MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci VS225 chromosome

Total Repeats: 24630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018621	ACA	2	6	23038	23043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456189
502	NC_018621	AAG	2	6	23052	23057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456189
503	NC_018621	AAG	2	6	23079	23084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456189
504	NC_018621	AAC	2	6	23110	23115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456189
505	NC_018621	GGT	2	6	23162	23167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456189
506	NC_018621	AGC	2	6	23178	23183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456189
507	NC_018621	ATG	2	6	23268	23273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456189
508	NC_018621	AGC	2	6	23285	23290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456189
509	NC_018621	GCT	2	6	23291	23296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456189
510	NC_018621	CTG	2	6	23382	23387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456189
511	NC_018621	ATG	2	6	23583	23588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456189
512	NC_018621	TTA	2	6	23601	23606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456189
513	NC_018621	AAG	2	6	23658	23663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456189
514	NC_018621	GA	3	6	23672	23677	50 %	0 %	50 %	0 %	407456189
515	NC_018621	T	7	7	23805	23811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018621	A	6	6	23889	23894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018621	AGA	2	6	23904	23909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018621	TTG	2	6	24014	24019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456190
519	NC_018621	TGT	2	6	24051	24056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456190
520	NC_018621	AGT	2	6	24068	24073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456190
521	NC_018621	TTG	2	6	24080	24085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456190
522	NC_018621	TCC	2	6	24119	24124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407456190
523	NC_018621	AGCT	2	8	24169	24176	25 %	25 %	25 %	25 %	407456190
524	NC_018621	TTG	2	6	24356	24361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456190
525	NC_018621	GAA	2	6	24366	24371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456190
526	NC_018621	T	6	6	24383	24388	0 %	100 %	0 %	0 %	407456190
527	NC_018621	AAAT	2	8	24506	24513	75 %	25 %	0 %	0 %	407456190
528	NC_018621	CTT	2	6	24520	24525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456190
529	NC_018621	AGG	2	6	24541	24546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456190
530	NC_018621	GTA	2	6	24554	24559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456190
531	NC_018621	GCA	2	6	24615	24620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456190
532	NC_018621	TTA	2	6	24624	24629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456190
533	NC_018621	AATT	2	8	24631	24638	50 %	50 %	0 %	0 %	407456190
534	NC_018621	ATAA	2	8	24698	24705	75 %	25 %	0 %	0 %	407456190
535	NC_018621	T	7	7	24800	24806	0 %	100 %	0 %	0 %	407456191
536	NC_018621	TGT	2	6	24821	24826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456191
537	NC_018621	GCT	2	6	24851	24856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456191
538	NC_018621	TTCT	2	8	24928	24935	0 %	75 %	0 %	25 %	407456191
539	NC_018621	ATC	2	6	24943	24948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456191
540	NC_018621	ACC	2	6	24967	24972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456191
541	NC_018621	TAGT	2	8	24986	24993	25 %	50 %	25 %	0 %	407456191
542	NC_018621	TTG	2	6	25011	25016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456191
543	NC_018621	TTG	2	6	25021	25026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456191
544	NC_018621	ATT	2	6	25114	25119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456191
545	NC_018621	TTC	2	6	25240	25245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456191
546	NC_018621	TTG	2	6	25390	25395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456191
547	NC_018621	GAAC	2	8	25445	25452	50 %	0 %	25 %	25 %	407456191
548	NC_018621	CAG	2	6	25470	25475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456191
549	NC_018621	TA	3	6	25505	25510	50 %	50 %	0 %	0 %	407456191
550	NC_018621	GCA	2	6	25511	25516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456191
551	NC_018621	GTT	2	6	25544	25549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456191
552	NC_018621	AG	3	6	25612	25617	50 %	0 %	50 %	0 %	407456191
553	NC_018621	TAA	2	6	25644	25649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456191
554	NC_018621	CTT	3	9	25650	25658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456191
555	NC_018621	TTA	2	6	25679	25684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456191
556	NC_018621	TTA	2	6	25754	25759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456191
557	NC_018621	TAT	2	6	25791	25796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456191
558	NC_018621	TCA	2	6	25797	25802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456191
559	NC_018621	CCA	2	6	25817	25822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456191
560	NC_018621	TGG	2	6	25824	25829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456191
561	NC_018621	A	6	6	25867	25872	100 %	0 %	0 %	0 %	407456191
562	NC_018621	ATTC	2	8	25884	25891	25 %	50 %	0 %	25 %	407456191
563	NC_018621	TTC	2	6	25897	25902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456191
564	NC_018621	TCT	2	6	25919	25924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456191
565	NC_018621	T	6	6	25996	26001	0 %	100 %	0 %	0 %	407456191
566	NC_018621	TTTC	2	8	26016	26023	0 %	75 %	0 %	25 %	407456191
567	NC_018621	ATT	2	6	26041	26046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456191
568	NC_018621	ATAG	2	8	26111	26118	50 %	25 %	25 %	0 %	407456191
569	NC_018621	AAT	2	6	26119	26124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456191
570	NC_018621	TGT	2	6	26212	26217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456191
571	NC_018621	AGG	2	6	26296	26301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407456191
572	NC_018621	AAC	2	6	26330	26335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456191
573	NC_018621	TAAA	2	8	26475	26482	75 %	25 %	0 %	0 %	407456191
574	NC_018621	TA	3	6	26515	26520	50 %	50 %	0 %	0 %	407456191
575	NC_018621	AGA	2	6	26524	26529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456191
576	NC_018621	ATT	2	6	26537	26542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018621	T	8	8	26579	26586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018621	TTC	2	6	26616	26621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456192
579	NC_018621	ATTT	2	8	26657	26664	25 %	75 %	0 %	0 %	407456192
580	NC_018621	ATTA	2	8	26668	26675	50 %	50 %	0 %	0 %	407456192
581	NC_018621	TTA	2	6	26699	26704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456192
582	NC_018621	A	6	6	26774	26779	100 %	0 %	0 %	0 %	407456193
583	NC_018621	CCA	2	6	26818	26823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407456193
584	NC_018621	TTA	2	6	26825	26830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456193
585	NC_018621	CAA	2	6	26903	26908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456193
586	NC_018621	TGA	2	6	26911	26916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456193
587	NC_018621	AGA	2	6	26959	26964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456193
588	NC_018621	TAA	2	6	26974	26979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456193
589	NC_018621	CTG	2	6	27057	27062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456193
590	NC_018621	GTA	2	6	27066	27071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456193
591	NC_018621	ACA	2	6	27115	27120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456193
592	NC_018621	TTA	2	6	27134	27139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407456193
593	NC_018621	A	6	6	27149	27154	100 %	0 %	0 %	0 %	407456193
594	NC_018621	CTGG	2	8	27188	27195	0 %	25 %	50 %	25 %	407456193
595	NC_018621	AAG	2	6	27276	27281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456193
596	NC_018621	AGC	2	6	27292	27297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456193
597	NC_018621	TA	3	6	27375	27380	50 %	50 %	0 %	0 %	407456193
598	NC_018621	TCT	2	6	27416	27421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407456193
599	NC_018621	GGT	2	6	27431	27436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407456193
600	NC_018621	TC	3	6	27460	27465	0 %	50 %	0 %	50 %	407456193
601	NC_018621	AGA	3	9	27565	27573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456193
602	NC_018621	ACA	2	6	27595	27600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456193
603	NC_018621	GCT	2	6	27770	27775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456193
604	NC_018621	GTT	2	6	27794	27799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456193
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607	NC_018621	AATT	2	8	27961	27968	50 %	50 %	0 %	0 %	407456193
608	NC_018621	TGA	2	6	27976	27981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407456193
609	NC_018621	AAC	2	6	27993	27998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456193
610	NC_018621	TAA	2	6	28009	28014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407456193
611	NC_018621	TA	3	6	28052	28057	50 %	50 %	0 %	0 %	407456193
612	NC_018621	TTG	2	6	28077	28082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456193
613	NC_018621	CTA	2	6	28098	28103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407456193
614	NC_018621	ACA	2	6	28106	28111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407456193
615	NC_018621	AAG	2	6	28143	28148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456193
616	NC_018621	GAC	2	6	28198	28203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456193
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619	NC_018621	GCA	2	6	28370	28375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456193
620	NC_018621	T	6	6	28618	28623	0 %	100 %	0 %	0 %	407456193
621	NC_018621	TGC	2	6	28711	28716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407456193
622	NC_018621	CAG	2	6	28748	28753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456193
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625	NC_018621	AGC	2	6	28837	28842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407456193
626	NC_018621	GAA	2	6	28883	28888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456193
627	NC_018621	GTT	2	6	29002	29007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407456193
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629	NC_018621	GAA	2	6	29078	29083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407456193
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