MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 2054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018620	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018620	GT	3	6	309	314	0 %	50 %	50 %	0 %	407454813
3	NC_018620	TG	3	6	498	503	0 %	50 %	50 %	0 %	407454813
4	NC_018620	TC	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	407454813
5	NC_018620	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	407454814
6	NC_018620	GT	3	6	1461	1466	0 %	50 %	50 %	0 %	407454814
7	NC_018620	TC	3	6	1584	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	407454814
8	NC_018620	TG	3	6	1888	1893	0 %	50 %	50 %	0 %	407454814
9	NC_018620	GA	3	6	2786	2791	50 %	0 %	50 %	0 %	407454815
10	NC_018620	GA	3	6	3340	3345	50 %	0 %	50 %	0 %	407454816
11	NC_018620	AT	3	6	4227	4232	50 %	50 %	0 %	0 %	407454816
12	NC_018620	CT	3	6	4729	4734	0 %	50 %	0 %	50 %	407454816
13	NC_018620	AC	3	6	6153	6158	50 %	0 %	0 %	50 %	407454817
14	NC_018620	CT	3	6	6469	6474	0 %	50 %	0 %	50 %	407454817
15	NC_018620	GA	3	6	6893	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	407454819
16	NC_018620	GT	3	6	7804	7809	0 %	50 %	50 %	0 %	407454819
17	NC_018620	TC	3	6	7875	7880	0 %	50 %	0 %	50 %	407454819
18	NC_018620	AT	3	6	8464	8469	50 %	50 %	0 %	0 %	407454820
19	NC_018620	GT	3	6	8687	8692	0 %	50 %	50 %	0 %	407454820
20	NC_018620	AG	3	6	9230	9235	50 %	0 %	50 %	0 %	407454821
21	NC_018620	TG	3	6	10492	10497	0 %	50 %	50 %	0 %	407454821
22	NC_018620	GT	3	6	10801	10806	0 %	50 %	50 %	0 %	407454821
23	NC_018620	TC	3	6	11262	11267	0 %	50 %	0 %	50 %	407454822
24	NC_018620	AC	3	6	11278	11283	50 %	0 %	0 %	50 %	407454822
25	NC_018620	AT	3	6	11522	11527	50 %	50 %	0 %	0 %	407454822
26	NC_018620	GA	3	6	11601	11606	50 %	0 %	50 %	0 %	407454822
27	NC_018620	AG	3	6	11789	11794	50 %	0 %	50 %	0 %	407454822
28	NC_018620	TC	3	6	11842	11847	0 %	50 %	0 %	50 %	407454822
29	NC_018620	GT	3	6	12057	12062	0 %	50 %	50 %	0 %	407454822
30	NC_018620	AG	3	6	12514	12519	50 %	0 %	50 %	0 %	407454822
31	NC_018620	GA	3	6	12585	12590	50 %	0 %	50 %	0 %	407454822
32	NC_018620	GT	3	6	12866	12871	0 %	50 %	50 %	0 %	407454822
33	NC_018620	TA	3	6	13806	13811	50 %	50 %	0 %	0 %	407454822
34	NC_018620	TA	3	6	13826	13831	50 %	50 %	0 %	0 %	407454822
35	NC_018620	AT	3	6	14110	14115	50 %	50 %	0 %	0 %	407454823
36	NC_018620	CT	3	6	14790	14795	0 %	50 %	0 %	50 %	407454825
37	NC_018620	TA	3	6	15120	15125	50 %	50 %	0 %	0 %	407454825
38	NC_018620	TG	4	8	15658	15665	0 %	50 %	50 %	0 %	407454825
39	NC_018620	AG	3	6	17697	17702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018620	TC	3	6	18953	18958	0 %	50 %	0 %	50 %	407454830
41	NC_018620	GT	3	6	19394	19399	0 %	50 %	50 %	0 %	407454830
42	NC_018620	TA	3	6	19438	19443	50 %	50 %	0 %	0 %	407454830
43	NC_018620	TC	3	6	19544	19549	0 %	50 %	0 %	50 %	407454830
44	NC_018620	GT	3	6	19673	19678	0 %	50 %	50 %	0 %	407454830
45	NC_018620	AC	3	6	20114	20119	50 %	0 %	0 %	50 %	407454830
46	NC_018620	TC	3	6	21145	21150	0 %	50 %	0 %	50 %	407454831
47	NC_018620	GA	3	6	22446	22451	50 %	0 %	50 %	0 %	407454832
48	NC_018620	GA	3	6	23669	23674	50 %	0 %	50 %	0 %	407454832
49	NC_018620	AT	3	6	24448	24453	50 %	50 %	0 %	0 %	407454833
50	NC_018620	TC	3	6	24509	24514	0 %	50 %	0 %	50 %	407454833
51	NC_018620	AG	3	6	25608	25613	50 %	0 %	50 %	0 %	407454833
52	NC_018620	TA	3	6	26511	26516	50 %	50 %	0 %	0 %	407454833
53	NC_018620	TA	3	6	27371	27376	50 %	50 %	0 %	0 %	407454834
54	NC_018620	TC	3	6	27456	27461	0 %	50 %	0 %	50 %	407454834
55	NC_018620	AC	3	6	27624	27629	50 %	0 %	0 %	50 %	407454834
56	NC_018620	TA	3	6	28048	28053	50 %	50 %	0 %	0 %	407454834
57	NC_018620	GA	3	6	28757	28762	50 %	0 %	50 %	0 %	407454834
58	NC_018620	AG	3	6	29919	29924	50 %	0 %	50 %	0 %	407454836
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60	NC_018620	GA	3	6	31102	31107	50 %	0 %	50 %	0 %	407454838
61	NC_018620	GA	4	8	31232	31239	50 %	0 %	50 %	0 %	407454838
62	NC_018620	TC	3	6	31845	31850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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64	NC_018620	AG	3	6	34605	34610	50 %	0 %	50 %	0 %	407454843
65	NC_018620	AG	3	6	34677	34682	50 %	0 %	50 %	0 %	407454843
66	NC_018620	AT	3	6	34723	34728	50 %	50 %	0 %	0 %	407454843
67	NC_018620	TG	3	6	34812	34817	0 %	50 %	50 %	0 %	407454843
68	NC_018620	CG	3	6	35124	35129	0 %	0 %	50 %	50 %	407454843
69	NC_018620	AT	3	6	35443	35448	50 %	50 %	0 %	0 %	407454843
70	NC_018620	GA	3	6	35924	35929	50 %	0 %	50 %	0 %	407454844
71	NC_018620	TA	3	6	37497	37502	50 %	50 %	0 %	0 %	407454844
72	NC_018620	TC	3	6	37735	37740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018620	GA	3	6	38467	38472	50 %	0 %	50 %	0 %	407454845
74	NC_018620	CG	3	6	38496	38501	0 %	0 %	50 %	50 %	407454845
75	NC_018620	TA	3	6	38502	38507	50 %	50 %	0 %	0 %	407454845
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78	NC_018620	GC	3	6	40340	40345	0 %	0 %	50 %	50 %	407454848
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80	NC_018620	AT	3	6	41774	41779	50 %	50 %	0 %	0 %	407454848
81	NC_018620	CT	3	6	41884	41889	0 %	50 %	0 %	50 %	407454848
82	NC_018620	CA	3	6	44107	44112	50 %	0 %	0 %	50 %	407454852
83	NC_018620	CA	3	6	44318	44323	50 %	0 %	0 %	50 %	407454853
84	NC_018620	AG	3	6	45650	45655	50 %	0 %	50 %	0 %	407454854
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88	NC_018620	AT	3	6	48260	48265	50 %	50 %	0 %	0 %	407454857
89	NC_018620	AT	3	6	48512	48517	50 %	50 %	0 %	0 %	407454857
90	NC_018620	CT	3	6	48569	48574	0 %	50 %	0 %	50 %	407454857
91	NC_018620	TA	3	6	48872	48877	50 %	50 %	0 %	0 %	407454857
92	NC_018620	AG	3	6	49400	49405	50 %	0 %	50 %	0 %	407454857
93	NC_018620	GC	3	6	49969	49974	0 %	0 %	50 %	50 %	407454858
94	NC_018620	TC	3	6	50374	50379	0 %	50 %	0 %	50 %	407454858
95	NC_018620	TA	3	6	50547	50552	50 %	50 %	0 %	0 %	407454858
96	NC_018620	TA	3	6	52209	52214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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98	NC_018620	AT	3	6	53286	53291	50 %	50 %	0 %	0 %	407454860
99	NC_018620	AG	3	6	55427	55432	50 %	0 %	50 %	0 %	407454863
100	NC_018620	AG	4	8	56041	56048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_018620	AG	3	6	58514	58519	50 %	0 %	50 %	0 %	407454866
104	NC_018620	GA	3	6	59289	59294	50 %	0 %	50 %	0 %	407454866
105	NC_018620	TG	3	6	59854	59859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018620	AG	3	6	60268	60273	50 %	0 %	50 %	0 %	407454867
107	NC_018620	TA	3	6	60538	60543	50 %	50 %	0 %	0 %	407454867
108	NC_018620	AG	3	6	60569	60574	50 %	0 %	50 %	0 %	407454867
109	NC_018620	AG	3	6	62101	62106	50 %	0 %	50 %	0 %	407454867
110	NC_018620	TC	3	6	62553	62558	0 %	50 %	0 %	50 %	407454867
111	NC_018620	TG	4	8	62769	62776	0 %	50 %	50 %	0 %	407454867
112	NC_018620	TG	3	6	63268	63273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018620	TC	3	6	64747	64752	0 %	50 %	0 %	50 %	407454869
114	NC_018620	TG	3	6	65512	65517	0 %	50 %	50 %	0 %	407454869
115	NC_018620	CA	4	8	65799	65806	50 %	0 %	0 %	50 %	407454869
116	NC_018620	GA	4	8	66538	66545	50 %	0 %	50 %	0 %	407454870
117	NC_018620	AT	3	6	67317	67322	50 %	50 %	0 %	0 %	407454871
118	NC_018620	GA	4	8	67424	67431	50 %	0 %	50 %	0 %	407454871
119	NC_018620	CT	3	6	67502	67507	0 %	50 %	0 %	50 %	407454871
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121	NC_018620	GT	3	6	68130	68135	0 %	50 %	50 %	0 %	407454871
122	NC_018620	TA	3	6	68571	68576	50 %	50 %	0 %	0 %	407454872
123	NC_018620	TA	3	6	69274	69279	50 %	50 %	0 %	0 %	407454872
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126	NC_018620	GT	3	6	71996	72001	0 %	50 %	50 %	0 %	407454876
127	NC_018620	GT	3	6	73658	73663	0 %	50 %	50 %	0 %	407454878
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130	NC_018620	TC	3	6	75993	75998	0 %	50 %	0 %	50 %	407454880
131	NC_018620	GC	3	6	76225	76230	0 %	0 %	50 %	50 %	407454881
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133	NC_018620	TC	3	6	76395	76400	0 %	50 %	0 %	50 %	407454881
134	NC_018620	CA	3	6	76530	76535	50 %	0 %	0 %	50 %	407454881
135	NC_018620	CT	3	6	76718	76723	0 %	50 %	0 %	50 %	407454881
136	NC_018620	CG	3	6	76828	76833	0 %	0 %	50 %	50 %	407454881
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143	NC_018620	AC	3	6	81914	81919	50 %	0 %	0 %	50 %	407454885
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