MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 4891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018019	TTCC	2	8	710	717	0 %	50 %	0 %	50 %	392399584
2	NC_018019	AGCC	2	8	857	864	25 %	0 %	25 %	50 %	392399584
3	NC_018019	ATGC	2	8	922	929	25 %	25 %	25 %	25 %	392399584
4	NC_018019	CAGG	2	8	1029	1036	25 %	0 %	50 %	25 %	392399584
5	NC_018019	TACG	2	8	1223	1230	25 %	25 %	25 %	25 %	392399584
6	NC_018019	GATG	2	8	1560	1567	25 %	25 %	50 %	0 %	392399584
7	NC_018019	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018019	GAAG	2	8	2430	2437	50 %	0 %	50 %	0 %	392399585
9	NC_018019	CCCA	2	8	2485	2492	25 %	0 %	0 %	75 %	392399585
10	NC_018019	CTGC	2	8	2770	2777	0 %	25 %	25 %	50 %	392399585
11	NC_018019	GAAA	2	8	3256	3263	75 %	0 %	25 %	0 %	392399585
12	NC_018019	TTAC	2	8	3399	3406	25 %	50 %	0 %	25 %	392399585
13	NC_018019	TCGT	2	8	3684	3691	0 %	50 %	25 %	25 %	392399586
14	NC_018019	AAGG	2	8	4840	4847	50 %	0 %	50 %	0 %	392399586
15	NC_018019	ATAC	2	8	5415	5422	50 %	25 %	0 %	25 %	392399587
16	NC_018019	ATGC	2	8	5817	5824	25 %	25 %	25 %	25 %	392399588
17	NC_018019	ACTC	2	8	9478	9485	25 %	25 %	0 %	50 %	392399592
18	NC_018019	CAAC	2	8	9636	9643	50 %	0 %	0 %	50 %	392399592
19	NC_018019	GCAT	2	8	9731	9738	25 %	25 %	25 %	25 %	392399592
20	NC_018019	CACG	2	8	10762	10769	25 %	0 %	25 %	50 %	392399592
21	NC_018019	TTAG	2	8	11988	11995	25 %	50 %	25 %	0 %	392399593
22	NC_018019	TCGC	2	8	12462	12469	0 %	25 %	25 %	50 %	392399594
23	NC_018019	GGAT	2	8	12472	12479	25 %	25 %	50 %	0 %	392399594
24	NC_018019	TTCC	2	8	12739	12746	0 %	50 %	0 %	50 %	392399594
25	NC_018019	GCTA	2	8	12807	12814	25 %	25 %	25 %	25 %	392399594
26	NC_018019	GCCT	2	8	12826	12833	0 %	25 %	25 %	50 %	392399594
27	NC_018019	TTGT	2	8	13533	13540	0 %	75 %	25 %	0 %	392399595
28	NC_018019	GCCC	2	8	13683	13690	0 %	0 %	25 %	75 %	392399595
29	NC_018019	AGTG	2	8	13932	13939	25 %	25 %	50 %	0 %	392399595
30	NC_018019	TGGG	2	8	14426	14433	0 %	25 %	75 %	0 %	392399596
31	NC_018019	AATC	2	8	14956	14963	50 %	25 %	0 %	25 %	392399597
32	NC_018019	AAAG	2	8	15048	15055	75 %	0 %	25 %	0 %	392399597
33	NC_018019	AGCT	2	8	15347	15354	25 %	25 %	25 %	25 %	392399597
34	NC_018019	AAGG	2	8	15667	15674	50 %	0 %	50 %	0 %	392399597
35	NC_018019	TGCG	2	8	16294	16301	0 %	25 %	50 %	25 %	392399598
36	NC_018019	GCCA	2	8	16973	16980	25 %	0 %	25 %	50 %	392399599
37	NC_018019	GCTT	2	8	17830	17837	0 %	50 %	25 %	25 %	392399600
38	NC_018019	ACCG	2	8	18832	18839	25 %	0 %	25 %	50 %	392399601
39	NC_018019	CAAT	2	8	19218	19225	50 %	25 %	0 %	25 %	392399602
40	NC_018019	GAAA	2	8	20224	20231	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018019	CGTG	2	8	20787	20794	0 %	25 %	50 %	25 %	392399605
42	NC_018019	TCCC	2	8	20975	20982	0 %	25 %	0 %	75 %	392399606
43	NC_018019	AGCA	2	8	21762	21769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018019	AAAG	2	8	21772	21779	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018019	CGAT	2	8	21933	21940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018019	TACC	2	8	22812	22819	25 %	25 %	0 %	50 %	392399608
47	NC_018019	TTGA	2	8	23792	23799	25 %	50 %	25 %	0 %	392399609
48	NC_018019	TCAT	2	8	24373	24380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018019	TGAT	2	8	24391	24398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018019	GGTG	2	8	25530	25537	0 %	25 %	75 %	0 %	392399610
51	NC_018019	TGAG	2	8	26047	26054	25 %	25 %	50 %	0 %	392399611
52	NC_018019	TCGG	2	8	26176	26183	0 %	25 %	50 %	25 %	392399611
53	NC_018019	AATT	2	8	28212	28219	50 %	50 %	0 %	0 %	392399613
54	NC_018019	GAGT	2	8	28251	28258	25 %	25 %	50 %	0 %	392399613
55	NC_018019	TGGA	2	8	28369	28376	25 %	25 %	50 %	0 %	392399613
56	NC_018019	GAAG	2	8	28524	28531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018019	GAAA	2	8	29185	29192	75 %	0 %	25 %	0 %	392399614
58	NC_018019	CTTC	2	8	29194	29201	0 %	50 %	0 %	50 %	392399614
59	NC_018019	AGAA	2	8	29226	29233	75 %	0 %	25 %	0 %	392399614
60	NC_018019	GCCC	2	8	29393	29400	0 %	0 %	25 %	75 %	392399614
61	NC_018019	GCTA	2	8	29685	29692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018019	TGAG	2	8	30332	30339	25 %	25 %	50 %	0 %	392399616
63	NC_018019	GTAC	2	8	30533	30540	25 %	25 %	25 %	25 %	392399616
64	NC_018019	GATC	2	8	31142	31149	25 %	25 %	25 %	25 %	392399616
65	NC_018019	GGAA	2	8	32280	32287	50 %	0 %	50 %	0 %	392399617
66	NC_018019	TGGC	2	8	32542	32549	0 %	25 %	50 %	25 %	392399617
67	NC_018019	GGTT	2	8	32787	32794	0 %	50 %	50 %	0 %	392399617
68	NC_018019	CTGA	2	8	32819	32826	25 %	25 %	25 %	25 %	392399617
69	NC_018019	GGAC	2	8	34143	34150	25 %	0 %	50 %	25 %	392399618
70	NC_018019	GATA	2	8	34889	34896	50 %	25 %	25 %	0 %	392399618
71	NC_018019	TAAC	2	8	36278	36285	50 %	25 %	0 %	25 %	392399619
72	NC_018019	CAAG	2	8	36482	36489	50 %	0 %	25 %	25 %	392399619
73	NC_018019	CAGG	2	8	36897	36904	25 %	0 %	50 %	25 %	392399620
74	NC_018019	ACCA	2	8	37040	37047	50 %	0 %	0 %	50 %	392399620
75	NC_018019	GCCC	2	8	37086	37093	0 %	0 %	25 %	75 %	392399620
76	NC_018019	TGGC	2	8	37206	37213	0 %	25 %	50 %	25 %	392399620
77	NC_018019	TGGT	2	8	38108	38115	0 %	50 %	50 %	0 %	392399621
78	NC_018019	GCTT	2	8	38356	38363	0 %	50 %	25 %	25 %	392399621
79	NC_018019	TACT	2	8	39591	39598	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018019	AAGA	2	8	39673	39680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018019	TGCG	2	8	40123	40130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018019	AAAG	2	8	40451	40458	75 %	0 %	25 %	0 %	392399623
83	NC_018019	TAGA	2	8	40697	40704	50 %	25 %	25 %	0 %	392399623
84	NC_018019	TAAG	2	8	40837	40844	50 %	25 %	25 %	0 %	392399623
85	NC_018019	CAAG	2	8	41058	41065	50 %	0 %	25 %	25 %	392399624
86	NC_018019	GCTG	2	8	42005	42012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018019	GCTG	2	8	42104	42111	0 %	25 %	50 %	25 %	392399626
88	NC_018019	ATCA	2	8	42516	42523	50 %	25 %	0 %	25 %	392399626
89	NC_018019	AATG	2	8	42865	42872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018019	GGAA	3	12	43043	43054	50 %	0 %	50 %	0 %	392399627
91	NC_018019	AGCC	2	8	43972	43979	25 %	0 %	25 %	50 %	392399627
92	NC_018019	AAAT	2	8	44509	44516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018019	TTGC	2	8	46238	46245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018019	ATAC	2	8	47215	47222	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018019	TGCG	2	8	47327	47334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018019	GCAT	2	8	48796	48803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018019	TCAT	2	8	49635	49642	25 %	50 %	0 %	25 %	392399633
98	NC_018019	ATCG	2	8	49871	49878	25 %	25 %	25 %	25 %	392399633
99	NC_018019	CGAT	2	8	50347	50354	25 %	25 %	25 %	25 %	392399634
100	NC_018019	ATGA	2	8	50481	50488	50 %	25 %	25 %	0 %	392399634
101	NC_018019	CTGG	2	8	50882	50889	0 %	25 %	50 %	25 %	392399635
102	NC_018019	ATGC	2	8	52203	52210	25 %	25 %	25 %	25 %	392399637
103	NC_018019	TGAT	2	8	52437	52444	25 %	50 %	25 %	0 %	392399637
104	NC_018019	CAAG	2	8	52522	52529	50 %	0 %	25 %	25 %	392399637
105	NC_018019	ACTT	2	8	52613	52620	25 %	50 %	0 %	25 %	392399637
106	NC_018019	GCGG	2	8	54986	54993	0 %	0 %	75 %	25 %	392399640
107	NC_018019	CGAC	2	8	55127	55134	25 %	0 %	25 %	50 %	392399641
108	NC_018019	CATC	2	8	55446	55453	25 %	25 %	0 %	50 %	392399641
109	NC_018019	GAGG	2	8	55659	55666	25 %	0 %	75 %	0 %	392399641
110	NC_018019	ATTG	2	8	55994	56001	25 %	50 %	25 %	0 %	392399641
111	NC_018019	TTGG	2	8	56219	56226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018019	AGGG	2	8	57645	57652	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018019	GCAC	2	8	58752	58759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018019	TGAC	2	8	58799	58806	25 %	25 %	25 %	25 %	392399644
115	NC_018019	CGTT	2	8	59046	59053	0 %	50 %	25 %	25 %	392399644
116	NC_018019	AAAC	2	8	59092	59099	75 %	0 %	0 %	25 %	392399644
117	NC_018019	TCAT	2	8	59340	59347	25 %	50 %	0 %	25 %	392399644
118	NC_018019	TGCT	2	8	59833	59840	0 %	50 %	25 %	25 %	392399645
119	NC_018019	CGTA	2	8	60376	60383	25 %	25 %	25 %	25 %	392399646
120	NC_018019	CTTT	2	8	60514	60521	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018019	ACCT	2	8	61005	61012	25 %	25 %	0 %	50 %	392399647
122	NC_018019	ATAC	2	8	61164	61171	50 %	25 %	0 %	25 %	392399647
123	NC_018019	CATG	2	8	61188	61195	25 %	25 %	25 %	25 %	392399647
124	NC_018019	AACA	2	8	62196	62203	75 %	0 %	0 %	25 %	392399648
125	NC_018019	TCTT	2	8	62593	62600	0 %	75 %	0 %	25 %	392399648
126	NC_018019	TGGG	2	8	63651	63658	0 %	25 %	75 %	0 %	392399649
127	NC_018019	GTGG	2	8	64449	64456	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018019	GATT	2	8	64466	64473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018019	CCAG	2	8	65318	65325	25 %	0 %	25 %	50 %	392399650
130	NC_018019	GGTG	2	8	65534	65541	0 %	25 %	75 %	0 %	392399650
131	NC_018019	ATCC	2	8	65825	65832	25 %	25 %	0 %	50 %	392399650
132	NC_018019	GGCT	2	8	67064	67071	0 %	25 %	50 %	25 %	392399651
133	NC_018019	GCTG	2	8	67606	67613	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018019	CTTG	2	8	67931	67938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018019	TCCA	2	8	68074	68081	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018019	AGTG	2	8	68293	68300	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018019	GGTT	2	8	68811	68818	0 %	50 %	50 %	0 %	392399652
138	NC_018019	GGGC	2	8	69463	69470	0 %	0 %	75 %	25 %	392399653
139	NC_018019	TAGC	2	8	69494	69501	25 %	25 %	25 %	25 %	392399653
140	NC_018019	TGCT	2	8	69736	69743	0 %	50 %	25 %	25 %	392399654
141	NC_018019	TGAG	2	8	69867	69874	25 %	25 %	50 %	0 %	392399654
142	NC_018019	ATGA	2	8	70909	70916	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018019	TTGC	2	8	72371	72378	0 %	50 %	25 %	25 %	392399655
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