MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HT isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018417	TAAA	2	8	260	267	75 %	25 %	0 %	0 %	400404502
2	NC_018417	TTTA	2	8	678	685	25 %	75 %	0 %	0 %	400404502
3	NC_018417	ATAA	2	8	748	755	75 %	25 %	0 %	0 %	400404502
4	NC_018417	TAAA	2	8	857	864	75 %	25 %	0 %	0 %	400404502
5	NC_018417	ATTT	2	8	995	1002	25 %	75 %	0 %	0 %	400404502
6	NC_018417	TAAT	2	8	1127	1134	50 %	50 %	0 %	0 %	400404502
7	NC_018417	AATT	2	8	1290	1297	50 %	50 %	0 %	0 %	400404502
8	NC_018417	TTTA	2	8	1299	1306	25 %	75 %	0 %	0 %	400404502
9	NC_018417	ATTC	2	8	1551	1558	25 %	50 %	0 %	25 %	400404503
10	NC_018417	ATTC	2	8	1590	1597	25 %	50 %	0 %	25 %	400404503
11	NC_018417	TAGA	2	8	1612	1619	50 %	25 %	25 %	0 %	400404503
12	NC_018417	ATTA	2	8	1926	1933	50 %	50 %	0 %	0 %	400404503
13	NC_018417	AAAT	2	8	2395	2402	75 %	25 %	0 %	0 %	400404503
14	NC_018417	ATTA	2	8	2522	2529	50 %	50 %	0 %	0 %	400404503
15	NC_018417	TAAT	2	8	2536	2543	50 %	50 %	0 %	0 %	400404503
16	NC_018417	TATT	2	8	2802	2809	25 %	75 %	0 %	0 %	400404503
17	NC_018417	AATA	2	8	2940	2947	75 %	25 %	0 %	0 %	400404504
18	NC_018417	AATT	2	8	3030	3037	50 %	50 %	0 %	0 %	400404504
19	NC_018417	TAAT	2	8	3128	3135	50 %	50 %	0 %	0 %	400404504
20	NC_018417	ATTT	2	8	3405	3412	25 %	75 %	0 %	0 %	400404504
21	NC_018417	ATTA	2	8	3475	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	400404505
22	NC_018417	AAAT	2	8	3688	3695	75 %	25 %	0 %	0 %	400404505
23	NC_018417	ATTA	2	8	3870	3877	50 %	50 %	0 %	0 %	400404506
24	NC_018417	AAAT	2	8	3892	3899	75 %	25 %	0 %	0 %	400404506
25	NC_018417	ATAA	2	8	4156	4163	75 %	25 %	0 %	0 %	400404507
26	NC_018417	ATTA	2	8	4287	4294	50 %	50 %	0 %	0 %	400404507
27	NC_018417	TAAA	2	8	4426	4433	75 %	25 %	0 %	0 %	400404508
28	NC_018417	ACAA	2	8	4500	4507	75 %	0 %	0 %	25 %	400404508
29	NC_018417	TGAA	2	8	4654	4661	50 %	25 %	25 %	0 %	400404508
30	NC_018417	AATT	2	8	4723	4730	50 %	50 %	0 %	0 %	400404508
31	NC_018417	TAAT	2	8	4777	4784	50 %	50 %	0 %	0 %	400404508
32	NC_018417	GTAT	2	8	4815	4822	25 %	50 %	25 %	0 %	400404508
33	NC_018417	CATG	2	8	5025	5032	25 %	25 %	25 %	25 %	400404508
34	NC_018417	ATTT	2	8	5293	5300	25 %	75 %	0 %	0 %	400404508
35	NC_018417	ATAA	2	8	5676	5683	75 %	25 %	0 %	0 %	400404508
36	NC_018417	ATAA	2	8	5975	5982	75 %	25 %	0 %	0 %	400404509
37	NC_018417	ATTT	2	8	6228	6235	25 %	75 %	0 %	0 %	400404509
38	NC_018417	TAAA	2	8	6270	6277	75 %	25 %	0 %	0 %	400404509
39	NC_018417	TAAT	2	8	6468	6475	50 %	50 %	0 %	0 %	400404509
40	NC_018417	ATTT	2	8	6589	6596	25 %	75 %	0 %	0 %	400404510
41	NC_018417	AATT	2	8	6959	6966	50 %	50 %	0 %	0 %	400404510
42	NC_018417	TAAA	2	8	7073	7080	75 %	25 %	0 %	0 %	400404510
43	NC_018417	ATGA	2	8	7102	7109	50 %	25 %	25 %	0 %	400404510
44	NC_018417	ACCA	2	8	7277	7284	50 %	0 %	0 %	50 %	400404510
45	NC_018417	AAGA	2	8	7313	7320	75 %	0 %	25 %	0 %	400404510
46	NC_018417	TTTA	2	8	7562	7569	25 %	75 %	0 %	0 %	400404510
47	NC_018417	AAAT	2	8	7898	7905	75 %	25 %	0 %	0 %	400404511
48	NC_018417	TAAT	2	8	8075	8082	50 %	50 %	0 %	0 %	400404512
49	NC_018417	TAAT	2	8	8249	8256	50 %	50 %	0 %	0 %	400404512
50	NC_018417	AATT	2	8	8360	8367	50 %	50 %	0 %	0 %	400404512
51	NC_018417	ATAA	2	8	8527	8534	75 %	25 %	0 %	0 %	400404512
52	NC_018417	TAAA	2	8	8642	8649	75 %	25 %	0 %	0 %	400404512
53	NC_018417	AAAT	2	8	8732	8739	75 %	25 %	0 %	0 %	400404512
54	NC_018417	TAAA	2	8	8961	8968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018417	TTAT	2	8	8982	8989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018417	TTAT	2	8	9057	9064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018417	TAAA	2	8	9550	9557	75 %	25 %	0 %	0 %	400404513
58	NC_018417	TAAT	2	8	9885	9892	50 %	50 %	0 %	0 %	400404514
59	NC_018417	AATT	2	8	10260	10267	50 %	50 %	0 %	0 %	400404514
60	NC_018417	ATTT	2	8	10432	10439	25 %	75 %	0 %	0 %	400404514
61	NC_018417	ATTT	2	8	10528	10535	25 %	75 %	0 %	0 %	400404514
62	NC_018417	ATAA	2	8	10768	10775	75 %	25 %	0 %	0 %	400404514
63	NC_018417	AAGT	2	8	10872	10879	50 %	25 %	25 %	0 %	400404514
64	NC_018417	CATC	2	8	11021	11028	25 %	25 %	0 %	50 %	400404514
65	NC_018417	TAAA	2	8	11055	11062	75 %	25 %	0 %	0 %	400404514
66	NC_018417	TAAA	2	8	11574	11581	75 %	25 %	0 %	0 %	400404515
67	NC_018417	AAAT	2	8	12132	12139	75 %	25 %	0 %	0 %	400404515
68	NC_018417	ATTT	2	8	12237	12244	25 %	75 %	0 %	0 %	400404515
69	NC_018417	TATT	2	8	12275	12282	25 %	75 %	0 %	0 %	400404515
70	NC_018417	AATT	2	8	12393	12400	50 %	50 %	0 %	0 %	400404515
71	NC_018417	TTAA	2	8	12440	12447	50 %	50 %	0 %	0 %	400404515
72	NC_018417	AATT	2	8	12454	12461	50 %	50 %	0 %	0 %	400404515
73	NC_018417	TAAA	2	8	12495	12502	75 %	25 %	0 %	0 %	400404515
74	NC_018417	ATTA	2	8	12601	12608	50 %	50 %	0 %	0 %	400404515
75	NC_018417	AAAT	2	8	12925	12932	75 %	25 %	0 %	0 %	400404515
76	NC_018417	TAAT	2	8	13375	13382	50 %	50 %	0 %	0 %	400404516
77	NC_018417	TTTA	2	8	13479	13486	25 %	75 %	0 %	0 %	400404516
78	NC_018417	AATA	2	8	13505	13512	75 %	25 %	0 %	0 %	400404516
79	NC_018417	TAAA	2	8	13585	13592	75 %	25 %	0 %	0 %	400404516
80	NC_018417	ATCT	2	8	14129	14136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018417	ATTT	2	8	14307	14314	25 %	75 %	0 %	0 %	400404518
82	NC_018417	TAAT	2	8	14875	14882	50 %	50 %	0 %	0 %	400404518
83	NC_018417	TAAT	2	8	14939	14946	50 %	50 %	0 %	0 %	400404518
84	NC_018417	TAAA	2	8	15027	15034	75 %	25 %	0 %	0 %	400404518
85	NC_018417	ATGT	2	8	15151	15158	25 %	50 %	25 %	0 %	400404519
86	NC_018417	TATT	2	8	15394	15401	25 %	75 %	0 %	0 %	400404519
87	NC_018417	AAAT	2	8	15501	15508	75 %	25 %	0 %	0 %	400404519
88	NC_018417	TAAT	2	8	15612	15619	50 %	50 %	0 %	0 %	400404519
89	NC_018417	ATTT	2	8	15635	15642	25 %	75 %	0 %	0 %	400404519
90	NC_018417	TAAA	2	8	16074	16081	75 %	25 %	0 %	0 %	400404520
91	NC_018417	TTAA	2	8	16408	16415	50 %	50 %	0 %	0 %	400404521
92	NC_018417	AATA	2	8	16566	16573	75 %	25 %	0 %	0 %	400404521
93	NC_018417	CAAA	2	8	16760	16767	75 %	0 %	0 %	25 %	400404521
94	NC_018417	TAAT	2	8	17599	17606	50 %	50 %	0 %	0 %	400404523
95	NC_018417	TAAA	2	8	17926	17933	75 %	25 %	0 %	0 %	400404523
96	NC_018417	AATT	2	8	18020	18027	50 %	50 %	0 %	0 %	400404523
97	NC_018417	AATA	2	8	18476	18483	75 %	25 %	0 %	0 %	400404523
98	NC_018417	TATG	2	8	18889	18896	25 %	50 %	25 %	0 %	400404523
99	NC_018417	ATTT	2	8	19459	19466	25 %	75 %	0 %	0 %	400404523
100	NC_018417	TAAA	2	8	19657	19664	75 %	25 %	0 %	0 %	400404523
101	NC_018417	ATTT	2	8	20156	20163	25 %	75 %	0 %	0 %	400404523
102	NC_018417	TTAC	2	8	20566	20573	25 %	50 %	0 %	25 %	400404523
103	NC_018417	TTAA	2	8	20823	20830	50 %	50 %	0 %	0 %	400404523
104	NC_018417	ATTA	2	8	20963	20970	50 %	50 %	0 %	0 %	400404524
105	NC_018417	TAAA	2	8	20985	20992	75 %	25 %	0 %	0 %	400404524
106	NC_018417	ATTT	2	8	21148	21155	25 %	75 %	0 %	0 %	400404524
107	NC_018417	ACTA	2	8	21693	21700	50 %	25 %	0 %	25 %	400404525
108	NC_018417	TTAT	2	8	21824	21831	25 %	75 %	0 %	0 %	400404525
109	NC_018417	TAAA	2	8	21841	21848	75 %	25 %	0 %	0 %	400404525
110	NC_018417	ATAA	2	8	21957	21964	75 %	25 %	0 %	0 %	400404525
111	NC_018417	TTGT	2	8	21978	21985	0 %	75 %	25 %	0 %	400404525
112	NC_018417	AAAT	2	8	22036	22043	75 %	25 %	0 %	0 %	400404525
113	NC_018417	ATTA	2	8	22088	22095	50 %	50 %	0 %	0 %	400404525
114	NC_018417	AGAA	2	8	22616	22623	75 %	0 %	25 %	0 %	400404525
115	NC_018417	ATTA	2	8	22781	22788	50 %	50 %	0 %	0 %	400404525
116	NC_018417	TAAT	2	8	23101	23108	50 %	50 %	0 %	0 %	400404525
117	NC_018417	AATA	2	8	23244	23251	75 %	25 %	0 %	0 %	400404525
118	NC_018417	ATAA	2	8	23373	23380	75 %	25 %	0 %	0 %	400404525
119	NC_018417	ATAA	2	8	23489	23496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018417	TTTA	2	8	23907	23914	25 %	75 %	0 %	0 %	400404527
121	NC_018417	TTTG	2	8	24424	24431	0 %	75 %	25 %	0 %	400404528
122	NC_018417	AAAT	2	8	24905	24912	75 %	25 %	0 %	0 %	400404528
123	NC_018417	TATT	2	8	25533	25540	25 %	75 %	0 %	0 %	400404529
124	NC_018417	TAAA	2	8	25776	25783	75 %	25 %	0 %	0 %	400404529
125	NC_018417	AAAT	2	8	25842	25849	75 %	25 %	0 %	0 %	400404529
126	NC_018417	TAAT	2	8	26052	26059	50 %	50 %	0 %	0 %	400404529
127	NC_018417	AAAT	2	8	26097	26104	75 %	25 %	0 %	0 %	400404529
128	NC_018417	ATTA	2	8	26488	26495	50 %	50 %	0 %	0 %	400404529
129	NC_018417	TGAT	2	8	26604	26611	25 %	50 %	25 %	0 %	400404529
130	NC_018417	ATTA	2	8	26678	26685	50 %	50 %	0 %	0 %	400404529
131	NC_018417	TTAA	2	8	26778	26785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018417	ATTA	2	8	26968	26975	50 %	50 %	0 %	0 %	400404530
133	NC_018417	ATTT	2	8	27017	27024	25 %	75 %	0 %	0 %	400404530
134	NC_018417	ATTA	2	8	27596	27603	50 %	50 %	0 %	0 %	400404531
135	NC_018417	ATTG	2	8	27633	27640	25 %	50 %	25 %	0 %	400404531
136	NC_018417	ATTT	2	8	27710	27717	25 %	75 %	0 %	0 %	400404531
137	NC_018417	ATTA	2	8	27939	27946	50 %	50 %	0 %	0 %	400404531
138	NC_018417	TAAT	2	8	28108	28115	50 %	50 %	0 %	0 %	400404531
139	NC_018417	ATTA	2	8	28263	28270	50 %	50 %	0 %	0 %	400404531
140	NC_018417	TAAA	2	8	28313	28320	75 %	25 %	0 %	0 %	400404531
141	NC_018417	ATTA	2	8	28355	28362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018417	ATTT	2	8	28470	28477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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