MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Carsonella ruddii CE isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 8417

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018414	AAT	2	6	4	9	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
2	NC_018414	TTC	2	6	42	47	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400403788
3	NC_018414	TTA	2	6	89	94	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
4	NC_018414	TAA	2	6	101	106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
5	NC_018414	A	7	7	105	111	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
6	NC_018414	AT	3	6	145	150	50 %	50 %	0 %	0 %	400403788
7	NC_018414	A	6	6	160	165	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
8	NC_018414	GTTTT	2	10	184	193	0 %	80 %	20 %	0 %	400403788
9	NC_018414	T	6	6	190	195	0 %	100 %	0 %	0 %	400403788
10	NC_018414	TGT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400403788
11	NC_018414	TAA	2	6	272	277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
12	NC_018414	ATT	2	6	288	293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
13	NC_018414	AGAA	2	8	327	334	75 %	0 %	25 %	0 %	400403788
14	NC_018414	AT	3	6	336	341	50 %	50 %	0 %	0 %	400403788
15	NC_018414	AAC	2	6	379	384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	400403788
16	NC_018414	TAT	2	6	391	396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
17	NC_018414	A	7	7	434	440	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
18	NC_018414	TATT	2	8	441	448	25 %	75 %	0 %	0 %	400403788
19	NC_018414	TAA	2	6	455	460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
20	NC_018414	A	6	6	459	464	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
21	NC_018414	ATA	2	6	505	510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
22	NC_018414	ATT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
23	NC_018414	A	7	7	522	528	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
24	NC_018414	TCA	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400403788
25	NC_018414	T	6	6	543	548	0 %	100 %	0 %	0 %	400403788
26	NC_018414	A	7	7	555	561	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
27	NC_018414	A	7	7	567	573	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
28	NC_018414	ATT	2	6	582	587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
29	NC_018414	TAT	2	6	593	598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
30	NC_018414	TAAA	2	8	599	606	75 %	25 %	0 %	0 %	400403788
31	NC_018414	A	7	7	610	616	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
32	NC_018414	TTTA	2	8	681	688	25 %	75 %	0 %	0 %	400403788
33	NC_018414	A	6	6	741	746	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
34	NC_018414	AACAA	2	10	753	762	80 %	0 %	0 %	20 %	400403788
35	NC_018414	ATTT	2	8	763	770	25 %	75 %	0 %	0 %	400403788
36	NC_018414	TAA	2	6	782	787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
37	NC_018414	CAG	2	6	800	805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400403788
38	NC_018414	A	6	6	822	827	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
39	NC_018414	A	6	6	836	841	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
40	NC_018414	A	6	6	852	857	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
41	NC_018414	TAAA	2	8	860	867	75 %	25 %	0 %	0 %	400403788
42	NC_018414	ATATT	2	10	886	895	40 %	60 %	0 %	0 %	400403788
43	NC_018414	ATTTA	2	10	906	915	40 %	60 %	0 %	0 %	400403788
44	NC_018414	T	7	7	945	951	0 %	100 %	0 %	0 %	400403788
45	NC_018414	AATAA	2	10	952	961	80 %	20 %	0 %	0 %	400403788
46	NC_018414	ATT	2	6	973	978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
47	NC_018414	TAA	2	6	983	988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
48	NC_018414	AT	3	6	998	1003	50 %	50 %	0 %	0 %	400403788
49	NC_018414	A	7	7	1008	1014	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
50	NC_018414	A	6	6	1032	1037	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
51	NC_018414	ATT	2	6	1042	1047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
52	NC_018414	A	6	6	1062	1067	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
53	NC_018414	AT	3	6	1078	1083	50 %	50 %	0 %	0 %	400403788
54	NC_018414	T	6	6	1095	1100	0 %	100 %	0 %	0 %	400403788
55	NC_018414	AAT	2	6	1107	1112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
56	NC_018414	ATT	3	9	1125	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403788
57	NC_018414	TGAAT	2	10	1140	1149	40 %	40 %	20 %	0 %	400403788
58	NC_018414	TAA	2	6	1173	1178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
59	NC_018414	T	6	6	1187	1192	0 %	100 %	0 %	0 %	400403788
60	NC_018414	TGT	2	6	1204	1209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	400403788
61	NC_018414	TAA	2	6	1235	1240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
62	NC_018414	A	8	8	1247	1254	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
63	NC_018414	TAA	3	9	1281	1289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403788
64	NC_018414	A	6	6	1293	1298	100 %	0 %	0 %	0 %	400403788
65	NC_018414	T	7	7	1302	1308	0 %	100 %	0 %	0 %	400403788
66	NC_018414	AT	3	6	1332	1337	50 %	50 %	0 %	0 %	400403788
67	NC_018414	ATT	3	9	1341	1349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
68	NC_018414	TCT	2	6	1386	1391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	400403789
69	NC_018414	GTA	2	6	1402	1407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400403789
70	NC_018414	ATA	2	6	1435	1440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
71	NC_018414	AGG	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400403789
72	NC_018414	TAA	2	6	1492	1497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
73	NC_018414	AGAAAT	2	12	1499	1510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	400403789
74	NC_018414	AGG	2	6	1514	1519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	400403789
75	NC_018414	ATT	2	6	1540	1545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
76	NC_018414	ATTC	2	8	1551	1558	25 %	50 %	0 %	25 %	400403789
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78	NC_018414	CATT	2	8	1593	1600	25 %	50 %	0 %	25 %	400403789
79	NC_018414	TAGA	2	8	1612	1619	50 %	25 %	25 %	0 %	400403789
80	NC_018414	TA	3	6	1624	1629	50 %	50 %	0 %	0 %	400403789
81	NC_018414	ATTAT	2	10	1633	1642	40 %	60 %	0 %	0 %	400403789
82	NC_018414	ATT	3	9	1646	1654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
83	NC_018414	A	9	9	1658	1666	100 %	0 %	0 %	0 %	400403789
84	NC_018414	TAA	2	6	1669	1674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
85	NC_018414	A	6	6	1693	1698	100 %	0 %	0 %	0 %	400403789
86	NC_018414	A	6	6	1710	1715	100 %	0 %	0 %	0 %	400403789
87	NC_018414	TA	3	6	1716	1721	50 %	50 %	0 %	0 %	400403789
88	NC_018414	TAA	2	6	1726	1731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
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90	NC_018414	T	9	9	1747	1755	0 %	100 %	0 %	0 %	400403789
91	NC_018414	A	6	6	1757	1762	100 %	0 %	0 %	0 %	400403789
92	NC_018414	TAA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
93	NC_018414	AT	3	6	1816	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	400403789
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95	NC_018414	T	6	6	1853	1858	0 %	100 %	0 %	0 %	400403789
96	NC_018414	A	6	6	1871	1876	100 %	0 %	0 %	0 %	400403789
97	NC_018414	TA	3	6	1877	1882	50 %	50 %	0 %	0 %	400403789
98	NC_018414	AT	3	6	1934	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	400403789
99	NC_018414	A	7	7	1947	1953	100 %	0 %	0 %	0 %	400403789
100	NC_018414	T	6	6	1996	2001	0 %	100 %	0 %	0 %	400403789
101	NC_018414	ATA	3	9	2008	2016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
102	NC_018414	TAA	2	6	2050	2055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
103	NC_018414	A	8	8	2064	2071	100 %	0 %	0 %	0 %	400403789
104	NC_018414	A	6	6	2076	2081	100 %	0 %	0 %	0 %	400403789
105	NC_018414	TCA	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400403789
106	NC_018414	TAAA	2	8	2095	2102	75 %	25 %	0 %	0 %	400403789
107	NC_018414	TAA	2	6	2162	2167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
108	NC_018414	T	7	7	2182	2188	0 %	100 %	0 %	0 %	400403789
109	NC_018414	TTA	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
110	NC_018414	TAG	2	6	2207	2212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	400403789
111	NC_018414	TTTA	2	8	2218	2225	25 %	75 %	0 %	0 %	400403789
112	NC_018414	A	6	6	2263	2268	100 %	0 %	0 %	0 %	400403789
113	NC_018414	A	8	8	2291	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	400403789
114	NC_018414	TAT	2	6	2303	2308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
115	NC_018414	AT	3	6	2389	2394	50 %	50 %	0 %	0 %	400403789
116	NC_018414	GAA	2	6	2430	2435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	400403789
117	NC_018414	GCA	3	9	2436	2444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400403789
118	NC_018414	TAT	3	9	2491	2499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
119	NC_018414	A	7	7	2507	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	400403789
120	NC_018414	TA	3	6	2523	2528	50 %	50 %	0 %	0 %	400403789
121	NC_018414	ATTA	2	8	2534	2541	50 %	50 %	0 %	0 %	400403789
122	NC_018414	ACAAT	2	10	2623	2632	60 %	20 %	0 %	20 %	400403789
123	NC_018414	ATT	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
124	NC_018414	AAAAT	2	10	2676	2685	80 %	20 %	0 %	0 %	400403789
125	NC_018414	TAT	2	6	2691	2696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403789
126	NC_018414	AAT	2	6	2697	2702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
127	NC_018414	TA	3	6	2716	2721	50 %	50 %	0 %	0 %	400403789
128	NC_018414	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
129	NC_018414	A	7	7	2739	2745	100 %	0 %	0 %	0 %	400403789
130	NC_018414	T	9	9	2760	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	400403789
131	NC_018414	ATA	3	9	2778	2786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403789
132	NC_018414	AT	3	6	2807	2812	50 %	50 %	0 %	0 %	400403789
133	NC_018414	A	6	6	2814	2819	100 %	0 %	0 %	0 %	400403789
134	NC_018414	T	9	9	2838	2846	0 %	100 %	0 %	0 %	400403790
135	NC_018414	A	7	7	2847	2853	100 %	0 %	0 %	0 %	400403790
136	NC_018414	TTAAAT	3	18	2860	2877	50 %	50 %	0 %	0 %	400403790
137	NC_018414	ATA	3	9	2878	2886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	400403790
138	NC_018414	TAT	2	6	2895	2900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	400403790
139	NC_018414	T	8	8	2904	2911	0 %	100 %	0 %	0 %	400403790
140	NC_018414	TATT	2	8	2915	2922	25 %	75 %	0 %	0 %	400403790
141	NC_018414	ATAA	2	8	2923	2930	75 %	25 %	0 %	0 %	400403790
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143	NC_018414	T	10	10	2939	2948	0 %	100 %	0 %	0 %	400403790
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