MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 24352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018620	TTA	2	6	191153	191158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455002
4002	NC_018620	TCT	2	6	191233	191238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455002
4003	NC_018620	CTT	3	9	191269	191277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455002
4004	NC_018620	A	6	6	191280	191285	100 %	0 %	0 %	0 %	407455002
4005	NC_018620	ATA	2	6	191343	191348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407455002
4006	NC_018620	TCA	2	6	191352	191357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455002
4007	NC_018620	ATT	2	6	191392	191397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455002
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4009	NC_018620	A	6	6	191433	191438	100 %	0 %	0 %	0 %	407455002
4010	NC_018620	GAA	2	6	191445	191450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455002
4011	NC_018620	CAA	2	6	191466	191471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455002
4012	NC_018620	ATT	3	9	191491	191499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455002
4013	NC_018620	TGG	2	6	191503	191508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407455002
4014	NC_018620	TCA	2	6	191532	191537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455002
4015	NC_018620	ATC	2	6	191566	191571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455002
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4017	NC_018620	GAAA	2	8	191618	191625	75 %	0 %	25 %	0 %	407455002
4018	NC_018620	ACA	2	6	191626	191631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455002
4019	NC_018620	TTG	2	6	191646	191651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_018620	AGAT	2	8	191689	191696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_018620	ACG	2	6	191712	191717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_018620	TTC	2	6	191744	191749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455003
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4030	NC_018620	AAG	2	6	192199	192204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455003
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4033	NC_018620	TTA	2	6	192426	192431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455003
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4036	NC_018620	TC	3	6	192610	192615	0 %	50 %	0 %	50 %	407455003
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4054	NC_018620	TGA	2	6	193151	193156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455003
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4057	NC_018620	ATC	2	6	193276	193281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455003
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4064	NC_018620	T	6	6	193549	193554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_018620	CT	3	6	193614	193619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_018620	GTTT	2	8	193622	193629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4071	NC_018620	TTTTA	2	10	193821	193830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4073	NC_018620	ATTTA	2	10	193855	193864	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_018620	T	8	8	193904	193911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_018620	TTC	2	6	194027	194032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455004
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4096	NC_018620	GCTA	2	8	195100	195107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_018620	TGT	2	6	195178	195183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_018620	CCCTA	2	10	195184	195193	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4099	NC_018620	ATT	2	6	195295	195300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_018620	GTCT	2	8	195324	195331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4101	NC_018620	AGT	2	6	195343	195348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_018620	TAAA	3	12	195362	195373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_018620	CA	3	6	195405	195410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_018620	GAG	2	6	195445	195450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_018620	TAA	2	6	195512	195517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_018620	AGT	2	6	195525	195530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_018620	TTA	2	6	195537	195542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_018620	A	7	7	195577	195583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_018620	TAA	2	6	195590	195595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_018620	A	6	6	195632	195637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_018620	GAA	2	6	195642	195647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_018620	CTA	2	6	195648	195653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_018620	GTT	2	6	195663	195668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_018620	G	6	6	195689	195694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_018620	ACA	2	6	195720	195725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455005
4116	NC_018620	GAC	2	6	195745	195750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407455005
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4120	NC_018620	CAAA	2	8	195858	195865	75 %	0 %	0 %	25 %	407455005
4121	NC_018620	AAC	2	6	195885	195890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455005
4122	NC_018620	AAG	2	6	195949	195954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455005
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4126	NC_018620	GAG	2	6	196079	196084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407455005
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4128	NC_018620	TTA	2	6	196106	196111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455005
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4236	NC_018620	TTA	2	6	200812	200817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455010
4237	NC_018620	A	6	6	200855	200860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_018620	T	6	6	200888	200893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_018620	ATTAA	2	10	200950	200959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_018620	TAAT	2	8	200966	200973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_018620	ATC	2	6	201180	201185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455011
4242	NC_018620	CTTA	2	8	201240	201247	25 %	50 %	0 %	25 %	407455011
4243	NC_018620	TTGGT	2	10	201326	201335	0 %	60 %	40 %	0 %	407455011
4244	NC_018620	CAA	2	6	201413	201418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455011
4245	NC_018620	GAT	2	6	201433	201438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455011
4246	NC_018620	CAT	2	6	201503	201508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455011
4247	NC_018620	AGG	2	6	201551	201556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_018620	CCT	2	6	201564	201569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407455012
4249	NC_018620	TTC	2	6	201629	201634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455012
4250	NC_018620	CTT	2	6	201688	201693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455012
4251	NC_018620	AAG	2	6	201696	201701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455012
4252	NC_018620	TC	4	8	201763	201770	0 %	50 %	0 %	50 %	407455012
4253	NC_018620	TCT	2	6	201780	201785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407455012
4254	NC_018620	GTA	2	6	201803	201808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407455012
4255	NC_018620	TCAT	2	8	201855	201862	25 %	50 %	0 %	25 %	407455012
4256	NC_018620	A	6	6	202019	202024	100 %	0 %	0 %	0 %	407455012
4257	NC_018620	CTG	2	6	202042	202047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407455012
4258	NC_018620	TCA	2	6	202089	202094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455012
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4260	NC_018620	CAA	2	6	202135	202140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455012
4261	NC_018620	TGCAGA	2	12	202148	202159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407455012
4262	NC_018620	T	6	6	202199	202204	0 %	100 %	0 %	0 %	407455012
4263	NC_018620	ACA	2	6	202254	202259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455012
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4265	NC_018620	GA	3	6	202305	202310	50 %	0 %	50 %	0 %	407455012
4266	NC_018620	CCT	2	6	202314	202319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407455012
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4271	NC_018620	TAC	2	6	202549	202554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455012
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4273	NC_018620	T	6	6	202681	202686	0 %	100 %	0 %	0 %	407455012
4274	NC_018620	AAT	2	6	202703	202708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407455012
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4283	NC_018620	CTTT	2	8	203187	203194	0 %	75 %	0 %	25 %	407455012
4284	NC_018620	T	6	6	203244	203249	0 %	100 %	0 %	0 %	407455012
4285	NC_018620	T	6	6	203258	203263	0 %	100 %	0 %	0 %	407455012
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4293	NC_018620	A	6	6	203668	203673	100 %	0 %	0 %	0 %	407455014
4294	NC_018620	T	6	6	203674	203679	0 %	100 %	0 %	0 %	407455014
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4296	NC_018620	AGCAA	2	10	203803	203812	60 %	0 %	20 %	20 %	407455014
4297	NC_018620	ATC	2	6	203839	203844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407455014
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4300	NC_018620	A	6	6	203893	203898	100 %	0 %	0 %	0 %	407455014
4301	NC_018620	TAAA	2	8	203979	203986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4302	NC_018620	TTG	2	6	204000	204005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4332	NC_018620	TAG	2	6	205139	205144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4347	NC_018620	GAA	2	6	205772	205777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455018
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4353	NC_018620	ATA	2	6	206058	206063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4364	NC_018620	ATT	2	6	206335	206340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407455019
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4369	NC_018620	AGA	3	9	206823	206831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455019
4370	NC_018620	AAAAT	2	10	206864	206873	80 %	20 %	0 %	0 %	407455019
4371	NC_018620	CAA	2	6	206917	206922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407455019
4372	NC_018620	A	6	6	206991	206996	100 %	0 %	0 %	0 %	407455019
4373	NC_018620	GAA	2	6	207001	207006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407455019
4374	NC_018620	GTCG	2	8	207076	207083	0 %	25 %	50 %	25 %	407455019
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4499	NC_018620	AAAG	2	8	213155	213162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_018620	TAC	2	6	213181	213186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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