MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018618	TTTGA	2	10	1369	1378	20 %	60 %	20 %	0 %	407453020
2	NC_018618	TTATT	2	10	3203	3212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018618	TGTTT	2	10	3222	3231	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018618	TTTTG	2	10	3247	3256	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018618	TAAAA	2	10	3710	3719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018618	TAAAG	2	10	3880	3889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018618	ACAAA	2	10	3989	3998	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018618	AATTA	2	10	4315	4324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018618	ATAAA	2	10	5548	5557	80 %	20 %	0 %	0 %	407453022
10	NC_018618	AAAAT	2	10	5816	5825	80 %	20 %	0 %	0 %	407453023
11	NC_018618	TAAAA	2	10	6860	6869	80 %	20 %	0 %	0 %	407453023
12	NC_018618	AACAA	2	10	7907	7916	80 %	0 %	0 %	20 %	407453024
13	NC_018618	CATGC	2	10	8074	8083	20 %	20 %	20 %	40 %	407453024
14	NC_018618	AAATT	2	10	8650	8659	60 %	40 %	0 %	0 %	407453024
15	NC_018618	AATAC	2	10	10275	10284	60 %	20 %	0 %	20 %	407453027
16	NC_018618	GTAAC	2	10	10330	10339	40 %	20 %	20 %	20 %	407453027
17	NC_018618	TAATA	2	10	11103	11112	60 %	40 %	0 %	0 %	407453028
18	NC_018618	ATCTA	2	10	12737	12746	40 %	40 %	0 %	20 %	407453029
19	NC_018618	TTGTT	2	10	14162	14171	0 %	80 %	20 %	0 %	407453030
20	NC_018618	CAAAA	2	10	14836	14845	80 %	0 %	0 %	20 %	407453030
21	NC_018618	TGCAT	2	10	15065	15074	20 %	40 %	20 %	20 %	407453030
22	NC_018618	ATATT	2	10	15590	15599	40 %	60 %	0 %	0 %	407453031
23	NC_018618	TAAAT	2	10	15619	15628	60 %	40 %	0 %	0 %	407453031
24	NC_018618	TCCAT	3	15	15854	15868	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_018618	TCTAT	4	20	15869	15888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018618	ATTTT	2	10	17526	17535	20 %	80 %	0 %	0 %	407453032
27	NC_018618	CATAT	2	10	17727	17736	40 %	40 %	0 %	20 %	407453033
28	NC_018618	TTTCT	2	10	19649	19658	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018618	TGTTT	2	10	20622	20631	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018618	TTTTG	2	10	21064	21073	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018618	ATTAT	2	10	21291	21300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018618	TTTTA	2	10	21416	21425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018618	TGTAA	2	10	21464	21473	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018618	CTTTT	2	10	21491	21500	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018618	TGTGT	2	10	21859	21868	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018618	TGGGG	3	15	22223	22237	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018618	ACTAA	2	10	22532	22541	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018618	TATAA	2	10	22579	22588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018618	AAACA	2	10	23845	23854	80 %	0 %	0 %	20 %	407453037
40	NC_018618	TTGTG	2	10	25389	25398	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018618	TATTT	2	10	26440	26449	20 %	80 %	0 %	0 %	407453038
42	NC_018618	TTCAT	2	10	26849	26858	20 %	60 %	0 %	20 %	407453038
43	NC_018618	TAATT	2	10	27152	27161	40 %	60 %	0 %	0 %	407453038
44	NC_018618	TACTT	2	10	27182	27191	20 %	60 %	0 %	20 %	407453038
45	NC_018618	TAAAA	2	10	27513	27522	80 %	20 %	0 %	0 %	407453038
46	NC_018618	AACAA	2	10	28331	28340	80 %	0 %	0 %	20 %	407453039
47	NC_018618	TTGTT	2	10	29050	29059	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018618	TTGTT	2	10	29211	29220	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018618	GAATT	2	10	29651	29660	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018618	GTAAA	2	10	30401	30410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018618	AATAA	2	10	30718	30727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018618	AAAAC	2	10	31654	31663	80 %	0 %	0 %	20 %	407453040
53	NC_018618	AATTT	2	10	31676	31685	40 %	60 %	0 %	0 %	407453040
54	NC_018618	TAATA	2	10	31819	31828	60 %	40 %	0 %	0 %	407453040
55	NC_018618	AATTA	2	10	31851	31860	60 %	40 %	0 %	0 %	407453040
56	NC_018618	ATAAC	2	10	33177	33186	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018618	CATAT	2	10	33674	33683	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018618	ATAAA	2	10	35822	35831	80 %	20 %	0 %	0 %	407453043
59	NC_018618	TTGTT	2	10	36703	36712	0 %	80 %	20 %	0 %	407453044
60	NC_018618	GAAAA	2	10	37388	37397	80 %	0 %	20 %	0 %	407453044
61	NC_018618	TATAA	2	10	38211	38220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018618	TTTTC	2	10	38236	38245	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018618	GTATA	2	10	38378	38387	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018618	CATTA	2	10	38991	39000	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018618	CTTAA	2	10	39323	39332	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018618	ACAAT	2	10	39459	39468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018618	TTAAT	2	10	39758	39767	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018618	ACAAA	2	10	40648	40657	80 %	0 %	0 %	20 %	407453045
69	NC_018618	CATAA	2	10	40731	40740	60 %	20 %	0 %	20 %	407453045
70	NC_018618	ATTTA	2	10	40804	40813	40 %	60 %	0 %	0 %	407453046
71	NC_018618	AACAA	2	10	43735	43744	80 %	0 %	0 %	20 %	407453050
72	NC_018618	AATGA	2	10	45935	45944	60 %	20 %	20 %	0 %	407453052
73	NC_018618	GCTTT	2	10	47589	47598	0 %	60 %	20 %	20 %	407453054
74	NC_018618	ACCTC	2	10	48701	48710	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_018618	AACCT	2	10	49533	49542	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_018618	ATTAT	2	10	51155	51164	40 %	60 %	0 %	0 %	407453056
77	NC_018618	ACAAA	2	10	51503	51512	80 %	0 %	0 %	20 %	407453056
78	NC_018618	GGAAA	2	10	52285	52294	60 %	0 %	40 %	0 %	407453057
79	NC_018618	AATAC	2	10	52776	52785	60 %	20 %	0 %	20 %	407453058
80	NC_018618	TAAAA	2	10	53953	53962	80 %	20 %	0 %	0 %	407453059
81	NC_018618	ATTAC	2	10	54541	54550	40 %	40 %	0 %	20 %	407453060
82	NC_018618	ATTAA	2	10	54812	54821	60 %	40 %	0 %	0 %	407453061
83	NC_018618	AATTA	2	10	55543	55552	60 %	40 %	0 %	0 %	407453061
84	NC_018618	CAAAG	2	10	55909	55918	60 %	0 %	20 %	20 %	407453061
85	NC_018618	AAAAC	2	10	56457	56466	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018618	AAAAT	2	10	57176	57185	80 %	20 %	0 %	0 %	407453062
87	NC_018618	GTTTT	2	10	57688	57697	0 %	80 %	20 %	0 %	407453062
88	NC_018618	GTGTT	2	10	57770	57779	0 %	60 %	40 %	0 %	407453062
89	NC_018618	AAGAA	2	10	58112	58121	80 %	0 %	20 %	0 %	407453062
90	NC_018618	CTTTA	2	10	58954	58963	20 %	60 %	0 %	20 %	407453063
91	NC_018618	TTGTT	2	10	59604	59613	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018618	TTAAT	2	10	59774	59783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018618	CTTTC	2	10	59785	59794	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_018618	TTTTC	2	10	59853	59862	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018618	TTTTC	2	10	59960	59969	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_018618	ACATA	2	10	60036	60045	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018618	AAACT	2	10	60218	60227	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_018618	ATAAC	4	20	60231	60250	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018618	ACAAA	2	10	60352	60361	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_018618	AAAAT	2	10	61014	61023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018618	ATAAA	2	10	61257	61266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018618	CAAAA	2	10	61391	61400	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018618	AAGAA	2	10	62140	62149	80 %	0 %	20 %	0 %	407453064
104	NC_018618	AACAA	2	10	62883	62892	80 %	0 %	0 %	20 %	407453064
105	NC_018618	CAAAT	2	10	62958	62967	60 %	20 %	0 %	20 %	407453064
106	NC_018618	AGGTA	2	10	63670	63679	40 %	20 %	40 %	0 %	407453064
107	NC_018618	TTAAA	2	10	64773	64782	60 %	40 %	0 %	0 %	407453065
108	NC_018618	ATATT	2	10	64846	64855	40 %	60 %	0 %	0 %	407453065
109	NC_018618	AATAA	2	10	65288	65297	80 %	20 %	0 %	0 %	407453065
110	NC_018618	ACATT	2	10	65766	65775	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018618	AAACA	2	10	65786	65795	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018618	ACAAA	2	10	65910	65919	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_018618	AAACA	2	10	66088	66097	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018618	ATTTG	2	10	66136	66145	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018618	TACAA	2	10	66558	66567	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018618	TTAAC	2	10	66637	66646	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018618	CAAAA	2	10	67343	67352	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018618	TTTAA	2	10	67482	67491	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018618	ATTAA	2	10	67533	67542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018618	AAATG	2	10	67692	67701	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018618	AAGAT	2	10	67915	67924	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018618	TATAT	2	10	68079	68088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018618	AGTTA	2	10	68300	68309	40 %	40 %	20 %	0 %	407453066
124	NC_018618	TAAAA	2	10	68636	68645	80 %	20 %	0 %	0 %	407453066
125	NC_018618	ATAAA	2	10	68716	68725	80 %	20 %	0 %	0 %	407453066
126	NC_018618	GATAT	2	10	69001	69010	40 %	40 %	20 %	0 %	407453066
127	NC_018618	AAAAT	2	10	69429	69438	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018618	TTTTA	2	10	69731	69740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018618	ATAAA	2	10	71762	71771	80 %	20 %	0 %	0 %	407453067
130	NC_018618	TTTTA	2	10	71965	71974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018618	AGTGG	2	10	72576	72585	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018618	TTAAA	2	10	72650	72659	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018618	GTATG	2	10	72710	72719	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018618	GTATT	2	10	73039	73048	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018618	TTAAA	2	10	73669	73678	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018618	ATAAA	2	10	74721	74730	80 %	20 %	0 %	0 %	407453069
137	NC_018618	CAAAA	2	10	74817	74826	80 %	0 %	0 %	20 %	407453069
138	NC_018618	TATAA	2	10	75065	75074	60 %	40 %	0 %	0 %	407453069
139	NC_018618	ATGTG	2	10	75136	75145	20 %	40 %	40 %	0 %	407453069
140	NC_018618	AAAAT	2	10	75377	75386	80 %	20 %	0 %	0 %	407453069
141	NC_018618	AAGAG	2	10	75651	75660	60 %	0 %	40 %	0 %	407453070
142	NC_018618	TAATA	2	10	75924	75933	60 %	40 %	0 %	0 %	407453070
143	NC_018618	TTAAA	2	10	76043	76052	60 %	40 %	0 %	0 %	407453070
144	NC_018618	ATTTT	2	10	77112	77121	20 %	80 %	0 %	0 %	407453071
145	NC_018618	AAAAG	2	10	77233	77242	80 %	0 %	20 %	0 %	407453071
146	NC_018618	ACAAA	2	10	77343	77352	80 %	0 %	0 %	20 %	407453071
147	NC_018618	ATTTA	2	10	77375	77384	40 %	60 %	0 %	0 %	407453071
148	NC_018618	AATAT	2	10	77456	77465	60 %	40 %	0 %	0 %	407453071
149	NC_018618	AAAAG	2	10	78933	78942	80 %	0 %	20 %	0 %	407453073
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151	NC_018618	TTACA	2	10	79116	79125	40 %	40 %	0 %	20 %	407453073
152	NC_018618	TTTTA	2	10	79640	79649	20 %	80 %	0 %	0 %	407453074
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155	NC_018618	GATTT	2	10	80907	80916	20 %	60 %	20 %	0 %	407453075
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187	NC_018618	ATGCT	2	10	112677	112686	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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194	NC_018618	GTTAT	2	10	118611	118620	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_018618	CTAAC	2	10	132524	132533	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
211	NC_018618	TAACT	2	10	132868	132877	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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232	NC_018618	AAAAT	2	10	147476	147485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_018618	AAAAT	2	10	148407	148416	80 %	20 %	0 %	0 %	407453138
234	NC_018618	AAAAT	2	10	149104	149113	80 %	20 %	0 %	0 %	407453138
235	NC_018618	GTGAT	2	10	149191	149200	20 %	40 %	40 %	0 %	407453138
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245	NC_018618	AAAAT	2	10	155494	155503	80 %	20 %	0 %	0 %	407453144
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248	NC_018618	AAAAG	2	10	156537	156546	80 %	0 %	20 %	0 %	407453145
249	NC_018618	TAAAT	2	10	157547	157556	60 %	40 %	0 %	0 %	407453145
250	NC_018618	GTTAA	2	10	157987	157996	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
251	NC_018618	TAGTT	2	10	158258	158267	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
252	NC_018618	TGTTA	2	10	158678	158687	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
253	NC_018618	TGTTA	2	10	158824	158833	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
254	NC_018618	AGGTA	2	10	158857	158866	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
255	NC_018618	ATTAT	2	10	160196	160205	40 %	60 %	0 %	0 %	407453147
256	NC_018618	TTTAT	2	10	161735	161744	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_018618	TTTTA	2	10	161818	161827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_018618	CTTTT	2	10	162042	162051	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
259	NC_018618	ATAAA	2	10	162121	162130	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_018618	ACAAA	2	10	163084	163093	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_018618	GTATT	2	10	168902	168911	20 %	60 %	20 %	0 %	407453152
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277	NC_018618	GCTTT	2	10	170741	170750	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
278	NC_018618	GAATA	2	10	172013	172022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
279	NC_018618	TTTTA	2	10	172873	172882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_018618	CCAAT	2	10	172960	172969	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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