MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 24869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018619	TCT	2	6	236478	236483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453715
5002	NC_018619	TTA	2	6	236494	236499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453715
5003	NC_018619	GTA	2	6	236501	236506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453715
5004	NC_018619	TC	4	8	236513	236520	0 %	50 %	0 %	50 %	407453715
5005	NC_018619	ATC	2	6	236537	236542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453715
5006	NC_018619	TCT	2	6	236659	236664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453715
5007	NC_018619	TG	4	8	236677	236684	0 %	50 %	50 %	0 %	407453715
5008	NC_018619	TC	4	8	236769	236776	0 %	50 %	0 %	50 %	407453715
5009	NC_018619	CTT	2	6	236836	236841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453715
5010	NC_018619	ATG	2	6	236851	236856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453715
5011	NC_018619	TGT	2	6	236886	236891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453715
5012	NC_018619	TGG	2	6	236915	236920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453715
5013	NC_018619	AG	3	6	236982	236987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_018619	AT	3	6	237052	237057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_018619	CTA	2	6	237161	237166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_018619	CGA	2	6	237399	237404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453716
5017	NC_018619	TGC	2	6	237410	237415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453716
5018	NC_018619	T	6	6	237494	237499	0 %	100 %	0 %	0 %	407453716
5019	NC_018619	AAC	3	9	237569	237577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453716
5020	NC_018619	T	6	6	237584	237589	0 %	100 %	0 %	0 %	407453716
5021	NC_018619	GTT	2	6	237590	237595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453716
5022	NC_018619	TAA	2	6	237596	237601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453716
5023	NC_018619	TGC	2	6	237657	237662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453716
5024	NC_018619	CTT	2	6	237676	237681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453716
5025	NC_018619	ACT	2	6	237728	237733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453716
5026	NC_018619	CTTT	2	8	237753	237760	0 %	75 %	0 %	25 %	407453716
5027	NC_018619	TGC	2	6	237845	237850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453716
5028	NC_018619	CATC	2	8	237880	237887	25 %	25 %	0 %	50 %	407453716
5029	NC_018619	GCT	2	6	237897	237902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453716
5030	NC_018619	CTT	2	6	237958	237963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453716
5031	NC_018619	CGA	2	6	238014	238019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453716
5032	NC_018619	CATG	2	8	238138	238145	25 %	25 %	25 %	25 %	407453716
5033	NC_018619	CTTG	2	8	238156	238163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_018619	GAAT	2	8	238207	238214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_018619	GAA	3	9	238221	238229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_018619	T	6	6	238244	238249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_018619	AAG	2	6	238253	238258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_018619	T	7	7	238268	238274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_018619	AAG	2	6	238307	238312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_018619	ACC	2	6	238326	238331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_018619	AATT	2	8	238346	238353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_018619	GAT	2	6	238387	238392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_018619	TTTC	2	8	238446	238453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_018619	GTT	2	6	238474	238479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_018619	A	8	8	238514	238521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_018619	AGA	2	6	238556	238561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_018619	GAG	2	6	238642	238647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453717
5048	NC_018619	T	7	7	238702	238708	0 %	100 %	0 %	0 %	407453717
5049	NC_018619	GTT	2	6	238759	238764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453718
5050	NC_018619	CT	3	6	238766	238771	0 %	50 %	0 %	50 %	407453718
5051	NC_018619	AGC	2	6	238819	238824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453718
5052	NC_018619	TTG	2	6	238827	238832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453718
5053	NC_018619	CTC	2	6	238916	238921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453718
5054	NC_018619	CTTT	2	8	238962	238969	0 %	75 %	0 %	25 %	407453718
5055	NC_018619	T	6	6	238967	238972	0 %	100 %	0 %	0 %	407453718
5056	NC_018619	AGA	2	6	239119	239124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453718
5057	NC_018619	GATT	2	8	239130	239137	25 %	50 %	25 %	0 %	407453718
5058	NC_018619	GCA	2	6	239163	239168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453718
5059	NC_018619	ACTA	2	8	239339	239346	50 %	25 %	0 %	25 %	407453718
5060	NC_018619	TTG	2	6	239426	239431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453718
5061	NC_018619	GGA	2	6	239474	239479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453718
5062	NC_018619	AGGC	2	8	239497	239504	25 %	0 %	50 %	25 %	407453718
5063	NC_018619	AAG	2	6	239575	239580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453718
5064	NC_018619	T	7	7	239603	239609	0 %	100 %	0 %	0 %	407453718
5065	NC_018619	ATTATA	2	12	239689	239700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_018619	A	6	6	239724	239729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_018619	CTT	2	6	239761	239766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_018619	TAT	2	6	239788	239793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_018619	ATAA	2	8	239829	239836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_018619	GA	3	6	239871	239876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_018619	A	6	6	239906	239911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_018619	GCA	2	6	239924	239929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_018619	GCA	2	6	239934	239939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_018619	CAA	2	6	239992	239997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453719
5075	NC_018619	GCTT	2	8	240007	240014	0 %	50 %	25 %	25 %	407453719
5076	NC_018619	TTC	2	6	240050	240055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453719
5077	NC_018619	TAAAA	2	10	240106	240115	80 %	20 %	0 %	0 %	407453719
5078	NC_018619	T	6	6	240150	240155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_018619	TCA	2	6	240157	240162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453720
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5082	NC_018619	A	6	6	240416	240421	100 %	0 %	0 %	0 %	407453720
5083	NC_018619	TAG	2	6	240522	240527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453720
5084	NC_018619	T	6	6	240626	240631	0 %	100 %	0 %	0 %	407453720
5085	NC_018619	AAAT	2	8	240645	240652	75 %	25 %	0 %	0 %	407453720
5086	NC_018619	TCT	2	6	240695	240700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453720
5087	NC_018619	GAG	2	6	240726	240731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453720
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5089	NC_018619	GTTT	2	8	240878	240885	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_018619	TAG	2	6	240946	240951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_018619	A	7	7	241038	241044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_018619	AG	3	6	241080	241085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_018619	TAT	2	6	241096	241101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_018619	TCAT	2	8	241108	241115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5095	NC_018619	ATA	2	6	241123	241128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_018619	CGT	2	6	241144	241149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453721
5097	NC_018619	GAA	2	6	241181	241186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453721
5098	NC_018619	ATC	2	6	241228	241233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453721
5099	NC_018619	TAT	2	6	241265	241270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453721
5100	NC_018619	GAG	2	6	241280	241285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453721
5101	NC_018619	GAT	2	6	241304	241309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453721
5102	NC_018619	TTCAG	2	10	241334	241343	20 %	40 %	20 %	20 %	407453721
5103	NC_018619	TTG	2	6	241409	241414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453721
5104	NC_018619	CAT	2	6	241526	241531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453721
5105	NC_018619	ATT	2	6	241536	241541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453721
5106	NC_018619	GTTT	2	8	241647	241654	0 %	75 %	25 %	0 %	407453721
5107	NC_018619	AGG	2	6	241673	241678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453721
5108	NC_018619	TG	3	6	241731	241736	0 %	50 %	50 %	0 %	407453721
5109	NC_018619	ATT	2	6	241771	241776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453721
5110	NC_018619	TTC	2	6	241832	241837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453721
5111	NC_018619	AGA	2	6	241845	241850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453721
5112	NC_018619	TGA	2	6	241880	241885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453721
5113	NC_018619	TTG	2	6	241930	241935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453721
5114	NC_018619	CGG	2	6	241937	241942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407453721
5115	NC_018619	TTG	2	6	241948	241953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453721
5116	NC_018619	ATT	2	6	241983	241988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453721
5117	NC_018619	ATG	2	6	242053	242058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453721
5118	NC_018619	ATG	2	6	242085	242090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453721
5119	NC_018619	GCA	2	6	242115	242120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453721
5120	NC_018619	AAG	2	6	242137	242142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453721
5121	NC_018619	A	6	6	242160	242165	100 %	0 %	0 %	0 %	407453721
5122	NC_018619	TCA	2	6	242171	242176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453721
5123	NC_018619	GCTT	2	8	242230	242237	0 %	50 %	25 %	25 %	407453721
5124	NC_018619	AT	3	6	242311	242316	50 %	50 %	0 %	0 %	407453721
5125	NC_018619	TGA	2	6	242435	242440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453721
5126	NC_018619	GAA	2	6	242445	242450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453721
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5128	NC_018619	TGA	2	6	242504	242509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453721
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5130	NC_018619	TTA	2	6	242580	242585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453721
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5232	NC_018619	TCT	2	6	247554	247559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453727
5233	NC_018619	ATC	2	6	247586	247591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453727
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5235	NC_018619	T	6	6	247698	247703	0 %	100 %	0 %	0 %	407453728
5236	NC_018619	AAT	2	6	247792	247797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453728
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5239	NC_018619	ATA	2	6	247935	247940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453729
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5243	NC_018619	GTT	2	6	248149	248154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453729
5244	NC_018619	GAT	2	6	248199	248204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453729
5245	NC_018619	GA	3	6	248253	248258	50 %	0 %	50 %	0 %	407453729
5246	NC_018619	TATT	2	8	248269	248276	25 %	75 %	0 %	0 %	407453729
5247	NC_018619	GAA	2	6	248325	248330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453729
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5249	NC_018619	CAA	2	6	248366	248371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453729
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5370	NC_018619	T	8	8	254122	254129	0 %	100 %	0 %	0 %	407453737
5371	NC_018619	TCT	2	6	254212	254217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453737
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5498	NC_018619	GTT	2	6	260164	260169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453741
5499	NC_018619	ATGC	2	8	260172	260179	25 %	25 %	25 %	25 %	407453741
5500	NC_018619	TTG	2	6	260340	260345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453741

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