MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Carsonella ruddii HC isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 8584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_018416	ATT	2	6	164787	164792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404453
8502	NC_018416	T	6	6	164798	164803	0 %	100 %	0 %	0 %	400404453
8503	NC_018416	A	7	7	164804	164810	100 %	0 %	0 %	0 %	400404453
8504	NC_018416	TAA	2	6	164811	164816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404453
8505	NC_018416	ATT	2	6	164817	164822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404453
8506	NC_018416	TAA	2	6	164839	164844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404453
8507	NC_018416	TAT	2	6	164845	164850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404453
8508	NC_018416	A	6	6	164857	164862	100 %	0 %	0 %	0 %	400404453
8509	NC_018416	A	12	12	164875	164886	100 %	0 %	0 %	0 %	400404453
8510	NC_018416	A	8	8	164900	164907	100 %	0 %	0 %	0 %	400404453
8511	NC_018416	TAA	2	6	164911	164916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404453
8512	NC_018416	T	9	9	164937	164945	0 %	100 %	0 %	0 %	400404453
8513	NC_018416	TTA	2	6	164947	164952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404453
8514	NC_018416	TTTTA	2	10	164953	164962	20 %	80 %	0 %	0 %	400404453
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8516	NC_018416	A	8	8	164978	164985	100 %	0 %	0 %	0 %	400404453
8517	NC_018416	ATTTT	2	10	164991	165000	20 %	80 %	0 %	0 %	400404453
8518	NC_018416	A	9	9	165004	165012	100 %	0 %	0 %	0 %	400404453
8519	NC_018416	TAA	2	6	165022	165027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404453
8520	NC_018416	ATT	2	6	165031	165036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404453
8521	NC_018416	TAA	2	6	165040	165045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404453
8522	NC_018416	TAT	2	6	165048	165053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404453
8523	NC_018416	TAAA	2	8	165054	165061	75 %	25 %	0 %	0 %	400404453
8524	NC_018416	TA	3	6	165064	165069	50 %	50 %	0 %	0 %	400404453
8525	NC_018416	ATTA	2	8	165070	165077	50 %	50 %	0 %	0 %	400404453
8526	NC_018416	TA	3	6	165104	165109	50 %	50 %	0 %	0 %	400404454
8527	NC_018416	T	6	6	165136	165141	0 %	100 %	0 %	0 %	400404454
8528	NC_018416	TAATT	2	10	165199	165208	40 %	60 %	0 %	0 %	400404454
8529	NC_018416	AAAT	2	8	165223	165230	75 %	25 %	0 %	0 %	400404454
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8532	NC_018416	TAT	2	6	165311	165316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_018416	ATTT	2	8	165326	165333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_018416	A	15	15	165355	165369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_018416	TAA	2	6	165390	165395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404455
8536	NC_018416	TTA	2	6	165433	165438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404455
8537	NC_018416	TTAATT	2	12	165445	165456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404455
8538	NC_018416	AAT	2	6	165473	165478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404455
8539	NC_018416	TAT	2	6	165491	165496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404455
8540	NC_018416	TAA	2	6	165497	165502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400404455
8541	NC_018416	T	10	10	165504	165513	0 %	100 %	0 %	0 %	400404455
8542	NC_018416	AT	3	6	165516	165521	50 %	50 %	0 %	0 %	400404455
8543	NC_018416	TA	3	6	165528	165533	50 %	50 %	0 %	0 %	400404455
8544	NC_018416	AGA	2	6	165534	165539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400404455
8545	NC_018416	TCT	2	6	165544	165549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400404455
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8547	NC_018416	T	6	6	165586	165591	0 %	100 %	0 %	0 %	400404455
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8549	NC_018416	A	10	10	165606	165615	100 %	0 %	0 %	0 %	400404455
8550	NC_018416	TTA	2	6	165616	165621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400404455
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8553	NC_018416	A	9	9	165654	165662	100 %	0 %	0 %	0 %	400404455
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8555	NC_018416	T	6	6	165681	165686	0 %	100 %	0 %	0 %	400404455
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8557	NC_018416	A	9	9	165698	165706	100 %	0 %	0 %	0 %	400404455
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8584	NC_018416	T	7	7	166146	166152	0 %	100 %	0 %	0 %	400404455

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.