MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 24352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_018620	CAA	2	6	45426	45431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454853
1003	NC_018620	GCT	2	6	45599	45604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454854
1004	NC_018620	A	6	6	45616	45621	100 %	0 %	0 %	0 %	407454854
1005	NC_018620	A	6	6	45633	45638	100 %	0 %	0 %	0 %	407454854
1006	NC_018620	AG	3	6	45650	45655	50 %	0 %	50 %	0 %	407454854
1007	NC_018620	GTT	2	6	45713	45718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454854
1008	NC_018620	GAA	4	12	45734	45745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454854
1009	NC_018620	AGC	2	6	45775	45780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454854
1010	NC_018620	AGA	3	9	45829	45837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454854
1011	NC_018620	AGA	2	6	45856	45861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454854
1012	NC_018620	AAG	2	6	45870	45875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454854
1013	NC_018620	AGA	2	6	45883	45888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454854
1014	NC_018620	A	9	9	45947	45955	100 %	0 %	0 %	0 %	407454854
1015	NC_018620	TAAA	2	8	45989	45996	75 %	25 %	0 %	0 %	407454854
1016	NC_018620	ACA	2	6	46041	46046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454855
1017	NC_018620	TCTTT	2	10	46088	46097	0 %	80 %	0 %	20 %	407454855
1018	NC_018620	CAA	2	6	46108	46113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454855
1019	NC_018620	AAG	2	6	46160	46165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454855
1020	NC_018620	GTG	2	6	46169	46174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407454855
1021	NC_018620	TGA	2	6	46176	46181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454855
1022	NC_018620	AGA	2	6	46191	46196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454855
1023	NC_018620	TCT	2	6	46213	46218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454855
1024	NC_018620	AGA	3	9	46221	46229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454855
1025	NC_018620	AGA	2	6	46233	46238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454855
1026	NC_018620	CAG	2	6	46271	46276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454855
1027	NC_018620	GTT	2	6	46318	46323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454855
1028	NC_018620	CAG	2	6	46426	46431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454855
1029	NC_018620	TAG	2	6	46433	46438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454855
1030	NC_018620	GAT	2	6	46546	46551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454855
1031	NC_018620	AAT	2	6	46585	46590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454855
1032	NC_018620	A	6	6	46623	46628	100 %	0 %	0 %	0 %	407454855
1033	NC_018620	GAA	2	6	46690	46695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454855
1034	NC_018620	TGC	2	6	46719	46724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454855
1035	NC_018620	AAG	2	6	46757	46762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454855
1036	NC_018620	CAG	4	12	46771	46782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454855
1037	NC_018620	GAA	2	6	46813	46818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454855
1038	NC_018620	AGC	2	6	46851	46856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454856
1039	NC_018620	TCC	2	6	46935	46940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454856
1040	NC_018620	GAAA	2	8	46971	46978	75 %	0 %	25 %	0 %	407454856
1041	NC_018620	AGA	2	6	46989	46994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454856
1042	NC_018620	CTG	2	6	47030	47035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454856
1043	NC_018620	CA	3	6	47058	47063	50 %	0 %	0 %	50 %	407454856
1044	NC_018620	TCTT	2	8	47077	47084	0 %	75 %	0 %	25 %	407454856
1045	NC_018620	AGCCC	2	10	47085	47094	20 %	0 %	20 %	60 %	407454856
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1047	NC_018620	TCA	2	6	47460	47465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454856
1048	NC_018620	GAA	2	6	47524	47529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454856
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1050	NC_018620	GTT	2	6	47570	47575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454856
1051	NC_018620	AGA	2	6	47592	47597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454856
1052	NC_018620	GCTT	2	8	47606	47613	0 %	50 %	25 %	25 %	407454856
1053	NC_018620	TTG	2	6	47648	47653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454856
1054	NC_018620	AAG	2	6	47702	47707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454856
1055	NC_018620	GAA	2	6	47716	47721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454856
1056	NC_018620	TAG	2	6	47768	47773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454856
1057	NC_018620	TC	4	8	47817	47824	0 %	50 %	0 %	50 %	407454856
1058	NC_018620	AAGA	2	8	48048	48055	75 %	0 %	25 %	0 %	407454857
1059	NC_018620	AAG	2	6	48166	48171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454857
1060	NC_018620	ATT	2	6	48177	48182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454857
1061	NC_018620	TA	3	6	48246	48251	50 %	50 %	0 %	0 %	407454857
1062	NC_018620	AT	3	6	48260	48265	50 %	50 %	0 %	0 %	407454857
1063	NC_018620	TGTT	2	8	48458	48465	0 %	75 %	25 %	0 %	407454857
1064	NC_018620	AT	3	6	48512	48517	50 %	50 %	0 %	0 %	407454857
1065	NC_018620	AAC	2	6	48526	48531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454857
1066	NC_018620	CT	3	6	48569	48574	0 %	50 %	0 %	50 %	407454857
1067	NC_018620	TAA	2	6	48773	48778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454857
1068	NC_018620	AGC	2	6	48802	48807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454857
1069	NC_018620	CAG	2	6	48813	48818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454857
1070	NC_018620	TTG	2	6	48844	48849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454857
1071	NC_018620	CTT	2	6	48857	48862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407454857
1072	NC_018620	TA	3	6	48872	48877	50 %	50 %	0 %	0 %	407454857
1073	NC_018620	TAC	2	6	48909	48914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454857
1074	NC_018620	TAT	2	6	48992	48997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454857
1075	NC_018620	A	7	7	49135	49141	100 %	0 %	0 %	0 %	407454857
1076	NC_018620	A	7	7	49184	49190	100 %	0 %	0 %	0 %	407454857
1077	NC_018620	TAC	2	6	49214	49219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454857
1078	NC_018620	AG	3	6	49400	49405	50 %	0 %	50 %	0 %	407454857
1079	NC_018620	GAA	2	6	49506	49511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_018620	ATAA	2	8	49526	49533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_018620	A	6	6	49535	49540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_018620	TCTAT	2	10	49559	49568	20 %	60 %	0 %	20 %	407454858
1083	NC_018620	TGC	2	6	49672	49677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407454858
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1085	NC_018620	A	7	7	49711	49717	100 %	0 %	0 %	0 %	407454858
1086	NC_018620	AAGC	2	8	49724	49731	50 %	0 %	25 %	25 %	407454858
1087	NC_018620	CCAA	2	8	49748	49755	50 %	0 %	0 %	50 %	407454858
1088	NC_018620	A	6	6	49772	49777	100 %	0 %	0 %	0 %	407454858
1089	NC_018620	A	7	7	49837	49843	100 %	0 %	0 %	0 %	407454858
1090	NC_018620	A	6	6	49879	49884	100 %	0 %	0 %	0 %	407454858
1091	NC_018620	TTCC	2	8	49895	49902	0 %	50 %	0 %	50 %	407454858
1092	NC_018620	AAG	2	6	49908	49913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454858
1093	NC_018620	A	6	6	49914	49919	100 %	0 %	0 %	0 %	407454858
1094	NC_018620	GAA	3	9	49943	49951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454858
1095	NC_018620	GC	3	6	49969	49974	0 %	0 %	50 %	50 %	407454858
1096	NC_018620	A	6	6	50015	50020	100 %	0 %	0 %	0 %	407454858
1097	NC_018620	AGA	2	6	50026	50031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454858
1098	NC_018620	AAG	3	9	50052	50060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454858
1099	NC_018620	AAC	2	6	50121	50126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454858
1100	NC_018620	CAA	2	6	50160	50165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454858
1101	NC_018620	AAG	3	9	50166	50174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407454858
1102	NC_018620	TTA	2	6	50267	50272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454858
1103	NC_018620	TC	3	6	50374	50379	0 %	50 %	0 %	50 %	407454858
1104	NC_018620	TGT	2	6	50521	50526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454858
1105	NC_018620	TA	3	6	50547	50552	50 %	50 %	0 %	0 %	407454858
1106	NC_018620	ATT	2	6	50579	50584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407454858
1107	NC_018620	ATG	2	6	50601	50606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454858
1108	NC_018620	AGC	2	6	50689	50694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454858
1109	NC_018620	TCC	2	6	50858	50863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454858
1110	NC_018620	AACA	2	8	50872	50879	75 %	0 %	0 %	25 %	407454858
1111	NC_018620	ACT	2	6	50890	50895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454858
1112	NC_018620	GAT	2	6	50933	50938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454858
1113	NC_018620	GCA	2	6	50951	50956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407454858
1114	NC_018620	ATC	2	6	50965	50970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454858
1115	NC_018620	TCA	2	6	51102	51107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454858
1116	NC_018620	AAT	2	6	51140	51145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407454858
1117	NC_018620	AGT	2	6	51184	51189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454858
1118	NC_018620	TGA	2	6	51304	51309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454858
1119	NC_018620	CCT	2	6	51383	51388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454858
1120	NC_018620	ATG	2	6	51452	51457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407454858
1121	NC_018620	TTTGG	2	10	51473	51482	0 %	60 %	40 %	0 %	407454858
1122	NC_018620	CTC	2	6	51539	51544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407454858
1123	NC_018620	CAA	2	6	51611	51616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407454858
1124	NC_018620	CAT	2	6	51618	51623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407454858
1125	NC_018620	TTG	2	6	51627	51632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407454858
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