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_018622	A	6	6	241047	241052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_018622	AG	3	6	241088	241093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_018622	TAT	2	6	241104	241109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_018622	ATA	2	6	241131	241136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_018622	TTG	2	6	241157	241162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457785
5084	NC_018622	GAA	2	6	241189	241194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457785
5085	NC_018622	ATC	2	6	241236	241241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457785
5086	NC_018622	GAT	2	6	241312	241317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457785
5087	NC_018622	TTCAG	2	10	241342	241351	20 %	40 %	20 %	20 %	407457785
5088	NC_018622	TTG	2	6	241417	241422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457785
5089	NC_018622	TG	3	6	241451	241456	0 %	50 %	50 %	0 %	407457785
5090	NC_018622	TTA	2	6	241526	241531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457785
5091	NC_018622	ATT	2	6	241544	241549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457785
5092	NC_018622	TG	3	6	241739	241744	0 %	50 %	50 %	0 %	407457785
5093	NC_018622	ATT	2	6	241779	241784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457785
5094	NC_018622	TTC	2	6	241840	241845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457785
5095	NC_018622	AGA	2	6	241853	241858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457785
5096	NC_018622	TGA	2	6	241888	241893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457785
5097	NC_018622	CTGGT	2	10	241932	241941	0 %	40 %	40 %	20 %	407457785
5098	NC_018622	ATT	2	6	241991	241996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457785
5099	NC_018622	ATG	2	6	242061	242066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457785
5100	NC_018622	TGA	2	6	242091	242096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457785
5101	NC_018622	AAG	2	6	242145	242150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457785
5102	NC_018622	GCTT	2	8	242238	242245	0 %	50 %	25 %	25 %	407457785
5103	NC_018622	ATACC	2	10	242355	242364	40 %	20 %	0 %	40 %	407457785
5104	NC_018622	AAC	2	6	242422	242427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457785
5105	NC_018622	TGA	2	6	242443	242448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457785
5106	NC_018622	GAA	2	6	242453	242458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457785
5107	NC_018622	ATT	2	6	242468	242473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457785
5108	NC_018622	GAA	2	6	242561	242566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457785
5109	NC_018622	TTA	2	6	242588	242593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457785
5110	NC_018622	TTTAG	2	10	242632	242641	20 %	60 %	20 %	0 %	407457785
5111	NC_018622	TGT	2	6	242652	242657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_018622	AG	3	6	242702	242707	50 %	0 %	50 %	0 %	407457786
5113	NC_018622	T	7	7	242733	242739	0 %	100 %	0 %	0 %	407457786
5114	NC_018622	GCA	2	6	242763	242768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457786
5115	NC_018622	AAG	2	6	242778	242783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457786
5116	NC_018622	TAAT	2	8	242830	242837	50 %	50 %	0 %	0 %	407457786
5117	NC_018622	ATG	2	6	242889	242894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457786
5118	NC_018622	ACT	2	6	242907	242912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457786
5119	NC_018622	GCT	2	6	242928	242933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457786
5120	NC_018622	CGT	2	6	242973	242978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457786
5121	NC_018622	CTC	2	6	242986	242991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457786
5122	NC_018622	GAA	2	6	243086	243091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457786
5123	NC_018622	ATCG	2	8	243153	243160	25 %	25 %	25 %	25 %	407457786
5124	NC_018622	CAG	2	6	243175	243180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457786
5125	NC_018622	TTA	2	6	243201	243206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457786
5126	NC_018622	AAT	2	6	243303	243308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457787
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5129	NC_018622	CTG	2	6	243368	243373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457787
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5131	NC_018622	ATG	2	6	243395	243400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457787
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5135	NC_018622	GGTA	2	8	243502	243509	25 %	25 %	50 %	0 %	407457787
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5143	NC_018622	TTGAAT	2	12	244010	244021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5145	NC_018622	AG	3	6	244054	244059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5161	NC_018622	TTC	2	6	245025	245030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457788
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5228	NC_018622	TATT	2	8	248275	248282	25 %	75 %	0 %	0 %	407457793
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5231	NC_018622	CAA	2	6	248372	248377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457793
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5241	NC_018622	TCCT	2	8	248814	248821	0 %	50 %	0 %	50 %	407457793
5242	NC_018622	TTC	2	6	248898	248903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457793
5243	NC_018622	GCA	2	6	248930	248935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457793
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5245	NC_018622	GAAT	2	8	249086	249093	50 %	25 %	25 %	0 %	407457793
5246	NC_018622	AG	3	6	249129	249134	50 %	0 %	50 %	0 %	407457793
5247	NC_018622	T	6	6	249217	249222	0 %	100 %	0 %	0 %	407457793
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5386	NC_018622	AAGAT	2	10	255947	255956	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5494	NC_018622	ATCTC	2	10	261114	261123	20 %	40 %	0 %	40 %	407457807
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