MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 24352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018620	AGAAA	2	10	143313	143322	80 %	0 %	20 %	0 %	407454958
3002	NC_018620	ATT	2	6	143325	143330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454958
3003	NC_018620	TAC	2	6	143343	143348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454958
3004	NC_018620	TGA	2	6	143487	143492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454958
3005	NC_018620	TAC	2	6	143522	143527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454958
3006	NC_018620	CAG	2	6	143531	143536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454958
3007	NC_018620	TTG	3	9	143591	143599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454958
3008	NC_018620	TA	3	6	143654	143659	50 %	50 %	0 %	0 %	407454958
3009	NC_018620	ATG	2	6	143762	143767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454958
3010	NC_018620	TAT	2	6	143781	143786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454958
3011	NC_018620	ATT	2	6	143833	143838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454958
3012	NC_018620	TAG	2	6	143870	143875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454958
3013	NC_018620	TTC	2	6	143876	143881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454958
3014	NC_018620	GTG	2	6	143882	143887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454958
3015	NC_018620	AGA	2	6	143888	143893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454958
3016	NC_018620	TTG	2	6	143899	143904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454958
3017	NC_018620	TTA	2	6	143998	144003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454959
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3019	NC_018620	GAG	2	6	144064	144069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407454959
3020	NC_018620	TCTA	2	8	144107	144114	25 %	50 %	0 %	25 %	407454959
3021	NC_018620	T	6	6	144200	144205	0 %	100 %	0 %	0 %	407454959
3022	NC_018620	TTG	2	6	144235	144240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454959
3023	NC_018620	ATA	2	6	144400	144405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454959
3024	NC_018620	CAG	2	6	144408	144413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454959
3025	NC_018620	TAG	2	6	144418	144423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454959
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3029	NC_018620	AT	3	6	144734	144739	50 %	50 %	0 %	0 %	407454959
3030	NC_018620	T	6	6	144791	144796	0 %	100 %	0 %	0 %	407454959
3031	NC_018620	AAT	2	6	144810	144815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454959
3032	NC_018620	TGAA	2	8	144822	144829	50 %	25 %	25 %	0 %	407454959
3033	NC_018620	GGAA	3	12	144830	144841	50 %	0 %	50 %	0 %	407454959
3034	NC_018620	TCC	2	6	144842	144847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454959
3035	NC_018620	AGTA	2	8	144863	144870	50 %	25 %	25 %	0 %	407454959
3036	NC_018620	A	7	7	144879	144885	100 %	0 %	0 %	0 %	407454959
3037	NC_018620	TAT	2	6	144956	144961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_018620	TAA	2	6	144963	144968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_018620	AAT	2	6	145049	145054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454960
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3052	NC_018620	ACT	2	6	145515	145520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454960
3053	NC_018620	TTA	2	6	145538	145543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454960
3054	NC_018620	CT	4	8	145632	145639	0 %	50 %	0 %	50 %	407454960
3055	NC_018620	TCC	2	6	145693	145698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454960
3056	NC_018620	T	6	6	145730	145735	0 %	100 %	0 %	0 %	407454960
3057	NC_018620	AGA	2	6	145756	145761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454960
3058	NC_018620	GAT	2	6	145870	145875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454960
3059	NC_018620	TA	3	6	145963	145968	50 %	50 %	0 %	0 %	407454960
3060	NC_018620	AAAGA	2	10	145978	145987	80 %	0 %	20 %	0 %	407454960
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3062	NC_018620	ATA	2	6	146034	146039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454960
3063	NC_018620	TTAT	2	8	146060	146067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_018620	TTAT	2	8	146095	146102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_018620	GTAA	2	8	146116	146123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_018620	TG	3	6	146314	146319	0 %	50 %	50 %	0 %	407454961
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3071	NC_018620	A	6	6	146509	146514	100 %	0 %	0 %	0 %	407454962
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3076	NC_018620	TAGAG	2	10	146649	146658	40 %	20 %	40 %	0 %	407454962
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3078	NC_018620	TCT	2	6	146730	146735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_018620	TTA	2	6	146768	146773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_018620	TAGG	2	8	146930	146937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_018620	GAA	2	6	147025	147030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_018620	T	6	6	147036	147041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_018620	TTC	2	6	147061	147066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_018620	CT	3	6	147107	147112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3092	NC_018620	T	6	6	147504	147509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_018620	G	6	6	147580	147585	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_018620	TGTTT	2	10	147586	147595	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_018620	ACA	2	6	147603	147608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_018620	A	6	6	147624	147629	100 %	0 %	0 %	0 %	407454965
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3099	NC_018620	TGA	2	6	147686	147691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454965
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3101	NC_018620	TCTGAA	2	12	147732	147743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407454965
3102	NC_018620	A	7	7	147747	147753	100 %	0 %	0 %	0 %	407454965
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3104	NC_018620	TGA	2	6	147801	147806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_018620	TAA	2	6	147901	147906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_018620	TAA	2	6	147931	147936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_018620	C	6	6	148038	148043	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3108	NC_018620	TTTTA	2	10	148084	148093	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_018620	ATT	2	6	148157	148162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_018620	TAA	2	6	148167	148172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_018620	AGA	2	6	148173	148178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_018620	TCGT	2	8	148203	148210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3113	NC_018620	T	6	6	148245	148250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_018620	GAA	2	6	148319	148324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_018620	A	6	6	148428	148433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_018620	AAAG	2	8	148488	148495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_018620	T	6	6	148530	148535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_018620	AAAG	2	8	148536	148543	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_018620	T	7	7	148551	148557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_018620	GTT	2	6	148558	148563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_018620	GTG	2	6	148627	148632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_018620	TGC	2	6	148686	148691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_018620	GT	3	6	148729	148734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_018620	GT	3	6	148753	148758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_018620	GTC	2	6	148789	148794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_018620	AATG	2	8	148828	148835	50 %	25 %	25 %	0 %	407454966
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3128	NC_018620	CAT	2	6	148911	148916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454966
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