MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 24630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018621	AGCG	2	8	190058	190065	25 %	0 %	50 %	25 %	407456372
4002	NC_018621	GAA	2	6	190155	190160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456372
4003	NC_018621	TC	3	6	190165	190170	0 %	50 %	0 %	50 %	407456372
4004	NC_018621	CAG	2	6	190185	190190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456372
4005	NC_018621	GCCTTG	2	12	190216	190227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456372
4006	NC_018621	TTA	2	6	190253	190258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456372
4007	NC_018621	CGG	2	6	190265	190270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407456372
4008	NC_018621	TCT	2	6	190301	190306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456372
4009	NC_018621	CAC	2	6	190339	190344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456372
4010	NC_018621	AAG	2	6	190479	190484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456372
4011	NC_018621	CTT	2	6	190536	190541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456372
4012	NC_018621	TTAT	2	8	190620	190627	25 %	75 %	0 %	0 %	407456372
4013	NC_018621	TTC	3	9	190635	190643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456372
4014	NC_018621	ATG	2	6	190683	190688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456372
4015	NC_018621	GAT	2	6	190742	190747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456372
4016	NC_018621	GT	3	6	190772	190777	0 %	50 %	50 %	0 %	407456372
4017	NC_018621	GGT	2	6	190827	190832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456372
4018	NC_018621	GCA	2	6	190888	190893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456372
4019	NC_018621	TTC	2	6	190958	190963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456372
4020	NC_018621	GATAA	2	10	190965	190974	60 %	20 %	20 %	0 %	407456372
4021	NC_018621	ATTT	2	8	190977	190984	25 %	75 %	0 %	0 %	407456372
4022	NC_018621	CTAT	2	8	191052	191059	25 %	50 %	0 %	25 %	407456372
4023	NC_018621	TGA	2	6	191062	191067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456372
4024	NC_018621	TCT	2	6	191097	191102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456372
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4027	NC_018621	TTA	2	6	191199	191204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456372
4028	NC_018621	TCT	2	6	191279	191284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456372
4029	NC_018621	CTT	3	9	191315	191323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456372
4030	NC_018621	A	6	6	191326	191331	100 %	0 %	0 %	0 %	407456372
4031	NC_018621	ATA	2	6	191389	191394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456372
4032	NC_018621	TCA	2	6	191398	191403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456372
4033	NC_018621	ATT	2	6	191438	191443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456372
4034	NC_018621	TTAA	2	8	191460	191467	50 %	50 %	0 %	0 %	407456372
4035	NC_018621	A	6	6	191479	191484	100 %	0 %	0 %	0 %	407456372
4036	NC_018621	GAA	2	6	191491	191496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456372
4037	NC_018621	CAA	2	6	191512	191517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456372
4038	NC_018621	ATT	3	9	191537	191545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456372
4039	NC_018621	TGG	2	6	191549	191554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456372
4040	NC_018621	TCA	2	6	191578	191583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456372
4041	NC_018621	ATC	2	6	191612	191617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456372
4042	NC_018621	CTT	2	6	191637	191642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456372
4043	NC_018621	GAAA	2	8	191664	191671	75 %	0 %	25 %	0 %	407456372
4044	NC_018621	ACA	2	6	191672	191677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456372
4045	NC_018621	TTG	2	6	191692	191697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_018621	AGAT	2	8	191735	191742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_018621	ACG	2	6	191758	191763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_018621	TTC	2	6	191790	191795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456373
4049	NC_018621	AT	3	6	191815	191820	50 %	50 %	0 %	0 %	407456373
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4051	NC_018621	TGC	2	6	191880	191885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456373
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4053	NC_018621	CTT	2	6	192085	192090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456373
4054	NC_018621	T	6	6	192132	192137	0 %	100 %	0 %	0 %	407456373
4055	NC_018621	GAAG	2	8	192189	192196	50 %	0 %	50 %	0 %	407456373
4056	NC_018621	AAG	2	6	192245	192250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456373
4057	NC_018621	ATC	2	6	192293	192298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456373
4058	NC_018621	GTG	2	6	192413	192418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456373
4059	NC_018621	TTA	2	6	192472	192477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456373
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4062	NC_018621	TTG	2	6	192712	192717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456373
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4067	NC_018621	A	6	6	192828	192833	100 %	0 %	0 %	0 %	407456373
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4073	NC_018621	GGA	2	6	193054	193059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456373
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4089	NC_018621	CT	3	6	193660	193665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_018621	GTTT	2	8	193668	193675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_018621	TTA	2	6	193738	193743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_018621	GTT	2	6	193820	193825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_018621	TTTTA	2	10	193870	193879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_018621	TTC	2	6	193886	193891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_018621	T	8	8	193953	193960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4103	NC_018621	ATG	2	6	194378	194383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456374
4104	NC_018621	ATTT	2	8	194384	194391	25 %	75 %	0 %	0 %	407456374
4105	NC_018621	TGA	3	9	194496	194504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456374
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4108	NC_018621	CAAAGG	2	12	194657	194668	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	407456374
4109	NC_018621	ATT	2	6	194671	194676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456374
4110	NC_018621	GA	3	6	194742	194747	50 %	0 %	50 %	0 %	407456374
4111	NC_018621	TGT	2	6	194763	194768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456374
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4115	NC_018621	AC	3	6	194908	194913	50 %	0 %	0 %	50 %	407456374
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4122	NC_018621	ACA	2	6	195137	195142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456374
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4253	NC_018621	TATG	2	8	200216	200223	25 %	50 %	25 %	0 %	407456379
4254	NC_018621	AGA	2	6	200290	200295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456379
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4257	NC_018621	CTG	2	6	200344	200349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456379
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4273	NC_018621	CCT	2	6	200986	200991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4275	NC_018621	TAAT	2	8	201023	201030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4363	NC_018621	TAATG	2	10	204974	204983	40 %	40 %	20 %	0 %	407456384
4364	NC_018621	TCT	2	6	205031	205036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456385
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4366	NC_018621	T	7	7	205103	205109	0 %	100 %	0 %	0 %	407456385
4367	NC_018621	GAT	2	6	205118	205123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456385
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4370	NC_018621	TAG	2	6	205195	205200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4372	NC_018621	ACG	2	6	205310	205315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456386
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