MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	TAA	2	6	66	71	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018606	ATA	2	6	148	153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018606	ATA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
4	NC_018606	TAA	2	6	281	286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
5	NC_018606	TTA	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025742
6	NC_018606	TTA	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025742
7	NC_018606	AAG	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025742
8	NC_018606	CCA	2	6	538	543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025742
9	NC_018606	TTG	2	6	645	650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025742
10	NC_018606	TTC	2	6	669	674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025742
11	NC_018606	TTC	2	6	775	780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025742
12	NC_018606	TAA	2	6	953	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
13	NC_018606	TAA	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
14	NC_018606	GTA	2	6	1105	1110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025742
15	NC_018606	AGC	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025742
16	NC_018606	ACT	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025742
17	NC_018606	TCG	2	6	1221	1226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018606	TAA	2	6	1344	1349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018606	ACG	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018606	TTA	2	6	1387	1392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018606	TGT	2	6	1400	1405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018606	ACG	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025743
23	NC_018606	ATG	2	6	1528	1533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025743
24	NC_018606	GTA	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025743
25	NC_018606	ATA	2	6	1662	1667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025743
26	NC_018606	TAT	2	6	1716	1721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025743
27	NC_018606	AGG	2	6	1766	1771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406025743
28	NC_018606	CTA	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025743
29	NC_018606	GTG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025743
30	NC_018606	GAA	2	6	2013	2018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
31	NC_018606	CAT	2	6	2132	2137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025743
32	NC_018606	AGA	2	6	2153	2158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
33	NC_018606	AGA	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
34	NC_018606	AGA	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
35	NC_018606	AGA	2	6	2204	2209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
36	NC_018606	AGA	2	6	2216	2221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
37	NC_018606	GAA	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
38	NC_018606	TAT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025743
39	NC_018606	ATA	2	6	2372	2377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025743
40	NC_018606	ATA	2	6	2462	2467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025744
41	NC_018606	TAT	2	6	2626	2631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025744
42	NC_018606	ACC	2	6	2831	2836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025744
43	NC_018606	ATA	2	6	2861	2866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025744
44	NC_018606	TCC	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406025744
45	NC_018606	CTT	2	6	3020	3025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025745
46	NC_018606	TAA	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025745
47	NC_018606	AAT	2	6	3110	3115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025745
48	NC_018606	TTG	2	6	3213	3218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025745
49	NC_018606	TGT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025745
50	NC_018606	TAA	2	6	3276	3281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025745
51	NC_018606	CTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025745
52	NC_018606	TAT	2	6	3502	3507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018606	TGA	2	6	3585	3590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018606	AGA	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
55	NC_018606	CAG	2	6	3831	3836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025746
56	NC_018606	GTA	2	6	3842	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025746
57	NC_018606	TTA	2	6	3857	3862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025746
58	NC_018606	TAT	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025746
59	NC_018606	ATA	2	6	4104	4109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025746
60	NC_018606	ATG	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025746
61	NC_018606	GAA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
62	NC_018606	AAG	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
63	NC_018606	GAA	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
64	NC_018606	AGA	2	6	4492	4497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
65	NC_018606	AGA	2	6	4516	4521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
66	NC_018606	AGA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
67	NC_018606	AAG	2	6	4554	4559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
68	NC_018606	AAG	2	6	4566	4571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
69	NC_018606	GAA	2	6	4586	4591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
70	NC_018606	TAA	2	6	4709	4714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025746
71	NC_018606	ATT	2	6	4787	4792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025747
72	NC_018606	TAC	2	6	5060	5065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025747
73	NC_018606	TTA	2	6	5098	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025747
74	NC_018606	CTA	2	6	5257	5262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025747
75	NC_018606	CTT	2	6	5288	5293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025747
76	NC_018606	CAT	2	6	5367	5372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025747
77	NC_018606	TTC	2	6	5373	5378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025747
78	NC_018606	GAA	2	6	5443	5448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025747
79	NC_018606	AAT	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025747
80	NC_018606	TAA	2	6	5519	5524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018606	AAT	2	6	5525	5530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018606	TAC	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018606	ACT	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018606	TAT	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018606	TCT	2	6	6077	6082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025748
86	NC_018606	AGA	2	6	6118	6123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025748
87	NC_018606	AGC	2	6	6217	6222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025748
88	NC_018606	CTG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025748
89	NC_018606	TAT	2	6	6266	6271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025748
90	NC_018606	TCA	2	6	6284	6289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025748
91	NC_018606	TAA	2	6	6313	6318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025748
92	NC_018606	ATC	2	6	6355	6360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025748
93	NC_018606	GCA	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025748
94	NC_018606	TTG	3	9	6611	6619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025748
95	NC_018606	GTC	2	6	6651	6656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025748
96	NC_018606	GAA	2	6	6695	6700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025748
97	NC_018606	ATT	3	9	6709	6717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025748
98	NC_018606	GCA	3	9	6775	6783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025748
99	NC_018606	GTC	2	6	6791	6796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025748
100	NC_018606	CTA	2	6	6814	6819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025749
101	NC_018606	AAG	2	6	6920	6925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025749
102	NC_018606	CTA	2	6	6941	6946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025749
103	NC_018606	AGG	2	6	6951	6956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406025749
104	NC_018606	GTA	2	6	7002	7007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018606	ACT	2	6	7041	7046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018606	AAT	2	6	7135	7140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018606	TAA	2	6	7150	7155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018606	TCT	2	6	7164	7169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018606	ATT	2	6	7229	7234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025750
110	NC_018606	CGT	2	6	7238	7243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025750
111	NC_018606	TTA	2	6	7268	7273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025750
112	NC_018606	CGA	2	6	7391	7396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018606	AGT	2	6	7469	7474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025751
114	NC_018606	GCT	2	6	7481	7486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025751
115	NC_018606	TAC	2	6	7507	7512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025751
116	NC_018606	GTT	2	6	7611	7616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025751
117	NC_018606	TTA	2	6	7659	7664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025751
118	NC_018606	CAA	2	6	7811	7816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025751
119	NC_018606	GAA	2	6	7837	7842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025751
120	NC_018606	GAA	2	6	7945	7950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025752
121	NC_018606	CAA	2	6	7969	7974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025752
122	NC_018606	TGG	2	6	8076	8081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025752
123	NC_018606	CTT	2	6	8225	8230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025752
124	NC_018606	TAA	2	6	8247	8252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025752
125	NC_018606	TAA	2	6	8325	8330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025752
126	NC_018606	TTA	2	6	8333	8338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025752
127	NC_018606	TAT	2	6	8352	8357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025752
128	NC_018606	TAT	2	6	8467	8472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018606	TTA	2	6	8549	8554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018606	ATT	2	6	8581	8586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018606	TTA	2	6	8625	8630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018606	ATT	2	6	8663	8668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025753
133	NC_018606	CTT	2	6	8798	8803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025753
134	NC_018606	AAT	2	6	8903	8908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025753
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142	NC_018606	ATG	2	6	9499	9504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_018606	CTT	2	6	18990	18995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025762
261	NC_018606	TCA	2	6	19015	19020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025762
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263	NC_018606	TAC	2	6	19103	19108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025762
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