MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 24869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018619	TTC	2	6	282718	282723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453761
6002	NC_018619	CTT	3	9	282760	282768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453761
6003	NC_018619	TCA	2	6	282853	282858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453762
6004	NC_018619	TTC	2	6	282957	282962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453762
6005	NC_018619	ATA	2	6	283037	283042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453762
6006	NC_018619	GAT	2	6	283102	283107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453762
6007	NC_018619	CAG	2	6	283132	283137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453762
6008	NC_018619	TC	3	6	283138	283143	0 %	50 %	0 %	50 %	407453762
6009	NC_018619	CTG	2	6	283232	283237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453762
6010	NC_018619	ATC	2	6	283313	283318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453762
6011	NC_018619	TC	3	6	283431	283436	0 %	50 %	0 %	50 %	407453762
6012	NC_018619	TCT	2	6	283441	283446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453762
6013	NC_018619	CCT	2	6	283453	283458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453762
6014	NC_018619	A	6	6	283533	283538	100 %	0 %	0 %	0 %	407453762
6015	NC_018619	ATG	2	6	283609	283614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_018619	TCGT	2	8	283632	283639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_018619	A	8	8	283653	283660	100 %	0 %	0 %	0 %	407453763
6018	NC_018619	AGA	2	6	283667	283672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453763
6019	NC_018619	GA	3	6	283684	283689	50 %	0 %	50 %	0 %	407453763
6020	NC_018619	GAA	2	6	283791	283796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453763
6021	NC_018619	TCT	2	6	283878	283883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453763
6022	NC_018619	ATTG	2	8	283955	283962	25 %	50 %	25 %	0 %	407453763
6023	NC_018619	TGA	2	6	283964	283969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453763
6024	NC_018619	CAG	2	6	283986	283991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453763
6025	NC_018619	AGCACG	2	12	284102	284113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453763
6026	NC_018619	GGT	2	6	284172	284177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453763
6027	NC_018619	GGA	2	6	284184	284189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453763
6028	NC_018619	TAGA	2	8	284224	284231	50 %	25 %	25 %	0 %	407453763
6029	NC_018619	GAT	2	6	284234	284239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453763
6030	NC_018619	AAAGA	2	10	284290	284299	80 %	0 %	20 %	0 %	407453763
6031	NC_018619	GCG	2	6	284300	284305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407453763
6032	NC_018619	GT	3	6	284453	284458	0 %	50 %	50 %	0 %	407453763
6033	NC_018619	TTG	2	6	284527	284532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453763
6034	NC_018619	TGT	2	6	284585	284590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453763
6035	NC_018619	ATC	2	6	284673	284678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453763
6036	NC_018619	CAC	2	6	284743	284748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453763
6037	NC_018619	TCT	2	6	284792	284797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453763
6038	NC_018619	ATG	2	6	284887	284892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453763
6039	NC_018619	TCG	2	6	284912	284917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453763
6040	NC_018619	GAT	2	6	284922	284927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453763
6041	NC_018619	TTC	2	6	284999	285004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453763
6042	NC_018619	A	6	6	285063	285068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_018619	TTA	2	6	285077	285082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_018619	T	7	7	285123	285129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_018619	TTGT	2	8	285183	285190	0 %	75 %	25 %	0 %	407453764
6046	NC_018619	CTT	2	6	285244	285249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453764
6047	NC_018619	T	6	6	285382	285387	0 %	100 %	0 %	0 %	407453764
6048	NC_018619	GTT	2	6	285389	285394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453764
6049	NC_018619	GTT	2	6	285399	285404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453764
6050	NC_018619	T	6	6	285425	285430	0 %	100 %	0 %	0 %	407453764
6051	NC_018619	AGAC	2	8	285439	285446	50 %	0 %	25 %	25 %	407453764
6052	NC_018619	TCT	2	6	285451	285456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453764
6053	NC_018619	TAT	2	6	285604	285609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453764
6054	NC_018619	CTTA	2	8	285612	285619	25 %	50 %	0 %	25 %	407453764
6055	NC_018619	TCCCG	2	10	285635	285644	0 %	20 %	20 %	60 %	407453764
6056	NC_018619	GAG	2	6	285659	285664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453764
6057	NC_018619	CTTAT	2	10	285753	285762	20 %	60 %	0 %	20 %	407453764
6058	NC_018619	AGAA	2	8	285790	285797	75 %	0 %	25 %	0 %	407453764
6059	NC_018619	TCT	2	6	285806	285811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453764
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6062	NC_018619	TAT	3	9	285849	285857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453764
6063	NC_018619	TTC	2	6	285877	285882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453764
6064	NC_018619	T	6	6	285952	285957	0 %	100 %	0 %	0 %	407453764
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6083	NC_018619	A	8	8	286911	286918	100 %	0 %	0 %	0 %	407453765
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6089	NC_018619	CTT	2	6	287263	287268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453765
6090	NC_018619	TTC	2	6	287277	287282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453765
6091	NC_018619	A	6	6	287370	287375	100 %	0 %	0 %	0 %	407453765
6092	NC_018619	TTA	2	6	287461	287466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_018619	CTC	2	6	287520	287525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6094	NC_018619	CAT	2	6	287608	287613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_018619	TATC	2	8	287667	287674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6096	NC_018619	TCA	2	6	287747	287752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6103	NC_018619	AGA	2	6	288128	288133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453766
6104	NC_018619	TAC	2	6	288321	288326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453766
6105	NC_018619	T	6	6	288366	288371	0 %	100 %	0 %	0 %	407453766
6106	NC_018619	ACC	2	6	288376	288381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407453766
6107	NC_018619	GCTTT	2	10	288442	288451	0 %	60 %	20 %	20 %	407453766
6108	NC_018619	TGT	2	6	288637	288642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453766
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6110	NC_018619	AG	3	6	288696	288701	50 %	0 %	50 %	0 %	407453766
6111	NC_018619	AGG	2	6	288824	288829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453766
6112	NC_018619	CCT	2	6	288965	288970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453766
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6114	NC_018619	A	6	6	289018	289023	100 %	0 %	0 %	0 %	407453766
6115	NC_018619	CTG	2	6	289104	289109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453766
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6117	NC_018619	CCTT	2	8	289241	289248	0 %	50 %	0 %	50 %	407453766
6118	NC_018619	AAT	2	6	289311	289316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453766
6119	NC_018619	TAC	2	6	289326	289331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453766
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6122	NC_018619	CTT	2	6	289399	289404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453766
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