MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium ulcerans 0102

Total Repeats: 1492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018101	GAATT	2	10	41	50	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018101	CGTTG	2	10	268	277	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018101	GCAGA	2	10	1108	1117	40 %	0 %	40 %	20 %	397652753
4	NC_018101	ACCAC	2	10	2102	2111	40 %	0 %	0 %	60 %	397652753
5	NC_018101	TCAAC	2	10	3446	3455	40 %	20 %	0 %	40 %	397652754
6	NC_018101	GCTCA	2	10	5021	5030	20 %	20 %	20 %	40 %	397652755
7	NC_018101	TAGGG	2	10	5845	5854	20 %	20 %	60 %	0 %	397652756
8	NC_018101	CACGC	2	10	6155	6164	20 %	0 %	20 %	60 %	397652757
9	NC_018101	TGCCG	2	10	10491	10500	0 %	20 %	40 %	40 %	397652761
10	NC_018101	TGGTT	2	10	10704	10713	0 %	60 %	40 %	0 %	397652761
11	NC_018101	CGGTG	2	10	13493	13502	0 %	20 %	60 %	20 %	397652763
12	NC_018101	CAGTA	2	10	15086	15095	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018101	ATTTG	2	10	16417	16426	20 %	60 %	20 %	0 %	397652766
14	NC_018101	CTTTT	2	10	19737	19746	0 %	80 %	0 %	20 %	397652770
15	NC_018101	GCAAA	2	10	22479	22488	60 %	0 %	20 %	20 %	397652771
16	NC_018101	TTGCT	2	10	25914	25923	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018101	TTCGC	2	10	28859	28868	0 %	40 %	20 %	40 %	397652782
18	NC_018101	TGTCT	2	10	29554	29563	0 %	60 %	20 %	20 %	397652782
19	NC_018101	GATGG	2	10	31240	31249	20 %	20 %	60 %	0 %	397652783
20	NC_018101	AAGCG	2	10	31285	31294	40 %	0 %	40 %	20 %	397652783
21	NC_018101	TGCGA	2	10	31682	31691	20 %	20 %	40 %	20 %	397652783
22	NC_018101	CCCAG	2	10	31965	31974	20 %	0 %	20 %	60 %	397652783
23	NC_018101	CTGTT	2	10	32507	32516	0 %	60 %	20 %	20 %	397652784
24	NC_018101	AAAGC	2	10	34244	34253	60 %	0 %	20 %	20 %	397652785
25	NC_018101	CGGTG	2	10	37691	37700	0 %	20 %	60 %	20 %	397652789
26	NC_018101	ATTTT	2	10	38649	38658	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018101	CAGAC	2	10	41532	41541	40 %	0 %	20 %	40 %	397652792
28	NC_018101	TGCGG	2	10	42677	42686	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018101	CTGAT	2	10	43229	43238	20 %	40 %	20 %	20 %	397652794
30	NC_018101	GGAGC	2	10	44227	44236	20 %	0 %	60 %	20 %	397652795
31	NC_018101	CATCA	2	10	46710	46719	40 %	20 %	0 %	40 %	397652797
32	NC_018101	CTTTT	2	10	51301	51310	0 %	80 %	0 %	20 %	397652800
33	NC_018101	GACGG	2	10	51735	51744	20 %	0 %	60 %	20 %	397652800
34	NC_018101	TGAGG	2	10	52148	52157	20 %	20 %	60 %	0 %	397652800
35	NC_018101	GGCCC	2	10	52439	52448	0 %	0 %	40 %	60 %	397652801
36	NC_018101	ATCTG	2	10	53476	53485	20 %	40 %	20 %	20 %	397652802
37	NC_018101	TCATG	2	10	56130	56139	20 %	40 %	20 %	20 %	397652803
38	NC_018101	AACGG	2	10	57071	57080	40 %	0 %	40 %	20 %	397652805
39	NC_018101	CCTAT	2	10	57201	57210	20 %	40 %	0 %	40 %	397652805
40	NC_018101	GAGAA	2	10	58247	58256	60 %	0 %	40 %	0 %	397652806
41	NC_018101	CATCA	2	10	58834	58843	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_018101	TGTGG	2	10	60567	60576	0 %	40 %	60 %	0 %	397652809
43	NC_018101	ATGCC	2	10	63550	63559	20 %	20 %	20 %	40 %	397652813
44	NC_018101	GAGGC	2	10	66965	66974	20 %	0 %	60 %	20 %	397652815
45	NC_018101	GCCTC	2	10	67536	67545	0 %	20 %	20 %	60 %	397652815
46	NC_018101	CAGTG	2	10	73958	73967	20 %	20 %	40 %	20 %	397652821
47	NC_018101	TGAGA	2	10	74301	74310	40 %	20 %	40 %	0 %	397652822
48	NC_018101	AGTGA	2	10	74351	74360	40 %	20 %	40 %	0 %	397652822
49	NC_018101	TGAGG	2	10	74660	74669	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018101	GCAGC	2	10	77306	77315	20 %	0 %	40 %	40 %	397652828
51	NC_018101	GACTG	2	10	77322	77331	20 %	20 %	40 %	20 %	397652828
52	NC_018101	CAAGG	2	10	79567	79576	40 %	0 %	40 %	20 %	397652830
53	NC_018101	GCAAA	2	10	84471	84480	60 %	0 %	20 %	20 %	397652836
54	NC_018101	TGGTG	2	10	89474	89483	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018101	CCCAG	2	10	89754	89763	20 %	0 %	20 %	60 %	397652842
56	NC_018101	CCAAA	2	10	89802	89811	60 %	0 %	0 %	40 %	397652842
57	NC_018101	CTTCC	2	10	93323	93332	0 %	40 %	0 %	60 %	397652843
58	NC_018101	GCTGG	2	10	93454	93463	0 %	20 %	60 %	20 %	397652843
59	NC_018101	GAACG	2	10	95823	95832	40 %	0 %	40 %	20 %	397652845
60	NC_018101	TCCAC	2	10	97151	97160	20 %	20 %	0 %	60 %	397652846
61	NC_018101	CCGTT	2	10	98942	98951	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_018101	ACGGA	2	10	99102	99111	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018101	CGATG	2	10	100515	100524	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018101	ACCCT	2	10	104779	104788	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_018101	CTGGG	2	10	106289	106298	0 %	20 %	60 %	20 %	397652855
66	NC_018101	AGCCG	2	10	108429	108438	20 %	0 %	40 %	40 %	397652857
67	NC_018101	ACACC	2	10	108600	108609	40 %	0 %	0 %	60 %	397652857
68	NC_018101	AACTC	2	10	108983	108992	40 %	20 %	0 %	40 %	397652857
69	NC_018101	ACTGT	2	10	112239	112248	20 %	40 %	20 %	20 %	397652859
70	NC_018101	CGCGT	2	10	113376	113385	0 %	20 %	40 %	40 %	397652860
71	NC_018101	CGTAG	2	10	114881	114890	20 %	20 %	40 %	20 %	397652861
72	NC_018101	GCGGT	2	10	115563	115572	0 %	20 %	60 %	20 %	397652861
73	NC_018101	TAACA	2	10	116610	116619	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018101	GGTCT	2	10	119565	119574	0 %	40 %	40 %	20 %	397652867
75	NC_018101	CATGT	2	10	120146	120155	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_018101	ACTGA	2	10	121212	121221	40 %	20 %	20 %	20 %	397652868
77	NC_018101	AAGCT	2	10	121898	121907	40 %	20 %	20 %	20 %	397652868
78	NC_018101	TGGCA	2	10	122320	122329	20 %	20 %	40 %	20 %	397652869
79	NC_018101	AAAAT	2	10	123130	123139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018101	TAATT	2	10	124914	124923	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018101	CCGGT	2	10	125903	125912	0 %	20 %	40 %	40 %	397652873
82	NC_018101	CAACA	2	10	126811	126820	60 %	0 %	0 %	40 %	397652874
83	NC_018101	AGCTG	2	10	126842	126851	20 %	20 %	40 %	20 %	397652874
84	NC_018101	ACTTC	2	10	130167	130176	20 %	40 %	0 %	40 %	397652878
85	NC_018101	GTTGA	2	10	132406	132415	20 %	40 %	40 %	0 %	397652880
86	NC_018101	AGCGC	2	10	133495	133504	20 %	0 %	40 %	40 %	397652880
87	NC_018101	GGAGC	2	10	133687	133696	20 %	0 %	60 %	20 %	397652880
88	NC_018101	ATGGG	2	10	134504	134513	20 %	20 %	60 %	0 %	397652881
89	NC_018101	CATGG	2	10	134593	134602	20 %	20 %	40 %	20 %	397652881
90	NC_018101	TTGGA	2	10	137335	137344	20 %	40 %	40 %	0 %	397652885
91	NC_018101	GTGAA	2	10	137958	137967	40 %	20 %	40 %	0 %	397652886
92	NC_018101	TGGGA	2	10	138547	138556	20 %	20 %	60 %	0 %	397652888
93	NC_018101	TGGGG	2	10	139555	139564	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018101	TGCTT	2	10	140253	140262	0 %	60 %	20 %	20 %	397652889
95	NC_018101	TGCAA	2	10	146226	146235	40 %	20 %	20 %	20 %	397652894
96	NC_018101	GCTGG	2	10	146889	146898	0 %	20 %	60 %	20 %	397652895
97	NC_018101	TTGCT	2	10	147251	147260	0 %	60 %	20 %	20 %	397652895
98	NC_018101	AACGC	2	10	149814	149823	40 %	0 %	20 %	40 %	397652897
99	NC_018101	ACCAA	2	10	150724	150733	60 %	0 %	0 %	40 %	397652897
100	NC_018101	TTCAT	2	10	151992	152001	20 %	60 %	0 %	20 %	397652898
101	NC_018101	CGGTG	2	10	154238	154247	0 %	20 %	60 %	20 %	397652899
102	NC_018101	CCCTT	2	10	157095	157104	0 %	40 %	0 %	60 %	397652903
103	NC_018101	AGAAA	2	10	160692	160701	80 %	0 %	20 %	0 %	397652907
104	NC_018101	CTTTT	2	10	161864	161873	0 %	80 %	0 %	20 %	397652909
105	NC_018101	ATCCC	2	10	165098	165107	20 %	20 %	0 %	60 %	397652912
106	NC_018101	TGCGA	2	10	165622	165631	20 %	20 %	40 %	20 %	397652913
107	NC_018101	TGAGC	2	10	165982	165991	20 %	20 %	40 %	20 %	397652913
108	NC_018101	AGGTG	2	10	167752	167761	20 %	20 %	60 %	0 %	397652915
109	NC_018101	GGATG	2	10	172576	172585	20 %	20 %	60 %	0 %	397652918
110	NC_018101	GGGAT	2	10	180518	180527	20 %	20 %	60 %	0 %	397652925
111	NC_018101	ATATA	2	10	180760	180769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018101	AGGGG	2	10	182056	182065	20 %	0 %	80 %	0 %	397652928
113	NC_018101	GGGAC	3	15	186849	186863	20 %	0 %	60 %	20 %	397652938
114	NC_018101	GGAAG	2	10	186921	186930	40 %	0 %	60 %	0 %	397652938
115	NC_018101	AGGGG	2	10	187960	187969	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018101	GATCG	2	10	188168	188177	20 %	20 %	40 %	20 %	397652941
117	NC_018101	GATGC	2	10	191384	191393	20 %	20 %	40 %	20 %	397652944
118	NC_018101	CAAAA	2	10	192264	192273	80 %	0 %	0 %	20 %	397652945
119	NC_018101	CGGAG	2	10	194482	194491	20 %	0 %	60 %	20 %	397652948
120	NC_018101	GTTTT	2	10	197071	197080	0 %	80 %	20 %	0 %	397652953
121	NC_018101	GCCGC	2	10	201061	201070	0 %	0 %	40 %	60 %	397652957
122	NC_018101	CGGTG	2	10	202169	202178	0 %	20 %	60 %	20 %	397652957
123	NC_018101	TCTCA	2	10	205576	205585	20 %	40 %	0 %	40 %	397652958
124	NC_018101	GAGAG	2	10	205615	205624	40 %	0 %	60 %	0 %	397652958
125	NC_018101	CCAGG	2	10	207716	207725	20 %	0 %	40 %	40 %	397652960
126	NC_018101	GATTA	2	10	207799	207808	40 %	40 %	20 %	0 %	397652960
127	NC_018101	CCTGA	2	10	211617	211626	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_018101	CGGAA	2	10	212230	212239	40 %	0 %	40 %	20 %	397652966
129	NC_018101	CCTTC	2	10	212287	212296	0 %	40 %	0 %	60 %	397652966
130	NC_018101	AAAAT	2	10	212556	212565	80 %	20 %	0 %	0 %	397652966
131	NC_018101	GATGC	2	10	213250	213259	20 %	20 %	40 %	20 %	397652966
132	NC_018101	GCTGA	2	10	214126	214135	20 %	20 %	40 %	20 %	397652968
133	NC_018101	TCGCA	2	10	216425	216434	20 %	20 %	20 %	40 %	397652970
134	NC_018101	ATTCC	2	10	222290	222299	20 %	40 %	0 %	40 %	397652977
135	NC_018101	GCCGG	2	10	223771	223780	0 %	0 %	60 %	40 %	397652978
136	NC_018101	CAGTG	2	10	229988	229997	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018101	TATTT	2	10	231524	231533	20 %	80 %	0 %	0 %	397652984
138	NC_018101	GAAGT	2	10	235145	235154	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018101	TGAAC	2	10	236016	236025	40 %	20 %	20 %	20 %	397652988
140	NC_018101	GGCGA	2	10	236161	236170	20 %	0 %	60 %	20 %	397652988
141	NC_018101	ACGTG	2	10	237190	237199	20 %	20 %	40 %	20 %	397652989
142	NC_018101	GCCAG	2	10	237746	237755	20 %	0 %	40 %	40 %	397652990
143	NC_018101	CGAGG	2	10	238458	238467	20 %	0 %	60 %	20 %	397652990
144	NC_018101	GTACC	2	10	240908	240917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_018101	TTTCT	2	10	242863	242872	0 %	80 %	0 %	20 %	397652994
146	NC_018101	GCACC	2	10	243783	243792	20 %	0 %	20 %	60 %	397652996
147	NC_018101	TGCGG	2	10	244659	244668	0 %	20 %	60 %	20 %	397652997
148	NC_018101	ATCGA	2	10	247757	247766	40 %	20 %	20 %	20 %	397652999
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150	NC_018101	GCATA	2	10	251054	251063	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_018101	GCGCT	2	10	255889	255898	0 %	20 %	40 %	40 %	397653006
152	NC_018101	TTCCG	2	10	257576	257585	0 %	40 %	20 %	40 %	397653007
153	NC_018101	ACGGT	2	10	258532	258541	20 %	20 %	40 %	20 %	397653007
154	NC_018101	ATTTT	2	10	259426	259435	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018101	TGGCC	2	10	261959	261968	0 %	20 %	40 %	40 %	397653008
156	NC_018101	GCCGC	2	10	263260	263269	0 %	0 %	40 %	60 %	397653009
157	NC_018101	CGCAT	2	10	263932	263941	20 %	20 %	20 %	40 %	397653009
158	NC_018101	GGGCA	2	10	267134	267143	20 %	0 %	60 %	20 %	397653012
159	NC_018101	CAGTT	2	10	270017	270026	20 %	40 %	20 %	20 %	397653014
160	NC_018101	GTGGA	2	10	271699	271708	20 %	20 %	60 %	0 %	397653014
161	NC_018101	AAGCG	2	10	274338	274347	40 %	0 %	40 %	20 %	397653015
162	NC_018101	TAATA	2	10	276858	276867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018101	AAATG	2	10	277941	277950	60 %	20 %	20 %	0 %	397653018
164	NC_018101	TGCGC	2	10	281047	281056	0 %	20 %	40 %	40 %	397653020
165	NC_018101	AGGAT	2	10	282606	282615	40 %	20 %	40 %	0 %	397653021
166	NC_018101	TTGCA	2	10	283131	283140	20 %	40 %	20 %	20 %	397653021
167	NC_018101	AGTGC	2	10	285180	285189	20 %	20 %	40 %	20 %	397653025
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171	NC_018101	GCAGT	2	10	288629	288638	20 %	20 %	40 %	20 %	397653028
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175	NC_018101	CTGGG	2	10	300473	300482	0 %	20 %	60 %	20 %	397653039
176	NC_018101	GCGGG	2	10	302042	302051	0 %	0 %	80 %	20 %	397653041
177	NC_018101	AAATA	2	10	303115	303124	80 %	20 %	0 %	0 %	397653042
178	NC_018101	GGCGC	2	10	309137	309146	0 %	0 %	60 %	40 %	397653047
179	NC_018101	TGCGC	2	10	309393	309402	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
180	NC_018101	TGGCA	2	10	310190	310199	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
181	NC_018101	GCTGC	2	10	313611	313620	0 %	20 %	40 %	40 %	397653054
182	NC_018101	CGGGG	2	10	319065	319074	0 %	0 %	80 %	20 %	397653060
183	NC_018101	GAAAA	2	10	319205	319214	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018101	ATAAA	2	10	319681	319690	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018101	AGTTC	2	10	320163	320172	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
186	NC_018101	CGAGA	2	10	320528	320537	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
187	NC_018101	TTGCG	2	10	322188	322197	0 %	40 %	40 %	20 %	397653063
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192	NC_018101	GCCGC	2	10	345997	346006	0 %	0 %	40 %	60 %	397653083
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197	NC_018101	TGGCA	2	10	356284	356293	20 %	20 %	40 %	20 %	397653092
198	NC_018101	CTCGC	2	10	358184	358193	0 %	20 %	20 %	60 %	397653094
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201	NC_018101	GCTGA	2	10	368852	368861	20 %	20 %	40 %	20 %	397653103
202	NC_018101	AAATA	2	10	376277	376286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_018101	GAATG	2	10	377564	377573	40 %	20 %	40 %	0 %	397653113
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226	NC_018101	GCCCT	2	10	408719	408728	0 %	20 %	20 %	60 %	397653143
227	NC_018101	GCAGG	2	10	408933	408942	20 %	0 %	60 %	20 %	397653143
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234	NC_018101	CACAC	2	10	417693	417702	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
235	NC_018101	CAGAT	2	10	418085	418094	40 %	20 %	20 %	20 %	397653152
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239	NC_018101	GTTTT	2	10	423771	423780	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
240	NC_018101	CTTCG	2	10	425243	425252	0 %	40 %	20 %	40 %	397653159
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248	NC_018101	AAAAG	2	10	440998	441007	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
249	NC_018101	ACGTT	2	10	443956	443965	20 %	40 %	20 %	20 %	397653169
250	NC_018101	GGTGG	2	10	445052	445061	0 %	20 %	80 %	0 %	397653171
251	NC_018101	CTTGG	2	10	449076	449085	0 %	40 %	40 %	20 %	397653174
252	NC_018101	GAAAA	2	10	450570	450579	80 %	0 %	20 %	0 %	397653175
253	NC_018101	GACAG	2	10	452218	452227	40 %	0 %	40 %	20 %	397653177
254	NC_018101	CCCAA	2	10	452784	452793	40 %	0 %	0 %	60 %	397653178
255	NC_018101	TTCAC	2	10	455085	455094	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
256	NC_018101	ATGCA	2	10	458860	458869	40 %	20 %	20 %	20 %	397653183
257	NC_018101	GCGCG	2	10	463558	463567	0 %	0 %	60 %	40 %	397653189
258	NC_018101	AGGGG	2	10	464789	464798	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
259	NC_018101	CAGCC	2	10	470744	470753	20 %	0 %	20 %	60 %	397653204
260	NC_018101	CAGCC	2	10	471254	471263	20 %	0 %	20 %	60 %	397653204
261	NC_018101	TGGAG	2	10	472122	472131	20 %	20 %	60 %	0 %	397653204
262	NC_018101	CCATC	2	10	473075	473084	20 %	20 %	0 %	60 %	397653205
263	NC_018101	GTCAG	2	10	473423	473432	20 %	20 %	40 %	20 %	397653205
264	NC_018101	ACCCG	2	10	477872	477881	20 %	0 %	20 %	60 %	397653209
265	NC_018101	CCGCA	2	10	478004	478013	20 %	0 %	20 %	60 %	397653210
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