MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 24239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018622	ATT	2	6	212675	212680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457759
4502	NC_018622	GTT	2	6	212681	212686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457759
4503	NC_018622	TCC	2	6	212715	212720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457759
4504	NC_018622	AGA	3	9	212723	212731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457759
4505	NC_018622	TGA	2	6	212813	212818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457759
4506	NC_018622	TTG	2	6	212983	212988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_018622	ATC	2	6	213063	213068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_018622	TGC	2	6	213179	213184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457760
4509	NC_018622	AGC	2	6	213192	213197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457760
4510	NC_018622	CAT	2	6	213233	213238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_018622	AT	3	6	213237	213242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_018622	AAAG	2	8	213258	213265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_018622	TAC	2	6	213284	213289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_018622	GGT	2	6	213338	213343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_018622	ATA	2	6	213414	213419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_018622	TCT	2	6	213462	213467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_018622	CATA	2	8	213535	213542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_018622	CCT	2	6	213594	213599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_018622	ATGT	2	8	213651	213658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_018622	ACA	2	6	213663	213668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_018622	GCC	2	6	213693	213698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_018622	AAG	2	6	213703	213708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_018622	A	7	7	213737	213743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_018622	T	7	7	213761	213767	0 %	100 %	0 %	0 %	407457761
4525	NC_018622	TTG	2	6	213798	213803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457761
4526	NC_018622	GTT	2	6	213818	213823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457761
4527	NC_018622	ATG	2	6	213868	213873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457761
4528	NC_018622	GTT	2	6	213939	213944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457761
4529	NC_018622	AGAT	2	8	214045	214052	50 %	25 %	25 %	0 %	407457761
4530	NC_018622	AGAA	2	8	214168	214175	75 %	0 %	25 %	0 %	407457761
4531	NC_018622	GAAAA	2	10	214197	214206	80 %	0 %	20 %	0 %	407457761
4532	NC_018622	TGC	2	6	214220	214225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457761
4533	NC_018622	T	7	7	214252	214258	0 %	100 %	0 %	0 %	407457761
4534	NC_018622	GTA	2	6	214289	214294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457761
4535	NC_018622	AAC	2	6	214310	214315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457761
4536	NC_018622	GTT	2	6	214328	214333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457761
4537	NC_018622	C	6	6	214336	214341	0 %	0 %	0 %	100 %	407457761
4538	NC_018622	CAA	2	6	214362	214367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457761
4539	NC_018622	GTT	2	6	214480	214485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457762
4540	NC_018622	ATT	2	6	214500	214505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457762
4541	NC_018622	TTC	2	6	214515	214520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457762
4542	NC_018622	TAGCA	2	10	214563	214572	40 %	20 %	20 %	20 %	407457762
4543	NC_018622	AGC	2	6	214638	214643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457762
4544	NC_018622	ACA	2	6	214648	214653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457762
4545	NC_018622	ACG	2	6	214690	214695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457762
4546	NC_018622	GCT	2	6	214760	214765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457762
4547	NC_018622	AGC	2	6	214767	214772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457762
4548	NC_018622	AG	3	6	214874	214879	50 %	0 %	50 %	0 %	407457762
4549	NC_018622	T	6	6	214993	214998	0 %	100 %	0 %	0 %	407457762
4550	NC_018622	T	7	7	215026	215032	0 %	100 %	0 %	0 %	407457762
4551	NC_018622	GCAC	2	8	215077	215084	25 %	0 %	25 %	50 %	407457762
4552	NC_018622	T	6	6	215087	215092	0 %	100 %	0 %	0 %	407457762
4553	NC_018622	TCT	2	6	215227	215232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457762
4554	NC_018622	AAGAA	2	10	215261	215270	80 %	0 %	20 %	0 %	407457762
4555	NC_018622	AAAG	2	8	215276	215283	75 %	0 %	25 %	0 %	407457762
4556	NC_018622	TTAG	2	8	215304	215311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_018622	TAA	2	6	215351	215356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_018622	T	7	7	215384	215390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_018622	AT	3	6	215429	215434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_018622	GA	3	6	215490	215495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_018622	GT	3	6	215530	215535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_018622	CT	3	6	215567	215572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_018622	T	6	6	215658	215663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_018622	T	6	6	215704	215709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_018622	A	6	6	215755	215760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_018622	AG	3	6	215794	215799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_018622	TC	3	6	215853	215858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4568	NC_018622	GAA	2	6	215897	215902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457763
4569	NC_018622	TCA	2	6	215922	215927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457763
4570	NC_018622	ACA	2	6	215935	215940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407457763
4571	NC_018622	AG	3	6	216032	216037	50 %	0 %	50 %	0 %	407457763
4572	NC_018622	TTG	2	6	216038	216043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457763
4573	NC_018622	GACA	2	8	216153	216160	50 %	0 %	25 %	25 %	407457763
4574	NC_018622	ATC	2	6	216206	216211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457763
4575	NC_018622	ATT	2	6	216267	216272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457763
4576	NC_018622	GGT	2	6	216386	216391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457763
4577	NC_018622	AGC	2	6	216442	216447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457763
4578	NC_018622	TTG	2	6	216507	216512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457763
4579	NC_018622	AAG	2	6	216542	216547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457764
4580	NC_018622	GAAAG	2	10	216563	216572	60 %	0 %	40 %	0 %	407457764
4581	NC_018622	TAT	2	6	216651	216656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457764
4582	NC_018622	ATTT	2	8	216734	216741	25 %	75 %	0 %	0 %	407457764
4583	NC_018622	TCA	2	6	216846	216851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457764
4584	NC_018622	CTTT	2	8	216898	216905	0 %	75 %	0 %	25 %	407457764
4585	NC_018622	GTG	2	6	216929	216934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407457764
4586	NC_018622	ACTC	2	8	216943	216950	25 %	25 %	0 %	50 %	407457764
4587	NC_018622	TTA	2	6	217037	217042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457764
4588	NC_018622	TGT	2	6	217095	217100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457764
4589	NC_018622	TG	3	6	217268	217273	0 %	50 %	50 %	0 %	407457764
4590	NC_018622	TAG	2	6	217284	217289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457764
4591	NC_018622	TAC	2	6	217300	217305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457764
4592	NC_018622	TTG	2	6	217342	217347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_018622	ACA	2	6	217389	217394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_018622	GC	3	6	217410	217415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_018622	CA	3	6	217586	217591	50 %	0 %	0 %	50 %	407457765
4596	NC_018622	AGAA	2	8	217838	217845	75 %	0 %	25 %	0 %	407457765
4597	NC_018622	TTG	2	6	217850	217855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457765
4598	NC_018622	CAAC	2	8	217905	217912	50 %	0 %	0 %	50 %	407457765
4599	NC_018622	ATGG	2	8	217948	217955	25 %	25 %	50 %	0 %	407457765
4600	NC_018622	GCA	2	6	218006	218011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4601	NC_018622	TTC	2	6	218244	218249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457765
4602	NC_018622	CAT	2	6	218309	218314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457765
4603	NC_018622	ATT	2	6	218325	218330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457765
4604	NC_018622	TGT	2	6	218336	218341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457765
4605	NC_018622	AGT	2	6	218405	218410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407457765
4606	NC_018622	GCG	2	6	218433	218438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407457765
4607	NC_018622	CTC	2	6	218442	218447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457765
4608	NC_018622	CTA	2	6	218569	218574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457765
4609	NC_018622	TAAG	2	8	218613	218620	50 %	25 %	25 %	0 %	407457765
4610	NC_018622	CTG	5	15	218756	218770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4611	NC_018622	AGG	2	6	218796	218801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457765
4612	NC_018622	TCT	2	6	218815	218820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407457765
4613	NC_018622	GTT	2	6	218850	218855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407457765
4614	NC_018622	TCC	2	6	218883	218888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407457765
4615	NC_018622	GAA	2	6	219055	219060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457765
4616	NC_018622	AAT	2	6	219061	219066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407457765
4617	NC_018622	GGA	2	6	219085	219090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407457765
4618	NC_018622	TTA	2	6	219109	219114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457765
4619	NC_018622	TTA	2	6	219133	219138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407457765
4620	NC_018622	AGA	2	6	219141	219146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407457765
4621	NC_018622	CAT	2	6	219170	219175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407457765
4622	NC_018622	GATT	2	8	219187	219194	25 %	50 %	25 %	0 %	407457765
4623	NC_018622	GCA	2	6	219196	219201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407457765
4624	NC_018622	AGAT	2	8	219243	219250	50 %	25 %	25 %	0 %	407457765
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4626	NC_018622	GCT	2	6	219448	219453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407457765
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5000	NC_018622	CTA	2	6	237174	237179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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