MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 24630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018621	T	7	7	118678	118684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_018621	A	6	6	118719	118724	100 %	0 %	0 %	0 %	407456298
2503	NC_018621	GTT	2	6	118764	118769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456298
2504	NC_018621	CAA	2	6	118787	118792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456298
2505	NC_018621	GTC	2	6	118877	118882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456298
2506	NC_018621	TGC	2	6	118889	118894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456298
2507	NC_018621	GT	3	6	118956	118961	0 %	50 %	50 %	0 %	407456298
2508	NC_018621	GTT	2	6	119022	119027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456298
2509	NC_018621	GAG	2	6	119105	119110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_018621	TTTAC	2	10	119137	119146	20 %	60 %	0 %	20 %	407456299
2511	NC_018621	AGTC	2	8	119166	119173	25 %	25 %	25 %	25 %	407456299
2512	NC_018621	ATG	2	6	119177	119182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456299
2513	NC_018621	ATT	2	6	119315	119320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456299
2514	NC_018621	AGA	2	6	119374	119379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456299
2515	NC_018621	ATC	2	6	119390	119395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456299
2516	NC_018621	TTA	2	6	119414	119419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456299
2517	NC_018621	ATT	2	6	119464	119469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456299
2518	NC_018621	TGG	2	6	119512	119517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456299
2519	NC_018621	AAG	2	6	119550	119555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456299
2520	NC_018621	TAC	2	6	119653	119658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456299
2521	NC_018621	CGT	2	6	119725	119730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456299
2522	NC_018621	AGA	2	6	119749	119754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456299
2523	NC_018621	AAG	2	6	119829	119834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456299
2524	NC_018621	A	6	6	119883	119888	100 %	0 %	0 %	0 %	407456299
2525	NC_018621	GAA	2	6	119896	119901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456299
2526	NC_018621	GAA	2	6	119912	119917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456299
2527	NC_018621	TTC	2	6	119952	119957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456299
2528	NC_018621	AGTT	2	8	119961	119968	25 %	50 %	25 %	0 %	407456299
2529	NC_018621	TTA	2	6	120051	120056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456299
2530	NC_018621	A	6	6	120195	120200	100 %	0 %	0 %	0 %	407456299
2531	NC_018621	AGAA	2	8	120268	120275	75 %	0 %	25 %	0 %	407456300
2532	NC_018621	CCA	2	6	120342	120347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456300
2533	NC_018621	GAA	2	6	120350	120355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456300
2534	NC_018621	ACT	2	6	120361	120366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456300
2535	NC_018621	CGT	2	6	120388	120393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456300
2536	NC_018621	GAT	2	6	120405	120410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456300
2537	NC_018621	AAG	2	6	120494	120499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456300
2538	NC_018621	GGT	2	6	120514	120519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456300
2539	NC_018621	TGG	2	6	120600	120605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456300
2540	NC_018621	TAT	2	6	120660	120665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456300
2541	NC_018621	T	8	8	120689	120696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_018621	ACT	2	6	120706	120711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_018621	TTC	2	6	120791	120796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456301
2544	NC_018621	CAG	2	6	120883	120888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456301
2545	NC_018621	TTG	2	6	120913	120918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456301
2546	NC_018621	A	6	6	121023	121028	100 %	0 %	0 %	0 %	407456301
2547	NC_018621	TAC	2	6	121175	121180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456301
2548	NC_018621	AGA	2	6	121229	121234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456301
2549	NC_018621	ACC	2	6	121245	121250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456301
2550	NC_018621	CGC	2	6	121256	121261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407456301
2551	NC_018621	CA	3	6	121268	121273	50 %	0 %	0 %	50 %	407456301
2552	NC_018621	A	7	7	121295	121301	100 %	0 %	0 %	0 %	407456301
2553	NC_018621	GAA	2	6	121485	121490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456301
2554	NC_018621	GTT	2	6	121500	121505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456301
2555	NC_018621	AAG	2	6	121507	121512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456301
2556	NC_018621	AAG	2	6	121555	121560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456301
2557	NC_018621	TCT	2	6	121566	121571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456301
2558	NC_018621	TTC	2	6	121592	121597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456301
2559	NC_018621	TTA	2	6	121698	121703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456301
2560	NC_018621	TAAA	2	8	121724	121731	75 %	25 %	0 %	0 %	407456301
2561	NC_018621	AGC	2	6	121822	121827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456302
2562	NC_018621	TGT	2	6	121844	121849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456302
2563	NC_018621	T	6	6	121886	121891	0 %	100 %	0 %	0 %	407456302
2564	NC_018621	CTG	2	6	121927	121932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456302
2565	NC_018621	AATTA	2	10	122030	122039	60 %	40 %	0 %	0 %	407456302
2566	NC_018621	AGC	2	6	122045	122050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456302
2567	NC_018621	GAA	2	6	122067	122072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456302
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2569	NC_018621	CTG	2	6	122116	122121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456302
2570	NC_018621	CTC	2	6	122128	122133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456302
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2572	NC_018621	A	7	7	122205	122211	100 %	0 %	0 %	0 %	407456302
2573	NC_018621	TAA	2	6	122213	122218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456302
2574	NC_018621	AGT	2	6	122231	122236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456302
2575	NC_018621	ATC	2	6	122240	122245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456302
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2578	NC_018621	GAA	2	6	122283	122288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456302
2579	NC_018621	AAAT	2	8	122297	122304	75 %	25 %	0 %	0 %	407456302
2580	NC_018621	AGA	2	6	122314	122319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456302
2581	NC_018621	ATT	2	6	122327	122332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456302
2582	NC_018621	CCT	2	6	122334	122339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456302
2583	NC_018621	AATT	2	8	122347	122354	50 %	50 %	0 %	0 %	407456302
2584	NC_018621	ATT	2	6	122481	122486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456302
2585	NC_018621	GAA	3	9	122493	122501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456302
2586	NC_018621	CTT	2	6	122539	122544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456302
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2588	NC_018621	TCT	2	6	122590	122595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_018621	AGT	2	6	122619	122624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_018621	T	6	6	122655	122660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_018621	ATTT	2	8	122704	122711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_018621	AAT	2	6	122716	122721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_018621	ATT	2	6	122736	122741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_018621	TGG	2	6	122749	122754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_018621	CTTTT	2	10	122826	122835	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2596	NC_018621	AAAG	2	8	122879	122886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_018621	T	6	6	122895	122900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_018621	T	6	6	122913	122918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_018621	T	6	6	122966	122971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_018621	TAAT	2	8	123048	123055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_018621	GCG	2	6	123074	123079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_018621	TTC	3	9	123137	123145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_018621	AT	3	6	123159	123164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_018621	AAC	2	6	123268	123273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456303
2605	NC_018621	AGCA	2	8	123298	123305	50 %	0 %	25 %	25 %	407456303
2606	NC_018621	TCCT	2	8	123307	123314	0 %	50 %	0 %	50 %	407456303
2607	NC_018621	AGAA	2	8	123364	123371	75 %	0 %	25 %	0 %	407456303
2608	NC_018621	GAGAT	2	10	123382	123391	40 %	20 %	40 %	0 %	407456303
2609	NC_018621	ACA	2	6	123437	123442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456303
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2611	NC_018621	TGA	2	6	123491	123496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456303
2612	NC_018621	CAA	2	6	123525	123530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456303
2613	NC_018621	AAG	2	6	123691	123696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456303
2614	NC_018621	TAC	2	6	123726	123731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456303
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2616	NC_018621	TTG	2	6	123829	123834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456303
2617	NC_018621	TA	4	8	124005	124012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_018621	TTG	2	6	124143	124148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456304
2619	NC_018621	AGC	2	6	124149	124154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456304
2620	NC_018621	AGC	2	6	124227	124232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456304
2621	NC_018621	GAG	2	6	124344	124349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456304
2622	NC_018621	GCT	3	9	124361	124369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456304
2623	NC_018621	AG	3	6	124413	124418	50 %	0 %	50 %	0 %	407456304
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2752	NC_018621	TA	3	6	130470	130475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2753	NC_018621	CT	3	6	130566	130571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2754	NC_018621	T	6	6	130577	130582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2865	NC_018621	A	7	7	135682	135688	100 %	0 %	0 %	0 %	407456314
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2873	NC_018621	CTA	2	6	135966	135971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456314
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2999	NC_018621	TTG	2	6	142925	142930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456323
3000	NC_018621	GTA	2	6	142949	142954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456323

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