MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	ATTATA	2	12	118	129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018606	CCTTTA	2	12	1114	1125	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406025742
3	NC_018606	TGATCT	2	12	5014	5025	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406025747
4	NC_018606	TTTTCT	2	12	5274	5285	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406025747
5	NC_018606	TTAACG	2	12	6732	6743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406025748
6	NC_018606	TAAAGG	2	12	7492	7503	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406025751
7	NC_018606	ATTATA	2	12	8489	8500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018606	CGTTAA	2	12	10937	10948	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406025755
9	NC_018606	TGTTTT	2	12	11903	11914	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	406025756
10	NC_018606	ATTTTG	2	12	24285	24296	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406025767
11	NC_018606	GTCTAC	3	18	24780	24797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406025767
12	NC_018606	TAGCTG	2	12	26014	26025	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406025769
13	NC_018606	AATCGG	2	12	28813	28824	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406025774
14	NC_018606	ATGAAG	2	12	28872	28883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406025774
15	NC_018606	GACAAA	2	12	29798	29809	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	406025774
16	NC_018606	TATAGA	2	12	32091	32102	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	406025776
17	NC_018606	ATTTGT	2	12	39819	39830	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	406025784
18	NC_018606	GTAATG	2	12	41051	41062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025787
19	NC_018606	TTTTCT	2	12	41437	41448	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406025787
20	NC_018606	TAAAGG	2	12	41936	41947	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406025788
21	NC_018606	ATTATA	2	12	42930	42941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018606	CATTAC	2	12	51403	51414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025799
23	NC_018606	ACCAAC	2	12	52809	52820	50 %	0 %	0 %	50 %	406025801
24	NC_018606	ACCAAC	2	12	52860	52871	50 %	0 %	0 %	50 %	406025801
25	NC_018606	ACCAAC	2	12	53013	53024	50 %	0 %	0 %	50 %	406025801
26	NC_018606	CATTAC	2	12	53208	53219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025802
27	NC_018606	ATAATT	2	12	53534	53545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018606	TTAATT	2	12	53958	53969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018606	GTAATG	2	12	55182	55193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025804

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.