MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 1471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	TAA	2	6	66	71	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018606	T	6	6	77	82	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018606	ATTATA	2	12	118	129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018606	ATA	2	6	148	153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018606	TTTC	2	8	188	195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018606	TAGA	2	8	224	231	50 %	25 %	25 %	0 %	406025742
7	NC_018606	TC	3	6	256	261	0 %	50 %	0 %	50 %	406025742
8	NC_018606	ATA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
9	NC_018606	TAA	2	6	281	286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
10	NC_018606	TTA	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025742
11	NC_018606	CTTT	2	8	331	338	0 %	75 %	0 %	25 %	406025742
12	NC_018606	TTA	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025742
13	NC_018606	AAG	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025742
14	NC_018606	TA	3	6	396	401	50 %	50 %	0 %	0 %	406025742
15	NC_018606	T	7	7	447	453	0 %	100 %	0 %	0 %	406025742
16	NC_018606	CCA	2	6	538	543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025742
17	NC_018606	TTG	2	6	645	650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025742
18	NC_018606	TTC	2	6	669	674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025742
19	NC_018606	GTTT	2	8	688	695	0 %	75 %	25 %	0 %	406025742
20	NC_018606	AC	3	6	731	736	50 %	0 %	0 %	50 %	406025742
21	NC_018606	TTC	2	6	775	780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025742
22	NC_018606	T	6	6	797	802	0 %	100 %	0 %	0 %	406025742
23	NC_018606	TAA	2	6	953	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
24	NC_018606	TAA	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025742
25	NC_018606	GTA	2	6	1105	1110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025742
26	NC_018606	CCTTTA	2	12	1114	1125	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	406025742
27	NC_018606	AGC	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025742
28	NC_018606	ACT	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025742
29	NC_018606	TCG	2	6	1221	1226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018606	CA	3	6	1227	1232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018606	TAA	2	6	1344	1349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018606	ACG	2	6	1374	1379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018606	TTA	2	6	1387	1392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018606	TGT	2	6	1400	1405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018606	ACG	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025743
36	NC_018606	ATG	2	6	1528	1533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025743
37	NC_018606	AAGA	2	8	1611	1618	75 %	0 %	25 %	0 %	406025743
38	NC_018606	GTA	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025743
39	NC_018606	ATA	2	6	1662	1667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025743
40	NC_018606	A	6	6	1702	1707	100 %	0 %	0 %	0 %	406025743
41	NC_018606	TAT	2	6	1716	1721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025743
42	NC_018606	CTCAG	2	10	1746	1755	20 %	20 %	20 %	40 %	406025743
43	NC_018606	AGG	2	6	1766	1771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406025743
44	NC_018606	A	6	6	1836	1841	100 %	0 %	0 %	0 %	406025743
45	NC_018606	TA	3	6	1845	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	406025743
46	NC_018606	TTCA	2	8	1904	1911	25 %	50 %	0 %	25 %	406025743
47	NC_018606	CTA	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025743
48	NC_018606	GTG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025743
49	NC_018606	T	6	6	1986	1991	0 %	100 %	0 %	0 %	406025743
50	NC_018606	GAA	2	6	2013	2018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
51	NC_018606	A	7	7	2024	2030	100 %	0 %	0 %	0 %	406025743
52	NC_018606	CAT	2	6	2132	2137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025743
53	NC_018606	AGA	2	6	2153	2158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
54	NC_018606	AGA	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
55	NC_018606	AGA	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
56	NC_018606	AGA	2	6	2204	2209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
57	NC_018606	AGA	2	6	2216	2221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
58	NC_018606	GAA	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025743
59	NC_018606	TAT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025743
60	NC_018606	ATA	2	6	2372	2377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025743
61	NC_018606	ATA	2	6	2462	2467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025744
62	NC_018606	TAT	2	6	2626	2631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025744
63	NC_018606	AGAT	2	8	2650	2657	50 %	25 %	25 %	0 %	406025744
64	NC_018606	ACC	2	6	2831	2836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025744
65	NC_018606	ATA	2	6	2861	2866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025744
66	NC_018606	TCC	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406025744
67	NC_018606	CTT	2	6	3020	3025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025745
68	NC_018606	TAA	2	6	3056	3061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025745
69	NC_018606	T	6	6	3062	3067	0 %	100 %	0 %	0 %	406025745
70	NC_018606	CAGGC	2	10	3086	3095	20 %	0 %	40 %	40 %	406025745
71	NC_018606	AAT	2	6	3110	3115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025745
72	NC_018606	T	7	7	3158	3164	0 %	100 %	0 %	0 %	406025745
73	NC_018606	T	6	6	3168	3173	0 %	100 %	0 %	0 %	406025745
74	NC_018606	TTG	2	6	3213	3218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025745
75	NC_018606	TGT	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025745
76	NC_018606	TAA	2	6	3276	3281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025745
77	NC_018606	CTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025745
78	NC_018606	TTAT	2	8	3435	3442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018606	AATG	2	8	3484	3491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018606	TAT	2	6	3502	3507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018606	TGA	2	6	3585	3590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018606	ACAA	2	8	3592	3599	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_018606	A	6	6	3641	3646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018606	A	8	8	3654	3661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018606	TA	3	6	3689	3694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018606	GATAT	2	10	3715	3724	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018606	A	6	6	3732	3737	100 %	0 %	0 %	0 %	406025746
88	NC_018606	AGA	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
89	NC_018606	TC	3	6	3825	3830	0 %	50 %	0 %	50 %	406025746
90	NC_018606	CAG	2	6	3831	3836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025746
91	NC_018606	GTA	2	6	3842	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025746
92	NC_018606	TTA	2	6	3857	3862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025746
93	NC_018606	CTAT	2	8	3899	3906	25 %	50 %	0 %	25 %	406025746
94	NC_018606	TAT	2	6	3998	4003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025746
95	NC_018606	TA	3	6	4014	4019	50 %	50 %	0 %	0 %	406025746
96	NC_018606	ATA	2	6	4104	4109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025746
97	NC_018606	AG	3	6	4144	4149	50 %	0 %	50 %	0 %	406025746
98	NC_018606	ATG	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025746
99	NC_018606	A	6	6	4242	4247	100 %	0 %	0 %	0 %	406025746
100	NC_018606	GAA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
101	NC_018606	AAG	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
102	NC_018606	GAA	2	6	4466	4471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
103	NC_018606	AGA	2	6	4492	4497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
104	NC_018606	AGA	2	6	4516	4521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
105	NC_018606	AGA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
106	NC_018606	AAG	2	6	4554	4559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
107	NC_018606	AAG	2	6	4566	4571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
108	NC_018606	GAA	2	6	4586	4591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025746
109	NC_018606	TAA	2	6	4709	4714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025746
110	NC_018606	TA	4	8	4717	4724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018606	ATT	2	6	4787	4792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025747
112	NC_018606	T	6	6	4833	4838	0 %	100 %	0 %	0 %	406025747
113	NC_018606	T	6	6	4944	4949	0 %	100 %	0 %	0 %	406025747
114	NC_018606	TATT	2	8	4987	4994	25 %	75 %	0 %	0 %	406025747
115	NC_018606	TGATCT	2	12	5014	5025	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406025747
116	NC_018606	TAC	2	6	5060	5065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025747
117	NC_018606	TGGA	2	8	5087	5094	25 %	25 %	50 %	0 %	406025747
118	NC_018606	TTA	2	6	5098	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025747
119	NC_018606	A	7	7	5121	5127	100 %	0 %	0 %	0 %	406025747
120	NC_018606	A	7	7	5163	5169	100 %	0 %	0 %	0 %	406025747
121	NC_018606	TA	3	6	5201	5206	50 %	50 %	0 %	0 %	406025747
122	NC_018606	CTA	2	6	5257	5262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025747
123	NC_018606	TTTTCT	2	12	5274	5285	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	406025747
124	NC_018606	CTT	2	6	5288	5293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025747
125	NC_018606	CAT	2	6	5367	5372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025747
126	NC_018606	TTC	2	6	5373	5378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025747
127	NC_018606	GAA	2	6	5443	5448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025747
128	NC_018606	AAT	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025747
129	NC_018606	TAA	2	6	5519	5524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018606	AAT	2	6	5525	5530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018606	TAC	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018606	AT	3	6	5598	5603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018606	T	9	9	5605	5613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018606	A	6	6	5655	5660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018606	AC	3	6	5666	5671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018606	AGAC	2	8	5678	5685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018606	T	8	8	5729	5736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018606	A	7	7	5793	5799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018606	AT	3	6	5812	5817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018606	T	6	6	5867	5872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018606	ACT	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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