MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018619	GAAAA	2	10	3354	3363	80 %	0 %	20 %	0 %	407453480
2	NC_018619	AGGAG	2	10	4412	4421	40 %	0 %	60 %	0 %	407453481
3	NC_018619	TGTTT	2	10	6760	6769	0 %	80 %	20 %	0 %	407453483
4	NC_018619	AACAT	2	10	7324	7333	60 %	20 %	0 %	20 %	407453484
5	NC_018619	ATAAA	2	10	13045	13054	80 %	20 %	0 %	0 %	407453486
6	NC_018619	AACTC	2	10	13489	13498	40 %	20 %	0 %	40 %	407453486
7	NC_018619	GTTTT	2	10	13559	13568	0 %	80 %	20 %	0 %	407453486
8	NC_018619	GAAAC	2	10	14327	14336	60 %	0 %	20 %	20 %	407453487
9	NC_018619	AACAA	2	10	15356	15365	80 %	0 %	0 %	20 %	407453487
10	NC_018619	AATAG	2	10	17068	17077	60 %	20 %	20 %	0 %	407453489
11	NC_018619	GCCTA	2	10	19904	19913	20 %	20 %	20 %	40 %	407453493
12	NC_018619	AGTGT	2	10	21117	21126	20 %	40 %	40 %	0 %	407453495
13	NC_018619	GCCAC	2	10	29445	29454	20 %	0 %	20 %	60 %	407453500
14	NC_018619	ATAAA	2	10	34285	34294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018619	AAGGA	2	10	38577	38586	60 %	0 %	40 %	0 %	407453510
16	NC_018619	CCATA	2	10	38784	38793	40 %	20 %	0 %	40 %	407453510
17	NC_018619	CTTTA	2	10	38950	38959	20 %	60 %	0 %	20 %	407453510
18	NC_018619	CTTTC	2	10	43212	43221	0 %	60 %	0 %	40 %	407453516
19	NC_018619	ACAAA	2	10	43874	43883	80 %	0 %	0 %	20 %	407453517
20	NC_018619	TATGG	2	10	44284	44293	20 %	40 %	40 %	0 %	407453518
21	NC_018619	TCTTT	2	10	46092	46101	0 %	80 %	0 %	20 %	407453520
22	NC_018619	AGCCC	2	10	47089	47098	20 %	0 %	20 %	60 %	407453521
23	NC_018619	TCAAA	2	10	47444	47453	60 %	20 %	0 %	20 %	407453521
24	NC_018619	TCTAT	2	10	49562	49571	20 %	60 %	0 %	20 %	407453524
25	NC_018619	TTTGG	2	10	51476	51485	0 %	60 %	40 %	0 %	407453524
26	NC_018619	TTTTG	2	10	52485	52494	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018619	TTTTC	2	10	55345	55354	0 %	80 %	0 %	20 %	407453528
28	NC_018619	GTAAG	2	10	57392	57401	40 %	20 %	40 %	0 %	407453532
29	NC_018619	TTAAT	2	10	57964	57973	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018619	TCTTT	2	10	59408	59417	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018619	AAAAT	2	10	60214	60223	80 %	20 %	0 %	0 %	407453534
32	NC_018619	TAGTT	2	10	62816	62825	20 %	60 %	20 %	0 %	407453534
33	NC_018619	GAATG	2	10	62832	62841	40 %	20 %	40 %	0 %	407453534
34	NC_018619	TTGTT	2	10	63818	63827	0 %	80 %	20 %	0 %	407453535
35	NC_018619	TCCTA	2	10	64882	64891	20 %	40 %	0 %	40 %	407453536
36	NC_018619	AGAAA	2	10	70138	70147	80 %	0 %	20 %	0 %	407453540
37	NC_018619	GGATA	2	10	70946	70955	40 %	20 %	40 %	0 %	407453542
38	NC_018619	CACTT	2	10	71129	71138	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_018619	ATAGC	2	10	74385	74394	40 %	20 %	20 %	20 %	407453546
40	NC_018619	GCACA	2	10	77218	77227	40 %	0 %	20 %	40 %	407453548
41	NC_018619	AATTT	2	10	77742	77751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018619	AAAGA	2	10	78171	78180	80 %	0 %	20 %	0 %	407453549
43	NC_018619	AGTTC	2	10	79176	79185	20 %	40 %	20 %	20 %	407453549
44	NC_018619	CGTAT	2	10	81545	81554	20 %	40 %	20 %	20 %	407453551
45	NC_018619	GAAAA	2	10	82755	82764	80 %	0 %	20 %	0 %	407453552
46	NC_018619	AGGAA	2	10	84754	84763	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018619	CTTTT	2	10	85643	85652	0 %	80 %	0 %	20 %	407453556
48	NC_018619	CAAAG	2	10	87114	87123	60 %	0 %	20 %	20 %	407453558
49	NC_018619	AACAA	2	10	87281	87290	80 %	0 %	0 %	20 %	407453558
50	NC_018619	AGAAA	2	10	87351	87360	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018619	AAAGA	2	10	89185	89194	80 %	0 %	20 %	0 %	407453560
52	NC_018619	TTTTC	2	10	90200	90209	0 %	80 %	0 %	20 %	407453560
53	NC_018619	AGGAT	2	10	90723	90732	40 %	20 %	40 %	0 %	407453560
54	NC_018619	ATAAC	2	10	90809	90818	60 %	20 %	0 %	20 %	407453560
55	NC_018619	TGGCA	2	10	93294	93303	20 %	20 %	40 %	20 %	407453561
56	NC_018619	AATTA	2	10	93959	93968	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018619	TGTTT	2	10	95020	95029	0 %	80 %	20 %	0 %	407453563
58	NC_018619	TCACC	2	10	96594	96603	20 %	20 %	0 %	60 %	407453564
59	NC_018619	AAAAT	2	10	96729	96738	80 %	20 %	0 %	0 %	407453564
60	NC_018619	TTAAT	2	10	97773	97782	40 %	60 %	0 %	0 %	407453565
61	NC_018619	ATTTG	2	10	98955	98964	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018619	AAAAT	2	10	99676	99685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018619	ATTAC	2	10	102903	102912	40 %	40 %	0 %	20 %	407453573
64	NC_018619	CTACA	2	10	103277	103286	40 %	20 %	0 %	40 %	407453573
65	NC_018619	AATTA	2	10	104824	104833	60 %	40 %	0 %	0 %	407453575
66	NC_018619	CTATA	2	10	105814	105823	40 %	40 %	0 %	20 %	407453576
67	NC_018619	CTTTT	2	10	108357	108366	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018619	AGCTT	2	10	108468	108477	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018619	GTTTG	2	10	108774	108783	0 %	60 %	40 %	0 %	407453580
70	NC_018619	AGTTA	2	10	115579	115588	40 %	40 %	20 %	0 %	407453595
71	NC_018619	AGTTT	2	10	116069	116078	20 %	60 %	20 %	0 %	407453596
72	NC_018619	TTTGC	2	10	116984	116993	0 %	60 %	20 %	20 %	407453598
73	NC_018619	TTTAC	2	10	119180	119189	20 %	60 %	0 %	20 %	407453601
74	NC_018619	AATTA	2	10	122072	122081	60 %	40 %	0 %	0 %	407453604
75	NC_018619	CTTTT	2	10	122869	122878	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018619	GAGAT	2	10	123425	123434	40 %	20 %	40 %	0 %	407453605
77	NC_018619	GTCAA	2	10	124744	124753	40 %	20 %	20 %	20 %	407453607
78	NC_018619	TAGGG	2	10	127216	127225	20 %	20 %	60 %	0 %	407453610
79	NC_018619	AACTT	2	10	128148	128157	40 %	40 %	0 %	20 %	407453610
80	NC_018619	TTCTT	2	10	131352	131361	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018619	TGTCA	2	10	132033	132042	20 %	40 %	20 %	20 %	407453613
82	NC_018619	AAAAG	2	10	135439	135448	80 %	0 %	20 %	0 %	407453615
83	NC_018619	TAAAA	2	10	135720	135729	80 %	20 %	0 %	0 %	407453615
84	NC_018619	GATTT	2	10	137979	137988	20 %	60 %	20 %	0 %	407453617
85	NC_018619	TTGTT	2	10	138321	138330	0 %	80 %	20 %	0 %	407453617
86	NC_018619	AAGAA	2	10	138802	138811	80 %	0 %	20 %	0 %	407453617
87	NC_018619	TTCTT	2	10	139395	139404	0 %	80 %	0 %	20 %	407453618
88	NC_018619	CTTTG	2	10	141299	141308	0 %	60 %	20 %	20 %	407453620
89	NC_018619	AGAAA	2	10	143336	143345	80 %	0 %	20 %	0 %	407453623
90	NC_018619	AAAGA	2	10	146000	146009	80 %	0 %	20 %	0 %	407453626
91	NC_018619	TTTTA	2	10	148179	148188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018619	TACTC	2	10	149630	149639	20 %	40 %	0 %	40 %	407453633
93	NC_018619	CGTTT	2	10	149677	149686	0 %	60 %	20 %	20 %	407453633
94	NC_018619	ATTTT	2	10	149817	149826	20 %	80 %	0 %	0 %	407453633
95	NC_018619	ACCAT	2	10	151848	151857	40 %	20 %	0 %	40 %	407453634
96	NC_018619	CAGAA	2	10	152813	152822	60 %	0 %	20 %	20 %	407453635
97	NC_018619	TTCAT	2	10	153383	153392	20 %	60 %	0 %	20 %	407453635
98	NC_018619	AAAGG	2	10	154213	154222	60 %	0 %	40 %	0 %	407453636
99	NC_018619	ATAGG	2	10	155905	155914	40 %	20 %	40 %	0 %	407453638
100	NC_018619	TTTGA	2	10	155991	156000	20 %	60 %	20 %	0 %	407453638
101	NC_018619	AAGGT	2	10	160931	160940	40 %	20 %	40 %	0 %	407453642
102	NC_018619	TTTTG	2	10	161870	161879	0 %	80 %	20 %	0 %	407453644
103	NC_018619	GGGGC	2	10	162017	162026	0 %	0 %	80 %	20 %	407453644
104	NC_018619	AGCAT	2	10	163307	163316	40 %	20 %	20 %	20 %	407453647
105	NC_018619	TAAAT	2	10	164494	164503	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018619	AAATG	2	10	166422	166431	60 %	20 %	20 %	0 %	407453648
107	NC_018619	GGGGA	2	10	168197	168206	20 %	0 %	80 %	0 %	407453649
108	NC_018619	TTTTC	2	10	169246	169255	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_018619	CTGTT	2	10	169724	169733	0 %	60 %	20 %	20 %	407453651
110	NC_018619	AATGA	2	10	169759	169768	60 %	20 %	20 %	0 %	407453651
111	NC_018619	ATTTT	2	10	173218	173227	20 %	80 %	0 %	0 %	407453655
112	NC_018619	GAGAG	2	10	173235	173244	40 %	0 %	60 %	0 %	407453655
113	NC_018619	CAAAA	2	10	173566	173575	80 %	0 %	0 %	20 %	407453656
114	NC_018619	CGCAT	2	10	173936	173945	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_018619	CTAAG	2	10	181175	181184	40 %	20 %	20 %	20 %	407453663
116	NC_018619	TTTTC	2	10	181775	181784	0 %	80 %	0 %	20 %	407453663
117	NC_018619	GGTAC	2	10	183770	183779	20 %	20 %	40 %	20 %	407453665
118	NC_018619	AGGGA	2	10	186956	186965	40 %	0 %	60 %	0 %	407453671
119	NC_018619	AATGT	2	10	187365	187374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018619	AGGAA	2	10	187979	187988	60 %	0 %	40 %	0 %	407453672
121	NC_018619	TTCTT	2	10	188358	188367	0 %	80 %	0 %	20 %	407453672
122	NC_018619	GATAA	2	10	191001	191010	60 %	20 %	20 %	0 %	407453672
123	NC_018619	CCCTT	2	10	193205	193214	0 %	40 %	0 %	60 %	407453673
124	NC_018619	TTTTA	2	10	193906	193915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018619	AGTTA	2	10	194196	194205	40 %	40 %	20 %	0 %	407453674
126	NC_018619	TTATT	2	10	194216	194225	20 %	80 %	0 %	0 %	407453674
127	NC_018619	CCCTA	2	10	195269	195278	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_018619	AGGGT	2	10	197140	197149	20 %	20 %	60 %	0 %	407453676
129	NC_018619	TGGAT	2	10	197581	197590	20 %	40 %	40 %	0 %	407453676
130	NC_018619	CTAAA	2	10	197638	197647	60 %	20 %	0 %	20 %	407453676
131	NC_018619	CTTTA	2	10	197941	197950	20 %	60 %	0 %	20 %	407453676
132	NC_018619	AAAAT	2	10	198118	198127	80 %	20 %	0 %	0 %	407453676
133	NC_018619	GTTTT	2	10	198621	198630	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018619	ATTAA	2	10	201044	201053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018619	TTGGT	2	10	201420	201429	0 %	60 %	40 %	0 %	407453680
136	NC_018619	AGCAA	2	10	203898	203907	60 %	0 %	20 %	20 %	407453684
137	NC_018619	TAATG	2	10	205013	205022	40 %	40 %	20 %	0 %	407453685
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