MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 24630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018621	G	6	6	142962	142967	0 %	0 %	100 %	0 %	407456323
3002	NC_018621	T	6	6	143082	143087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_018621	ATG	2	6	143169	143174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_018621	TG	3	6	143252	143257	0 %	50 %	50 %	0 %	407456324
3005	NC_018621	TCCT	2	8	143260	143267	0 %	50 %	0 %	50 %	407456324
3006	NC_018621	GTT	2	6	143281	143286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456324
3007	NC_018621	AGAAA	2	10	143291	143300	80 %	0 %	20 %	0 %	407456324
3008	NC_018621	ATT	2	6	143303	143308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456324
3009	NC_018621	TAC	2	6	143321	143326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456324
3010	NC_018621	TGA	2	6	143465	143470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456324
3011	NC_018621	TAC	2	6	143500	143505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456324
3012	NC_018621	CAG	2	6	143509	143514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456324
3013	NC_018621	TTG	3	9	143569	143577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456324
3014	NC_018621	TA	3	6	143632	143637	50 %	50 %	0 %	0 %	407456324
3015	NC_018621	ATG	2	6	143740	143745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456324
3016	NC_018621	TAT	2	6	143759	143764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456324
3017	NC_018621	ATT	2	6	143811	143816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456324
3018	NC_018621	TAG	2	6	143848	143853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456324
3019	NC_018621	TTC	2	6	143854	143859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456324
3020	NC_018621	GTG	2	6	143860	143865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456324
3021	NC_018621	AGA	2	6	143866	143871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456324
3022	NC_018621	TTG	2	6	143877	143882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456324
3023	NC_018621	TTA	2	6	143976	143981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456325
3024	NC_018621	AAT	2	6	144013	144018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456325
3025	NC_018621	GAG	2	6	144042	144047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456325
3026	NC_018621	TCTA	2	8	144085	144092	25 %	50 %	0 %	25 %	407456325
3027	NC_018621	T	6	6	144178	144183	0 %	100 %	0 %	0 %	407456325
3028	NC_018621	TTG	2	6	144213	144218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456325
3029	NC_018621	ATA	2	6	144378	144383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456325
3030	NC_018621	CAG	2	6	144386	144391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456325
3031	NC_018621	TAG	2	6	144396	144401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456325
3032	NC_018621	ATCA	2	8	144436	144443	50 %	25 %	0 %	25 %	407456325
3033	NC_018621	CAA	2	6	144576	144581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456325
3034	NC_018621	TGT	2	6	144608	144613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456325
3035	NC_018621	AT	3	6	144712	144717	50 %	50 %	0 %	0 %	407456325
3036	NC_018621	T	6	6	144769	144774	0 %	100 %	0 %	0 %	407456325
3037	NC_018621	AAT	2	6	144788	144793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456325
3038	NC_018621	TGAA	2	8	144800	144807	50 %	25 %	25 %	0 %	407456325
3039	NC_018621	GGAA	3	12	144808	144819	50 %	0 %	50 %	0 %	407456325
3040	NC_018621	TCC	2	6	144820	144825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456325
3041	NC_018621	AGTA	2	8	144841	144848	50 %	25 %	25 %	0 %	407456325
3042	NC_018621	A	7	7	144857	144863	100 %	0 %	0 %	0 %	407456325
3043	NC_018621	TAT	2	6	144934	144939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_018621	TAA	2	6	144941	144946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_018621	AAT	2	6	145027	145032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456326
3046	NC_018621	A	7	7	145060	145066	100 %	0 %	0 %	0 %	407456326
3047	NC_018621	TAT	2	6	145124	145129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456326
3048	NC_018621	T	7	7	145161	145167	0 %	100 %	0 %	0 %	407456326
3049	NC_018621	T	7	7	145212	145218	0 %	100 %	0 %	0 %	407456326
3050	NC_018621	TGTC	2	8	145230	145237	0 %	50 %	25 %	25 %	407456326
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3053	NC_018621	TTTA	2	8	145320	145327	25 %	75 %	0 %	0 %	407456326
3054	NC_018621	TTG	2	6	145343	145348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456326
3055	NC_018621	AC	3	6	145412	145417	50 %	0 %	0 %	50 %	407456326
3056	NC_018621	TTC	2	6	145439	145444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456326
3057	NC_018621	TGTTTT	2	12	145474	145485	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	407456326
3058	NC_018621	ACT	2	6	145493	145498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456326
3059	NC_018621	TTA	2	6	145516	145521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456326
3060	NC_018621	CT	4	8	145610	145617	0 %	50 %	0 %	50 %	407456326
3061	NC_018621	TCC	2	6	145671	145676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456326
3062	NC_018621	T	6	6	145708	145713	0 %	100 %	0 %	0 %	407456326
3063	NC_018621	AGA	2	6	145734	145739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456326
3064	NC_018621	GAT	2	6	145848	145853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456326
3065	NC_018621	TA	3	6	145941	145946	50 %	50 %	0 %	0 %	407456326
3066	NC_018621	AAAGA	2	10	145956	145965	80 %	0 %	20 %	0 %	407456326
3067	NC_018621	AAG	2	6	145972	145977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456326
3068	NC_018621	ATA	2	6	146012	146017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456326
3069	NC_018621	TTAT	2	8	146038	146045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_018621	TTAT	2	8	146073	146080	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_018621	GTAA	2	8	146094	146101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_018621	CCT	2	6	146257	146262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456327
3073	NC_018621	TATT	2	8	146278	146285	25 %	75 %	0 %	0 %	407456327
3074	NC_018621	CTTT	2	8	146331	146338	0 %	75 %	0 %	25 %	407456327
3075	NC_018621	CTT	2	6	146358	146363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456327
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3083	NC_018621	TCT	2	6	146725	146730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_018621	AAG	2	6	146750	146755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_018621	T	6	6	146760	146765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_018621	CTG	2	6	147013	147018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_018621	T	6	6	147036	147041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_018621	TCT	2	6	147059	147064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_018621	CTC	2	6	147102	147107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_018621	GAG	2	6	147137	147142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_018621	T	6	6	147146	147151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_018621	AT	3	6	147157	147162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_018621	A	6	6	147182	147187	100 %	0 %	0 %	0 %	407456330
3097	NC_018621	TTG	2	6	147203	147208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456330
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3099	NC_018621	TAC	2	6	147326	147331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456330
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3101	NC_018621	AATA	2	8	147423	147430	75 %	25 %	0 %	0 %	407456331
3102	NC_018621	AGT	2	6	147440	147445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_018621	ATTT	3	12	147481	147492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_018621	T	6	6	147537	147542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_018621	ATT	2	6	147551	147556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_018621	T	6	6	147561	147566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_018621	T	7	7	147645	147651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_018621	ACA	2	6	147661	147666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_018621	A	6	6	147682	147687	100 %	0 %	0 %	0 %	407456332
3110	NC_018621	CTT	2	6	147700	147705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456332
3111	NC_018621	CTT	2	6	147710	147715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456332
3112	NC_018621	TGA	2	6	147744	147749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456332
3113	NC_018621	AAGTAA	2	12	147758	147769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407456332
3114	NC_018621	AAG	2	6	147803	147808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456332
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3116	NC_018621	TGA	2	6	147853	147858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_018621	G	6	6	147863	147868	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_018621	C	6	6	147869	147874	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3119	NC_018621	CAT	2	6	147891	147896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_018621	TTCCGT	2	12	147971	147982	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_018621	T	6	6	148024	148029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_018621	TTTTA	2	10	148135	148144	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_018621	T	6	6	148147	148152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_018621	ATT	2	6	148208	148213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_018621	TAA	2	6	148218	148223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_018621	AGA	2	6	148224	148229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3128	NC_018621	GAA	2	6	148358	148363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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