MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 2116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018621	TA	3	6	95	100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018621	GT	3	6	311	316	0 %	50 %	50 %	0 %	407456173
3	NC_018621	TG	3	6	500	505	0 %	50 %	50 %	0 %	407456173
4	NC_018621	TC	3	6	729	734	0 %	50 %	0 %	50 %	407456173
5	NC_018621	AC	3	6	1297	1302	50 %	0 %	0 %	50 %	407456174
6	NC_018621	GT	3	6	1463	1468	0 %	50 %	50 %	0 %	407456174
7	NC_018621	TC	3	6	1586	1591	0 %	50 %	0 %	50 %	407456174
8	NC_018621	TG	3	6	1890	1895	0 %	50 %	50 %	0 %	407456174
9	NC_018621	GA	3	6	2788	2793	50 %	0 %	50 %	0 %	407456175
10	NC_018621	GA	3	6	3342	3347	50 %	0 %	50 %	0 %	407456176
11	NC_018621	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	407456176
12	NC_018621	CT	3	6	4731	4736	0 %	50 %	0 %	50 %	407456176
13	NC_018621	CT	3	6	6471	6476	0 %	50 %	0 %	50 %	407456177
14	NC_018621	GA	3	6	6895	6900	50 %	0 %	50 %	0 %	407456179
15	NC_018621	GT	3	6	7806	7811	0 %	50 %	50 %	0 %	407456179
16	NC_018621	TC	3	6	7877	7882	0 %	50 %	0 %	50 %	407456179
17	NC_018621	AT	3	6	8466	8471	50 %	50 %	0 %	0 %	407456180
18	NC_018621	GT	3	6	8689	8694	0 %	50 %	50 %	0 %	407456180
19	NC_018621	AG	3	6	9232	9237	50 %	0 %	50 %	0 %	407456181
20	NC_018621	TG	3	6	10494	10499	0 %	50 %	50 %	0 %	407456181
21	NC_018621	TC	3	6	11264	11269	0 %	50 %	0 %	50 %	407456182
22	NC_018621	AC	3	6	11280	11285	50 %	0 %	0 %	50 %	407456182
23	NC_018621	AT	3	6	11524	11529	50 %	50 %	0 %	0 %	407456182
24	NC_018621	GA	3	6	11603	11608	50 %	0 %	50 %	0 %	407456182
25	NC_018621	AG	3	6	11791	11796	50 %	0 %	50 %	0 %	407456182
26	NC_018621	TC	3	6	11844	11849	0 %	50 %	0 %	50 %	407456182
27	NC_018621	GT	3	6	12059	12064	0 %	50 %	50 %	0 %	407456182
28	NC_018621	GA	3	6	12447	12452	50 %	0 %	50 %	0 %	407456182
29	NC_018621	AG	3	6	12516	12521	50 %	0 %	50 %	0 %	407456182
30	NC_018621	GA	3	6	12587	12592	50 %	0 %	50 %	0 %	407456182
31	NC_018621	GT	3	6	12868	12873	0 %	50 %	50 %	0 %	407456182
32	NC_018621	TA	3	6	13808	13813	50 %	50 %	0 %	0 %	407456182
33	NC_018621	TA	3	6	13828	13833	50 %	50 %	0 %	0 %	407456182
34	NC_018621	AT	3	6	14112	14117	50 %	50 %	0 %	0 %	407456183
35	NC_018621	CT	3	6	14792	14797	0 %	50 %	0 %	50 %	407456183
36	NC_018621	TA	3	6	15122	15127	50 %	50 %	0 %	0 %	407456183
37	NC_018621	TG	4	8	15660	15667	0 %	50 %	50 %	0 %	407456183
38	NC_018621	AG	3	6	17699	17704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018621	TC	3	6	18955	18960	0 %	50 %	0 %	50 %	407456187
40	NC_018621	GT	3	6	19396	19401	0 %	50 %	50 %	0 %	407456187
41	NC_018621	TA	3	6	19440	19445	50 %	50 %	0 %	0 %	407456187
42	NC_018621	TC	3	6	19546	19551	0 %	50 %	0 %	50 %	407456187
43	NC_018621	GT	3	6	19675	19680	0 %	50 %	50 %	0 %	407456187
44	NC_018621	AC	3	6	20116	20121	50 %	0 %	0 %	50 %	407456187
45	NC_018621	TC	3	6	21147	21152	0 %	50 %	0 %	50 %	407456188
46	NC_018621	GA	3	6	22449	22454	50 %	0 %	50 %	0 %	407456189
47	NC_018621	GA	3	6	23672	23677	50 %	0 %	50 %	0 %	407456189
48	NC_018621	TA	3	6	25505	25510	50 %	50 %	0 %	0 %	407456191
49	NC_018621	AG	3	6	25612	25617	50 %	0 %	50 %	0 %	407456191
50	NC_018621	TA	3	6	26515	26520	50 %	50 %	0 %	0 %	407456191
51	NC_018621	TA	3	6	27375	27380	50 %	50 %	0 %	0 %	407456193
52	NC_018621	TC	3	6	27460	27465	0 %	50 %	0 %	50 %	407456193
53	NC_018621	TA	3	6	28052	28057	50 %	50 %	0 %	0 %	407456193
54	NC_018621	AG	3	6	29927	29932	50 %	0 %	50 %	0 %	407456195
55	NC_018621	AG	3	6	30588	30593	50 %	0 %	50 %	0 %	407456196
56	NC_018621	GA	3	6	31110	31115	50 %	0 %	50 %	0 %	407456197
57	NC_018621	GA	4	8	31240	31247	50 %	0 %	50 %	0 %	407456197
58	NC_018621	TC	3	6	31853	31858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018621	GT	3	6	33084	33089	0 %	50 %	50 %	0 %	407456199
60	NC_018621	AG	3	6	34613	34618	50 %	0 %	50 %	0 %	407456202
61	NC_018621	AG	3	6	34685	34690	50 %	0 %	50 %	0 %	407456202
62	NC_018621	AT	3	6	34731	34736	50 %	50 %	0 %	0 %	407456202
63	NC_018621	TG	3	6	34820	34825	0 %	50 %	50 %	0 %	407456202
64	NC_018621	CG	3	6	35132	35137	0 %	0 %	50 %	50 %	407456202
65	NC_018621	AT	3	6	35451	35456	50 %	50 %	0 %	0 %	407456202
66	NC_018621	GA	3	6	35932	35937	50 %	0 %	50 %	0 %	407456203
67	NC_018621	TA	3	6	37504	37509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018621	TC	3	6	37742	37747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018621	GA	3	6	38473	38478	50 %	0 %	50 %	0 %	407456206
70	NC_018621	CG	3	6	38502	38507	0 %	0 %	50 %	50 %	407456206
71	NC_018621	TA	3	6	38508	38513	50 %	50 %	0 %	0 %	407456206
72	NC_018621	GC	3	6	39840	39845	0 %	0 %	50 %	50 %	407456208
73	NC_018621	AG	3	6	39851	39856	50 %	0 %	50 %	0 %	407456208
74	NC_018621	AG	3	6	40731	40736	50 %	0 %	50 %	0 %	407456209
75	NC_018621	GC	3	6	41448	41453	0 %	0 %	50 %	50 %	407456209
76	NC_018621	AT	3	6	41780	41785	50 %	50 %	0 %	0 %	407456209
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82	NC_018621	TC	4	8	47823	47830	0 %	50 %	0 %	50 %	407456217
83	NC_018621	TA	3	6	48252	48257	50 %	50 %	0 %	0 %	407456218
84	NC_018621	AT	3	6	48266	48271	50 %	50 %	0 %	0 %	407456218
85	NC_018621	AT	3	6	48518	48523	50 %	50 %	0 %	0 %	407456218
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87	NC_018621	TA	3	6	48878	48883	50 %	50 %	0 %	0 %	407456218
88	NC_018621	AG	3	6	49405	49410	50 %	0 %	50 %	0 %	407456219
89	NC_018621	GC	3	6	49973	49978	0 %	0 %	50 %	50 %	407456220
90	NC_018621	TC	3	6	50378	50383	0 %	50 %	0 %	50 %	407456220
91	NC_018621	TA	3	6	50551	50556	50 %	50 %	0 %	0 %	407456220
92	NC_018621	TA	3	6	52213	52218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018621	GT	3	6	53103	53108	0 %	50 %	50 %	0 %	407456222
94	NC_018621	AT	3	6	53290	53295	50 %	50 %	0 %	0 %	407456222
95	NC_018621	AG	3	6	55433	55438	50 %	0 %	50 %	0 %	407456225
96	NC_018621	AG	4	8	56047	56054	50 %	0 %	50 %	0 %	407456225
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98	NC_018621	GA	3	6	57080	57085	50 %	0 %	50 %	0 %	407456227
99	NC_018621	CA	3	6	57543	57548	50 %	0 %	0 %	50 %	407456227
100	NC_018621	AG	3	6	58520	58525	50 %	0 %	50 %	0 %	407456228
101	NC_018621	GA	3	6	59295	59300	50 %	0 %	50 %	0 %	407456228
102	NC_018621	AG	3	6	60273	60278	50 %	0 %	50 %	0 %	407456229
103	NC_018621	AG	3	6	60574	60579	50 %	0 %	50 %	0 %	407456229
104	NC_018621	GA	3	6	60631	60636	50 %	0 %	50 %	0 %	407456229
105	NC_018621	GA	3	6	61818	61823	50 %	0 %	50 %	0 %	407456229
106	NC_018621	TC	3	6	62558	62563	0 %	50 %	0 %	50 %	407456229
107	NC_018621	TG	3	6	63273	63278	0 %	50 %	50 %	0 %	407456229
108	NC_018621	CT	3	6	63858	63863	0 %	50 %	0 %	50 %	407456229
109	NC_018621	TC	3	6	64753	64758	0 %	50 %	0 %	50 %	407456230
110	NC_018621	TG	3	6	65518	65523	0 %	50 %	50 %	0 %	407456230
111	NC_018621	CA	4	8	65805	65812	50 %	0 %	0 %	50 %	407456230
112	NC_018621	GA	4	8	66544	66551	50 %	0 %	50 %	0 %	407456231
113	NC_018621	AT	3	6	67323	67328	50 %	50 %	0 %	0 %	407456232
114	NC_018621	GA	4	8	67430	67437	50 %	0 %	50 %	0 %	407456232
115	NC_018621	AG	3	6	67543	67548	50 %	0 %	50 %	0 %	407456232
116	NC_018621	TG	3	6	67892	67897	0 %	50 %	50 %	0 %	407456232
117	NC_018621	GT	3	6	68136	68141	0 %	50 %	50 %	0 %	407456233
118	NC_018621	TA	3	6	68577	68582	50 %	50 %	0 %	0 %	407456233
119	NC_018621	TA	3	6	69280	69285	50 %	50 %	0 %	0 %	407456233
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121	NC_018621	GA	3	6	71724	71729	50 %	0 %	50 %	0 %	407456237
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123	NC_018621	GT	3	6	73662	73667	0 %	50 %	50 %	0 %	407456239
124	NC_018621	GA	3	6	74604	74609	50 %	0 %	50 %	0 %	407456240
125	NC_018621	TC	3	6	75192	75197	0 %	50 %	0 %	50 %	407456241
126	NC_018621	TC	3	6	75997	76002	0 %	50 %	0 %	50 %	407456241
127	NC_018621	GC	3	6	76229	76234	0 %	0 %	50 %	50 %	407456242
128	NC_018621	TC	3	6	76296	76301	0 %	50 %	0 %	50 %	407456242
129	NC_018621	TC	3	6	76399	76404	0 %	50 %	0 %	50 %	407456242
130	NC_018621	CA	3	6	76534	76539	50 %	0 %	0 %	50 %	407456242
131	NC_018621	CT	3	6	76722	76727	0 %	50 %	0 %	50 %	407456242
132	NC_018621	CG	3	6	76832	76837	0 %	0 %	50 %	50 %	407456242
133	NC_018621	GA	3	6	78823	78828	50 %	0 %	50 %	0 %	407456243
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139	NC_018621	AC	3	6	81707	81712	50 %	0 %	0 %	50 %	407456246
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142	NC_018621	AC	3	6	82287	82292	50 %	0 %	0 %	50 %	407456247
143	NC_018621	TG	3	6	82766	82771	0 %	50 %	50 %	0 %	407456247
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