MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 194

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	TTTC	2	8	188	195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018606	TAGA	2	8	224	231	50 %	25 %	25 %	0 %	406025742
3	NC_018606	CTTT	2	8	331	338	0 %	75 %	0 %	25 %	406025742
4	NC_018606	GTTT	2	8	688	695	0 %	75 %	25 %	0 %	406025742
5	NC_018606	AAGA	2	8	1611	1618	75 %	0 %	25 %	0 %	406025743
6	NC_018606	TTCA	2	8	1904	1911	25 %	50 %	0 %	25 %	406025743
7	NC_018606	AGAT	2	8	2650	2657	50 %	25 %	25 %	0 %	406025744
8	NC_018606	TTAT	2	8	3435	3442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018606	AATG	2	8	3484	3491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018606	ACAA	2	8	3592	3599	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018606	CTAT	2	8	3899	3906	25 %	50 %	0 %	25 %	406025746
12	NC_018606	TATT	2	8	4987	4994	25 %	75 %	0 %	0 %	406025747
13	NC_018606	TGGA	2	8	5087	5094	25 %	25 %	50 %	0 %	406025747
14	NC_018606	AGAC	2	8	5678	5685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018606	AAAT	2	8	5947	5954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018606	TCTA	2	8	6043	6050	25 %	50 %	0 %	25 %	406025748
17	NC_018606	CAAT	2	8	6098	6105	50 %	25 %	0 %	25 %	406025748
18	NC_018606	ACAA	2	8	6587	6594	75 %	0 %	0 %	25 %	406025748
19	NC_018606	TCAA	2	8	6639	6646	50 %	25 %	0 %	25 %	406025748
20	NC_018606	GTCT	2	8	7195	7202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018606	CAAA	2	8	7923	7930	75 %	0 %	0 %	25 %	406025752
22	NC_018606	AAAG	2	8	8281	8288	75 %	0 %	25 %	0 %	406025752
23	NC_018606	ATCT	2	8	8388	8395	25 %	50 %	0 %	25 %	406025752
24	NC_018606	AGAA	2	8	8424	8431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018606	CTAT	2	8	8573	8580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018606	AGGT	2	8	8989	8996	25 %	25 %	50 %	0 %	406025753
27	NC_018606	TGTT	2	8	9061	9068	0 %	75 %	25 %	0 %	406025753
28	NC_018606	TTCT	2	8	9490	9497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018606	CCTT	2	8	9691	9698	0 %	50 %	0 %	50 %	406025754
30	NC_018606	TTGA	2	8	11034	11041	25 %	50 %	25 %	0 %	406025755
31	NC_018606	TTGT	2	8	11086	11093	0 %	75 %	25 %	0 %	406025755
32	NC_018606	ATTG	2	8	11575	11582	25 %	50 %	25 %	0 %	406025755
33	NC_018606	ATAG	2	8	11629	11636	50 %	25 %	25 %	0 %	406025755
34	NC_018606	ATTT	2	8	11700	11707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018606	CTTT	2	8	12394	12401	0 %	75 %	0 %	25 %	406025756
36	NC_018606	CTAT	2	8	12816	12823	25 %	50 %	0 %	25 %	406025757
37	NC_018606	GTAA	2	8	13001	13008	50 %	25 %	25 %	0 %	406025757
38	NC_018606	ACAA	2	8	13066	13073	75 %	0 %	0 %	25 %	406025757
39	NC_018606	CTTT	2	8	13425	13432	0 %	75 %	0 %	25 %	406025757
40	NC_018606	AACT	2	8	13896	13903	50 %	25 %	0 %	25 %	406025758
41	NC_018606	ATAC	2	8	14211	14218	50 %	25 %	0 %	25 %	406025758
42	NC_018606	ATTG	2	8	15026	15033	25 %	50 %	25 %	0 %	406025759
43	NC_018606	TATT	2	8	15078	15085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018606	TATT	2	8	15160	15167	25 %	75 %	0 %	0 %	406025760
45	NC_018606	TAGT	2	8	15266	15273	25 %	50 %	25 %	0 %	406025760
46	NC_018606	ATTT	2	8	15572	15579	25 %	75 %	0 %	0 %	406025760
47	NC_018606	TTTC	2	8	16927	16934	0 %	75 %	0 %	25 %	406025762
48	NC_018606	TCAT	2	8	17083	17090	25 %	50 %	0 %	25 %	406025762
49	NC_018606	GCTA	2	8	17175	17182	25 %	25 %	25 %	25 %	406025762
50	NC_018606	GATA	2	8	17452	17459	50 %	25 %	25 %	0 %	406025762
51	NC_018606	TCAT	2	8	17698	17705	25 %	50 %	0 %	25 %	406025762
52	NC_018606	CAAA	2	8	17807	17814	75 %	0 %	0 %	25 %	406025762
53	NC_018606	AAAT	2	8	17877	17884	75 %	25 %	0 %	0 %	406025762
54	NC_018606	ATCT	2	8	17936	17943	25 %	50 %	0 %	25 %	406025762
55	NC_018606	ATAG	2	8	18039	18046	50 %	25 %	25 %	0 %	406025762
56	NC_018606	ATAA	2	8	18320	18327	75 %	25 %	0 %	0 %	406025762
57	NC_018606	TCTG	2	8	18386	18393	0 %	50 %	25 %	25 %	406025762
58	NC_018606	TTTC	2	8	18406	18413	0 %	75 %	0 %	25 %	406025762
59	NC_018606	AGAT	2	8	18771	18778	50 %	25 %	25 %	0 %	406025762
60	NC_018606	CTTT	2	8	19258	19265	0 %	75 %	0 %	25 %	406025762
61	NC_018606	TAAA	2	8	19324	19331	75 %	25 %	0 %	0 %	406025763
62	NC_018606	ATAG	2	8	19400	19407	50 %	25 %	25 %	0 %	406025763
63	NC_018606	TTTC	2	8	20113	20120	0 %	75 %	0 %	25 %	406025765
64	NC_018606	TTTC	2	8	20289	20296	0 %	75 %	0 %	25 %	406025765
65	NC_018606	ATTG	2	8	20358	20365	25 %	50 %	25 %	0 %	406025765
66	NC_018606	CTTT	2	8	20907	20914	0 %	75 %	0 %	25 %	406025765
67	NC_018606	ATAG	2	8	21042	21049	50 %	25 %	25 %	0 %	406025765
68	NC_018606	GGAT	2	8	21081	21088	25 %	25 %	50 %	0 %	406025765
69	NC_018606	ATTC	2	8	21157	21164	25 %	50 %	0 %	25 %	406025765
70	NC_018606	AAGG	2	8	21342	21349	50 %	0 %	50 %	0 %	406025765
71	NC_018606	GCTT	2	8	21711	21718	0 %	50 %	25 %	25 %	406025765
72	NC_018606	AAAT	2	8	22625	22632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018606	CCAG	2	8	22846	22853	25 %	0 %	25 %	50 %	406025766
74	NC_018606	TAAC	2	8	22872	22879	50 %	25 %	0 %	25 %	406025766
75	NC_018606	AAAT	2	8	22902	22909	75 %	25 %	0 %	0 %	406025766
76	NC_018606	ACAT	2	8	23018	23025	50 %	25 %	0 %	25 %	406025766
77	NC_018606	TTAT	2	8	23247	23254	25 %	75 %	0 %	0 %	406025767
78	NC_018606	CTAT	2	8	23386	23393	25 %	50 %	0 %	25 %	406025767
79	NC_018606	CATA	2	8	23427	23434	50 %	25 %	0 %	25 %	406025767
80	NC_018606	ATTC	2	8	23600	23607	25 %	50 %	0 %	25 %	406025767
81	NC_018606	ATGT	2	8	23741	23748	25 %	50 %	25 %	0 %	406025767
82	NC_018606	CAAA	2	8	23805	23812	75 %	0 %	0 %	25 %	406025767
83	NC_018606	TCTT	2	8	24145	24152	0 %	75 %	0 %	25 %	406025767
84	NC_018606	ATAG	2	8	24926	24933	50 %	25 %	25 %	0 %	406025767
85	NC_018606	TAAT	2	8	25113	25120	50 %	50 %	0 %	0 %	406025768
86	NC_018606	AGAA	2	8	25452	25459	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018606	CTGC	2	8	25692	25699	0 %	25 %	25 %	50 %	406025769
88	NC_018606	TTGA	2	8	25975	25982	25 %	50 %	25 %	0 %	406025769
89	NC_018606	CATA	2	8	26101	26108	50 %	25 %	0 %	25 %	406025769
90	NC_018606	CTTA	2	8	26234	26241	25 %	50 %	0 %	25 %	406025769
91	NC_018606	TTTA	2	8	26633	26640	25 %	75 %	0 %	0 %	406025769
92	NC_018606	AATT	2	8	26650	26657	50 %	50 %	0 %	0 %	406025769
93	NC_018606	ATTT	2	8	26671	26678	25 %	75 %	0 %	0 %	406025769
94	NC_018606	ACAA	2	8	26725	26732	75 %	0 %	0 %	25 %	406025769
95	NC_018606	GGAA	2	8	27062	27069	50 %	0 %	50 %	0 %	406025769
96	NC_018606	ATAG	2	8	27103	27110	50 %	25 %	25 %	0 %	406025769
97	NC_018606	TTCA	2	8	27329	27336	25 %	50 %	0 %	25 %	406025769
98	NC_018606	ATTT	2	8	27991	27998	25 %	75 %	0 %	0 %	406025772
99	NC_018606	ATTT	2	8	28182	28189	25 %	75 %	0 %	0 %	406025773
100	NC_018606	TCCC	2	8	28553	28560	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_018606	GAAA	2	8	28730	28737	75 %	0 %	25 %	0 %	406025774
102	NC_018606	ATAG	2	8	28832	28839	50 %	25 %	25 %	0 %	406025774
103	NC_018606	AACT	2	8	29367	29374	50 %	25 %	0 %	25 %	406025774
104	NC_018606	TAAA	2	8	29415	29422	75 %	25 %	0 %	0 %	406025774
105	NC_018606	AAAT	2	8	29542	29549	75 %	25 %	0 %	0 %	406025774
106	NC_018606	AGAA	2	8	29623	29630	75 %	0 %	25 %	0 %	406025774
107	NC_018606	CTAC	2	8	30030	30037	25 %	25 %	0 %	50 %	406025774
108	NC_018606	ATAC	2	8	30795	30802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018606	TGTA	2	8	31009	31016	25 %	50 %	25 %	0 %	406025775
110	NC_018606	TAAT	2	8	31193	31200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018606	TTAT	2	8	31243	31250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018606	TAAA	2	8	31806	31813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018606	ACTT	2	8	31876	31883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018606	TTAT	2	8	31892	31899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018606	CTAT	2	8	32881	32888	25 %	50 %	0 %	25 %	406025777
116	NC_018606	AATT	2	8	33554	33561	50 %	50 %	0 %	0 %	406025777
117	NC_018606	ATTG	2	8	33763	33770	25 %	50 %	25 %	0 %	406025777
118	NC_018606	ATAA	2	8	34009	34016	75 %	25 %	0 %	0 %	406025777
119	NC_018606	ACTA	2	8	34814	34821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018606	TAAA	2	8	35160	35167	75 %	25 %	0 %	0 %	406025779
121	NC_018606	ATTA	2	8	35380	35387	50 %	50 %	0 %	0 %	406025779
122	NC_018606	TCGT	2	8	35973	35980	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018606	TAGG	2	8	36066	36073	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018606	CTAT	2	8	36418	36425	25 %	50 %	0 %	25 %	406025780
125	NC_018606	TAAA	2	8	37213	37220	75 %	25 %	0 %	0 %	406025780
126	NC_018606	ATAA	2	8	37278	37285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018606	AGCA	2	8	37383	37390	50 %	0 %	25 %	25 %	406025781
128	NC_018606	ATAC	2	8	37978	37985	50 %	25 %	0 %	25 %	406025782
129	NC_018606	GACT	2	8	38225	38232	25 %	25 %	25 %	25 %	406025782
130	NC_018606	AGAC	2	8	38858	38865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018606	AAGC	2	8	39280	39287	50 %	0 %	25 %	25 %	406025784
132	NC_018606	GTTC	2	8	39428	39435	0 %	50 %	25 %	25 %	406025784
133	NC_018606	TAAA	2	8	39507	39514	75 %	25 %	0 %	0 %	406025784
134	NC_018606	CATT	2	8	39610	39617	25 %	50 %	0 %	25 %	406025784
135	NC_018606	AAAT	2	8	39881	39888	75 %	25 %	0 %	0 %	406025784
136	NC_018606	ATTT	2	8	40010	40017	25 %	75 %	0 %	0 %	406025785
137	NC_018606	ATTT	2	8	40299	40306	25 %	75 %	0 %	0 %	406025785
138	NC_018606	TTCT	2	8	40522	40529	0 %	75 %	0 %	25 %	406025785
139	NC_018606	ATTT	2	8	40624	40631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018606	TTAG	2	8	40872	40879	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018606	CAAA	2	8	42365	42372	75 %	0 %	0 %	25 %	406025788
142	NC_018606	AAAG	2	8	42723	42730	75 %	0 %	25 %	0 %	406025788
143	NC_018606	ATCT	2	8	42829	42836	25 %	50 %	0 %	25 %	406025788
144	NC_018606	AGAA	2	8	42865	42872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_018606	ATTT	2	8	47975	47982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_018606	ACTT	2	8	48494	48501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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182	NC_018606	TAAA	2	8	53128	53135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018606	TTAT	2	8	53149	53156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_018606	ATTA	2	8	53436	53443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_018606	TAAA	2	8	53458	53465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_018606	ATTT	2	8	53555	53562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_018606	TTCT	2	8	54282	54289	0 %	75 %	0 %	25 %	406025803
189	NC_018606	ATAG	2	8	54770	54777	50 %	25 %	25 %	0 %	406025803
190	NC_018606	CATT	2	8	55676	55683	25 %	50 %	0 %	25 %	406025805
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194	NC_018606	TTAT	2	8	57519	57526	25 %	75 %	0 %	0 %	406025806

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.