MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 11648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018618	TGTTAT	2	12	28745	28756	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_018618	ATA	2	6	28802	28807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018618	AGT	2	6	28810	28815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018618	TAT	2	6	28846	28851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018618	TGTT	2	8	28890	28897	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_018618	TTA	2	6	28901	28906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_018618	TGT	2	6	28921	28926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_018618	AG	3	6	28997	29002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_018618	TTA	2	6	29031	29036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_018618	TTGTT	2	10	29050	29059	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018618	TGTT	3	12	29056	29067	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_018618	GTT	2	6	29069	29074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_018618	TTA	2	6	29077	29082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_018618	TTTA	2	8	29087	29094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_018618	T	6	6	29137	29142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_018618	T	8	8	29153	29160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_018618	CTTT	2	8	29162	29169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_018618	TTC	2	6	29171	29176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_018618	T	7	7	29197	29203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_018618	TTGTT	2	10	29211	29220	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018618	TAT	2	6	29281	29286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_018618	TAC	2	6	29296	29301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_018618	TGT	2	6	29342	29347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018618	GTTA	2	8	29393	29400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_018618	TTA	2	6	29415	29420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018618	TGT	2	6	29453	29458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_018618	TGT	2	6	29552	29557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_018618	GAATT	2	10	29651	29660	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_018618	TAG	2	6	29711	29716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018618	AAG	2	6	29723	29728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_018618	GTA	2	6	29742	29747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_018618	AGGT	2	8	29749	29756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_018618	GT	3	6	29773	29778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018618	A	7	7	29788	29794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018618	GAT	2	6	29803	29808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_018618	TAAA	2	8	29822	29829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_018618	TG	3	6	29846	29851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_018618	A	6	6	29874	29879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018618	A	6	6	29912	29917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_018618	GA	3	6	29918	29923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018618	T	8	8	29952	29959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018618	GT	3	6	29972	29977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_018618	AAG	2	6	30005	30010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_018618	A	7	7	30032	30038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_018618	GTA	2	6	30044	30049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018618	A	6	6	30056	30061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_018618	TAA	2	6	30071	30076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_018618	AG	3	6	30101	30106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_018618	TGA	2	6	30126	30131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018618	GTTA	2	8	30136	30143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_018618	TGT	2	6	30156	30161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_018618	A	6	6	30181	30186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_018618	AGT	2	6	30193	30198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_018618	TA	4	8	30222	30229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_018618	ATT	2	6	30258	30263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_018618	TTG	2	6	30293	30298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_018618	TTA	2	6	30307	30312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_018618	TTAA	2	8	30315	30322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_018618	TAT	2	6	30356	30361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_018618	ATT	2	6	30377	30382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_018618	GTAAA	2	10	30401	30410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_018618	ATAG	2	8	30471	30478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_018618	GTG	2	6	30480	30485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_018618	AAT	2	6	30502	30507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_018618	A	8	8	30562	30569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_018618	TA	3	6	30580	30585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_018618	A	7	7	30635	30641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_018618	A	7	7	30668	30674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_018618	TAAAAT	2	12	30706	30717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_018618	AATAA	2	10	30718	30727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_018618	A	10	10	30730	30739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_018618	AAAT	2	8	30741	30748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_018618	TAG	2	6	30783	30788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453040
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1076	NC_018618	TTA	2	6	30965	30970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453040
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1078	NC_018618	A	7	7	31042	31048	100 %	0 %	0 %	0 %	407453040
1079	NC_018618	ATT	3	9	31064	31072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453040
1080	NC_018618	TAA	2	6	31134	31139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453040
1081	NC_018618	CCT	2	6	31211	31216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453040
1082	NC_018618	TGA	2	6	31219	31224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453040
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1086	NC_018618	AAG	2	6	31413	31418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453040
1087	NC_018618	AAG	2	6	31496	31501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453040
1088	NC_018618	TAA	2	6	31512	31517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453040
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1090	NC_018618	TAA	2	6	31536	31541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453040
1091	NC_018618	AT	3	6	31578	31583	50 %	50 %	0 %	0 %	407453040
1092	NC_018618	A	7	7	31639	31645	100 %	0 %	0 %	0 %	407453040
1093	NC_018618	TA	3	6	31646	31651	50 %	50 %	0 %	0 %	407453040
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1097	NC_018618	TAATA	2	10	31819	31828	60 %	40 %	0 %	0 %	407453040
1098	NC_018618	AATTA	2	10	31851	31860	60 %	40 %	0 %	0 %	407453040
1099	NC_018618	TAAA	2	8	31869	31876	75 %	25 %	0 %	0 %	407453040
1100	NC_018618	A	9	9	31874	31882	100 %	0 %	0 %	0 %	407453040
1101	NC_018618	AT	3	6	31887	31892	50 %	50 %	0 %	0 %	407453040
1102	NC_018618	AAT	2	6	31906	31911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453040
1103	NC_018618	A	6	6	31928	31933	100 %	0 %	0 %	0 %	407453040
1104	NC_018618	TAAT	2	8	31938	31945	50 %	50 %	0 %	0 %	407453040
1105	NC_018618	TAA	2	6	31995	32000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453040
1106	NC_018618	GGA	2	6	32024	32029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453040
1107	NC_018618	TAAA	2	8	32034	32041	75 %	25 %	0 %	0 %	407453040
1108	NC_018618	A	8	8	32051	32058	100 %	0 %	0 %	0 %	407453040
1109	NC_018618	AGA	2	6	32065	32070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453040
1110	NC_018618	A	6	6	32094	32099	100 %	0 %	0 %	0 %	407453040
1111	NC_018618	TAA	2	6	32109	32114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453040
1112	NC_018618	TA	3	6	32211	32216	50 %	50 %	0 %	0 %	407453040
1113	NC_018618	A	6	6	32222	32227	100 %	0 %	0 %	0 %	407453040
1114	NC_018618	CAA	2	6	32228	32233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453040
1115	NC_018618	AAT	2	6	32322	32327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_018618	TTGA	2	8	32343	32350	25 %	50 %	25 %	0 %	407453041
1117	NC_018618	A	6	6	32366	32371	100 %	0 %	0 %	0 %	407453041
1118	NC_018618	GTT	2	6	32380	32385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453041
1119	NC_018618	ATTT	2	8	32399	32406	25 %	75 %	0 %	0 %	407453041
1120	NC_018618	T	7	7	32409	32415	0 %	100 %	0 %	0 %	407453041
1121	NC_018618	TAA	2	6	32442	32447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453041
1122	NC_018618	ATA	3	9	32474	32482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453041
1123	NC_018618	TAA	3	9	32495	32503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453041
1124	NC_018618	TTTC	2	8	32548	32555	0 %	75 %	0 %	25 %	407453041
1125	NC_018618	A	6	6	32565	32570	100 %	0 %	0 %	0 %	407453041
1126	NC_018618	CAT	2	6	32582	32587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453041
1127	NC_018618	A	6	6	32592	32597	100 %	0 %	0 %	0 %	407453041
1128	NC_018618	TA	3	6	32614	32619	50 %	50 %	0 %	0 %	407453041
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1132	NC_018618	AT	3	6	32743	32748	50 %	50 %	0 %	0 %	407453041
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1134	NC_018618	TA	3	6	32788	32793	50 %	50 %	0 %	0 %	407453041
1135	NC_018618	A	6	6	32793	32798	100 %	0 %	0 %	0 %	407453041
1136	NC_018618	TAA	2	6	32820	32825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453041
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1138	NC_018618	TAT	2	6	32872	32877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453041
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1415	NC_018618	TTTTAT	2	12	41564	41575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	407453046
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1423	NC_018618	GTA	2	6	41869	41874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453047
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1464	NC_018618	A	6	6	42908	42913	100 %	0 %	0 %	0 %	407453049
1465	NC_018618	AT	3	6	42916	42921	50 %	50 %	0 %	0 %	407453049
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