MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 24869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018619	ACA	2	6	23034	23039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453496
502	NC_018619	AAG	2	6	23048	23053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453496
503	NC_018619	AAG	2	6	23075	23080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453496
504	NC_018619	AAC	2	6	23106	23111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453496
505	NC_018619	GGT	2	6	23158	23163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453496
506	NC_018619	AGC	2	6	23174	23179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453496
507	NC_018619	ATG	2	6	23264	23269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453496
508	NC_018619	AGC	2	6	23281	23286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453496
509	NC_018619	GCT	2	6	23287	23292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453496
510	NC_018619	CTG	2	6	23378	23383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453496
511	NC_018619	ATG	2	6	23579	23584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453496
512	NC_018619	TTA	2	6	23597	23602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453496
513	NC_018619	AAG	2	6	23654	23659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453496
514	NC_018619	GA	3	6	23668	23673	50 %	0 %	50 %	0 %	407453496
515	NC_018619	T	7	7	23801	23807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018619	A	6	6	23885	23890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018619	AGA	2	6	23900	23905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018619	TTG	2	6	24010	24015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453497
519	NC_018619	TGT	2	6	24047	24052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453497
520	NC_018619	AGT	2	6	24064	24069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453497
521	NC_018619	TTG	2	6	24076	24081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453497
522	NC_018619	TCC	2	6	24115	24120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453497
523	NC_018619	AGCT	2	8	24165	24172	25 %	25 %	25 %	25 %	407453497
524	NC_018619	TTG	2	6	24352	24357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453497
525	NC_018619	GAA	2	6	24362	24367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453497
526	NC_018619	T	6	6	24379	24384	0 %	100 %	0 %	0 %	407453497
527	NC_018619	AAAT	2	8	24502	24509	75 %	25 %	0 %	0 %	407453497
528	NC_018619	CTT	2	6	24516	24521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453497
529	NC_018619	AGG	2	6	24537	24542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453497
530	NC_018619	GTA	2	6	24550	24555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453497
531	NC_018619	GCA	2	6	24611	24616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453497
532	NC_018619	TTA	2	6	24620	24625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453497
533	NC_018619	AATT	2	8	24627	24634	50 %	50 %	0 %	0 %	407453497
534	NC_018619	ATAA	2	8	24694	24701	75 %	25 %	0 %	0 %	407453497
535	NC_018619	T	8	8	24796	24803	0 %	100 %	0 %	0 %	407453497
536	NC_018619	TGT	2	6	24818	24823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453497
537	NC_018619	GCT	2	6	24848	24853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453497
538	NC_018619	TTCT	2	8	24925	24932	0 %	75 %	0 %	25 %	407453497
539	NC_018619	ATC	2	6	24940	24945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453497
540	NC_018619	ACC	2	6	24964	24969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453497
541	NC_018619	TAGT	2	8	24983	24990	25 %	50 %	25 %	0 %	407453497
542	NC_018619	TTG	2	6	25008	25013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453497
543	NC_018619	TTG	2	6	25018	25023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453497
544	NC_018619	ATT	2	6	25111	25116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453497
545	NC_018619	TTC	2	6	25237	25242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453497
546	NC_018619	TTG	2	6	25387	25392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453497
547	NC_018619	GAAC	2	8	25442	25449	50 %	0 %	25 %	25 %	407453497
548	NC_018619	CAG	2	6	25467	25472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453497
549	NC_018619	TA	3	6	25502	25507	50 %	50 %	0 %	0 %	407453497
550	NC_018619	GCA	2	6	25508	25513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453497
551	NC_018619	GTT	2	6	25541	25546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453497
552	NC_018619	AG	3	6	25609	25614	50 %	0 %	50 %	0 %	407453497
553	NC_018619	TAA	2	6	25641	25646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453497
554	NC_018619	CTT	3	9	25647	25655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453497
555	NC_018619	TTA	2	6	25676	25681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453497
556	NC_018619	TTA	2	6	25751	25756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453497
557	NC_018619	TAT	2	6	25788	25793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453497
558	NC_018619	TCA	2	6	25794	25799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453497
559	NC_018619	CCA	2	6	25814	25819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453497
560	NC_018619	TGG	2	6	25821	25826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453497
561	NC_018619	A	6	6	25864	25869	100 %	0 %	0 %	0 %	407453497
562	NC_018619	ATTC	2	8	25881	25888	25 %	50 %	0 %	25 %	407453497
563	NC_018619	TTC	2	6	25894	25899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453497
564	NC_018619	TCT	2	6	25916	25921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453497
565	NC_018619	T	6	6	25993	25998	0 %	100 %	0 %	0 %	407453497
566	NC_018619	TTTC	2	8	26013	26020	0 %	75 %	0 %	25 %	407453497
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569	NC_018619	AAT	2	6	26116	26121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453497
570	NC_018619	TGT	2	6	26209	26214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453497
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574	NC_018619	TA	3	6	26512	26517	50 %	50 %	0 %	0 %	407453497
575	NC_018619	AGA	2	6	26521	26526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453497
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577	NC_018619	T	7	7	26577	26583	0 %	100 %	0 %	0 %	407453498
578	NC_018619	TTC	2	6	26613	26618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453498
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580	NC_018619	ATTA	2	8	26665	26672	50 %	50 %	0 %	0 %	407453498
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590	NC_018619	GTA	2	6	27063	27068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453499
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593	NC_018619	A	6	6	27146	27151	100 %	0 %	0 %	0 %	407453499
594	NC_018619	CTGG	2	8	27185	27192	0 %	25 %	50 %	25 %	407453499
595	NC_018619	AAG	2	6	27273	27278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453499
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598	NC_018619	TCT	2	6	27413	27418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453499
599	NC_018619	GGT	2	6	27428	27433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453499
600	NC_018619	TC	3	6	27457	27462	0 %	50 %	0 %	50 %	407453499
601	NC_018619	AGA	3	9	27562	27570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453499
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611	NC_018619	TA	3	6	28049	28054	50 %	50 %	0 %	0 %	407453499
612	NC_018619	TTG	2	6	28074	28079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453499
613	NC_018619	CTA	2	6	28095	28100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453499
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616	NC_018619	GAC	2	6	28195	28200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453499
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